Coronavirus (underfamilj)
| Coronavirus | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Svårt akut respiratoriskt syndrom-relaterat coronavirus (SARSCoV) | ||||||
| vetenskaplig klassificering | ||||||
| Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:OrthornaviraeSorts:PisuviricotaKlass:PisoniviricetesOrdning:NidoviralesUnderordning:CornidovirineaeFamilj:CoronavirusUnderfamilj:Coronavirus | ||||||
| Internationellt vetenskapligt namn | ||||||
| Orthocoronavirinae | ||||||
| Synonymer | ||||||
|
||||||
| Baltimore-gruppen | ||||||
| IV: (+)ssRNA-virus | ||||||
| ||||||
Coronaviruses [2] ( lat. Orthocoronavirinae ) är en underfamilj av virus från familjen Coronaviridae [3] som kombinerar höljeförsedda RNA- innehållande pleomorfa [K 1] virus som orsakar ett brett spektrum av sjukdomar av varierande svårighetsgrad hos djur, inklusive människor [4] ] . I de flesta fall är coronavirusinfektioner lindriga, men under 2000-talet har det skett utbrott av allvarliga sjukdomar orsakade av betacoronavirus MERS-CoV och SARS-CoV [4] , samt SARS-CoV-2 . Dessa är virus med en (+) enkelsträngad RNA-gen och en spiralformad nukleokapsid. Genomstorleken hos coronavirus varierar från cirka 27 till 34 kilobaser, det största kända RNA-viruset.
Genom
Coronavirus innehåller ett enkelsträngat sense RNA- genom . Deras genomstorlek varierar från 27 till 34 kilobaser och är en av de största bland RNA-virus. Genomet har ett 5'-metylerat lock och en 3'-polyadenylerad svans. Coronavirus genomisk organisation: 5'-UTR ledarsekvens - replikas / transkriptas - spik (S) - skal (E) - nukleokapsid (N) - 3'UTR - poly(A) svans. Öppna läsramarna 1a och 1b, som upptar de första två tredjedelarna av genomet, kodar för ett replikas/transkriptaspolyprotein. Replikas/transkriptaspolyproteinet självklyver för att bilda icke-strukturella proteiner (nsps). Därefter kommer läsramarna som kodar för de fyra huvudsakliga strukturella proteinerna: spik, hölje, membran och nukleokapsid. Varvat med dessa ramar finns läsramarna för tillbehörsproteiner. Antalet tillbehörsproteiner och deras funktion är olika för olika coronavirus.
Livscykel
Ursprung
Infektion börjar när det virala spike (S) glykoproteinet fäster till sin komplementära värdcellsreceptor. Efter vidhäftning klyver värdcellsproteaset och aktiverar spikproteinet fäst vid receptorn. Beroende på värdcellens tillgängliga proteas tillåter klyvning och aktivering cellen att komma in via endocytos eller direkt fusion av det virala höljet med värdmembranet. Vid penetrering in i värdcellen har den virala partikeln ingen beläggning och dess genom går in i cellens cytoplasma. Coronavirusets RNA-genom har ett 5'-metylerat lock och en 3' polyadenylerad svans, vilket gör att RNA:t kan fästa till värdcellens ribosom för translation. Värdribosomen översätter den ursprungliga överlappande öppna läsramen för det virala genomet och bildar ett långt polyprotein. Polyproteinet har sina egna proteaser som klyver polyproteinet till många icke-strukturella proteiner.
Klassificering
Fram till 2009 slogs representanter för underfamiljen samman till släktet Coronavirus [5] , men 2009 reviderades taxonomin för koronavirus: Coronavirus delades in i 3 släkten ( Alfacoronavirus , Betacoronavirus , Gammacoronavirus ), förenade i underfamiljen Coronavirinae [6] .
International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) från april 2020 identifierar fyra släkten i underfamiljen [7] :
- Släktet Alphacoronavirus (14 undersläkten och 19 arter)
- Släktet Betacoronavirus (5 undersläkten och 14 arter)
- Genus Gammacoronavirus (3 undersläkten och 5 arter)
- Släktet Deltacoronavirus ( 3 subgenera och 7 arter)
Anteckningar
Kommentarer- ↑ Pleomorfa virus är virus som varierar i form och storlek.
- ↑ Taxonomy of Viruses på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ Coronaviruses / Gorbalenya A.E. // Kongo - dop. - M .: Great Russian Encyclopedia, 2010. - S. 352. - ( Great Russian Encyclopedia : [i 35 volymer] / chefredaktör Yu. S. Osipov ; 2004-2017, v. 15). - ISBN 978-5-85270-346-0 .
- ↑ Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Studies historia och modern klassificering av coronavirus (Nidovirales: Coronaviridae) // Infektion och immunitet : vetenskaplig artikel. - 2020. - T. 10 , nr 2 . - S. 221-246 . Arkiverad från originalet den 25 juni 2020.
- ↑ 1 2 Zumla A., Chan JFW, Azhar EI, Hui DSC, Yuen K.-Y. Coronaviruses - läkemedelsupptäckt och terapeutiska alternativ (engelska) // Nature Reviews Drug Discovery . - 2016. - Vol. 15 . - s. 327-347 . - doi : 10.1038/nrd.2015.37 .
- ↑ ICTV Taxonomy History for Coronavirus Arkiverad 9 augusti 2016 på Wayback Machine på ICTV-webbplatsen ( tillgänglig 19 juli 2019) .
- ↑ Revision av familjen Coronaviridae : [ eng. ] // ICTV. — Kod(er) tilldelad: 2008.085-126V. - 2008. - S. 3-6. — Klockan 37.
- ↑ Taxonomy of Viruses på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 25 maj 2020) .