RBBP4

Retinoblastombindande protein 4

Introducerad baserat på PDB 2XU7 .
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning: PDBe , RCSB
Identifierare
SymbolRBBP4  ; NURF55; RBAP48; lin-53
Externa ID:nOMIM:  602923 MGI :  1194912 HomoloGene :  21153 GeneCards : RBBP4 Gene
ortologer
SeMänskligMus
Entrez592819646
EnsembleENSG00000162521ENSMUSG00000057236
UniProtQ09028Q60972
RefSeq (mRNA)NM_001135255NM_009030
RefSeq (protein)NP_001128727NP_033056
Locus (UCSC)Chr 1:
33,12 – 33,15 Mb		Chr 4:
129,31 – 129,34 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

Det histonbindande proteinet RBBP4 (även känt som RbAp48 eller NURF55 ) är ett protein som kodas hos människor av RBBP4 -genen . [1] [2]

Funktion

Denna gen kodar för ett allmänt uttryckt nukleärt protein som tillhör en mycket konserverad underfamilj av WD-repeterande proteiner. Det finns i proteinkomplex involverade i histonacetylering och kromatinmontering . Detta är en del av Mi-2/NuRD-komplexet som har varit inblandat i kromatinombyggnad och transkriptionell repression i samband med histondeacetylering. Detta kodade protein är också en del av corepressorkomplex som är integrerade i transkriptionell tystnad . Detta finns bland flera cellulära proteiner som binder direkt till retinoblastomproteinet för att reglera cellproliferation. Detta protein verkar också vara involverat i transkriptionell repression av E2F-responsiva gener. [3]

Klinisk betydelse

Minskningen av RbAp48 i dentat gyrus i hjärnans hippocampus misstänks vara den främsta orsaken till minnesförlust vid normalt åldrande . [4] En åldersrelaterad minskning av RbAp48 observeras i dentate gyrus under vävnadsobduktion efter mänsklig död, såväl som hos möss. Dessutom orsakar knackningsgenen i den dominerande negativa formen av RbAp48 minnesbrister hos unga möss, liknande det som observeras hos äldre möss. Slutligen, genöverföring av lentivirus för att öka uttrycket av RbAp48 i hjärnan reverserar minnesförsämring hos åldrade möss. [fyra]

RBBP4 använder en del av PKA - CREB1-CPB-vägen. [4] Således är en av de möjliga terapeutiska metoderna för att återställa åldersrelaterad minnesförlust användningen av PKA-CREB1-CPB metabolismvägar för stimulerande läkemedel. Dopamin D1/D5-agonister såsom 6-Br-APB och SKF-38393, som är positivt kopplade till adenylatcyklas och cAMP - fosfodiesterashämmaren rolipram , har tidigare visat sig minska minnesdefekter hos äldre möss. [5]

Interaktioner

RBBP4 har visat sig interagera med:

Anteckningar

  1. ↑ Qian YW, Wang YC, Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee EY Ett retinoblastombindande protein relaterat till en negativ regulator av Ras i jäst  //  Nature : journal. - 1993. - September ( vol. 364 , nr 6438 ). - s. 648-652 . - doi : 10.1038/364648a0 . — PMID 8350924 .
  2. ↑ Barak O., Lazzaro MA, Lane WS, Speicher DW, Picketts DJ, Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression   // EMBO J : journal. - 2003. - November ( vol. 22 , nr 22 ). - P. 6089-6100 . - doi : 10.1093/emboj/cdg582 . — PMID 14609955 .
  3. ↑ Entrez-gen: RBBP4 retinoblastombindande protein 4 .
  4. ↑ 1 2 3 Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small SA, Kandel ER Molecular Mechanism for Age-Related Memory Lost: The Histon-Binding Protein  RbAp48 .)  // Sci Transl Med : journal. - 2013. - Augusti ( vol. 5 , nr 200 ). — S. 200ra115 . - doi : 10.1126/scitranslmed.3006373 . — PMID 23986399 .
  5. ↑ Bach ME, Barad M., Son H., Zhuo M., Lu YF, Shih R., Mansuy I., Hawkins RD, Kandel ER Åldersrelaterade defekter i spatialt minne är korrelerade med defekter i den sena fasen av hippocampus långa -term potentiering in vitro och försvagas av läkemedel som förbättrar cAMP-signalvägen  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1999. - April ( vol. 96 , nr 9 ). - P. 5280-5285 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.5280 . — PMID 10220457 .
  6. ↑ Yarden RI, Brody LC BRCA1 interagerar med komponenter i histondeacetylaskomplexet  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4983-4988 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 . — PMID 10220405 .
  7. ↑ Zhang Q., Vo N., Goodman RH Histonbindande protein RbAp48 interagerar med ett komplex av CREB-bindande protein och fosforylerat CREB   // Mol . cell. Biol. : journal. - 2000. - Vol. 20 , nej. 14 . - P. 4970-4978 . - doi : 10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000 . — PMID 10866654 .
  8. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identifiering och funktionell karakterisering av p66/p68-komponenterna i MeCP1-komplexet   // Mol . cell. Biol. : journal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 2 . - s. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
  9. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Dubbla mekanismer för reglering av transkription av luteiniserande hormonreceptorgen av nukleära föräldralösa receptorer och histondeacetylaskomplex  (engelska)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : journal. - 2003. - Vol. 85 , nr. 2-5 . - s. 401-414 . - doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  10. ↑ 1 2 Yao YL, Yang WM De metastasassocierade proteinerna 1 och 2 bildar distinkta proteinkomplex med histon-deacetylasaktivitet  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  11. ↑ 1 2 3 Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouché D. Histondeacetylaset HDAC3 riktar RbAp48 till retinoblastomproteinet  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2001. - Vol. 29 , nr. 15 . - s. 3131-3136 . doi : 10.1093 / nar/29.15.3131 . — PMID 11470869 .
  12. ↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tre proteiner definierar en klass av humana histondeacetylaser relaterade till jäst Hda1p  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
  13. ↑ You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST är en integrerad komponent i CoREST-humant histon-deacetylaskomplex  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2001. - Vol. 98 , nr. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  14. ↑ 1 2 Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE Histondeacetylasaktivitet krävs för fullständig transkriptionell repression av mSin3A  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - s. 341-347 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80214-7 . — PMID 9150133 .
  15. ↑ Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 är en transkriptionsrepressor som tillhör MeCP1-histondeacetylaskomplexet  . )  / / Nat. Genet.  : journal. - 1999. - Vol. 23 , nr. 1 . - S. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  16. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analys av NuRD-subenheterna avslöjar ett histon-deacetylaskärnkomplex  och /ett samband med DNA-metylering  Genes Dev.  : journal. - 1999. - Vol. 13 , nr. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  17. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Tystnad av transkription av den humana luteiniserande hormonreceptorgenen av histon-deacetylas-mSin3A-komplex  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  18. ↑ Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL En roll för histon-deacetylasaktivitet i HDAC1-medierad transkriptionell repression  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidning. - 1998. - Vol. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  19. ↑ Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histoneacetylaser och SAP18, en ny polypeptid, är komponenter i ett humant Sin3-komplex  (engelska)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - s. 357-364 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  20. ↑ Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. En kandidatgen för X-länkad mental retardation är en komponent i en ny familj av histon-deacetylas-innehållande komplex  (engelska)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  21. ↑ Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Kromatindeacetylering av ett ATP-beroende nukleosomombyggnadskomplex  //  Nature: journal. - 1998. - Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  22. ↑ Qian YW, Lee EY Dubbla retinoblastombindande proteiner med egenskaper relaterade till en negativ regulator av ras i jäst  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1995. - Vol. 270 , nr. 43 . - P. 25507-25513 . doi : 10.1074/ jbc.270.43.25507 . — PMID 7503932 .
  23. ↑ Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D.  RbAp48 tillhör histon-deacetylaskomplexet som associerar med retinoblastomproteinet  // J Biol. Chem.  : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 13 . - P. 9797-9804 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9797 . — PMID 10734134 .
  24. ↑ 1 2 Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, ett nytt protein som konserveras mellan människa och jäst, är en komponent i ett histon-deacetylaskomplex  (engelska)  // Mol. cell : journal. - 1998. - Vol. 1 , nej. 7 . - P. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  25. ↑ Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Rollen av Sin3-histondeacetylaskomplexet i tillväxtreglering av kandidattumörsuppressorn p33(ING1  )  // Mol. cell. Biol. : journal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .

Litteratur