Spacers (från engelska spacer - "separator") är sektioner av icke-kodande DNA som ligger mellan tandem upprepade gener , till exempel mellan ribosomala RNA- gener [1] i eukaryoter . Deras funktion är mest sannolikt att ge en hög nivå av transkriptionell trohet i relaterade gener.
Hos bakterier består spacersektionerna av DNA endast av ett fåtal nukleotider . I eukaryoter kan de vara mycket större och inkludera repetitiva DNA-sekvenser , vilket innesluter det mesta av det genomiska DNA:t.
I ribosomalt DNA finns spacers både inom och mellan genkluster och benämns interna spacers (ITS) respektive externa spacers (ETS). Hos djur tenderar mitokondriella DNA-gener att ha mycket korta spacers. Hos svampar är mitokondriella DNA-spacers varierande i längd och kan vara rörliga [2] . Eftersom nukleotidsekvenserna för spacers under evolution förändras mycket snabbare än gensekvenser, tror man att funktionen hos en spacer inte beror på sekvensen av dess mononukleotider [3] .
I en snävare mening används termen "spacer" för att hänvisa till att dela DNA mellan tandemkopior av rRNA-gener.
Genetik : upprepade sekvenser | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Tandem upprepar sig |
| ||||||||||||
Dispergerade upprepningar |
| ||||||||||||
Genomisk ö | Genomisk ö |