IKZF1

Zinkfinger 1 (Ikaros) från IKAROS-familjen
Identifierare
SymbolIKZF1  ; Hs.54452; IK1; IKAROS; LYF1; LyF-1; PPP1R92; PR00758; ZNFN1A1
Externa ID:nOMIM:  603023 MGI :  1342540 HomoloGene :  55948 GeneCards : IKZF1 Gene
RNA-uttrycksprofil
Mer information
ortologer
SeMänskligMus
Entrez1032022778
EnsembleENSG00000185811ENSMUSG00000018654
UniProtQ13422Q03267
RefSeq (mRNA)NM_001220765NM_001025597
RefSeq (protein)NP_001207694NP_001020768
Locus (UCSC)Chr 7:
50,34 – 50,47 Mb		Chr 11:
11,69 – 11,77 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

DNA-bindande protein Ikaros , även känt som zinkfingerprotein 1 i Ikaros-familjen ( Eng.  DNA-bindande protein Ikaros, Ikaros-familjen zinkfingerprotein 1, IKZF1 ) är ett protein som kodas hos människor av IKZF1 -genen [1] [2 ] [3] .

Funktioner

Ikaros utför viktiga funktioner i det hematopoetiska systemet, och förlusten av dess funktioner är förknippad med utvecklingen av lymfoid leukemi [4] . I synnerhet har det under senare år visat sig att Ikaros är en av de viktigaste tumörsuppressorerna som är involverade i utvecklingen av akut lymfoblastisk leukemi från B-celler hos människor [4] . IKZF1 är uppreglerad i granulocyter , B-celler, T-celler som bär CD4- och CD8 -receptorer , NK-celler och nedregleras i erytroblaster , megakaryocyter och monocyter [5] . Hos IKZF1 knockoutmöss bildas fortfarande T-celler, men inte B-celler, sent i utvecklingen på grund av sent kompensatoriskt uttryck av den närbesläktade -genen (IKZF3) 6] . Ikaros resulterar i fosterdöd hos mutanta möss på grund av anemi ; de har allvarliga defekter i terminal differentiering av erytrocyter och granulocyter och överdriven produktion av makrofager [7] .

Klinisk betydelse

Hos människor har SNP : er belägna nära 3'-regionen av IKZF1-genen associerats med mottaglighet för akut lymfatisk leukemi hos barn (ALL) [8] såväl som typ 1-diabetes mellitus [9] . Dessa två effekter verkar vara i motsatta riktningar, d.v.s. den allelen som är ansvarig för mottaglighet för ALL ger skydd mot typ 1-diabetes mellitus och vice versa [9] .

Interaktioner med andra proteiner

IKZF1 har visats interagera med: IKZF2 [10] , IKZF3 [11] [12] [13] , IKZF4 [14] [15] , histondeacetylas 5 [16] , HDAC1 [ 17] [16] , HDAC7A [16] , SIN3B [12] [16] , SIN3A [12] [16] [18] och CTBP1 [19] .

Anteckningar

  1. ↑ Georgopoulos K., Moore DD, Derfler B. Ikaros, en tidig lymfoidspecifik transkriptionsfaktor och en förmodad mediator för T-cellsengagemang  //  Science : journal. - 1992. - December ( vol. 258 , nr 5083 ). - P. 808-812 . - doi : 10.1126/science.1439790 . — PMID 1439790 .
  2. ↑ Hahm K., Ernst P., Lo K., Kim GS, Turck C., Smale ST Den lymfoida transkriptionsfaktorn LyF-1 kodas av specifika, alternativt splitsade mRNA härrörande från Ikaros-genen   // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1994. - November ( vol. 14 , nr 11 ). - P. 7111-7123 . — PMID 7935426 .
  3. ↑ Entrez-gen: IKZF1 IKAROS-familjen zinkfinger 1 (Ikaros) .
  4. ↑ 1 2 Kastner P., Chan S. Role of Ikaros in T-cell acute lymfoblastic leukemi  (engelska)  // World J Biol Chem : journal. - 2011. - Juni ( vol. 2 , nr 6 ). - S. 108-114 . - doi : 10.4331/wjbc.v2.i6.108 . — PMID 21765975 .
  5. ↑ Watkins NA, Gusnanto A., de Bono B., De S., Miranda-Saavedra D., Hardie DL, Angenent WG, Attwood AP, Ellis PD, Erber W., Foad NS, Garner SF, Isacke CM, Jolley J ., Koch K., Macaulay IC, Morley SL, Rendon A., Rice KM, Taylor N., Thijssen-Timmer DC, Tijssen MR, van der Schoot CE, Wernisch L., Winzer T., Dudbridge F., Buckley CD Langford CF, Teichmann S., Göttgens B., Ouwehand WH; Bloodomics konsortium. A HaemAtlas: karakterisering av genuttryck i differentierade mänskliga   blodkroppar // Blod : journal. — American Society of Hematology, 2009. — Maj ( vol. 113 , nr 19 ). - P. e1-9 . - doi : 10.1182/blood-2008-06-162958 . — PMID 19228925 .
  6. ↑ Georgopoulos K., Winandy S., Avitahl N. Ikaros-genens roll i lymfocytutveckling och homeostas. (engelska)  // Ann Rev Immunol. : journal. - 1997. - Vol. 15 . - S. 155-176 . - doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.155 . — PMID 9143685 .
  7. ↑ Papathanasiou P., Perkins AC, Cobb BS, Ferrini R., Sridharan R., Hoyne GF, Nelms KA, Smale ST, Goodnow CC. Utbredd misslyckande av hematolymfoid differentiering orsakad av en recessiv nischfyllande allel av Ikaros transkriptionsfaktor  //  Immunity : journal. - 2003. - Juli ( vol. 19 , nr 1 ). - S. 131-144 . - doi : 10.1016/s1074-7613(03)00168-7 .
  8. ↑ Papaemmanuil E., Hosking FJ, Vijayakrishnan J., Price A., Olver B., Sheridan E., Kinsey SE, Lightfoot T., Roman E., Irving JA, Allan JM, Tomlinson IP, Taylor M., Greaves M. ., Holston RS. Loki på 7p12.2, 10q21.2 och 14q11.2 är förknippade med risken för akut lymfoblastisk leukemi hos barn. (engelska)  // Ann Rev Immunol. : journal. - 2009. - September ( vol. 41 , nr 9 ). - S. 1006-1010 . - doi : 10.1038/ng.430 . — PMID 19684604 .
  9. ↑ 1 2 Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C., Smyth DJ, Schuilenburg H., Maisuria-Armer M., Mistry T., Lenardo MJ, Todd JA. En allel av IKZF1 (Ikaros) som ger känslighet för akut lymfoblastisk leukemi hos barn skyddar mot typ 1-diabetes. (engelska)  // Diabetes: journal. - 2011. - Februari ( vol. 60 , nr 3 ). - P. 1041-1044 . doi : 10.2337 /db10-0446 . — PMID 21270240 .
  10. ↑ Kelley CM, Ikeda T., Koipally J., Avitahl N., Wu L., Georgopoulos K., Morgan BA. Helios, en ny dimeriseringspartner till Ikaros uttryckt i de tidigaste hematopoetiska progenitorerna  // Current Biology  : journal  . - Cell Press , 1998. - April ( vol. 8 , nr 9 ). - P. 508-915 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70202-7 . — PMID 9560339 .
  11. ↑ Morgan B., Sun L., Avitahl N., Andrikopoulos K., Ikeda T., Gonzales E., Wu P., Neben S., Georgopoulos K. Aiolos, en lymfoid begränsad transkriptionsfaktor som interagerar med Ikaros för att reglera lymfocyter differentiering. (engelska)  // EMBO: journal. - 1997. - April ( vol. 16 , nr 8 ). - P. 2004-2013 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.2004 . — PMID 9155026 .
  12. ↑ 1 2 3 Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression av Ikaros och Aiolos förmedlas genom histon-deacetylaskomplex. (engelska)  // EMBO: journal. - 1999. - Juni ( vol. 18 , nr 11 ). - P. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  13. ↑ Kim J., Sif S., Jones B., Jackson A., Koipally J., Heller E., Winandy S., Viel A., Sawyer A., ​​​​Ikeda T., Kingston R., Georgopoulos K. Ikaros DNA-bindande proteiner styr bildningen av kromatinremodelleringskomplex i lymfocyter. (engelska)  // Immunity : journal. - 1999. - Mars ( vol. 10 , nr 3 ). - S. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
  14. ↑ Honma, Y; Kiyosawa H., Mori T., Oguri A., Nikaido T., Kanazawa K., Tojo M., Takeda J., Tanno Y., Yokoya S., Kawabata I., Ikeda H., Wanaka A. Eos: a ny medlem av Ikaros-genfamiljen uttrycks övervägande i det utvecklande nervsystemet  //  FEBS Letters : journal. - NEDERLÄNDERNA, 1999. - Mars ( vol. 447 , nr 1 ). - S. 76-80 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)00265-3 . — PMID 10218586 .
  15. ↑ Perdomo, J; Holmes M; Chong B; Crossley M. Eos och pegasus, två medlemmar av Ikaros-familjen av proteiner med distinkta DNA-bindande aktiviteter  (engelska)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - USA, 2000. - December ( vol. 275 , nr 49 ). - P. 38347-38354 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M005457200 . — PMID 10978333 .
  16. ↑ 1 2 3 4 5 Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. En molekylär dissektion av Ikaros förtryckskretsar  (engelska)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - USA, 2002. - Augusti ( vol. 277 , nr 31 ). - P. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
  17. ↑ Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Repression av Ikaros och Aiolos förmedlas genom histondeacetylaskomplex  (engelska)  // The EMBO Journal : journal. - ENGLAND, 1999. - Juni ( vol. 18 , nr 11 ). - P. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  18. ↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. Ikaros-CtIP-interaktioner kräver inte C-terminalt bindande protein och deltar i ett deacetylasoberoende repressionssätt  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - USA, 2002. - Juni ( vol. 277 , nr 26 ). - P. 23143-23149 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
  19. ↑ Koipally, J; Georgopoulos K. Ikaros interaktioner med CtBP avslöjar en repressionsmekanism som är oberoende av histondeacetylasaktivitet  (engelska)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - USA, 2000. - Juni ( vol. 275 , nr 26 ). - P. 19594-19602 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M000254200 . — PMID 10766745 .

Litteratur