CHD3

DNA-bindande protein helikas kromodomän 3

Identifierare

CHD3 ; Mi-2a; Mi2-ALFA; ZFH

Externa ID:n

OMIM: 602120 MGI : 1344395 HomoloGene : 62693 GeneCards : CHD3 Gene

3.6.4.12

Genontologi
Fungera	• DNA-bindning • ATP-beroende DNA-helikasaktivitet • helikasaktivitet • proteinbindning • ATP-bindning • zinkjonbindning • poly(A) RNA-bindning
cellkomponent	• kärna • nukleolus • cytoplasma • centrosom • NuRD-komplex • mellanliggande filamentcytoskelett
biologisk process	• Katabolisk process för ATP • sammansättning eller demontering av kromatin • transkription, DNA-mall • reglering av transkription, DNA-mall • reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • spindelorganisation • kromatinmodifiering • DNA-duplexavlindning • centrosom organisation
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 17:
7,79 – 7,82 Mb

Chr 11:
69,34 – 69,37 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

CHD3 (från engelska Chromodomain- H elicase - D NA-bindande protein 3) är ett enzym som kodas hos människor av CHD3 -genen . [1] [2] [3]

Denna gen kodar för en medlem av CHD-familjen av proteiner som kännetecknas av närvaron av kromodomäner (kromatinmodifierande organisation) och SNF2-associerade helikas/ATPas-domäner. Detta protein är en av komponenterna i ett histon-deacetylaskomplex som kallas Mi-2/NuRD-komplexet, som är involverat i kromatin -remodellering under histon-deacetylering. Kromatinremodellering är avgörande för många processer, inklusive transkription . Autoantikroppar mot detta protein finns i en undergrupp av patienter med dermatomyosit . Det finns tre alternativa splitsningstranskript som kodar för olika isoformer. [3]

Interaktioner

CHD3 har visats interagera med HDAC1 , [4] [5] histondeacetylas 2 [4] [6] [7] och SERBP1 . [8] [9]

Anteckningar

↑ Woodage T., Basrai MA, Baxevanis AD, Hieter P., Collins FS Karakterisering av CHD-familjen av proteiner // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1997. - November ( vol. 94 , nr 21 ). - P. 11472-11477 . - doi : 10.1073/pnas.94.21.11472 . — PMID 9326634 .
↑ Ge Q., Nilasena DS, O'Brien CA, Frank MB, Targoff IN Molekylär analys av en viktig antigen region av 240-kD proteinet av Mi-2 autoantigen // J Clin Invest : journal. - 1995. - November ( vol. 96 , nr 4 ). - P. 1730-1737 . - doi : 10.1172/JCI118218 . — PMID 7560064 .
↑ 1 2 Entrez-gen: CHD3-kromodomänhelikas-DNA-bindande protein 3 . (obestämd)
↑ 12 Tong , JK; Hassig C.A.; Schnitzler GR; Kingston RE; Schreiber S L. Chromatin deacetylation by a ATP-dependent nucleosome remodeling complex (engelska) // Nature : journal. - ENGLAND, 1998. - Oktober ( vol. 395 , nr 6705 ). - P. 917-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
↑ Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument Bromage H; TempstP; Reinberg D. Rollen av Sin3-Histone Deacetylase Complex i tillväxtreglering av kandidattumörsuppressorn p33ING1 // Mol . cell. Biol. : journal. - USA, 2002. - Februari ( vol. 22 , nr 3 ). - s. 835-848 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. En kandidatgen för X-länkad mental retardation är en komponent i en ny familj av histon-deacetylas-innehållande komplex // J. Biol. Chem. : journal. - USA, 2003. - Februari ( vol. 278 , nr 9 ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Schmiesing John A; Dong Yuanshu; Barak Orr G; Speicher David W; Yokomori Kyoko; Shiekhattar Ramin. Ett kromatinombyggnadskomplex som laddar kohesin på mänskliga kromosomer (engelska) // Nature : journal. — England, 2002. — August ( vol. 418 , nr 6901 ). - s. 994-998 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
↑ Lemos, Taila A; Passos Dario O; Nery Flavia C; Kobarg Jörg. Karakterisering av en ny familj av proteiner som interagerar med den C-terminala regionen av kromatin-remodelleringsfaktorn CHD-3 // FEBS Lett . : journal. - Nederländerna, 2003. - Januari ( vol. 533 , nr 1-3 ). - S. 14-20 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
↑ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. A human protein-protein interaction network: a resurs for annotating the proteome // Cell : journal. - USA: Cell Press , 2005. - September ( vol. 122 , nr 6 ). - P. 957-968 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . — PMID 16169070 .

Litteratur

Bowen NJ, Fujita N., Kajita M., Wade PA Mi-2/NuRD: multipla komplex för många ändamål // Biochim . Biophys. Acta : journal. - 2004. - Vol. 1677 , nr. 1-3 . - S. 52-7 . - doi : 10.1016/j.bbaexp.2003.10.010 . — PMID 15020045 .
Gieser L., Swaroop A. Uttryckta sekvenstaggar och kromosomal lokalisering av cDNA-kloner från ett subtraherat retinalt pigmentepitelbibliotek (engelska) // Genomics : journal. - Academic Press , 1992. - Vol. 13 , nr. 3 . - s. 873-876 . - doi : 10.1016/0888-7543(92)90173-P . — PMID 1639417 .
Seelig HP, Moosbrugger I., Ehrfeld H., et al. Det huvudsakliga dermatomyositspecifika Mi-2-autoantigenet är en förmodad helikas involverad i transkriptionell aktivering // Arthritis Rheum . : journal. - 1995. - Vol. 38 , nr. 10 . - P. 1389-1399 . - doi : 10.1002/art.1780381006 . — PMID 7575689 .
Seelig HP, Renz M., Targoff IN, et al. Två former av det huvudsakliga antigena proteinet i det dermatomyosit-specifika Mi-2 autoantigenet // Arthritis Rheum . : journal. - 1996. - Vol. 39 , nr. 10 . - P. 1769-1771 . - doi : 10.1002/art.1780391029 . — PMID 8843877 .
Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalisering och subtraktion: två tillvägagångssätt för att underlätta genupptäckt // Genome Res . : journal. - 1997. - Vol. 6 , nr. 9 . - s. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
Aubry F., Mattéi MG, Galibert F. Identifiering av ett humant 17p-lokaliserat cDNA som kodar för ett protein från den Snf2-liknande helikasfamiljen // Eur . J Biochem. : journal. - 1998. - Vol. 254 , nr. 3 . - s. 558-564 . - doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2540558.x . — PMID 9688266 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, et al. Kromatindeacetylering av ett ATP-beroende nukleosomombyggnadskomplex (engelska) // Nature : journal. - 1998. - Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
Kleiderlein JJ, Nisson PE, Jessee J., et al. CCG upprepas i cDNA från mänsklig hjärna // Hum . Genet. : journal. - 1999. - Vol. 103 , nr. 6 . - s. 666-673 . - doi : 10.1007/s004390050889 . — PMID 9921901 .
Kim J., Sif S., Jones B., et al. Ikaros DNA-bindande proteiner styr bildningen av kromatinombyggnadskomplex i lymfocyter (engelska) // Immunitet : journal. - Cell Press , 1999. - Vol. 10 , nej. 3 . - S. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
Wade PA, Gegonne A., Jones PL, et al. Mi-2-komplex kopplar DNA-metylering till kromatinremodellering och histondeacetylering (engelska) // Nat. Genet. : journal. - 1999. - Vol. 23 , nr. 1 . - S. 62-6 . - doi : 10.1038/12664 . — PMID 10471500 .
Kusin P., Billotte J., Chaubert P., Shaw P. Fysisk karta över 17p13 och generna intill p53 // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Vol. 63 , nr. 1 . - S. 60-8 . doi : 10.1006/ geno.1999.6062 . — PMID 10662545 .
Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. Kovalent modifiering av p73alfa av SUMO-1. Tvåhybridscreening med p73 identifierar nya SUMO-1-interagerande proteiner och ett SUMO-1-interaktionsmotiv // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 46 . - P. 36316-36323 . - doi : 10.1074/jbc.M004293200 . — PMID 10961991 .
Schultz DC, Friedman JR, Rauscher FJ Inriktning på histon-deacetylaskomplex via KRAB-zinkfingerproteiner: PHD och bromodomänerna av KAP-1 bildar en kooperativ enhet som rekryterar en ny isoform av Mi-2α-subenheten av NuRD // Gene Dev. : journal. - 2001. - Vol. 15 , nr. 4 . - s. 428-443 . - doi : 10.1101/gad.869501 . — PMID 11230151 .
Yasui D., Miyano M., Cai S., et al. SATB1 är inriktad på kromatinremodellering för att reglera gener över långa avstånd // Nature : journal. - 2002. - Vol. 419 , nr. 6907 . - s. 641-645 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Lemos TA, Passos DO, Nery FC, Kobarg J. Karakterisering av en ny familj av proteiner som interagerar med den C-terminala regionen av den kromatinremodellerande faktorn CHD-3 // FEBS Lett . : journal. - 2003. - Vol. 533 , nr. 1-3 . - S. 14-20 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
Fujita N., Jaye DL, Kajita M., et al. MTA3, en Mi-2/NuRD komplex subenhet, reglerar en invasiv tillväxtväg vid bröstcancer (engelska) // Cell : journal. - Cell Press , 2003. - Vol. 113 , nr. 2 . - S. 207-219 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00234-4 . — PMID 12705869 .
Lee BH, Yoshimatsu K., Maeda A., et al. Association av nukleokapsidproteinet från Seoul- och Hantaan-hantavirusen med små ubiquitin-liknande modifier-1-relaterade molekyler // Virus Res. : journal. - 2004. - Vol. 98 , nr. 1 . - S. 83-91 . - doi : 10.1016/j.virusres.2003.09.001 . — PMID 14609633 .