Plastocyaninfamiljen av kopparbindande proteiner

Plastocyanin/azurinfamiljen av kopparbindande proteiner (eller blå proteindomän av typ 1)  är en familj av små proteiner som kan binda en enda kopparatom och kännetecknas av stark absorption som toppar runt 600 nm, på grund av vilket, i reducerat tillstånd, de färgas vanligtvis klarblått (se kopparinnehållande proteiner).proteiner ) [2] [3] . De mest kända medlemmarna i denna klass av proteiner är växtplastocyaninerna , små vattenlösliga kloroplastproteiner som överför en elektron från cytokrom f och är avlägset besläktade med bakterieproteinerna azuriner , som utbyter elektroner med cytokrom c551. Denna familj inkluderar även proteinet amycyanin från bakterier som Methylobacterium extorquens eller Paracoccus versutus ( Thiobacillus versutus ) som kan växa på metylamin ; auracyaniner A och B från Chloroflexus aurantiacus ; [4] blått kopparprotein från Alcaligenes faecalis ; cupredoxin från skalen av Cucumis sativus (gurka); [5] Cusacyanin (baserat blått protein) från gurka; halocyanin, ett membranbundet protein från Natronomonas pharaonis ( Natronobacterium pharaonis ), [6] pseudoazurin från Pseudomonas ; rusticyanin från Thiobacillus ferrooxidans ; [7] stellacyanin från Rhus vernicifera (japanskt lackträd); umecyanin från rötterna av Armoracia rusticana (pepparrot); och Ra3-allergen från ragweed . Detta pollenprotein ligger evolutionärt nära polypeptiderna som listas ovan, men verkar ha förlorat förmågan att binda koppar. Även om det finns markant divergens i den primära strukturen för alla dessa proteiner, förblir kopparbindningsstället mycket konserverat.

Anteckningar

1. ↑ Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC . Noggrannhet och precision i proteinstrukturanalys: begränsad förfining av minsta kvadraters struktur av poppelplastocyanin vid 1,33 A-upplösning   // Acta Cryst . B : journal. - International Union of Crystallography , 1992. - December ( vol. 48 , nr 6 ). - P. 790-811 . - doi : 10.1107/S0108768192004270 . — PMID 1492962 .
2. ↑ Clingeleffer DJ, Guss JM, Rogers SJ, Freeman HC, Garrett TP Kristallstrukturen av poppelapoplastocyanin vid 1,8-A upplösning. Geometrin för kopparbindningsstället skapas av polypeptiden  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1984. - Vol. 259 , nr. 5 . - P. 2822-2825 . — PMID 6698995 .
3. ↑ Hunt LT, Ryden LG Utveckling av proteinkomplexitet: de blå kopparinnehållande oxidaserna och relaterade proteiner  //  J. Mol. Evol. : journal. - 1993. - Vol. 36 , nr. 1 . - S. 41-66 . - doi : 10.1007/BF02407305 . — PMID 8433378 .
4. ↑ Meyer TE, Han J., McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J., Cusanovich MA, Tollin G., Blankenship RE Isolering, karakterisering och aminosyrasekvenser av auracyaniner, blå kopparproteiner från den gröna fotosyntetiska bakterien Chloroflexus aurantiacus  (engelska)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 1992. - Vol. 267 , nr. 10 . - P. 6531-6540 . — PMID 1313011 .
5. ↑ Messerschmidt A., Mann K., Thoenes U., Mehrabian Z., Nalbandyan R., Schafer W. Aminosyrasekvensen för ett kopparprotein av typ I med en ovanlig serin- och hydroxiprolinrik C-terminal domän isolerad från gurka peelings  (engelska)  // FEBS Lett. : journal. - 1992. - Vol. 314 , nr. 3 . - S. 220-223 . - doi : 10.1016/0014-5793(92)81475-2 . — PMID 1468551 .
6. ↑ Oesterhelt D., Mattar S., Scharf B., Rodewald K., Engelhard M., Kent SB Den primära strukturen av halocyanin, ett arkeiskt blått kopparprotein, förutsäger en ankarlipid för membranfixering  //  J. Chem.  : journal. - 1994. - Vol. 269 , nr. 21 . - P. 14939-14945 . — PMID 8195126 .
7. ↑ Yano T., Fukumori Y., Yamanaka T. Aminosyrasekvensen för rusticyanin isolerad från Thiobacillus ferrooxidans  // FEBS Lett  . : journal. - 1991. - Vol. 288 , nr. 1 . - S. 159-162 . - doi : 10.1016/0014-5793(91)81025-4 . — PMID 1879547 .