Fag T4

Fag T4
T4-fagens struktur
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [2]Rike:DuplodnaviriaRike:HeunggongviraeSorts:UroviricotaKlass:CaudoviricetesOrdning:CaudoviralesFamilj:MyovirusUnderfamilj:TevenvirinaeSläkte:TequatrovirusSe:Fag T4
Internationellt vetenskapligt namn
Escherichia virus T4
Synonymer
enligt ICTV [3] : Kolipag T2 Kolipag T4 Kolipag T6 Enterobakteriefag C16 Enterobakteriefag PST Enterobakteriefag T4 Fas C16 Phage PST
Baltimore-gruppen
I: dsDNA-virus
Systematik på Wikispecies Bilder på Wikimedia Commons

Fag T4 [4] ( Escherichia virus T4 ,  tidigare Enterobacteria fag T4 ) är ett av de mest studerade virusen , en bakteriofag som infekterar enterobakterier , inklusive Escherichia coli . Den har genomiskt DNA i storleksordningen 169-170 tusen baspar, packat i ett icosaedriskt huvud [5] . Virion har också en stam, stambas och stamprocesser - sex långa och sex korta.

T4-fagen använder ett DNA-polymeras av cirkulär typ ; dess glidmanschett är en trimer som liknar PCNA , men den delar ingen homologi med vare sig PCNA eller polymeras β.

T4 är en relativt stor fag, cirka 90 nm i diameter och cirka 200 nm lång. Viruset använder endast den lytiska utvecklingscykeln, men inte den lysogena [6] .

Nobelpristagarna Max Delbrück , Salvador Luria , Alfred Hershey , James Watson och Francis Crick , samt andra kända forskare - Michael Rossmann , Vadim Mesyanzhinov , Fumio Arisaka , Seymour Benzer , Bruce Alberts arbetade med T4-fager eller liknande bakteriofager .

År 2016 bytte T4, liksom andra bakteriofager, sitt vetenskapliga namn till Escherichia virus T4 [7] .

Litteratur

• Proteinsammansättning T4 (animation)
• Leiman, PG, Kanamaru, S., Mesyanzhinov, VV, Arisaka, F. och Rossmann, MG, "Struktur och morfogenes av bakteriofag T4." [ett]
• Karam, J., Petrov, V., Nolan, J., Chin, D., Shatley, C., Krisch, H. och Letarov, A. Genomprojektet för T4-liknande fager. https://web.archive.org/web/20070523215704/http://phage.bioc.tulane.edu/ . (Den T4-liknande fagen med full genomisk sekvens)
• Mosig, G. och F. Eiserling. 2006. T4 och relaterade fager: struktur och utveckling, R. Calendar och ST Abedon (red.), The Bacteriophages. Oxford University Press, Oxford. (Recension av fag T4-biologi) ISBN 0-19-514850-9
• Filee J. Tetart F., Suttle CA, Krisch HM Marine T4-typ bakteriofager, en allestädes närvarande komponent av mörk materia i biosfären   // Proc . Natl. Acad. sci. USA: tidskrift. - 2005. - Vol. 102 , nr. 35 . - P. 12471-12476 . - doi : 10.1073/pnas.0503404102 . — PMID 16116082 . (Indikation på prevalens och T4-liknande fager i naturen)
• Chibani-Chennoufi S., Canchaya C., Bruttin A., Brussow H. Jämförande genomik av den T4-liknande Escherichia coli -fagen JS98: implikationer för utvecklingen av T4-fager  //  Journal of Bacteriology : journal. - 2004. - Vol. 186 , nr. 24 . - P. 8276-8286 . - doi : 10.1128/JB.186.24.8276-8286.2004 . — PMID 15576776 . (Karakterisering av en T4-liknande fag)
• Desplats C., Krisch HM Mångfalden och utvecklingen av bakteriofager av T4-typ  (engelska)  // Res. mikrobiol. : journal. - 2003. - Maj ( vol. 154 , nr 4 ). - s. 259-267 . - doi : 10.1016/S0923-2508(03)00069-X . — PMID 12798230 .
• Miller, ES, Kutter E., Mosig G., Arisaka F., Kunisawa T., Ruger W. Bacteriophage T4-genom  (neopr.)  // Microbiol. Mol. Biol. Rev.. - 2003. - T. 67 , nr 1 . - S. 86-156 . - doi : 10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003 . — PMID 12626685 . (Review av fag T4, ur perspektivet av dess genom)
• Desplats C., Dez C., Tetart F., Eleaume H., Krisch HM Ögonblicksbild av genomet av pseudo-T-even bakteriofagen RB49  //  Journal of Bacteriology : journal. - 2002. - Vol. 184 , nr. 10 . - P. 2789-2804 . - doi : 10.1128/JB.184.10.2789-2804.2002 . — PMID 11976309 . (Översikt över RB49-genomet, en T4-liknande fag)
• Malys N., Chang DY, Baumann RG, Xie D., Black LW Ett bipartit bakteriofag T4 SOC och HOC randomiserat peptiddisplaybibliotek: detektion och analys av fag T4-terminas (gp17) och sen sigmafaktor (gp55)  interaktion  // J Mol Biol: tidskrift. - 2002. - Vol. 319 , nr. 2 . - s. 289-304 . - doi : 10.1016/S0022-2836(02)00298-X . — PMID 12051907 . (T4-fagapplikation inom bioteknik för att studera proteininteraktion)
• Tétart F., Desplats C., Kutateladze  M., Monod C., Ackermann  H.-W. , Krisch HM . : journal. - 2001. - Vol. 183 , nr. 1 . - s. 358-366 . - doi : 10.1128/JB.183.1.358-366.2001 . — PMID 11114936 . (Indikation på förekomsten av sekvenser av T4-typ i naturen)
• Abedon ST Det skumma ursprunget till Snövit och hennes T-jämna dvärgar  //  Genetics: journal. - 2000. - Vol. 155 , nr. 2 . - s. 481-486 . — PMID 10835374 . (Historisk beskrivning av isoleringen av de T4-liknande fagerna T2, T4 och T6)
• Ackermann HW, Krisch HM En katalog över bakteriofager av T4-typ  (neopr.)  // Arch. Virol .. - 1997. - T. 142 , nr 12 . - S. 2329-2345 . - doi : 10.1007/s007050050246 . — PMID 9672598 . Arkiverad från originalet den 1 november 2001. (Nästan komplett lista över då kända T4-liknande fager)
• Monod C., Repoila F., Kutateladze M., Tétart F., Krisch HM Genomet av pseudo T-even bakteriofager, en mångsidig grupp som liknar T4  //  J. Mol. Biol. : journal. - 1997. - Mars ( vol. 267 , nr 2 ). - S. 237-249 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0867 . — PMID 9096222 . (Översikt över olika T4-liknande fager utifrån deras genom)
• Kutter E., Gachechiladze K., Poglazov A., Marusich E., Shneider M., Aronsson P., Napuli A., Porter D., Mesyanzhinov V. Evolution of T4-related phages  (neopr.)  // Virus Genes. - 1995. - T. 11 , nr 2-3 . - S. 285-297 . - doi : 10.1007/BF01728666 . — PMID 8828153 .  (ej tillgänglig länk) (Jämförelse av genomen för olika T4-liknande fager)
• Karam, JD et al. 1994. Molecular Biology of Bacteriophage T4. ASM Press, Washington, DC. (Den andra T4-bibeln, gå hit, liksom Mosig och Eiserling, 2006, för att börja lära dig om biologins T4-fag) ISBN 1-55581-064-0
• Eddy, S.R. 1992. Introns in the T-Even Bacteriophages. Ph.D. avhandling. University of Colorado i Boulder. (Kapitel 3 ger en översikt över olika T4-liknande fager samt isolering av då nya T4-liknande fager)
• Mathews, CK, EM Kutter, G. Mosig och PB Berget. 1983. Bakteriofag T4. American Society for Microbiology, Washington, DC. (Den första T4-bibeln; inte all information här är duplicerad i Karam et al. , 1994; se särskilt det inledande kapitlet av Doermann för en historisk översikt över de T4-liknande fagerna) ISBN 0-914826-56-5
• Russell, R.L. 1967. Speciation Among the T-even Bacteriophages. Ph.D. avhandling. California Institute of Technology. (Isolering av RB-serien av T4-liknande fager)
• Kay D., Fildes P. Hydroxymethylcytosin-innehållande och tryptofanberoende bakteriofager isolerade från stadsavlopp  //  J. Gen. mikrobiol. : journal. - 1962. - Vol. 27 . - S. 143-146 . — PMID 14454648 . (T4-liknande fagisolering, inklusive den för fag Ox2)

Anteckningar

1. ↑ Victor Padilla Sanchez. Strukturell modell av Bacteriophage T4  // WikiJournal of Science. - 2021. - Vol. 4 , nr. 1 . - S. 5 . - doi : 10.15347/WJS/2021.005 . Arkiverad från originalet den 28 april 2022.
2. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
3. ↑ ICTV Taxonomy History: Escherichia virus T4 på ICTV-webbplatsen  ( tillgänglig  30 april 2019) .
4. ↑ Pinevich A.V. , Sirotkin A.K. , Gavrilova O.V. , Potekhin A.A. Virologi: lärobok. - St Petersburg.  : St. Petersburg University Press, 2012. - S. 177. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
5. ↑ Eric S. Miller, Elizabeth Kutter, Gisela Mosig, Fumio Arisaka, Takashi Kunisawa. Bakteriofag T4-genom  // Mikrobiologi och molekylärbiologi recensioner: MMBR. - 2003. - T. 67 , nr. 1 . - s. 86-156, innehållsförteckning . — ISSN 1092-2172 . - doi : 10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003 . Arkiverad från originalet den 20 augusti 2018.
6. ↑ HW Ackermann, HM Krisch. En katalog över bakteriofager av T4-typ  // Archives of Virology. - 1997. - T. 142 , nr. 12 . - S. 2329-2345 . — ISSN 0304-8608 . Arkiverad från originalet den 29 juni 2018.
7. ↑ För att byta namn på alla (522) existerande bakterievirus och 2 arkaeala virusarter  : [ eng. ]  : [ arch. 30 april 2019 ] // ICTV. — Tilldelad kod: 2015.025aB. - 2015. - 18 sid.

Ordböcker och uppslagsverk	Britannica (online)
Taxonomi	IRMNG