Histon deacetylas 2

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 3 juni 2015; kontroller kräver 6 redigeringar .
Histon deacetylas 2
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning: PDBe , RCSB
Identifierare
SymbolHDAC2  ; HD2; RPD3; YAF1
Externa ID:nOMIM:  605164 MGI :  1097691 HomoloGene :  68187 CHEMBL : 1937 GeneCards : HDAC2 Gene
EG-nummer3.5.1.98
RNA-uttrycksprofil
Mer information
ortologer
SeMänskligMus
Entrez306615182
EnsembleENSG00000196591ENSMUSG00000019777
UniProtQ92769P70288
RefSeq (mRNA)NM_001527NM_008229
RefSeq (protein)NP_001518NP_032255
Locus (UCSC)Chr 6:
114,25 – 114,33 Mb		Chr 10:
36,97 - 37 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

Histondeacetylas 2  är ett enzym från histondeacetylasfamiljen som kodas hos människor av HDAC2 -genen . [ett]

Funktion

HDAC2 - genprodukten tillhör familjen histon - deacetylaser . Histondeacetylaser fungerar som en del av stora multiproteinkomplex och är ansvariga för deacetyleringen av lysinrester vid den N-terminala regionen av kärnhistoner (H2A, H2B, H3 och H4). Detta protein bildar också transkriptionella repressorkomplex genom att binda till olika proteiner, inklusive YY1, en av däggdjurens transkriptionsfaktorer . Histondeacetylas 2 spelar en viktig roll i regleringen av transkription , cellcykel och utveckling. [2]

Interaktioner

Histondeacetylas 2 interagerar med:

Anteckningar

  1. ↑ Betz R., Gray SG, Ekström C., Larsson C., Ekström TJ Human histondeacetylase 2, HDAC2 (Human RPD3), är lokaliserad till 6q21 genom strålningshybridkartläggning  // Genomics  :  journal. - Academic Press , 1998. - December ( vol. 52 , nr 2 ). - S. 245-246 . doi : 10.1006/ geno.1998.5435 . — PMID 9782097 .
  2. ↑ Entrez-gen: HDAC2-histondeacetylas 2 .
  3. ↑ 1 2 Schmidt DR, Schreiber SL Molekylär association mellan ATR och två komponenter i nukleosomombildnings- och deacetyleringskomplexet, HDAC2 och CHD4  //  Biokemi: journal. — Vol. 38 , nr. 44 . - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
  4. ↑ 1 2 3 4 Yoon YM, Baek KH, Jeong SJ, Shin HJ, Ha GH, Jeon AH, Hwang SG, Chun JS, Lee CW WD-repetitionsinnehållande mitotiska kontrollpunktsproteiner fungerar som transkriptionsrepressorer under   interfas // FEBS Lett. : journal. — Vol. 575 , nr. 1-3 . - S. 23-9 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.07.089 . — PMID 15388328 .
  5. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. En kandidatgen för X-länkad mental retardation är en komponent i en ny familj av histon-deacetylas-innehållande komplex   // J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  6. ↑ 1 2 3 4 5 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Kromatindeacetylering av ett ATP-beroende nukleosomombyggnadskomplex  //  Nature: journal. — Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  7. ↑ 1 2 Hakimi MA, Bochar DA, Schmiesing JA, Dong Y., Barak OG, Speicher DW, Yokomori K., Shiekhattar R. Ett kromatinombyggnadskomplex som laddar kohesin på mänskliga kromosomer  //  Nature : journal. — Vol. 418 , nr. 6901 . - s. 994-998 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
  8. ↑ Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB DNMT1 binder HDAC2 och en ny co-repressor, DMAP1, för att bilda ett komplex vid replikationsfoci   // Nat . Genet.  : journal. — Vol. 25 , nr. 3 . - S. 269-277 . - doi : 10.1038/77023 . — PMID 10888872 .
  9. ↑ 1 2 3 van der Vlag J., Otte AP Transkriptionsrepression förmedlad av det mänskliga polykamgruppsproteinet EED involverar histondeacetylering   // Nat . Genet.  : journal. — Vol. 23 , nr. 4 . - s. 474-478 . - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
  10. ↑ Yang WM, Yao YL, Seto E. Det FK506-bindande proteinet 25 associeras funktionellt med histondeacetylaser och med transkriptionsfaktor YY1  // EMBO  J. : journal. — Vol. 20 , nej. 17 . - P. 4814-4825 . - doi : 10.1093/emboj/20.17.4814 . — PMID 11532945 .
  11. ↑ Trevägskontroll av fostrets hjärtcellsproliferation kan hjälpa till att regenerera hjärtceller  (7 oktober 2010). Arkiverad från originalet den 3 januari 2012. Hämtad 9 april 2015.
  12. ↑ Wen YD, Cress WD, Roy AL, Seto E. Histondeacetylas 3 binder till och reglerar den multifunktionella transkriptionsfaktorn TFII-I  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 278 , nr. 3 . - P. 1841-1847 . - doi : 10.1074/jbc.M206528200 . — PMID 12393887 .
  13. ↑ 1 2 Fischer DD, Cai R., Bhatia U., Asselbergs FA, Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Isolation and characterization of a novel class II histon deacetylase , HDAC10  (engelska)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 8 . - P. 6656-6666 . - doi : 10.1074/jbc.M108055200 . — PMID 11739383 .
  14. ↑ 1 2 3 Yao YL, Yang WM De metastasassocierade proteinerna 1 och 2 bildar distinkta proteinkomplex med histon-deacetylasaktivitet  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  15. ↑ 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Ett kärn-BRAF35-komplex som innehåller histondeacetylas förmedlar förtryck av neuronspecifika gener  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidskrift. — Vol. 99 , nr. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
  16. ↑ 1 2 Johnson CA, White DA, Lavender JS, O'Neill LP, Turner BM Mänskliga klass I histon-deacetylaskomplex visar ökad katalytisk aktivitet i närvaro av ATP och co-immunoutfällning med det ATP-beroende chaperonproteinet  Hsp70  // J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 11 . - P. 9590-9597 . - doi : 10.1074/jbc.M107942200 . — PMID 11777905 .
  17. ↑ Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Enzymatisk aktivitet associerad med klass II HDAC är beroende av ett multiproteinkomplex som innehåller HDAC3 och SMRT/N  -CoR  // Mol. cell : journal. — Vol. 9 , nej. 1 . - S. 45-57 . - doi : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
  18. ↑ Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7-histondeacetylasaktivitet är associerad med HDAC3 in vivo  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 276 , nr. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
  19. ↑ Ashburner BP, Westerheide SD, Baldwin AS P65 (RelA) subenheten av NF-kappaB interagerar med histon deacetylas (HDAC) corepressorerna HDAC1 och HDAC2 för att negativt reglera genuttryck   // Mol . cell. Biol. : journal. — Vol. 21 , nr. 20 . - P. 7065-7077 . - doi : 10.1128/MCB.21.20.7065-7077.2001 . — PMID 11564889 .
  20. ↑ 1 2 3 4 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analys av NuRD-subenheterna avslöjar ett histon-deacetylaskärnkomplex och ett samband med DNA-metylering   // Genes Dev .  : journal. — Vol. 13 , nr. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  21. ↑ Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL En roll för histon-deacetylasaktivitet i HDAC1-medierad transkriptionell repression  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidning. — Vol. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  22. ↑ Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histoneacetylaser och SAP18, en ny polypeptid, är komponenter i ett humant Sin3-komplex  (engelska)  // Cell  : journal. — Cell Tryck på . — Vol. 89 , nr. 3 . - s. 357-364 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  23. ↑ Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Human Sin3-deacetylas och trithorax-relaterat Set1/Ash2-histon H3-K4-metyltransferas binds samman selektivt av cellproliferationsfaktorn HCF-   1 // Genes Dev.  : journal. — Vol. 17 , nr. 7 . - P. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  24. ↑ Mazumdar A., ​​Wang RA, Mishra SK, Adam L., Bagheri-Yarmand R., Mandal M., Vadlamudi RK, Kumar R. Transcriptional repression of östrogen receptor by metastasis-associated protein 1   corepressor // Nat . Cell biol.  : journal. — Vol. 3 , nr. 1 . - S. 30-7 . - doi : 10.1038/35050532 . — PMID 11146623 .
  25. ↑ 1 2 Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN Histondeacetylaser associerade med mSin3-corepressorn förmedlar galen transkriptionell repression  (engelska)  // Cell  : journal. — Cell Tryck på . — Vol. 89 , nr. 3 . - s. 349-356 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  26. ↑ Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, Jansen JF, Vermeulen M., Stunnenberg HG, Vuister GW The Mad1-Sin3B interaction involves a novel spiral fold   // Nat . Struktur. Biol.  : journal. — Vol. 7 , nr. 12 . - P. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
  27. ↑ Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Två mycket besläktade p66-proteiner utgör en ny familj av potenta transkriptionsrepressorer som interagerar med MBD2 och MBD3  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 43 . - P. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
  28. ↑ Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 är en transkriptionsrepressor som tillhör MeCP1-histondeacetylaskomplexet  . )  / / Nat. Genet.  : journal. — Vol. 23 , nr. 1 . - S. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  29. ↑ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Karakterisering av BHC80 i BRAF-HDAC-komplex, involverad i neuronspecifik   genrepression // Biochem. Biophys. Res. kommun. : journal. — Vol. 322 , nr. 2 . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
  30. ↑ Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. Proteinfosfatas-1 (PP1) regulatorn, nukleär inhibitor av PP1 (NIPP1), interagerar med polycomb group protein, embryonal ektodermutveckling (EED), och fungerar som en transkriptionsrepressor  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 278 , nr. 33 . - P. 30677-30685 . - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
  31. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Dubbla mekanismer för reglering av transkription av luteiniserande hormonreceptorgen av nukleära föräldralösa receptorer och histondeacetylaskomplex  (engelska)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : journal. — Vol. 85 , nr. 2-5 . - s. 401-414 . - doi : 10.1016/s0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  32. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Dufau ML Tystnad av transkription av den humana luteiniserande hormonreceptorgenen av histon-deacetylas-mSin3A-komplex  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  33. ↑ You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST är en integrerad komponent i CoREST-humant histon-deacetylaskomplex  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . — Vol. 98 , nr. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  34. ↑ Kiernan R., Brès V., Ng RW, Coudart MP, El Messaoudi S., Sardet C., Jin DY, Emiliani S., Benkirane M. Efteraktivering av NF-kappa B-beroende transkription är reglerad genom acetylering av p65  (engelska)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 278 , nr. 4 . - P. 2758-2766 . - doi : 10.1074/jbc.M209572200 . — PMID 12419806 .
  35. ↑ Yu Z., Zhang W., Kone BC Histondeacetylaser förstärker cytokininduktion av iNOS-genen  //  J. Am. soc. Nephrol. : journal. — Vol. 13 , nr. 8 . - P. 2009-2017 . - doi : 10.1097/01.asn.0000024253.59665.f1 . — PMID 12138131 .
  36. ↑ Lai A., Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E., Branton PE RBP1 rekryterar både histondeacetylasberoende och -oberoende repressionsaktiviteter till proteiner i retinoblastomfamiljen   // Mol . cell. Biol. : journal. — Vol. 19 , nr. 10 . - P. 6632-6641 . — PMID 10490602 .
  37. ↑ Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, ett nytt protein som konserveras mellan människa och jäst, är en komponent i ett histondeacetylaskomplex   // Mol. cell : journal. — Vol. 1 , nej. 7 . - P. 1021-1031 . - doi : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  38. ↑ Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Rollen av Sin3-histondeacetylaskomplexet i tillväxtreglering av kandidattumörsuppressorn p33(ING1  )  // Mol. cell. Biol. : journal. — Vol. 22 , nr. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  39. ↑ Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Identifiering och karakterisering av tre nya komponenter i mSin3A-corepressorkomplexet   // Mol . cell. Biol. : journal. — Vol. 23 , nr. 10 . - P. 3456-3467 . - doi : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  40. ↑ Yang L., Mei Q., ​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA En ERG (ets-relaterad gen)-associerad histonmetyltransferas interagerar med histondeacetylaser 1/2 och transkriptionssamrepressorer mSin3A/B  (engelska)  // Biochem. J. : journal. — Vol. 369 , nr. Pt 3 . - s. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  41. ↑ Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Hayward SD En roll för SKIP i EBNA2-aktivering av CBF1-undertryckta promotorer  //  J. Virol. : journal. — Vol. 74 , nr. 4 . - P. 1939-1947 . doi : 10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000 . — PMID 10644367 .
  42. ↑ Vaute O., Nicolas E., Vandel L., Trouché D. Funktionell och fysisk interaktion mellan histonmetyltransferaset Suv39H1 och histondeacetylaser  // Nucleic Acids Res  . : journal. — Vol. 30 , nej. 2 . - s. 475-481 . doi : 10.1093 / nar/30.2.475 . — PMID 11788710 .
  43. ↑ 1 2 Won J., Yim J., Kim TK Sp1 och Sp3 rekryterar histondeacetylas för att undertrycka transkription av humant telomeras omvänt transkriptas (hTERT)-promotor i normala humana somatiska celler  (engelska)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 41 . - P. 38230-38238 . - doi : 10.1074/jbc.M206064200 . — PMID 12151407 .
  44. ↑ 1 2 Sun JM, Chen HY, Moniwa M., Litchfield DW, Seto E., Davie JR Transkriptionsrepressorn Sp3 är associerad med CK2-fosforylerat histondeacetylas 2  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 39 . - P. 35783-35786 . - doi : 10.1074/jbc.C200378200 . — PMID 12176973 .
  45. ↑ Tsai SC, Valkov N., Yang WM, Gump J., Sullivan D., Seto E. Histondeacetylas interagerar direkt med DNA-topoisomeras II   // Nat . Genet.  : journal. — Vol. 26 , nr. 3 . - s. 349-353 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
  46. ↑ Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E. Isolering och karakterisering av cDNA som motsvarar en ytterligare medlem av den humana histon-deacetylas-genfamiljen  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 272 , nr. 44 . - P. 28001-28007 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.28001 . — PMID 9346952 .
  47. ↑ Yao YL, Yang WM, Seto E. Reglering av transkriptionsfaktor YY1 genom acetylering och deacetylering   // Mol . cell. Biol. : journal. — Vol. 21 , nr. 17 . - P. 5979-5991 . - doi : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . — PMID 11486036 .
  48. ↑ Kalenik JL, Chen D., Bradley ME, Chen SJ, Lee TC Jäst tvåhybridkloning av ett nytt zinkfingerprotein som interagerar med den multifunktionella transkriptionsfaktorn YY1  // Nucleic Acids Res  . : journal. — Vol. 25 , nr. 4 . - s. 843-849 . doi : 10.1093 / nar/25.4.843 . — PMID 9016636 .

Litteratur