ARNT

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe RCSB

Lista över PDB-ID
4PKY , 1X0O , 2A24 , 2B02 , 2HV1 , 2K7S , 3F1N , 3F1O , 3F1P , 3H7W , 3H82 , 4EQ1 , 4GHI , 4GS9 , 4H6LPJ , 4H2ZJ _ _

Identifierare

Symboler

ARNT , HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, nukleär translokator för arylkolvätereceptor, kärntranslokator för arylkolvätereceptor

Externa ID:n

OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: 405

Genontologi
Funktioner	• sekvensspecifik DNA-bindning • DNA-bindande • proteindimeriseringsaktivitet • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet • GO:0001105 transkriptionskoaktivatoraktivitet • arylkolväte - transkriptionsreceptoraktivitet faktor • GO:0001948, GO:0016582 plasmaproteinbindning • proteinheterodimeriseringsaktivitet • transkriptionsfaktoraktivitet, RNA-polymeras II distal förstärkare sekvensspecifik bindning • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-bindande aktivitet transkription, DNA-bindande aktivitet RNA-polymeras II-specifik • proteinhomodimerisering • sekvensspecifik dubbelsträngad DNA-bindning • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nukleär receptoraktivitet
cellkomponent	• cytoplasma • transkriptionskomplexregulator • nukleoplasma • RNA-polymeras II transkriptionsregulatorkomplex • cellkärna • kärnkroppar
biologisk process	• positiv reglering av signalvägen för vaskulär endoteltillväxtfaktorreceptor • Celldifferentiering • svar på hypoxi • GO:0009373 DNA-beroende reglering av transkription • positiv reglering av endotelcellsproliferation • reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor som svar på oxidativ stress • positiv reglering av erytrocytdifferentiering • embryonal placentautveckling • mRNA-transkription av RNA-polymeras II • positiv reglering av proteinsumoylering • transkription, DNA-beroende • GO:0060469, GO:0009371 positiv reglering av transkription • intracellulär receptorsignalväg • reglering av transkription RNA-polymeras II-promotor som svar på hypoxi • positiv reglering av vaskulär endoteltillväxtfaktorproduktion • positiv reglering av glykolytisk process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positiv reglering av transkription av RNA-polymeras II promotor • positiv reglering av hormonbiosyntetisk process • xenobiotisk metabolisk process
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Typer

Mänsklig

Mus

Entrez


405


11863

Ensemble


ENSG00000143437


ENSMUSG00000015522

UniProt


P27540


P53762

RefSeq (mRNA)

NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426
NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226


NM_001037737 NM_009709

RefSeq (protein)

NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514
NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155


NP_001032826 NP_033839

Locus (UCSC)

Chr 1: 150,81 – 150,88 Mb

Chr 3: 95,34 – 95,4 Mb

PubMed- sökning

[ett]

[2]

Redigera (människa)

Redigera (mus)

ARNT (förkortning från engelska. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator ) - en nukleär translokator (bärare) av den aromatiska kolvätereceptorn (AHR), är ett protein som bildar ett komplex med den ligandbundna AHR-receptorn och är nödvändigt för receptorns funktion. Den kodas av ARNT -genen med samma namn , lokaliserad på den korta armen (p-armen) av 1-kromosomen [1] .

Det kodade proteinet har också identifierats som beta-subenheten av en heterodimer transkriptionsfaktor , hypoxiinducerbar faktor (HIF1β). Translokation t(1; 12) (q21; p13), som leder till vidhäftning till TEL-ARNT-proteinet, är associerad med akut myeloblastisk leukemi. Tre alternativa splitsade varianter har beskrivits för denna gen, som kodar för olika isoformer.

Den aromatiska kolvätereceptorn (AHR) är involverad i induktionen av flera enzymer som är involverade i metabolismen av xenobiotika . Den ligand-cytosoliska formen av den aromatiska kolvätereceptorn är komplext kopplad till värmechockproteinet (Hsp90). Bindning av ligander, inklusive dioxiner ( TCDD ) och polycykliska aromatiska kolväten (PAH), leder till translokation (rörelse) av den ligandbindande subenheten endast i [2] cellkärnan . Induktionen av enzymer involverade i metabolismen av xenobiotika sker på grund av bindningen av ligandbunden AhR till xenobiotikakänsliga element i promotorregionerna av generna för dessa enzymer.

Interaktioner med andra proteiner

ARNT interagerar med följande proteiner:

AIP , [3] [4]
AHR , [5] [6] [7] [8]
EPAS1 , [9]
HIF1A , [9] [10]
NCOA2 , [11] [11]
SIM1 , [10] [12] och
SIM2 . [10] [12] [13] [14]

Anteckningar

↑ HUGO gennomenklaturkommitté, HGNC: 700 . Hämtad 21 september 2017. Arkiverad från originalet 21 september 2017.
↑ Hughes D. , Guttenplan JB , Marcus CB , Subbaramaiah K. , Dannenberg AJ Heat Shock Protein 90-hämmare undertrycker Aryl-kolvätereceptormedierad aktivering av CYP1A1- och CYP1B1-transkription och DNA-adduktbildning // Cancerprevention Research. - 2008. - 1 november ( vol. 1 , nr 6 ). - s. 485-493 . — ISSN 1940-6207 . - doi : 10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149 .
↑ Carver LA, Bradfield CA Ligandberoende interaktion av arylkolvätereceptorn med en ny immunofilinhomolog in vivo // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - April ( vol. 272 , nr 17 ). - P. 11452-11456 . doi : 10.1074 / jbc.272.17.11452 . — PMID 9111057 .
↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. Chaperonekomplexet hsp90 reglerar intracellulär lokalisering av dioxinreceptorn // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2001. - April ( vol. 21 , nr 7 ). - P. 2594-2607 . - doi : 10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001 . — PMID 11259606 .
↑ Lindebro MC, Poellinger L., Whitelaw ML Protein-proteininteraktion via PAS-domäner: PAS-domänens roll i positiv och negativ reglering av bHLH/PAS-dioxinreceptorn-Arnt transkriptionsfaktorkomplexet // The EMBO Journal : journal. - 1995. - Juli ( vol. 14 , nr 14 ). - P. 3528-3539 . — PMID 7628454 .
↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson JA, Poellinger L. Ligandberoende rekrytering av Arnt-koregulatorn bestämmer DNA-igenkänning av dioxinreceptorn // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1993. - April ( vol. 13 , nr 4 ). - P. 2504-2514 . — PMID 8384309 .
↑ Yamaguchi Y., Kuo MT Funktionsanalys av arylkolvätereceptorns nukleära translokatorinteraktioner med arylkolvätereceptorn i jästens tvåhybridsystem // Biokemisk farmakologi : journal. - 1995. - Oktober ( vol. 50 , nr 8 ). - P. 1295-1302 . - doi : 10.1016/0006-2952(95)02016-6 . — PMID 7488247 .
↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identifiering av en ny mekanism för reglering av Ah (dioxin) receptorfunktion (engelska) // Genes & Development : journal. - 1999. - Januari ( vol. 13 , nr 1 ). - S. 20-5 . - doi : 10.1101/gad.13.1.20 . — PMID 9887096 .
↑ 1 2 Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M., Perdew GH, Bradfield CA Karakterisering av en delmängd av basic-helix-loop-helix-PAS superfamiljen som interagerar med komponenter av the dioxin signaling pathway (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Mars ( vol. 272 , nr 13 ). - P. 8581-8593 . doi : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . — PMID 9079689 .
↑ 1 2 3 Woods SL, Whitelaw ML Olika aktiviteter av murina singelsinnade 1 (SIM1) och SIM2 på ett hypoxiskt svarselement. Cross-talk mellan grundläggande helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homologi transkriptionsfaktorer (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Mars ( vol. 277 , nr 12 ). - P. 10236-10243 . - doi : 10.1074/jbc.M110752200 . — PMID 11782478 .
↑ 1 2 Beischlag TV, Wang S., Rose DW, Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family av transkriptionskoaktivatorer av arylkolvätereceptorn/arylkolvätereceptorn nukleär translokatorkomplex // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2002. - Juni ( vol. 22 , nr 12 ). - P. 4319-4333 . - doi : 10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002 . — PMID 12024042 .
↑ 1 2 Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Två murina homologer av Drosophila singel-minded protein som interagerar med mus aryl kolvätereceptor nukleära translokatorprotein (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal . - 1997. - Februari ( vol. 272 , nr 7 ). - P. 4451-4457 . doi : 10.1074 / jbc.272.7.4451 . — PMID 9020169 .
↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identifiering av en ny grundläggande helix-loop-helix-PAS-faktor, NXF, avslöjar en Sim2-kompetitiv, positiv regulatorisk roll i dendritisk-cytoskelettmodulator-drebrin genuttryck (engelska) // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2004. - Januari ( vol. 24 , nr 2 ). - s. 608-616 . - doi : 10.1128/mcb.24.2.608-616.2004 . — PMID 14701734 .
↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. Den murina Sim-2-genprodukten hämmar transkription genom aktiv repression och funktionell interferens // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1997. - September ( vol. 17 , nr 9 ). - P. 4933-4947 . - doi : 10.1128/mcb.17.9.4933 . — PMID 9271372 .