SIN3B

Medlem B av SIN3-familjen av transkriptionella regulatorer

Det preliminära budgetförslaget bygger på 1e91 .

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe , RCSB

Lista över PDB-ID
1e91 , 1pd7 , 2cr7 , 2czy , 2f05

Identifierare

Symbol

SIN3B ; KIAA0700

Externa ID:n

OMIM: 607777 MGI : 107158 HomoloGene : 81810 GeneCards : SIN3B Gene

Genontologi
Fungera	• kromatinbindning • transkriptionssampressoraktivitet • proteinbindning
cellkomponent	• Xkromosom • Y-kromosom • XY-kropp • kärna • nukleoplasma • cytoplasma • autosome
biologisk process	• transkription, DNA-mallad • utveckling av skelettmuskelvävnad • cellulär lipidmetabolisk process • metabolisk process för små molekyler • negativ reglering av transkription, DNA-mallad • rytmisk process • utveckling av hjärtmuskelvävnad
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
16,94 – 16,99 Mb

Chr 8:
72,72 – 72,76 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

SIN3B ( Pired amphipathic helix protein Sin3a ) är ett protein som kodas hos människor av SIN3B -genen [1] [2] .

Interaktioner med andra proteiner

SIN3B har visats interagera med HDAC1 [3] [4] , zinkfinger och BTB-domän innehållande protein 16 [5] , SUDS3 [6] och IKZF1 [4] [7] .

Anteckningar

↑ Ishikawa K., Nagase T., Suyama M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. X. De kompletta sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kan koda för stora proteiner in vitro // DNA Res : journal. - 1998. - December ( vol. 5 , nr 3 ). - S. 169-176 . - doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . — PMID 9734811 .
↑ Entrez-gen: SIN3B SIN3-homolog B, transkriptionsregulator (jäst) . Arkiverad från originalet den 5 december 2010. (obestämd)
↑ Zhang, Y; NgHH; Erdjument Bromage H; TempstP; Fågel A; Reinberg D. Analys av NuRD-subenheterna avslöjar ett histondeacetylaskärnkomplex och ett samband med DNA-metylering // Genes Dev . : journal. - USA, 1999. - Augusti ( vol. 13 , nr 15 ). - P. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
↑ 1 2 Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Repression av Ikaros och Aiolos förmedlas genom histon-deacetylaskomplex (engelska) // EMBO J. : journal. - ENGLAND, 1999. - Juni ( vol. 18 , nr 11 ). - P. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
↑ David, G; Alland L; Hong S.H.; Wong CW; DePinho RA; Dejean A. Histon-deacetylas associerat med mSin3A förmedlar repression av det akuta promyelocytiska leukemi-associerade PLZF- proteinet // Onkogen : journal. - ENGLAND, 1998. - Maj ( vol. 16 , nr 19 ). - P. 2549-2556 . — ISSN 0950-9232 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
↑ Alland, Leila; David Gregory, Shen-Li Hong, Potes Jason, Muhle Rebecca, Lee Hye-Chun, Hou Harry, Chen Ken, DePinho Ronald A. Identifiering av Mammalian Sds3 som en integrerad komponent av Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex / Mol. cell. Biol. : journal. - USA, 2002. - April ( vol. 22 , nr 8 ). - P. 2743-2750 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. En molekylär dissektion av Ikaros repressionskretsar // J. Biol. Chem. : journal. - USA, 2002. - Augusti ( vol. 277 , nr 31 ). - P. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .

Litteratur

Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN Mad-Max transkriptionell repression förmedlas av ternär komplexbildning med däggdjurshomologer av jästrepressor Sin3 // Cell : journal. - Cell Press , 1995. - Vol. 80 , nej. 5 . - s. 767-776 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . — PMID 7889570 .
David G., Alland L., Hong SH, et al. Histondeacetylas associerat med mSin3A förmedlar repression av det akuta promyelocytiska leukemi-associerade PLZF- proteinet // Onkogen : journal. - 1998. - Vol. 16 , nr. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression av Ikaros och Aiolos förmedlas genom histon-deacetylaskomplex // EMBO J. : journal. - 1999. - Vol. 18 , nr. 11 . - P. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
Naruse Y., Aoki T., Kojima T., Mori N. Neural restriktiv ljuddämparfaktor rekryterar mSin3 och histondeacetylaskomplex för att undertrycka neuronspecifika målgener // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2000. - Vol. 96 , nr. 24 . - P. 13691-13696 . - doi : 10.1073/pnas.96.24.13691 . — PMID 10570134 .
Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, et al. Mad1-Sin3B-interaktionen involverar en ny spiralformad veck // Nat . Struktur. Biol. : journal. - 2001. - Vol. 7 , nr. 12 . - P. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
Spronk CA, Jansen JF, Tessari M., et al. Sekvensspecifik tilldelning av PAH2-domänen av Sin3B fri och bunden till Mad1 // J. Biomol . NMR : journal. - 2001. - Vol. 19 , nr. 4 . - s. 377-378 . - doi : 10.1023/A:1011262214741 . — PMID 11370785 .
Alland L., David G., Shen-Li H., et al. Identifiering av Mammalian Sds3 som en integrerad komponent av Sin3/Histone Deacetylas Corepressor Complex // Mol . cell. Biol. : journal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 8 . - P. 2743-2750 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
Rayman JB, Takahashi Y., Indian VB, et al. E2F förmedlar cellcykelberoende transkriptionsrepression in vivo genom rekrytering av ett HDAC1/mSin3B-corepressorkomplex // Genes Dev. : journal. - 2002. - Vol. 16 , nr. 8 . - P. 933-947 . - doi : 10.1101/gad.969202 . — PMID 11959842 .
Koipally J., Georgopoulos K. En molekylär dissektion av Ikaros repressionskretsar // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
Yang L., Mei Q., Zielinska-Kwiatkowska A., et al. En ERG (ets-relaterad gen)-associerad histonmetyltransferas interagerar med histondeacetylaser 1/2 och transkriptionssamrepressorer mSin3A/B // Biochem . J. : journal. - 2003. - Vol. 369 , nr. Pt 3 . - s. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Petrie K., Guidez F., Howell L., et al. Histon-deacetylas 9-genen kodar för flera proteinisoformer // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 18 . - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, et al. Humant Sin3-deacetylas och tritoraxrelaterat Set1/Ash2-histon H3-K4-metyltransferas binds samman selektivt av cellproliferationsfaktorn HCF-1 // Genes Dev . : journal. - 2003. - Vol. 17 , nr. 7 . - P. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNA // Nat . Genet. : journal. - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Dugast-Darzacq C., Pirity M., Blanck JK, et al. Mxi1-SRalpha: en ny Mxi1-isoform med förbättrad transkriptionell repressionspotential // Onkogen : journal. - 2004. - Vol. 23 , nr. 55 . - P. 8887-8899 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208107 . — PMID 15467743 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Statusen, kvaliteten och expansionen av NIHs fullängds cDNA-projekt: The Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rampalli S., Pavithra L., Bhatt A., et al. Tumörsuppressor SMAR1 medierar cyklin D1-repression genom rekrytering av SIN3/Histoneacetylas 1-komplexet // Mol . cell. Biol. : journal. - 2005. - Vol. 25 , nr. 19 . - P. 8415-8429 . - doi : 10.1128/MCB.25.19.8415-8429.2005 . — PMID 16166625 .
Xu Y., Sengupta PK, Seto E., Smith BD RFX-familjens proteiner interagerar differentiellt med HDAC för att undertrycka kollagen alfa 2(I) gen (COL1A2) uttryck (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2006. - Vol. 281 , nr. 14 . - P. 9260-9270 . - doi : 10.1074/jbc.M511724200 . — PMID 16464847 .