IFRD1
Interferonbindande utvecklingsregulator 1 är ett protein som kodas hos människor av IFRD1 -genen . [1] [2] Denna gen uttrycks huvudsakligen i neutrofiler , skelett- och hjärtmuskeln, hjärnan, bukspottkörteln. [1] [2] Hos råttor och möss är homologerna för dessa gener (och deras proteiner) också kända som PC4 [3] respektive Tis21. IFRD1 är en medlem av genfamiljen som innehåller en andra gen, IFRD2, även känd som SKmc15. [1] [2]
Klinisk betydelse
IFRD1 har identifierats som en modifierande gen för en lungsjukdom som cystisk fibros . [fyra]
Induktion av muskelregenerering
IFRD1 (även känd som PC4 eller Tis7, se ovan) är involverad i differentieringen av skelettmuskelceller. Faktum är att hämning av IFRD1-funktionen hos C2C12-myoblaster förhindrar deras morfologiska och biokemiska differentiering genom att hämma uttrycket av MyoD och myogenin , huvudnyckeln för muskelutvecklingsgener. [5] In vivo finns det också en roll för IFRD1 i muskeldifferentiering. Muskler från möss som saknar IFRD1 visar minskade protein-, mRNA-nivåer, MyoD-myogenin och fördröjd regenerering efter muskelskada hos unga möss. [6]
Det har nyligen visat sig att uppreglering av IFRD1 in vivo i skadad muskel förbättrar muskelregenerering genom att öka produktionen av stamala muskelceller (satellitceller). [7] Den underliggande molekylära mekanismen ligger i förmågan hos IFRD1 att samarbeta med MyoD för att inducera MEF2C - transkriptionsaktivitet . Detta beror på förmågan hos IFRD1 att selektivt binda till MEF2C och därmed förhindra dess interaktion med HDAC4. [7] [8] Således verkar IFRD1 fungera som en positiv kofaktor för MyoD. [7] [8] På senare tid har IFRD1 visat sig potentiera muskelregenerering genom en andra MyoD-förstärkande mekanism, d.v.s. genom att undertrycka transkriptionsaktiviteten av NF-kB , som är känd för att hämma ackumuleringen av MyoD i mRNA. IFRD1 undertrycker p65 NF-kB- aktivitet genom att öka HDAC-medierad deacetylering av p65-subenheten, vilket gynnar HDAC3-rekrytering till p65. Faktum är att IFRD1 bildar trimolekylära komplex med p65 och HDAC3. [7]
Således kan IFRD1 inducera muskelregenerering genom att fungera som en nyckelregulator av MyoD genom flera mekanismer. Med tanke på den dramatiska minskningen av myogena celler som förekommer vid degenerativa muskelsjukdomar såsom Duchenne-dystrofi , antyder förmågan hos IFRD1 att potentiera regenereringsprocessen att IFRD1 kan vara ett terapeutiskt mål.
Interaktioner
IFRD1 har visats interagera med flera proteiner i SIN3-komplexet, inklusive SIN3B , SAP30 , NCOR1 och HDAC1 . [9]
Dessutom binder IFRD1- proteinet till MyoD , Mef2c , HDAC4 , HDAC3 och p65-subenheten av NF-kB för att bilda trimolekylära komplex med HDAC3 och p65-proteinerna av NF-kB . [10] [11] IFRD1-proteinet bildar också homodimerer . [åtta]
Anteckningar
- ↑ 1 2 3 Buanne P., Incerti B., Guardavaccaro D., Avvantaggiato V., Simeone A., Tirone F. Kloning av den humana interferonrelaterade utvecklingsregulatorgenen (IFRD1) som kodar för PC4-proteinet, en medlem av en ny familj av utvecklingsreglerade gener (engelska) // Genomics: journal. - 1998. - November ( vol. 51 , nr 2 ). - S. 233-242 . - doi : 10.1006/geno.1998.5260 . — PMID 9722946 .
- ↑ 1 2 3 Entrez-gen: IFRD1-interferonrelaterad utvecklingsregulator 1 . (obestämd)
- ↑ Tirone F., Shooter EM Tidig genreglering av nervtillväxtfaktor i PC12-celler: induktion av en interferonrelaterad gen // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1989. - Mars ( vol. 86 , nr 6 ). - P. 2088-2092 . - doi : 10.1073/pnas.86.6.2088 . — PMID 2467301 .
- ↑ Gu Y., Harley IT, Henderson LB, Aronow BJ, Vietor I., Huber LA, Harley JB, Kilpatrick JR, Langefeld CD, Williams AH, Jegga AG, Chen J., Wills-Karp M., Arshad SH, Ewart SL, Thio CL, Flick LM, Filippi MD, Grimes HL, Drumm ML, Cutting GR, Knowles MR, Karp CL Identifiering av IFRD1 som en modifieringsgen för cystisk fibros lungsjukdom // Nature : journal. - 2009. - April ( vol. 458 , nr 7241 ). - P. 1039-1042 . - doi : 10.1038/nature07811 . — PMID 19242412 .
- ↑ Montagnoli A., Guardavaccaro D., Starace G., Tirone F. Överuttryck av den nervtillväxtfaktorinducerbara PC3-genen omedelbart tidigt är associerad med tillväxthämning // Molecular Cancer Research : journal. - 1996. - Oktober ( vol. 7 , nr 10 ). - P. 1327-1336 . — PMID 8891336 .
- ↑ Vadivelu SK, Kurzbauer R., Dieplinger B., Zweyer M., Schafer R., Wernig A., Vietor I., Huber LA Muskelregenerering och myogena differentieringsdefekter hos möss som saknar TIS7 // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2004. - April ( vol. 24 , nr 8 ). - P. 3514-3525 . - doi : 10.1128/mcb.24.8.3514-3525.2004 . — PMID 15060170 .
- ↑ 1 2 3 4 Micheli L., Leonardi L., Conti F., Maresca G., Colazingari S., Mattei E., Lira SA, Farioli-Vecchioli S., Caruso M., Tirone F. PC4/Tis7/IFRD1 stimulerar skelettmuskelregenerering och är involverad i myoblastdifferentiering som en regulator av MyoD och NF-kappaB // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2011. - Februari ( vol. 286 , nr 7 ). - P. 5691-5707 . - doi : 10.1074/jbc.M110.162842 . — PMID 21127072 .
- ↑ 1 2 3 Micheli L., Leonardi L., Conti F., Buanne P., Canu N., Caruso M., Tirone F. PC4 samaktiverar MyoD genom att lindra den histondeacetylas 4-medierade hämningen av myocytförstärkarfaktor 2C.) // Molekylär och cellulär biologi : journal. - 2005. - Mars ( vol. 25 , nr 6 ). - P. 2242-2259 . - doi : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . — PMID 15743821 .
- ↑ Vietor I., Vadivelu SK, Wick N., Hoffman R., Cotten M., Seiser C., Fialka I., Wunderlich W., Haase A., Korinkova G., Brosch G., Huber LA TIS7 interagerar med däggdjurs SIN3 histondeacetylaskomplex i epitelceller // The EMBO Journal : journal. - 2002. - September ( vol. 21 , nr 17 ). - P. 4621-4631 . - doi : 10.1093/emboj/cdf461 . — PMID 12198164 .
- ↑ Micheli L., Leonardi L., Conti F., Maresca G., Colazingari S., Mattei E., Lira SA, Farioli-Vecchioli S., Caruso M., Tirone F. PC4/Tis7/IFRD1 stimulerar skelettmuskelregenerering och är involverad i myoblastdifferentiering som regulator av MyoD och NF-kappaB // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2011. - Februari ( vol. 286 , nr 7 ). - P. 5691-5707 . - doi : 10.1074/jbc.M110.162842 . — PMID 21127072 .
- ↑ Micheli L., Leonardi L., Conti F., Buanne P., Canu N., Caruso M., Tirone F. PC4 samaktiverar MyoD genom att lindra den histondeacetylas 4-medierade hämningen av myocytförstärkarfaktor 2C // Molecular and Cellular Biologi : journal. - 2005. - Mars ( vol. 25 , nr 6 ). - P. 2242-2259 . - doi : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . — PMID 15743821 .
Litteratur
- Tirone F., Shooter EM Tidig genreglering av nervtillväxtfaktor i PC12-celler: induktion av en interferonrelaterad gen (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1989. - Vol. 86 , nr. 6 . - P. 2088-2092 . - doi : 10.1073/pnas.86.6.2088 . — PMID 2467301 .
- Varnum BC, Lim RW, Herschman HR Karakterisering av TIS7, en gen inducerad i schweiziska 3T3-celler av tumörpromotorn tetradekanoylforbolacetat // Onkogen : journal. - 1989. - Vol. 4 , nr. 10 . - P. 1263-1265 . — PMID 2797820 .
- Guardavaccaro D., Ciotti MT, Schäfer BW, Montagnoli A., Tirone F. Hämning av differentiering i myoblaster som berövats det interferonrelaterade proteinet PC4 // Molecular Cancer Research : journal. - 1995. - Vol. 6 , nr. 2 . - S. 159-169 . — PMID 7756174 .
- Guardavaccaro D., Montagnoli A., Ciotti MT, Gatti A., Lotti L., Di Lazzaro C., Torrisi MR, Tirone F. Nervtillväxtfaktor reglerar den subcellulära lokaliseringen av det nervtillväxtfaktorinducerbara proteinet PC4 i PC12-celler ( Engelska) // Journal of Neuroscience Research : journal. - 1994. - Vol. 37 , nr. 5 . - s. 660-674 . - doi : 10.1002/jnr.490370514 . — PMID 8028043 .
- Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider (engelska) // Gene : journal. - 1994. - Vol. 138 , nr. 1-2 . - S. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
- Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalisering och subtraktion : två metoder för att underlätta genupptäckt // Genomforskning : journal. - 1996. - Vol. 6 , nr. 9 . - s. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
- Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändeberikat cDNA-bibliotek (engelska) // Gene : journal. - 1997. - Vol. 200 , nej. 1-2 . - S. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
- Ge H., Si Y., Roeder RG Isolering av cDNA som kodar för nya transkriptionskoaktivatorer p52 och p75 avslöjar en alternativ regleringsmekanism för transkriptionell aktivering // The EMBO Journal : journal. - 1998. - Vol. 17 , nr. 22 . - P. 6723-6729 . - doi : 10.1093/emboj/17.22.6723 . — PMID 9822615 .
- Wistow G., Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A., Touchman JW, Bouffard G., Smith D., Peterson K. Uttryckt taggsekvensanalys av mänsklig RPE/choroidea för NEIBank-projektet: över 6000 icke-redundanta transkript, nya gener och splitsningsvarianter // Molecular Vision : journal. - 2002. - Vol. 8 . - S. 205-220 . — PMID 12107410 .
- Vietor I., Vadivelu SK, Wick N., Hoffman R., Cotten M., Seiser C., Fialka I., Wunderlich W., Haase A., Korinkova G., Brosch G., Huber LA TIS7 interagerar med däggdjuret SIN3 histondeacetylaskomplex i epitelceller (engelska) // The EMBO Journal : journal. - 2002. - Vol. 21 , nr. 17 . - P. 4621-4631 . - doi : 10.1093/emboj/cdf461 . — PMID 12198164 .
- Roth A., Gill R., Certa U. Temporala experimentella och rumsliga genuttrycksmönster efter stroke i en råttmodell och karakterisering av PC4, en potentiell regulator av transkription // Molecular and Cellular Neuroscience : journal. - 2003. - Vol. 22 , nr. 3 . - s. 353-364 . - doi : 10.1016/S1044-7431(02)00039-8 . — PMID 12691737 .
- Imabayashi H., Mori T., Gojo S., Kiyono T., Sugiyama T., Irie R., Isogai T., Hata J., Toyama Y., Umezawa A. Redifferentiering av dedifferentierade kondrocyter och kondrogenes av mänsklig benmärgsstromal celler via kondrosfärsbildning med uttrycksprofilering genom storskalig cDNA-analys // Experimentell cellforskning : journal. - 2003. - Vol. 288 , nr. 1 . - S. 35-50 . - doi : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . — PMID 12878157 .
- Micheli L., Leonardi L., Conti F., Buanne P., Canu N., Caruso M., Tirone F. PC4 samaktiverar MyoD genom att lindra den histondeacetylas 4-medierade hämningen av myocytförstärkarfaktor 2C // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2005. - Vol. 25 , nr. 6 . - P. 2242-2259 . - doi : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . — PMID 15743821 .
- Vietor I., Kurzbauer R., Brosch G., Huber LA TIS7-reglering av beta-catenin/Tcf-4-målgenen osteopontin (OPN) är histondeacetylasberoende (engelska) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2005. - Vol. 280 , nr. 48 . - P. 39795-39801 . - doi : 10.1074/jbc.M509836200 . — PMID 16204248 .
- Guo H., Gao C., Mi Z., Zhang J., Kuo PC Karakterisering av PC4-bindningsdomänen och dess interaktioner med HNF4alpha // Journal of Biochemistry : journal. - 2007. - Vol. 141 , nr. 5 . - s. 635-640 . - doi : 10.1093/jb/mvm066 . — PMID 17317687 .