Spacer (biologi)

Spacers (från engelska  spacer  - "separator") är sektioner av icke-kodande DNA som ligger mellan tandem upprepade gener , till exempel mellan ribosomala RNA- gener [1] i eukaryoter . Deras funktion är mest sannolikt att ge en hög nivå av transkriptionell trohet i relaterade gener.

Hos bakterier består spacersektionerna av DNA endast av ett fåtal nukleotider . I eukaryoter kan de vara mycket större och inkludera repetitiva DNA-sekvenser , vilket innesluter det mesta av det genomiska DNA:t.

I ribosomalt DNA finns spacers både inom och mellan genkluster och benämns interna spacers (ITS) respektive externa spacers (ETS). Hos djur tenderar mitokondriella DNA-gener att ha mycket korta spacers. Hos svampar är mitokondriella DNA-spacers varierande i längd och kan vara rörliga [2] . Eftersom nukleotidsekvenserna för spacers under evolution förändras mycket snabbare än gensekvenser, tror man att funktionen hos en spacer inte beror på sekvensen av dess mononukleotider [3] .

I en snävare mening används termen "spacer" för att hänvisa till att dela DNA mellan tandemkopior av rRNA-gener.

Anteckningar

1. ↑ Lackie, JM, red. (2007), The Dictionary of Cell & Molecular Biology (4:e upplagan), Burlington, MA: Academic Press, sid. 394
2. ↑ Rédei, G. P. (2008), Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics (3:e upplagan), Springer, sid. 1848
3. ↑ Sudbery, P. (2002), Human Molecular Genetics (2:a upplagan), Pearson Education, s. 35-36