En DNA-sekvenserare ( sekvenserare) är ett vetenskapligt instrument eller anordning som automatiskt bestämmer sekvensen av nukleotider i en DNA - kedjesekvensering . Ett DNA-prov laddas in i sekvenseraren, resultatet av dess arbete är en uppsättning adenin- , tymin- , guanin- , cytosinbassekvenser , vanligtvis lagrade som textsträngar med bokstäverna A, T, G, C (de så kallade "reads") ").
De första automatiserade sekvenserna introducerades av Applied Biosystems 1987 och använde Sanger-metoden . Denna metod ligger till grund för den första generationens sequencers. Med hans hjälp avslutades Human Genome Project 2001 (fullständig läsning av det mänskliga genomet ). Installationer av den första generationen var automatiseringen av elektroforetiska system som bestämde migreringen av märkta DNA-fragment i gelén, separerade dem efter massa (längd).
Human Genome Project ledde till utvecklingen av billigare precisionssekvenseringssystem med hög genomströmning som kallas Next Generation Sequencers (NGS). Bland sådana system: 454, SOLiD, Illumina DNA. Sådana sekvenserare har påskyndat processen att läsa DNA-koder i storleksordningar jämfört med den tidigare Sanger-metoden. Beredningen av DNA-prover för sådana enheter är automatiserad och tar ungefär en och en halv timme. Det tar bara några dagar att läsa ett genom i mänsklig storlek 15 gånger.
Nyare sekvenserare är tredje generationen (t.ex. SMRT och Oxford Nanopore) och fungerar genom realtidsmätning av individuella nukleotider av enstaka DNA-molekyler (genom att lägga till nukleotider eller genom att dra en kedja genom en nanopore proteinstruktur ).
Modern[ när? ] sequencers[ vad? ] har optiska system med hjälp av vilka signaler är fixerade - färgämnesterminatorer ( eng. dye-terminators ) - fluorokromer med olika våglängder och följaktligen färg, fäster till en specifik nukleotid i DNA (grön- adenin , röd -tymin , svart -guanin , blå -cytosin ).
Den första automatiserade DNA-sekvenseraren baserad på Sanger-metoden utvecklades av L. M. Smith och kommersialiserades av Applied Biosystems 1987. [ett]