Icke-homolog ändskarvning

Non -homologous end joining [1] , eller non- homologous end joining [2] ( engelska  non-homologous end joining, NHEJ ) är ett av sätten att reparera dubbelsträngsbrott i DNA . Denna process kallas icke-homolog eftersom de skadade ändarna av kedjan är förbundna med ett ligas direkt, utan behov av en homolog mall, i motsats till processen med homolog rekombination [3] [4] [5] [6] . NHEJ är betydligt mindre exakt än homolog rekombination och resulterar ofta i förlust av nukleotider , translokationer eller telomerfusion , de två senare är tecken på en tumörcell [ 7] . NHEJ finns i representanter för alla naturriken , dessutom i däggdjursceller fungerar det som det huvudsakliga sättet att reparera dubbelsträngsbrott [8] .

I prokaryoter

Många bakteriearter , inklusive Escherichia coli , har inte NHEJ och måste därför endast förlita sig på homolog rekombination i händelse av skada på bakteriens DNA. Proteiner involverade i NHEJ har dock hittats i vissa bakterier, såsom Bacillus subtilis , Mycobacterium tuberculosis och Mycobacterium smegmatis [9] [10] . Bakterier använder en extremt kompakt version av NHEJ, där alla nödvändiga åtgärder utförs av bara två proteiner: Ku -proteinet heterodimer och det multifunktionella ligas / polymeras / nukleas LigD [11] . I mykobakterier är NHEJ mycket mer felbenägen än i jäst [10] . Många bakterier som har NHEJ-proteiner tillbringar en betydande del av sin livscykel i ett stationärt haploid tillstånd, när en mall för rekombination inte är tillgänglig och homolog rekombination är omöjlig [9] . Det är möjligt att NHEJ hos dessa bakterier hjälper till att reparera dubbelsträngsbrott som uppstår under torkning [12] . Corndog och Omega, två relaterade bakteriofager från Mycobacterium smegmatis , använder också NHEJ för att öppna sitt genom under infektion [13] .

NHEJ är en av vägarna för att reparera dubbelsträngsbrott också i arkéer . I archaea involverar NHEJ också bindning och retention av brytändar av Ku-proteiner, följt av luckfyllning. I archaea binder Ku ändarna som har trunkerats av exonukleas så att en utskjutande 3'-ände bildas, som kan förlängas genom DNA-strängsyntes med förskjutning av den gamla strängen med DNA-polymeras [14] .

I eukaryoter

Till skillnad från bakterier använder eukaryot NHEJ ett brett utbud av proteiner som är involverade i följande steg [15] :

När NHEJ-mekanismen är inaktiv kan dubbelsträngsbrott repareras på ett alternativt, mer felbenäget sätt, mikrohomologiförmedlad ändskarvning ( MMEJ ) .  På så sätt bildas först korta homologa sekvenser (mikrohomologier) på båda sidor av brytningen, som sedan trimmas under reparationen [16] .

Bindning och fixering av ändar

I jäst rekryteras MRX [ -komplexet , bestående av Mre11-, Rad50- och Xrs2-proteinerna, tidigt in i reparationsprocessen och tros hjälpa till att kedja DNA-ändarna [17] . Motsvarande komplex hos däggdjur, känt som ( MRN )-komplexet, består av Mre11-, Rad50- och Nbs1- proteinerna och är också involverat i NHEJ, men det kan agera i andra steg i processen förutom att hålla avbrottsändarna i omedelbar närhet av varandra [18] .

Det eukaryota Ku-proteinet är en heterodimer av Ku70 och Ku80 som bildar ett komplex med ett DNA-beroende proteinkinas som finns i däggdjur men saknas i jäst. Ku-proteinet är korgformat och "glider" längs DNA-strängen. Faktum är att den fungerar som en sensor som upptäcker DNA-skador [1] . Det kan också fungera som ett dockningsställe för andra molekyler som är involverade i NHEJ, och interagerar också med DNA-ligas IV-komplexet och XLF- proteinet [19] [20] .

DNA-beroende proteinkinas DNA-PK

I eukaryoter spelar det DNA-beroende proteinkinaset DNA-PK, som består av den katalytiska DNA-PKcs-subenheten sammansmält med C-terminalen av Ku80 -proteinet, en central roll i NHEJ-reparation och svaret på DNA-skada . DNA-PKcs rekryteras till C-terminalen av Ku80-proteinet efter bildandet av Ku70/Ku80-komplexet vid ändarna av DNA-dubbelsträngsbrottet. DNA-PKcs autofosforylerar och fosforylerar sedan ett antal proteiner som är involverade i DNA-skadesvaret, inklusive Artemis [21] -proteinet . DNA-beroende proteinkinaser tros också vara involverade i ändsammanfogning under NHEJ [22] .

Hantera paus slutar

Slutbearbetning innebär att man tar bort några få nukleotider från överhängen med ett nukleas och reparerar den dubbelsträngade strukturen med DNA-polymeras . Detta steg är inte nödvändigt om ändarna redan är kompatibla, dvs har en fri 3'- hydroxyl- och 5'- fosfatgrupp . Till exempel kan Artemis -proteinet , aktiverat av DNA-beroende proteinkinas , fungera som både ett endonukleas och ett exonukleas under V(D)J-rekombination . Mre11 har nukleasaktivitet men verkar vara involverad i homolog rekombination snarare än NHEJ. Därefter återställer DNA-polymeraserna λ och μ (Pol4 i jäst) den dubbelsträngade DNA-strukturen i stället för de utskjutande enkelsträngade ändarna. Således görs ändarna på pausen trubbiga [5] [23] [24] [1] .

Ligering

DNA-ligas IV-komplexet, bestående av den katalytiska subenheten av DNA-ligas IV och kofaktorn XRCC4 (Dnl4 och Lif1 i jäst), utför ligering i slutskedet av NHEJ [25] . Det involverar också XLF proteinet (i jäst Nej1) [26] [27] . Den exakta rollen för XLF är okänd, men det är känt att interagera med XRCC4/DNA-ligas IV-komplexet och är sannolikt involverat i ligeringsprocessen [28] . Nya bevis tyder på att XLF främjar readenylering av DNA-ligas IV efter ligering, "laddar upp" det så att det kan katalysera en andra ligering [29] .

Förordning

Valet mellan homolog och icke-homolog reparation av DNA-skada regleras i det inledande skedet av rekombination, trimningen av enkelsträngade utskjutande regioner. Otrimmade ändar kan sammanfogas av NHEJ, och avlägsnande av till och med ett fåtal nukleotider under trimningssteget undertrycker NHEJ, och reparation utförs via homolog rekombination [24] . NHEJ kan förekomma under hela cellcykeln , men är mest aktiv i G1 -fasen när det inte finns några mallar tillgängliga för homolog rekombination. En viktig roll i regleringen av NHEJ spelas av cyklinberoende kinas 1 (Cdk1; cdc28 i jäst), som är avstängd i G1-fasen och uttrycks i S- och G2- faserna. Cdk1 fosforylerar Sae2-nukleaset, vilket utlöser ändtrimning [30] .

Utlösningen av NHEJ-vägen börjar med rekryteringen av proteinet 53BP1 till det skadade området , vilket främjar ytterligare reparation av dubbelsträngbrottet längs NHEJ-vägen. Fram till ögonblicket för att klippa ändarna är byte till homolog rekombination möjlig, vilket uppnås genom att attrahera 53BP1-antagonistproteinet - BRCA1 till det skadade området . Om BRCA1 förskjuter 53BP1, kommer dubbelsträngbrottet att repareras genom homolog rekombination [31] . Förutom 53BP1 och BRCA1, är RIF1- proteiner och CtIP, ett nukleas involverat i terminering vid de första stadierna av homolog rekombination, involverade i valet av en väg för att reparera ett dubbelsträngsbrott. Således styr 53BP1 och RIF1 reduktionen längs den icke-homologa ändanslutningsvägen, medan BRCA1 och CtIP styr reduktionen längs den homologa rekombinationsvägen [32] .

Homolog rekombination för att reparera dubbelsträngsbrott kan endast användas i S- och G2-faserna , när en mall för reparation uppträder som ett resultat av DNA-fördubbling (därför är NHEJ, som är aktiv under hela cellcykeln, den huvudsakliga mekanism för att reparera dubbelsträngsbrott i däggdjursceller). Undantag är regioner av genomet som innehåller upprepningar, såsom upprepningar av gener som kodar för rRNA (rDNA). I rDNA är mallen för att reparera ett dubbelsträngsbrott i upprepningen tillgänglig under hela cellcykeln ; det kan vara vilken annan upprepning som helst. När det gäller rDNA elimineras små lesioner snabbt av NHEJ inuti nukleolen (NHEJ-flödestiden är cirka 30 minuter och homolog rekombination är cirka 7 timmar), medan stora och komplexa lesioner rör sig tillsammans med proteinerna i fibrillärcentra och den täta fibrillära komponenten till periferin, som bildar den så kallade nukleolära hatten. I det nukleolära locket inträffar alla utom de allra första stadierna av homolog rekombination, med rDNA-upprepningar närmar sig, vilket främjar rekombination. NHEJ förekommer inte i nukleolära lock [33] . Valet av en dubbeltrådig brottreparationsväg påverkas också av skadans komplexitet. NHEJ används vanligtvis för att reparera mindre lesioner [34] .

V(D)J-rekombination

NHEJ spelar en viktig roll i V(D)J-rekombination  , den process genom vilken en mångfald av B-cells- och T- cellsreceptorer skapas i ryggradsdjurens immunsystem [35] . I början av processen skapar nukleaser från RAG1/RAG2 hårnålsskyddade dubbelsträngsbrott i regionen för specifika signalsekvenser [36]. Därefter skär Artemis nukleas hårnålarna och de resulterande ändarna förenas av NHEJ [ 37] . Ett specialiserat DNA-polymeras som kallas terminalt deoxinukleotidtransferas , som bara fungerar i lymfoida vävnader, lägger till icke-mallnukleotider till ändarna av kedjan innan de senare kopplas samman. Denna process omarrangerar och kombinerar V (variabel), D (diversitet) och J (sammanfogande) regioner, från vilka den variabla regionen av T-cells- och B-cellsreceptorer sedan avläses. Till skillnad från typiska NHEJ, där exakt reparation är det mest fördelaktiga resultatet, är det mer fördelaktigt för V(D)J-rekombination att NHEJ arbetar med fel, eftersom detta ökar mångfalden av genkodande sekvenser [ 38] [39] .

I telomerer

Telomerer skyddas vanligtvis av ett speciellt protein-"lock", så de känns inte igen som dubbelsträngsbrott. Förlusten av locket orsakar förkortning av telomerer och deras anslutning genom NHEJ, vilket leder till bildandet av en dicentrisk kromosom som går sönder under mitos . Märkligt nog är vissa NHEJ-proteiner involverade i bildandet av telomerhöljet. Till exempel leder borttagning av Ku som finns på telomerer till att de förkortas [40] .

Klinisk betydelse

Flera mänskliga sjukdomar är associerade med NHEJ-dysfunktion [41] . Mutationer som påverkar LIG4 och XLF är ansvariga för LIG4-syndrom respektive XLF-associerad allvarlig kombinerad immunbrist (SCID). Dessa syndrom har många karakteristiska egenskaper, inklusive cellulär strålkänslighet, mikrocefali och SCID på grund av defekter i V(D)J-rekombination. Mutationer i Artemis leder också till SCID, men de utvecklar inte neurologiska defekter som mutationer i LIG4 och XLF. Skillnaden i sjukdomens svårighetsgrad kan förklaras av rollen av muterade proteiner: Artemis är ett nukleas, som troligen endast krävs för reparation av dubbelsträngsbrott med skadade ändar, medan både DNA-ligas IV och XLF är involverade i alla varianter av NHEJ. Mutationer i NHEJ-proteinerna kan också leda till ataxi telangiectasia , Fanconi-anemi och ärftlig bröst- och äggstockscancer . Möss som slogs ut för XRCC4 eller LIG4 dog under embryonal utveckling , så NHEJ är en viktig process för däggdjur. Däremot var möss som saknade Ku eller DNA-beroende proteinkinas livskraftiga, förmodligen för att NHEJ fortfarande kan uppstå utan dessa proteiner, om än på en låg nivå [42] .

Effekter på åldrande

Ett system utvecklades för att mäta effektiviteten av NHEJ i musceller [ 43] . Det kan användas för att jämföra effektiviteten av NHEJ i olika vävnader och i möss i olika åldrar. NHEJ är mest aktiv i hudceller , lung- och njurfibroblaster , och betydligt lägre i hjärtfibroblaster och hjärnastrocyter . Dessutom minskar effektiviteten av NHEJ med åldern med 1,8-3,8 gånger, beroende på vävnaden. En minskning av effektiviteten av NHEJ leder till en ökning av oreparerade eller dåligt reparerade DNA-sektioner, vilket avsevärt bidrar till åldrandet . Det har visat sig att Ku80 uttrycks på signifikant olika nivåer hos människor, kor och möss, och denna nivå är associerad med livslängd [44] [45] .

Studiens historia

Det första beviset på att Ku-proteiner interagerar med linjära och cirkulära DNA-fragment som innehåller ett gap erhölls på 1980-1990-talet. 1986 visade sig Ku binda brytningar mycket effektivt: 40 femtomol Ku binder 90 % av DNA:t slutar i ett prov med en DNA-koncentration på 25 femtomol. Samtidigt visades det att nypfria cirkulära plasmider inte interagerar med Ku-proteiner, utan börjar binda Ku efter att ha behandlats med restriktionsendonukleaser . Därefter visades det att Ku-proteiner snabbt binder ändarna av en dubbelsträngsbrytning och håller dem nära varandra, vilket gör att de kan återförenas ytterligare, d.v.s. reparera brottet [46] . År 1996 myntade J. K. Moore och J. E. Haber termen "icke-homolog ändskarvning" för att beteckna en ny väg för reparation av dubbelsträngbrott [3] .

Anteckningar

  1. ↑ 1 2 3 Krebs, Goldstein, Kilpatrick, 2017 , sid. 406.
  2. ↑ Proshkina, Yuraneva, Moskalev, 2018 , sid. 22.
  3. ↑ 1 2 Moore JK , Haber JE Cellcykel och genetiska krav för två vägar för icke-homolog ändförbindande reparation av dubbelsträngsbrott i Saccharomyces cerevisiae.  (engelska)  // Molecular And Cellular Biology. - 1996. - Maj ( vol. 16 , nr 5 ). - P. 2164-2173 . — PMID 8628283 .
  4. ↑ Boulton SJ , Jackson SP Saccharomyces cerevisiae Ku70 potentierar illegitim DNA-dubbelsträngsbrottsreparation och fungerar som en barriär för felbenägna DNA-reparationsvägar.  (engelska)  // The EMBO Journal. - 1996. - 16 september ( vol. 15 , nr 18 ). - P. 5093-5103 . — PMID 8890183 .
  5. ↑ 1 2 Wilson TE , Lieber MR Effektiv bearbetning av DNA-ändar under icke-homologa ändsammanfogning av jäst. Bevis för en DNA-polymeras beta (Pol4)-beroende väg.  (engelska)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 1999. - 13 augusti ( vol. 274 , nr 33 ). - P. 23599-23609 . — PMID 10438542 .
  6. ↑ Budman J. , Chu G. Bearbetning av DNA för icke-homolog ändsammanfogning med cellfritt extrakt.  (engelska)  // The EMBO Journal. - 2005. - 23 februari ( vol. 24 , nr 4 ). - P. 849-860 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600563 . — PMID 15692565 .
  7. ↑ Espejel S. , Franco S. , Rodríguez-Perales S. , Bouffler SD , ​​​​Cigudosa JC , Blasco MA Mammalian Ku86 förmedlar kromosomala fusioner och apoptos orsakad av kritiskt korta telomerer.  (engelska)  // The EMBO Journal. - 2002. - 1 maj ( vol. 21 , nr 9 ). - P. 2207-2219 . - doi : 10.1093/emboj/21.9.2207 . — PMID 11980718 .
  8. ↑ Guirouilh-Barbat J. , Huck S. , Bertrand P. , Pirzio L. , Desmaze C. , Sabatier L. , Lopez BS Effekten av KU80-vägen på NHEJ-inducerade genomomläggningar i däggdjursceller.  (engelska)  // Molecular Cell. - 2004. - 4 juni ( vol. 14 , nr 5 ). - s. 611-623 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.008 . — PMID 15175156 .
  9. ↑ 1 2 Weller GR , Kysela B. , Roy R. , Tonkin LM , Scanlan E. , Della M. , Devine SK , Day JP , Wilkinson A. , d'Adda di Fagagna F. , Devine KM , Bowater RP , Jeggo PA , Jackson SP , Doherty AJ Identifiering av ett icke-homologt DNA-ändförbindningskomplex i bakterier.  (engelska)  // Science (New York, NY). - 2002. - 6 september ( vol. 297 , nr 5587 ). - P. 1686-1689 . - doi : 10.1126/science.1074584 . — PMID 12215643 .
  10. ↑ 1 2 Gong C. , Bongiorno P. , Martins A. , Stephanou NC , Zhu H. , Shuman S. , Glickman MS Mechanism of nonhomologous end-joining in mycobacteria: a low-fidelity reparationssystem driven av Ku, ligas D och ligase C.  (engelska)  // Nature Structural & Molecular Biology. - 2005. - April ( vol. 12 , nr 4 ). - s. 304-312 . doi : 10.1038 / nsmb915 . — PMID 15778718 .
  11. ↑ Della M. , Palmbos PL , Tseng HM , Tonkin LM , Daley JM , Topper LM , Pitcher RS ​​, Tomkinson AE , Wilson TE , Doherty AJ Mycobacterial Ku och ligasproteiner utgör en tvåkomponents NHEJ reparationsmaskin.  (engelska)  // Science (New York, NY). - 2004. - 22 oktober ( vol. 306 , nr 5696 ). - s. 683-685 . - doi : 10.1126/science.1099824 . — PMID 15499016 .
  12. ↑ Pitcher RS , Green AJ , Brzostek A. , Korycka-Machala M. , Dziadek J. , Doherty AJ NHEJ skyddar mykobakterier i stationär fas mot de skadliga effekterna av uttorkning.  (engelska)  // DNA Repair. - 2007. - 1 september ( vol. 6 , nr 9 ). - P. 1271-1276 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2007.02.009 . — PMID 17360246 .
  13. ↑ Pitcher RS , Tonkin LM , Daley JM , Palmbos PL , Green AJ , Velting TL , Brzostek A. , Korycka-Machala M. , Cresawn S. , Dziadek J. , Hatfull GF , Wilson TE exploit , Doherty AJ NHEJhagee Mycobacteriophage för att underlätta genomcirkulationen.  (engelska)  // Molecular Cell. - 2006. - 1 september ( vol. 23 , nr 5 ). - s. 743-748 . - doi : 10.1016/j.molcel.2006.07.009 . — PMID 16949369 .
  14. ↑ Marshall Craig J. , Santangelo Thomas J. Archaeal DNA-reparationsmekanismer   // Biomolecules . - 2020. - 23 oktober ( vol. 10 , nr 11 ). - S. 1472 . — ISSN 2218-273X . - doi : 10.3390/biom10111472 .
  15. ↑ Davis Anthony J. , Chen Benjamin PC , Chen David J. DNA-PK: Ett dynamiskt enzym i en mångsidig DSB-reparationsväg  //  DNA-reparation. - 2014. - Maj ( vol. 17 ). - S. 21-29 . — ISSN 1568-7864 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2014.02.020 .
  16. ↑ McVey M. , Lee SE MMEJ reparation av dubbelsträngsbrott (direktörens klipp): raderade sekvenser och alternativa avslutningar.  (engelska)  // Trends In Genetics : TIG. - 2008. - November ( vol. 24 , nr 11 ). - s. 529-538 . - doi : 10.1016/j.tig.2008.08.007 . — PMID 18809224 .
  17. ↑ Chen L. , Trujillo K. , Ramos W. , Sung P. , Tomkinson AE Promotion of Dnl4-catalysed DNA end-joining by Rad50/Mre11/Xrs2 and Hdf1/Hdf2 complexes.  (engelska)  // Molecular Cell. - 2001. - November ( vol. 8 , nr 5 ). - P. 1105-1115 . — PMID 11741545 .
  18. ↑ Zha S. , Boboila C. , Alt FW Mre11: roller i DNA-reparation bortom homolog rekombination.  (engelska)  // Nature Structural & Molecular Biology. - 2009. - Augusti ( vol. 16 , nr 8 ). — S. 798-800 . - doi : 10.1038/nsmb0809-798 . — PMID 19654615 .
  19. ↑ Palmbos PL , Wu D. , Daley JM , Wilson TE Rekrytering av Saccharomyces cerevisiae Dnl4-Lif1-komplex till ett dubbelsträngsbrott kräver interaktioner med Yku80 och Xrs2 FHA-domänen.  (engelska)  // Genetik. - 2008. - December ( vol. 180 , nr 4 ). - P. 1809-1819 . - doi : 10.1534/genetics.108.095539 . — PMID 18832348 .
  20. ↑ Yano K. , Morotomi-Yano K. , Wang SY , Uematsu N. , Lee KJ , Asaithamby A. , Weterings E. , Chen DJ Ku rekryterar XLF till DNA-dubbelsträngsbrott.  (engelska)  // EMBO Reports. - 2008. - Januari ( vol. 9 , nr 1 ). - S. 91-96 . - doi : 10.1038/sj.embor.7401137 . — PMID 18064046 .
  21. ↑ Chirgadze DY et al. DNA-PKcs, allosteri och DNA dubbelsträngsbrottsreparation: definiera strukturen och sätta scenen  //  Metoder inom enzymologi. - 2017. - Vol. 592 . - S. 145-157 . - doi : 10.1016/bs.mie.2017.04.001 .
  22. ↑ DeFazio LG , Stansel RM , Griffith JD , Chu G. Synapsis of DNA ends by DNA-dependent protein kinase.  (engelska)  // The EMBO Journal. - 2002. - 17 juni ( vol. 21 , nr 12 ). - P. 3192-3200 . - doi : 10.1093/emboj/cdf299 . — PMID 12065431 .
  23. ↑ Nick McElhinny SA , Ramsden DA Syskonrivalitet: konkurrens mellan Pol X-familjemedlemmar i V(D)J-rekombination och allmän dubbelsträngbrottsreparation.  (engelska)  // Immunologiska recensioner. - 2004. - Augusti ( vol. 200 ). - S. 156-164 . - doi : 10.1111/j.0105-2896.2004.00160.x . — PMID 15242403 .
  24. ↑ 1 2 Daley JM , Laan RL , Suresh A. , Wilson TE . DNA-ledsberoende av pol X-familjens polymerasverkan vid icke-homolog ändfogning.  (engelska)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 2005. - 12 augusti ( vol. 280 , nr 32 ). - P. 29030-29037 . - doi : 10.1074/jbc.M505277200 . — PMID 15964833 .
  25. ↑ Wilson TE , Grawunder U. , Lieber MR Jäst-DNA-ligas IV förmedlar icke-homologa DNA-ändsammanfogningar.  (engelska)  // Nature. - 1997. - 31 juli ( vol. 388 , nr 6641 ). - S. 495-498 . - doi : 10.1038/41365 . — PMID 9242411 .
  26. ↑ Ahnesorg P. , Smith P. , Jackson SP XLF interagerar med XRCC4-DNA-ligas IV-komplexet för att främja icke-homolog DNA-ändfogning.  (engelska)  // Cell. - 2006. - 27 januari ( vol. 124 , nr 2 ). - s. 301-313 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.12.031 . — PMID 16439205 .
  27. ↑ Buck D. , Malivert L. , de Chasseval R. , Barraud A. , Fondanèche MC , Sanal O. , Plebani A. , Stéphan JL , Hufnagel M. , le Deist F. , Fischer A. , Durandy A. , de Villartay JP , Revy P. Cernunnos, en ny icke-homolog ändbindningsfaktor, är muterad i human immunbrist med mikrocefali.  (engelska)  // Cell. - 2006. - 27 januari ( vol. 124 , nr 2 ). - s. 287-299 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.12.030 . — PMID 16439204 .
  28. ↑ Callebaut I. , Malivert L. , Fischer A. , Mornon JP , Revy P. , de Villartay JP Cernunnos interagerar med XRCC4 x DNA-ligas IV-komplexet och är homolog med den icke-homologa ändbindningsfaktorn Nej1 från jäst.  (engelska)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 2006. - 19 maj ( vol. 281 , nr 20 ). - P. 13857-13860 . - doi : 10.1074/jbc.C500473200 . — PMID 16571728 .
  29. ↑ Riballo E. , Woodbine L. , Stiff T. , Walker SA , Goodarzi AA , Jeggo PA XLF-Cernunnos främjar DNA-ligas IV-XRCC4-återadenylering efter ligering.  (engelska)  // Nucleic Acids Research. - 2009. - Februari ( vol. 37 , nr 2 ). - s. 482-492 . doi : 10.1093 / nar/gkn957 . — PMID 19056826 .
  30. ↑ Mimitou EP , Symington LS DNA-ändresektion: många nukleaser får lätt att fungera.  (engelska)  // DNA-reparation. - 2009. - Vol. 8, nr. 9 . - s. 983-995. - doi : 10.1016/j.dnarep.2009.04.017 . — PMID 19473888 .
  31. ↑ Ragu Sandrine , Matos-Rodrigues Gabriel , Thomas Melissa , Lopez Bernard S. Homolog rekombination i däggdjursceller: Från molekylära mekanismer till patologi  //  Genome Stability. - 2021. - P. 367-392 . - doi : 10.1016/B978-0-323-85679-9.00020-9 .
  32. ↑ Decottignies A. Alternativa ändsammanfogningsmekanismer: ett historiskt perspektiv.  (engelska)  // Frontiers In Genetics. - 2013. - Vol. 4 . - S. 48-48 . - doi : 10.3389/fgene.2013.00048 . — PMID 23565119 .
  33. ↑ Blokhina Yana P. , Buchwalter Abigail. Rör sig snabbt och bryter saker: Förekomst och reparation av DNA-skador inom ribosomala DNA-repetitioner  //  Mutationsforskning/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenes. - 2020. - Maj ( vol. 821 ). — S. 111715 . — ISSN 0027-5107 . - doi : 10.1016/j.mrfmmm.2020.111715 .
  34. ↑ Shibata A. , Conrad S. , Birraux J. , Geuting V. , Barton O. , Ismail A. , Kakarougkas A. , Meek K. , Taucher-Scholz G. , Löbrich M. , Jeggo PA Faktorer som bestämmer DNA dubbel- strängbrottsreparationsväg val i G2-fas.  (engelska)  // The EMBO Journal. - 2011. - 16 mars ( vol. 30 , nr 6 ). - P. 1079-1092 . - doi : 10.1038/emboj.2011.27 . — PMID 21317870 .
  35. ↑ Jung D. , Alt FW Unraveling V(D)J-rekombination; insikter i genreglering.  (engelska)  // Cell. - 2004. - 23 januari ( vol. 116 , nr 2 ). - s. 299-311 . — PMID 14744439 .
  36. ↑ Schatz DG , Baltimore D. Stabilt uttryck av immunoglobulingenens V(D)J-rekombinasaktivitet genom genöverföring till 3T3-fibroblaster.  (engelska)  // Cell. - 1988. - 8 april ( vol. 53 , nr 1 ). - S. 107-115 . — PMID 3349523 .
  37. ↑ Ma Y. , Pannicke U. , Schwarz K. , Lieber MR Bearbetning av hårnålsöppning och överhäng av ett Artemis/DNA-beroende proteinkinaskomplex i icke-homolog ändfogning och V(D)J-rekombination.  (engelska)  // Cell. - 2002. - 22 mars ( vol. 108 , nr 6 ). - s. 781-794 . — PMID 11955432 .
  38. ↑ Gilfillan S. , Dierich A. , Lemeur M. , Benoist C. , Mathis D. Möss som saknar TdT: mogna djur med en omogen lymfocytrepertoar.  (engelska)  // Science (New York, NY). - 1993. - 27 augusti ( vol. 261 , nr 5125 ). - P. 1175-1178 . — PMID 8356452 .
  39. ↑ Komori T. , Okada A. , Stewart V. , Alt F. W. Brist på N-regioner i gener för antigenreceptorvariabel region av TdT-defekta lymfocyter.  (engelska)  // Science (New York, NY). - 1993. - 27 augusti ( vol. 261 , nr 5125 ). - P. 1171-1175 . — PMID 8356451 .
  40. ↑ Boulton SJ , Jackson SP Komponenter av den Ku-beroende icke-homologa ändkopplingsvägen är involverade i underhåll av telomerlängd och telomer tystnad.  (engelska)  // The EMBO Journal. - 1998. - 16 mars ( vol. 17 , nr 6 ). - P. 1819-1828 . - doi : 10.1093/emboj/17.6.1819 . — PMID 9501103 .
  41. ↑ Kerzendorfer C. , O'Driscoll M. Humant DNA-skadesvar och reparationsbristsyndrom: kopplar samman genomisk instabilitet och kompetens för cellcykelkontroll.  (engelska)  // DNA Repair. - 2009. - 2 september ( vol. 8 , nr 9 ). - P. 1139-1152 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2009.04.018 . — PMID 19473885 .
  42. ↑ Lees D. , Lepage P. Kommer robotar någonsin att ersätta skötare? Utforska robotars nuvarande kapacitet och framtida potential inom utbildning och rehabilitering.  (engelska)  // International Journal Of Rehabilitation Research. Internationale Zeitschrift Fur Rehabilitationsforschung. Revue Internationale De Recherches De Readaptation. - 1994. - December ( vol. 17 , nr 4 ). - s. 285-304 . — PMID 7875923 .
  43. ↑ Vaidya A. , Mao Z. , Tian X. , Spencer B. , Seluanov A. , Gorbunova V. Knock-in-reportermöss visar att DNA-reparation genom icke-homolog ändsammanfogning avtar med åldern.  (engelska)  // PLoS Genetics. - 2014. - Juli ( vol. 10 , nr 7 ). - P. e1004511-1004511 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1004511 . — PMID 25033455 .
  44. ↑ Gorbunova V. , Seluanov A. , Mao Z. , Hine C. Förändringar i DNA-reparation under åldrande  //  Nucleic Acids Research. - 2007. - 26 november ( vol. 35 , nr 22 ). - P. 7466-7474 . — ISSN 0305-1048 . - doi : 10.1093/nar/gkm756 .
  45. ↑ Lorenzini A. , Johnson FB , Oliver A. , Tresini M. , Smith JS , Hdeib M. , Sell C. , Cristofalo VJ , Stamato TD Signifikant korrelation mellan arternas livslängd med DNA dubbelsträngsbrottsigenkänning men inte med telomerlängd.  (engelska)  // Mekanismer för åldrande och utveckling. - 2009. - November ( vol. 130 , nr 11-12 ). - s. 784-792 . - doi : 10.1016/j.mad.2009.10.004 . — PMID 19896964 .
  46. ↑ Yang Kai , Guo Rong , Xu Dongyi. Icke-homolog slutförening: framsteg och gränser  //  Acta Biochimica et Biophysica Sinica. - 2016. - 23 maj ( vol. 48 , nr 7 ). - s. 632-640 . — ISSN 1672-9145 . - doi : 10.1093/abbs/gmw046 .

Litteratur

 DNA-reparation
Excision reparation
Andra typer av reparationer
Andra proteiner
förordning