BioBrick

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 3 februari 2019; kontroller kräver 8 redigeringar .

BioBrick  (BioBlock) - DNA-sekvenser avsedda för sammansättning med restriktionsligeringsmetoden, som används för att utveckla och skapa konstgjorda biologiska system med vissa egenskaper [1] [2] . Sedan 2008 har det erkänts som den ledande standarden för syntetisk biologi [2] . När den väl utvecklats på en dator, injiceras koden vanligtvis i levande celler, såsom Escherichia coli , för att ge dem nya funktioner.

Hierarki för standarden

Standarden har ett hierarkiskt system på tre nivåer som syntetisk biologi är baserad på :

  1. Delar: DNA-sekvens som bildar en funktionell enhet (t.ex. promotorer , ribosombindningsställen , kodande sekvenser, terminatorsekvenser , etc.)
  2. Enheter: en uppsättning sammankopplade komplementära delar som har en given funktion;
  3. System: en uppsättning enheter som utför uppgifter på hög nivå;

Fördelar med standarden

Standarden utvecklades vid MIT för att tillämpa tekniska principer för abstraktion och modularitet för programmering av biologiska system och levande organismer. Fördelar med Biobricks standardiserade tillvägagångssätt :

Historia om BioBrick

2003

BioBrick - standarden beskrevs och presenterades av Tom Knight vid MIT. Sedan dess har olika forskargrupper börjat använda BioBrick för att skapa nya biologiska enheter och system.

2006

2006 grundades den ideella organisationen BioBricks Foundation av ingenjörer och forskare med målet att standardisera biologiska delar inom detta vetenskapsområde. [3]

2008

Sedan starten av projektet har mer än 2 000 BioBricks släppts till allmänheten och är tillgängliga i Registry of Standard Biological Parts. BioBrick är erkänt som den ledande standarden inom syntetisk biologi [2]

2015

5018 deltagare (280 lag) från 38 länder deltog i iGEM 2015- tävlingar [1]

2017

5400 deltagare (310 lag) deltog i iGEM 2017-tävlingarna.

2018

BioBrick Parts Catalog hade redan över 20 000 dokumenterade genetiska delar. Dessa delar är tillgängliga för fri användning av iGEM-team och akademiska labb [2] .

Alternativa standarder

Det första försöket att skapa en lista över standardiserade biologiska delar av NOMAD gjordes 1996 av en grupp forskare under ledning av D. Rebatchuk. Hans team presenterade en kloningsstrategi för sammansättning av korta DNA-fragment. Men detta tidiga försök antogs inte allmänt. [fyra]

Anteckningar

  1. ↑ Tom Knight (2003). Idempotent vektordesign för standardmontering av biobrickor . Hämtad 26 september 2014. Arkiverad från originalet 6 oktober 2014.
  2. ↑ 1 2 3 Riddare, Thomas F; Reshma P Shetty; Drew Andy. Engineering BioBrick-vektorer från BioBrick-delar  (neopr.)  // Journal of Biological Engineering. - 2008. - 14 april ( vol. 2 , nr 5 ). - S. 1-12 . - doi : 10.1186/1754-1611-2-5 . — PMID 18410688 . Arkiverad från originalet den 28 september 2015.
  3. ↑ BioBricks Foundation . BioBricks Foundation . Hämtad 19 mars 2018. Arkiverad från originalet 12 mars 2018.
  4. ↑ Rebatchouk, Dmitri; Daraselia, N.; Narita, JO NOMAD: en mångsidig strategi för in vitro DNA-manipulation tillämpad på promotoranalys och vektordesign.  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidskrift. - 1996. - 1 oktober ( vol. 93 , nr 20 ). - P. 10891-10896 . - doi : 10.1073/pnas.93.20.10891 . Arkiverad från originalet den 24 september 2015.
 Bioteknik
Områden för bioteknik
Relaterade artiklar
Forskare
Popularisatorer