Zinkfinger och BTB-domän som innehåller protein 16

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 17 november 2021; kontroller kräver 2 redigeringar .
Zinkfinger och BTB-domän som innehåller 16

Det preliminära budgetförslaget representeras av exemplet 1buo.
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning: PDBe , RCSB
Identifierare
SymbolZBTB16  ; P.L.Z.; ZNF145
Externa ID:nOMIM:  176797 MGI :  103222 HomoloGene :  21214 GeneCards : ZBTB16 Gene
RNA-uttrycksprofil
Mer information
ortologer
SeMänskligMus
Entrez7704235320
EnsembleENSG00000109906ENSMUSG00000066687
UniProtQ05516A3KMN0
RefSeq (mRNA)NM_001018011NM_001033324
RefSeq (protein)NP_001018011NP_001028496
Locus (UCSC)Chr 11:
113,93 – 114,12 Mb
Chr 9:
48,65 – 48,84 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

Protein 16, som innehåller ett zinkfinger och en BTB-domän  , är ett protein som kodas hos människor av ZBTB16 -genen .

Funktion

Denna gen är en medlem av C2H2- zinkfingerkruppel -proteinfamiljen och kodar för zinkfingertranskriptionsfaktorn , som innehåller nio zinkfingerkruppeldomäner ( tyska :  Krueppel ) vid C-terminalen. Detta protein finns i kärnan, är involverat i utvecklingen av cellcykeln och interagerar med histondeacetylas . Specifika fall av avvikande genomarrangemang på detta ställe har associerats med akut promyelocytisk leukemi [1] och fysiologiska funktioner har identifierats hos möss som naturliga mördar-T-celler [2] [3] och gamma-delta T-celler. [4] Det finns alternativa transkriptionella splitsningsvarianter som har karakteriserats hos människor. [5] [6]

Interaktioner

Protein 16, som innehåller ett zinkfinger och en BTB-domän, har visats interagera med följande strukturer:

Anteckningar

  1. Chen Z., Brand NJ, Chen A., Chen SJ, Tong JH, Wang ZY, Waxman S., Zelent A. Fusion mellan en ny Krüppel-liknande zinkfingergen och retinsyrareceptor-alfalokuset på grund av en variant t(11;17) translokation associerad med akut promyelocytisk leukemi  (engelska)  // The EMBO Journal : journal. - 1993. - Vol. 12 , nr. 3 . - s. 1161-1167 . — PMID 8384553 .
  2. Kovalovsky D., Uche OU, Eladad S., Hobbs RM, Yi W., Alonzo E., Chua K., Eidson M., Kim HJ, Im JS, Pandolfi PP, Sant'Angelo DB The BTB-zinc finger transcriptional regulator, PLZF, kontrollerar utvecklingen av iNKT-celleffektorfunktioner  (engelska)  // Nature Immunology  : journal. - 2008. - Vol. 9 , nej. 9 . - P. 1055-1064 . - doi : 10.1038/ni.1641 . — PMID 18660811 .
  3. Savage AK, Constantinides MG, Han J., Picard D., Martin E., Li B., Lantz O., Bendelac A. Transkriptionsfaktorn PLZF (Zbtb16) styr effektorprogrammet för NKT-celllinjen  //  Immunitet: tidning. - Cell Press , 2008. - Vol. 29 , nr. 3 . - s. 391-403 . - doi : 10.1016/j.immuni.2008.07.011 . — PMID 18703361 .
  4. Kreslavsky T., Savage AK, Hobbs R., Gounari F., Bronson R., Pereira P., Pandolfi PP, Bendelac A., von Boehmer H. TCR-inducerbar PLZF-transkriptionsfaktor som krävs för medfödd fenotyp av en delmängd av γδ T-celler med begränsad TCR-diversitet  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2009. - Vol. 106 , nr. 30 . - P. 12453-12458 . - doi : 10.1073/pnas.0903895106 . — PMID 19617548 .
  5. Zhang T., Xiong H., Kan LX, Zhang CK, Jiao XF, Fu G., Zhang QH, Lu L., Tong JH, Gu BW, Yu M., Liu JX, Licht J., Waxman S., Zelent A., Chen E., Chen SJ Genomisk sekvens, strukturell organisation, molekylär evolution och avvikande omarrangemang av promyelocytisk leukemi zinkfingergen  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Vol. 96 , nr. 20 . - P. 11422-11427 . - doi : 10.1073/pnas.96.20.11422 . — PMID 10500192 .
  6. ZBTB16 zinkfinger och BTB-domän som innehåller 16 . Entrez (4 oktober 2009). Hämtad: 10 oktober 2009.
  7. Senbonmatsu T., Saito T., Landon EJ, Watanabe O., Price E., Roberts RL, Imboden H., Fitzgerald TG, Gaffney FA, ​​​​Inagami T. En ny signalväg för angiotensin II typ 2-receptor: möjlig roll i hjärthypertrofi  (engelska)  // EMBO J. : journal. — Vol. 22 , nr. 24 . - P. 6471-6482 . - doi : 10.1093/emboj/cdg637 . — PMID 14657020 .
  8. Dhordain P., Albagli O., Honore N., Guidez F., Lantoine D., Schmid M., The HD, Zelent A., Koken MH Kolokalisering och heteromerisering mellan de två humana onkogena POZ/zinkfingerproteinerna, LAZ3 ( BCL6 ) och PLZF   // Onkogen : journal. — Vol. 19 , nr. 54 . - P. 6240-6250 . - doi : 10.1038/sj.onc.1203976 . — PMID 11175338 .
  9. Barna M., Merghoub T., Costoya JA, Ruggero D., Branford M., Bergia A., Samori B., Pandolfi PP Plzf förmedlar transkriptionell repression av HoxD-genuttryck genom kromatinremodellering  (Eng.)  // Dev. cell : journal. — Vol. 3 , nr. 4 . - S. 499-510 . - doi : 10.1016/s1534-5807(02)00289-7 . — PMID 12408802 .
  10. 1 2 Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP -receptorn  // Blod : journal. — American Society of Hematology. — Vol. 98 , nr. 12 . - P. 3290-3300 . - doi : 10.1182/blood.v98.12.3290 . — PMID 11719366 .
  11. Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C., Ruthardt M. AML-associerad translokation produkter blockerar vitamin D(3)-inducerad differentiering genom att binda vitamin D(3)  -receptorn //  Cancerforskning : journal. — American Association for Cancer Research. — Vol. 62 , nr. 23 . - P. 7050-7058 . — PMID 12460926 .
  12. McLoughlin P., Ehler E., Carlile G., Licht JD, Schäfer BW Det LIM-bara proteinet DRAL/FHL2 interagerar med och är en corepressor för det promyelocytiska leukemi zinkfingerproteinet  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 40 . - P. 37045-37053 . - doi : 10.1074/jbc.M203336200 . — PMID 12145280 .
  13. Labbaye C., Quaranta MT, Pagliuca A., Militi S., Licht JD, Testa U., Peschle C. PLZF inducerar megakaryocytisk utveckling, aktiverar Tpo-receptoruttryck och interagerar med GATA1-  protein //  Onkogen : journal. — Vol. 21 , nr. 43 . - P. 6669-6679 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205884 . — PMID 12242665 .
  14. Tsuzuki S., Enver T. Interaktioner av GATA-2 med proteinet promyelocytisk leukemi zinkfinger (PLZF), dess homolog FAZF och den t(11;17)-genererade PLZF-retinsyrareceptorn alfa-   onkoprotein / Blod : journal. — American Society of Hematology. — Vol. 99 , nr. 9 . - P. 3404-3410 . - doi : 10.1182/blood.v99.9.3404 . — PMID 11964310 .
  15. 1 2 3 4 Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 förmedlar transkriptionell repression av det akuta promyelocytiska leukemi-associerade proteinet PLZF   // Onkogen _ : journal. — Vol. 23 , nr. 54 . - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .
  16. 1 2 3 David G., Alland L., Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A. Histondeacetylas associerat med mSin3A förmedlar repression av det akuta promyelocytiska leukemi-associerade PLZF-  proteinet //  Onkogen : journal. — Vol. 16 , nr. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
  17. 1 2 3 Wong CW, Privalsky ML Komponenter i SMRT-corepressorkomplexet uppvisar distinkta interaktioner med POZ-domänens onkoproteiner PLZF, PLZF-RARalpha och BCL-6  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 273 , nr. 42 . - P. 27695-27702 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27695 . — PMID 9765306 .
  18. 1 2 Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Histon-deacetylaser av klass II rekryteras direkt av BCL6-transkriptionsrepressor  (engelska)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Vol. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
  19. Nanba D., Mammoto A., Hashimoto K., Higashiyama S. Proteolytisk frisättning av det karboxiterminala fragmentet av proHB-EGF orsakar kärnexport av PLZF  //  J. Cell Biol. : journal. — Vol. 163 , nr. 3 . - s. 489-502 . - doi : 10.1083/jcb.200303017 . — PMID 14597771 .
  20. Nanba D., Toki F., Higashiyama S. Roller för laddade aminosyrarester i den cytoplasmatiska domänen av proHB-EGF   // Biochem . Biophys. Res. kommun. : journal. — Vol. 320 , nr. 2 . - s. 376-382 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.05.176 . — PMID 15219838 .
  21. Takahashi S., McConnell MJ, Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick AM, Licht JD Den interna tandemdupliceringsmutanten Flt3 hämmar funktionen hos transkriptionsrepressorer genom att blockera interaktioner med   SMRT // Blood : journal. — American Society of Hematology. — Vol. 103 , nr. 12 . - P. 4650-4658 . - doi : 10.1182/blood-2003-08-2759 . — PMID 14982881 .
  22. Hong SH, David G., Wong CW, Dejean A., Privalsky ML SMRT-corepressor interagerar med PLZF och med PML-retinsyrareceptorn alfa (RARalpha) och  PLZF- RARalpha onkoproteiner associerade med akut promyelocytisk leukemi  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidskrift. — Vol. 94 , nr. 17 . - P. 9028-9033 . - doi : 10.1073/pnas.94.17.9028 . — PMID 9256429 .
  23. Koken MH, Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix MK, Davies JM, Kabarowski JH, Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan CC, Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Leukemiassocierade retinoinsyrareceptor-alfafusionspartners, PML och PLZF, heterodimeriserar och samlokaliserar till nukleära kroppar  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . — Vol. 94 , nr. 19 . - P. 10255-10260 . - doi : 10.1073/pnas.94.19.10255 . — PMID 9294197 .
  24. Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A., ​​​​Carlile GW, Arai S., Ball HJ, Lutterbach B., Hiebert SW, Licht JD ETO-proteinet som störs i t(8;21)-associerad akut myeloid leukemi är en corepressor för promyelocytisk leukemi zinkfingerprotein  (engelska)  // Mol. cell. Biol. : journal. — Vol. 20 , nej. 6 . - P. 2075-2086 . - doi : 10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000 . — PMID 10688654 .
  25. Melnick A., Carlile GW, McConnell MJ, Polinger A., ​​​​Hiebert SW, Licht JD AML-1  / ETO-fusionsprotein är en dominant negativ hämmare av transkriptionsrepression av det promyelocytiska leukemi-zinkfingerproteinet  // Blod : journal. — American Society of Hematology. — Vol. 96 , nr. 12 . - P. 3939-3947 . — PMID 11090081 .
  26. Martin PJ, Delmotte MH, Formstecher P., Lefebvre P. PLZF är en negativ regulator av retinsyrareceptortranskriptionsaktivitet   // Nucl . Recept. : journal. — Vol. 1 , nej. 1 . — S. 6 . - doi : 10.1186/1478-1336-1-6 . — PMID 14521715 .
  27. Hoatlin ME, Zhi Y., Ball H., Silvey K., Melnick A., Stone S., Arai S., Hawe N., Owen G., Zelent A., Licht JD Ett nytt BTB/POZ transkriptionsrepressorprotein interagerar med Fanconi anemi grupp C protein och   PLZF // Blod : journal. — American Society of Hematology. — Vol. 94 , nr. 11 . - P. 3737-3747 . — PMID 10572087 .

Litteratur