Worden, Alexandra

Alexandra Worden
engelsk  Alexandra (Alex) Z. Worden

Vaktmästare 2017
Födelsedatum 1970
Födelseort
Land
Arbetsplats
Alma mater

Alexandra Warden ( eng.  Alexandra (Alex) Z. Worden , född 1970 , Middlesex , Massachusetts ) är en mikrobiolog och genomekolog känd för sin kunskap om ekologin och evolutionen av oceaniska mikrober och deras inflytande på globala biogeokemiska cykler .

Forskningsbidrag

Wordens forskning fokuserar på eukaryotiskt växtplanktons fysiologi och ekologi och deras roll i kolets kretslopp [1] [2] . Hon initierade denna forskning genom ett NSF postdoktoralt stipendium i mikrobiell biologi och utökade det därefter genom att anpassa flera molekylära och ohmska metoder för att karakterisera evolutionen och ekologiska bidrag från detta fotosyntetiska plankton som nu är känt för att vara havets främsta primärproducent [3] [4] . Vid Scripps Institution of Oceanographyandra studier av mikrobiella interaktioner utförda i Farouk Azams laboratorium, ledde till hennes arbete, som motbevisade tanken att V. cholerae existerar främst knuten till copepoder i vattensystem [5] . Detta ansågs viktigt för att förstå ekologin hos denna mänskliga patogen och vektorerna för överföring av infektiösa celler. Under denna period introducerade hon och Azam begreppet ekosystembiologi (ekosystembiologi) och myntade termen 2004 [6] . Detta koncept har antagits av det vetenskapliga samfundet i flera nyare artiklar [7] [8] och utvecklas för närvarande av biologen Jeroen Raes och mikrobiell oceanograf Edward DeLong . Jacques Monod-konferensen om biologi i marina ekosystem lanserades 2015 [9] .

Warden är också känd som en pionjär inom "targeted metagenomics" [10] [11] [12] , där celler av särskilt intresse separeras från massor med flödescytometri (på ett skepp) och sedan genom sekvenseras endast från celler av störst intresse. . Genom att använda detta tillvägagångssätt sekvenserade Worden och hennes medarbetare vid det amerikanska energidepartementets Joint Genome Institute partiella genom från nyckelgrupp av oodlade eukaryota alger, vilket visar fördelningen av dessa fotosyntetiska protozoer i havet På senare tid har hennes labb anpassat dessa metoder för att studera outodlade encelliga rovdjur i havet och har upptäckt jättevirus som infekterar choanoflagellater , en utbredd grupp av djurrelaterade rovdjur. Anmärkningsvärt är att virus tillför den icke-fotosyntetiska, rovdjursvärden kompletta bakteriodopsinliknande fotosystem som pumpar protoner [13] .

Hennes laboratorium undersöker också förfäders komponenter av landväxter [14] , evolutionär biologi och distribution av oodlade taxa [15] [16] och interaktioner mellan virus och växtplanktonvärdceller. 2015 krävde hon och medförfattare att "omtanke om den marina kolcykeln" [17] . Warden publicerar inom områdena miljömikrobiologi, evolutionsbiologi, genomvetenskap och oceanografi .

Karriär

Worden startade sitt labb 2004 som biträdande professor vid Rosenstiel School of Marine and Atmospheric Sciences.i Miami , Florida , USA . 2007 anställdes hon av Monterey Bay Aquarium Research Institute.på USA:s västkust när det leddes av Marsha McNutt , som nu är president för US National Academy of Sciences . Medan han var på MBARI steg Worden också i graderna för att bli adjungerad professor vid University of California, Santa Cruz . Hon är för närvarande professor och avdelningschef vid GEOMAR Helmholtz Center for Ocean Research i Kieloch universitetet i Kiel i Tyskland.

Wardens första utmärkelser kom som ett NASA Graduate Earth Science Scholarship och University of Georgia Regents Postgraduate Award. År 2000 fick hon ett US National Science Foundation Postdoctoral Fellowship in Microbial Biology för att stödja sin banbrytande forskning om pikoeukaryoter. Efter att ha grundat sitt laboratorium 2004 tilldelades hon Young Investigator Award [18] .

2009 utsågs Worden till forskare vid Canadian Institute for Advanced Study .(CIFAR) och blev senare CIFAR Senior Fellow (2011). Hon valdes ut från en internationell pool av ledande forskare som marinforskare för Gordon and Betty Moore Foundation.2013 [19] för hennes "kreativitet, innovation och potential att göra stora nya genombrott" [20] . 2015 och 2016 var Worden marin- och klimatforskare vid HWK [21] i Tyskland. 2016 valdes hon till Fellow i American Academy of Microbiology, en hedersledargrupp inom American Society for Microbiology .[22] . 2021 utsågs hon till Max Planck Fellow vid Max Planck Institute for Evolutionary Biologyi Plön [23] och blev forskare vid Radcliffe Institute for Advanced Study Harvard University [24] . 2022 valdes hon till ledamot av den tyska nationella vetenskapsakademin Leopoldina .

Worden är en förespråkare för STEM- utbildning och innovation och betonar behovet av lämpliga "...rollmodeller som inspirerar till större mångfald och kreativitet" inom vetenskapen [25] .

Utbildning

Worden gick på Wellesley College , där hon tog en Bachelor of Arts-examen i historia och avslutade kurser i Earth, Atmospheric and Planetary Sciences vid Massachusetts Institute of Technology . Under sin tid vid MIT arbetade hon i laboratorierna av maringeokemisten och paleo-oceanografen John M. Edmond [26] , klimatologen Reginald Newell [27] och oceanografibiologen Sally W. Chisholm . Hon tog sin doktorsexamen i ekologi från Odum School of Ecology University of Georgia i Aten , Georgia , USA 2000.

Hennes tidiga exponering för ingenjörskonst kom genom datorprogrammering vid BBN Technologies , och sedan gick hon till universitetet och deltog i ett MIT -projekt för elfordon för solenergi. Vid den tiden bestod det prisbelönta MIT Solar Electric Vehicle [28] -teamet av flera individer som har blivit ledande innovatörer inom teknologivärlden, inklusive Gill Pratt [29] och Megan Smith ; laget grundades av Wardens bror, James Warden [30] [31] [32] . Ingenjörsvetenskap och teknisk innovation har förblivit en konstant del av hennes oceanografiska forskning.

Familj

Warden har en partner och två barn [33] [34] .

Se även

Anteckningar

  1. Europeiska kommissionen: CORDIS: Nyheter och evenemang: Gröna gener ger insikter om klimatförändringar . cordis.europa.eu .
  2. DOE Joint Genome Institute JGI Community Faces: Alexandra Z. Worden (16 oktober 2008).
  3. Worden Alexandra Z (2004). "Bedöma dynamiken och ekologin hos marint pikofytoplankton: Vikten av den eukaryota komponenten". Limnologi och oceanografi . 49 (1): 168-179. Bibcode : 2004LimOc..49..168W . CiteSeerX  10.1.1.527.5206 . DOI : 10.4319/lo.2004.49.1.0168 .
  4. Martin, Cyrus (april 2015). Biologins mörka materia. Aktuell biologi . 25 (8): R301-R307. DOI : 10.1016/j.cub.2015.03.010 . PMID26082952  . _
  5. Worden AZ, Seidel M, Smriga S, Wick A, Malfatti F, Bartlett D, Azam F (2006). "Trofisk reglering av Vibrio cholerae i kustnära marina vatten". miljömikrobiologi . 8 (1): 21&ndash, 29. DOI : 10.1111/j.1462-2920.2005.00863.x . PMID  16343318 .
  6. Azam, F; Worden, A-Z (2004). "Oceanografi. Mikrober, molekyler och marina ekosystem”. vetenskap . 303 (5664): 1622-4. DOI : 10.1126/science.1093892 . PMID  15016987 .
  7. Raes, J; Bork, P (2008). "Molecular eco-systems biology: Towards an understanding of community function" (PDF) . Naturrecensioner Mikrobiologi . 6 (9): 693-9. DOI : 10.1038/nrmicro1935 . PMID  18587409 .
  8. Karsenti, E; Acinas, S.G.; Bork, P; Bowler, C; DeVargas, C; Raes, J; Sullivan, M; Arendt, D; Benzoni, F; Claverie, JM; Följer, M; Gorsky, G; Hingamp, P; Judicone, D; Jaillon, O; Kandels-Lewis, S; Krzic, U; Inte, F; Ogata, H; Pesant, S; Reynaud, E.G.; Sardet, C; Sieracki, M.E.; Speich, S; Velayoudon, D; Weissenbach, J; Wincker, P; The Tara Oceans, Consortium (2011). "En holistisk syn på marin ekosystembiologi" . PLOS Biologi . 9 (10): e1001177. doi : 10.1371/journal.pbio.1001177 . PMC  3196472 . PMID22028628  . _
  9. CNRS - Konferenser Jacques Monod 2015 . www.cnrs.fr. _
  10. Cuvelier, Marie L.; Allen, Andrew E.; Monier, Adam; McCrow, John P.; Messié, Monique; Tringe, Susannah G.; Woyke, Tanja; Welsh, Rory M.; Ishoey, Thomas; Lee, Jae Hyeok; Binder, Brian J.; DuPont, Chris L.; Latasa, Mikel; Guigand, Cedric; Buck, Kurt R.; Hilton, Jason; Thiagarajan, Mathangi; Caler, Elisabet; Läs, Betsy; Lasken, Roger S.; Chavez, Francisco P.; Worden, Alexandra Z. (2010-08-17). "Riktad metagenomik och ekologi för globalt viktigt oodlat eukaryotiskt växtplankton" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (33): 14679-14684. Bibcode : 2010PNAS..10714679C . DOI : 10.1073/pnas.1001665107 . PMC2930470  . _ PMID20668244  . _
  11. Raven JA (2012). "Algbiogeografi: metagenomik visar distributionen av en pikoplanktonisk pelagofyt." Aktuell biologi . 22 (17): R675&ndash, 7. DOI : 10.1016/j.cub.2012.07.030 . PMID  22974994 .
  12. Martin, Cyrus (2015-04-20). Biologins mörka materia. Aktuell biologi . 25 (8): R301-R307. DOI : 10.1016/j.cub.2015.03.010 . PMID26082952  . _
  13. Needham, David M.; Yoshizawa, Susumu; Hosaka, Toshiaki; Poirier, Camille; Choi, Chang Jae; Hehenberger, Elisabeth; Irwin, Nicholas A.T.; Wilken, Susanne; Yung, Cheuk-Man; Bachy, Charles; Kurihara, Rika; Nakajima, Yu; Kojima, Keiichi; Kimura-Someya, Tomomi; Leonard, Guy; Malmström, Rex R.; Mende, Daniel R.; Olson, Daniel K.; Sudo, Yuki; Sudek, Sebastian; Richards, Thomas A.; Delong, Edward F.; Keeling, Patrick J.; Santoro, Alyson E.; Shirouzu, Mikako; Iwasaki, Wataru; Worden, Alexandra Z. (2019-10-08). "En distinkt härstamning av jättevirus ger ett rhodopsin-fotosystem till encelliga marina rovdjur . " Proceedings of the National Academy of Sciences . 116 (41): 20574-20583. Bibcode : 2019PNAS..11620574N . DOI : 10.1073/pnas.1907517116 . PMC  6789865 . PMID  31548428 .
  14. Archibald JM (2009). "Grön evolution, grön revolution". vetenskap . 324 (5924): 191&ndash, 192. Bibcode : 2009Sci...324..191A . DOI : 10.1126/science.1172972 . PMID  19359572 .
  15. redOrbit- biologer hittar en ny grupp alger som lever i färskt och saltvatten - Redorbit . redorbit.com (21 januari 2011).
  16. http://www.sea-technology.com/news/archives/2011/mar_resources/mar_resources0311.php Arkiverad från originalet den 24 januari 2012. SeaTechnology Magazine Artikel om nyupptäckta alger
  17. Worden, AZ; Följer, MJ; Giovannoni, SJ; Wilken, S; Zimmerman, AE; Keeling, PJ (2015). "Miljövetenskap. Att tänka om den marina kolcykeln: Ta hänsyn till mikrobernas mångfaldiga livsstilar”. vetenskap . 347 (6223): 1257594. doi : 10.1126 /science.1257594 . PMID25678667  . _
  18. Mitchum, Gary T. (december 2004). BOKRECENSION. Limnologi och Oceanografi Bulletin . 13 (4): 73-74. doi : 10.1002/ lob.200413473 .
  19. Gordon och Betty Moore Foundation identifierar 16 ledande forskare för att bedriva högriskforskning inom marin mikrobiell ekologi .
  20. Minimikrober gör ett stort plask - Good Times Santa Cruz . goodtimes.sc (13 februari 2013).
  21. Hanse-Wissenschaftskolleg - Institutet för avancerade studier: Hem .
  22. Urban, Joanna 78 stipendiater invalda till American Academy of Microbiology . www.asm.org . Hämtad 3 september 2016. Arkiverad från originalet 11 september 2016.
  23. Alexandra Worden utnämnde Max Planck Fellow .
  24. Harvard Radcliffe Institute tillkännager 2021–2022 stipendiater .
  25. "Alexandra Z. Worden": 252.i ”Självbiografiska skisser” . oceanografi . 27 (4):49-258. december 2014.
  26. JOHN EDMOND . web.mit.edu _
  27. Professor Reginald Newell dör vid 71; studerat klimatsystem, luftföroreningar .
  28. Hej världen .
  29. Gill Pratt diskuterar Toyotas AI-planer och framtiden för robotar och bilar . IEEE Spectrum: Technology, Engineering, and Science News (2015).
  30. Wald, Matthew L. . profil; I Quest for Electric Cars lägger han till trons kraft  (6 mars 1994).
  31. Solectria - Uppnå mål genom att sänka dem . wordpress.com (28 juli 2014).
  32. Solbil sätter världsrekord - The Tech . tech.mit.edu .
  33. Alexandra Worden och livets eukaryota träd . aaas.org (10 juni 2016).
  34. Arlington-infödd namngiven American Academy of Microbiology-stipendiat . arlington.wickedlocal.com .

Länkar