PRPF8

Pre-mRNA splicing processing factor 8 ( engelska  "Pre-mRNA-processing-splising factor 8 ") är ett protein som hos människor kodas av PRPF8 -genen . [1] [2]

Pre-mRNA splitsning går igenom två på varandra följande transesterifieringssteg. Proteinet som kodas av denna gen är en komponent av både U2- och U12-beroende spliceosomer , och skapar det som behövs för att katalysera steg II av pre-mRNA- splitsningsprocessen . Den producerar flera WD-repetitioner som fungerar i protein-till-protein-interaktioner. Detta protein har vissa likheter med jästproteinet Prp8. Denna gen är en kandidat för autosomal dominant retinitis pigmentosa . [3]

Interaktioner

PRPF8 har visat sig interagera med WDR57 [4] [5] och EFTUD2. [5]

Anteckningar

1. ↑ McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R., van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J., Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF Mutationer i pre-mRNA splitsningsfaktorgenen PRPC8 i autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13  )  // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 2001. - Juli ( vol. 10 , nr 15 ). - P. 1555-1562 . - doi : 10.1093/hmg/10.15.1555 . — PMID 11468273 .
2. ↑ Luo HR, Moreau GA, Levin N., Moore MJ Det humana Prp8-proteinet är en komponent i både U2- och U12-beroende spliceosomer  //  RNA : journal. - 1999. - Juli ( vol. 5 , nr 7 ). - P. 893-908 . - doi : 10.1017/S1355838299990520 . — PMID 10411133 .
3. ↑ Entrez-gen: PRPF8 PRP8-pre-mRNA-bearbetningsfaktor 8-homolog (S. cerevisiae) . (obestämd)
4. ↑ Ewing, Rob M; Chu Peter, Elisma Fred, Li Hongyan, Taylor Paul, Climie Shane, McBroom-Cerajewski Linda, Robinson Mark D., O'Connor Liam, Li Michael, Taylor Rod, Dharsee Moyez, Ho Yuen, Heilbut Adrian, Moore Lynda, Zhang Shudong , Ornatsky Olga, Bukhman Yury V., Ethier Martin, Sheng Yinglun, Vasilescu Julian, Abu-Farha Mohamed, Lambert Jean-Philippe, Duewel Henry S., Stewart Ian I., Kuehl Bonnie, Hogue Kelly, Colwill Karen, Gladwish Katharine, Muskat Brenda, Kinach Robert, Adams Sally-Lin, Moran Michael F., Morin Gregg B., Topaloglou Thodoros, Figeys Daniel. Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri   // Mol . Syst. Biol. : journal. — England, 2007. — Vol. 3 , nr. 1 . — S. 89 . - doi : 10.1038/msb4100134 . — PMID 17353931 .
5. ↑ 1 2 Achsel, T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp S; Lührmann R. Det mänskliga U5-220kD-proteinet (hPrp8) bildar ett stabilt RNA-fritt komplex med flera U5-specifika proteiner, inklusive ett RNA Unwindase, en homolog av ribosomal förlängningsfaktor EF-2 och ett nytt WD-40-  protein.)  // Mol. cell. Biol. : journal. - USA, 1998. - November ( vol. 18 , nr 11 ). - P. 6756-6766 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9774689 .

Länkar

• GeneReviews/NIH/NCBI/UW-post om Retinitis Pigmentosa Översikt

Litteratur

• Grainger RJ, Beggs JD Prp8-protein: I hjärtat av spliceosomen  (neopr.)  // RNA. - 2005. - T. 11 , nr 5 . - S. 533-557 . - doi : 10.1261/rna.2220705 . — PMID 15840809 .
• Garcia-Blanco MA, Anderson GJ, Beggs J., Sharp PA Ett däggdjursprotein på 220 kDa binder pre-mRNA i spliceosomen  : en potentiell homolog av jäst-PRP8-proteinet  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of Amerika  : tidskrift. - 1990. - Vol. 87 , nr. 8 . - P. 3082-3086 . - doi : 10.1073/pnas.87.8.3082 . — PMID 2139226 .
• Pinto AL, Steitz JA Däggdjursanalogen av jäst PRP8 splitsningsprotein finns i U4/5/6 lilla nukleära ribonukleoproteinpartikel och spliceosomen   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1989. - Vol. 86 , nr. 22 . - P. 8742-8746 . - doi : 10.1073/pnas.86.22.8742 . — PMID 2479028 .
• Bach M., Winkelmann G., Lührmann R. 20S litet nukleärt ribonukleoprotein U5 visar en överraskande komplex proteinsammansättning  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1989. - Vol. 86 , nr. 16 . - P. 6038-6042 . - doi : 10.1073/pnas.86.16.6038 . — PMID 2527369 .
• Anderson GJ, Bach M., Lührmann R., Beggs JD Bevarande mellan jäst och människa av ett protein associerat med U5 litet nukleärt ribonukleoprotein  (engelska)  // Nature: journal. - 1990. - Vol. 342 , nr. 6251 . - P. 819-821 . - doi : 10.1038/342819a0 . — PMID 2532307 .
• Umen JG, Guthrie C. Prp16p, Slu7p och Prp8p interagerar med 3'-splitsningsstället i två distinkta steg under det andra katalytiska steget av pre-mRNA splitsning  //  RNA: journal. - 1996. - Vol. 1 , nej. 6 . - s. 584-597 . — PMID 7489518 .
• Goliat R; Shugart Y; Janssens P; Weissenbach, J; Beighton, P; Ramasar, R; Greenberg, J. Fin lokalisering av platsen för autosomal dominant retinitis pigmentosa på kromosom 17p   // Am . J. Hum. Genet. : journal. - 1995. - Vol. 57 , nr. 4 . - s. 962-964 . — PMID 7573060 .
• Greenberg J., Goliath R., Beighton P., Ramesar R. Ett nytt ställe för autosomal dominant retinitis pigmentosa på den korta armen av kromosom 17  // Human Molecular  Genetics : journal. - Oxford University Press , 1994. - Vol. 3 , nr. 6 . - P. 915-918 . - doi : 10.1093/hmg/3.6.915 . — PMID 7951236 .
• Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider  (engelska)  // Gen : journal. - Elsevier , 1994. - Vol. 138 , nr. 1-2 . - S. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
• Kojis TL; Heinzmann C; Flodman P; Ngo, JT; Sparkes, R.S.; Spence, M.A.; Bateman, JB; Heckenlively, JR Kartlägger förfining av locus RP13 till human kromosom 17p13.3 i en andra familj med autosomal dominant retinitis pigmentosa   // Am . J. Hum. Genet. : journal. - 1996. - Vol. 58 , nr. 2 . - s. 347-355 . — PMID 8571961 .
• Reyes JL, Kois P., Konforti BB, Konarska MM Den kanoniska GU-dinukleotiden vid 5'-splitsningsstället känns igen av p220 av U5 snRNP i spliceosomen  //  RNA: journal. - 1996. - Vol. 2 , nr. 3 . - S. 213-225 . — PMID 8608445 .
• Hinz M., Moore MJ, Bindereif A. Domänanalys av humant U5 RNA. Cap-trimetylering, proteinbindning och spliceosomsammansättning  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1996. - Vol. 271 , nr. 31 . - P. 19001-19007 . doi : 10.1074 / jbc.271.31.19001 . — PMID 8702566 .
• Chiara MD, Palandjian L., Feld Kramer R., Reed R. Bevis för att U5 snRNP känner igen 3'-skarvstället för katalytiskt steg II hos däggdjur  // EMBO  J. : journal. - 1997. - Vol. 16 , nr. 15 . - P. 4746-4759 . - doi : 10.1093/emboj/16.15.4746 . — PMID 9303319 .
• Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; Suyama, A; Sugano, S. Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändeberikat cDNA-  bibliotek //  Gen : journal. - Elsevier , 1997. - Vol. 200 , nej. 1-2 . - S. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
• Achsel T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp, ​​S; Lührmann, R. Det mänskliga U5-220kD-proteinet (hPrp8) bildar ett stabilt RNA-fritt komplex med flera U5-specifika proteiner, inklusive ett RNA Unwindase, en homolog av ribosomal förlängningsfaktor EF-2 och ett nytt WD-40-protein  ( engelska)  // Mol. cell. Biol. : journal. - 1998. - Vol. 18 , nr. 11 . - P. 6756-6766 . — PMID 9774689 .
• Reyes JL; Gustafson EH; LuoHR; Moore, Melissa J.; Konarska, Maria M. Den C-terminala regionen av hPrp8 interagerar med den konserverade GU-dinukleotiden vid 5'-splitsningsstället  //  RNA: journal. - 1999. - Vol. 5 , nej. 2 . - S. 167-179 . - doi : 10.1017/S1355838299981785 . — PMID 10024169 .
• Makarov EM, Makarova OV, Achsel T., Lührmann R. Den humana homologen av jästsplitsningsfaktorn prp6p innehåller flera TPR-element och är stabilt associerad med U5 snRNP via protein-proteininteraktioner  (engelska)  // J. Mol. Biol. : journal. - 2000. - Vol. 298 , nr. 4 . - s. 567-575 . doi : 10.1006 / jmbi.2000.3685 . — PMID 10788320 .
• Le Hir H., Moore MJ, Maquat LE Pre-mRNA-skarvning förändrar mRNP-sammansättningen: bevis för stabil association av proteiner vid exon-exon-korsningar  // Genes Dev  .  : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 9 . - P. 1098-1108 . — PMID 10809668 .
• McHale JC, McKie AB, Tarttelin EE, Inglehearn CF Uttryckskarta över human kromosomregion 17p13.3, som spänner över RP13 dominant retinitis pigmentosa locus, Miller-Dieker lissencephaly syndrome (MDLS) regionen och en förmodad tumörsuppressor  locus  // Cytogenetic and Genomforskning : journal. — Karger förlag, 2000. - Vol. 88 , nr. 3-4 . - S. 225-229 . - doi : 10.1159/000015556 . — PMID 10828595 .