Proteobakterier

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 28 januari 2021; kontroller kräver 4 redigeringar .
Proteobakterier

Escherichia coli
vetenskaplig klassificering
Domän:bakterieSorts:Proteobakterier
Internationellt vetenskapligt namn
Proteobacteria Stackebrandt et al. 1986
Undergrupper

Acidithiobacilla

  • Acidithiobacillales

Alphaproteobacteria
(Alpha proteobacteria)

  • Caulobacterales
  • Kopriimonadales
  • Kordiimonadales
  • Parvularculales
  • Rhizobiales
  • Rhodobacterales
  • Rhodospirillales
  • Rickettsiales
  • Sneathiellales
  • Sphingomonadales

Betaproteobacteria
(Beta-proteobacteria)

  • Burkholderiales
  • Hydrogenophilales
  • Metylofiler
  • Neisseriales
  • Nitrosomonadales
  • Rhodocyclales
  • Procabacteriales

Gammaproteobacteria
(Gamma proteobacteria)

  • Aeromonadales
  • Alteromonadales
  • Cardiobacteriales
  • Chromatiales
  • Enterobacteriales
  • Legionellales
  • Metylokocker
  • Oceanospirillales
  • Pasteurellales
  • Pseudomonadales
  • Thiotrichales
  • Vibrionales
  • Xanthomonadales

Deltaproteobacteria
(Delta proteobacteria)

  • Bdellovibrionales
  • Desulfarculales
  • Desulfobacterales
  • Desulfovibrionales
  • Desulfurellales
  • Desulfuromonadales
  • Myxococcales
  • Syntrophobacterales

Epsilonproteobacteria
(Epsilon-proteobacteria)

  • Campylobacterales
  • Nautiliales

Zetaproteobacteria
(Zeta-proteobacteria)

  • Mariprofundales

Oligoflexi

  • Oligoflexales

Proteobakterier ( lat.  Proteobacteria ) är den mest talrika gruppen av bakterier - 1534 arter eller ungefär en tredjedel av alla kända bakteriearter [1] .

Proteobakterier är en mycket heterogen grupp, denna grupp inkluderar både eukaryota symbionter , såväl som ett stort antal patogena och opportunistiska mikroorganismer , foto- och kemotrofa bakterier, både autotrofa och heterotrofa . Alla proteobakterier är gramnegativa , med ett yttre membran byggt av lipopolysackarid . I gruppen ingår både obligata och fakultativa aeroba och anaeroba bakterier. Rörelsetyperna är också olika, gruppen omfattar både bakterier med flageller , samt orörliga bakterier och bakterier med s.k. "glidande" typ av rörelse.

Morfologiskt är gruppen också heterogen: detta inkluderar stavformade bakterier och kocker och spiralformade bakterier.

Carl Woese pekade ut denna grupp 1987 och kallade den skämtsamt "lila bakterier och deras släktingar" [2] . Gruppen isolerades baserat på analys av 16S rRNA- nukleotidsekvenser , uppkallade efter den antika grekiska guden Proteus , som visste hur man ändrade form efter behag (namnet på proteobakterier återspeglar en mängd olika biokemiska, fysiologiska och morfologiska egenskaper som är inneboende i denna grupp ).

Baserat på reglerna för bakterienomenklaturen är Proteobacterium-taxonen illegitim på grund av frånvaron av en definierad typ av lägre taxon [3] .

Taxonomi

Proteobakterier är indelade i klasser , betecknade med bokstäverna i det grekiska alfabetet: Alfa- , Beta- , Gamma- , Delta- och Epsilonproteobacteria . Indelningen i klasser gjordes också på basis av analysen av 16S rRNA . Klasserna alfa, beta, delta och epsilon proteobakterier är monofyletiska [4] [5] [6] . Släktet Acidithiobacillus  från klassen Gammaproteobacteria överfördes till klassen Acidithiobacilli 2013 [7] . Enligt nyare data är detta släkte parafyletisk med avseende på beta-proteobakterier [8] . Relativt nyligen beskrevs den sjätte klassen - zeta-proteobakterier ( Zetaproteobacteria ), vars representant hittills är den enda arten (isolerad i ren kultur) - Mariprofundus ferrooxydans [9] , en järnoxiderande neutrofil kemolitoautotrof, som först upptäcktes nära Loihi- vulkanen i 1996 [10] .

Alpha proteobacteria

Klassen av alfa-proteobakterier inkluderar ett stort antal fototrofer, den inkluderar också symbionter av eukaryoter ( Rhizobium ), obligata intracellulära parasiter ( Rickettsia , Wolbachia ), ättiksyrabakterier ( Acetobacter , Gluconacetobacter ), bakterier som kan mobiliseras ( Zymomona ) metylotrofer ( Methylobacteriaceae ) . Den förmodade förfadern till mitokondrierna kommer också från denna grupp.

Beta-proteobakterier

Denna klass inkluderar aeroba och fakultativa anaeroba bakterier. Detta inkluderar både kemoorganoheterotrofer och kemolitoautotrofer (t.ex. stadium I nitrifierare Nitrosomonadaceae , thiobacteria Thiobacillus ), fototrofa släkten ( Rhodocyclus och Rubrivivax ). Även inkluderade i denna grupp är smittämnen: Burkholderia mallei (orsakande medel för körtlar ) och Burkholderia pseudomallei (orsakande medel för melioidosis ), Bordetella pertussis (orsakande medel för kikhosta ) och släktet Neisseria (patogener av meningit och gonorré ).

Gamma proteobacteria

Denna klass inkluderar både fototrofa bakterier (till exempel Chromatium  - lila svavelsyrefria bakterier), metanotrofer (till exempel Methylococcus capsulatus ) och bakterier av klinisk och vetenskaplig betydelse - familjerna Enterobacteriaceae , Vibrionaceae , Pseudomonadellaceaee , Paciionellaceaeae , Paciionellaceaeaee och Franciscus . Denna grupp inkluderar sådana patogener av särskilt farliga infektioner: Yersinia pestis , Francisella tularensis , Haemophilus influenzae , Legionella pneumophila och Vibrio cholerae , såväl som en så viktig modellorganism ur vetenskaplig synvinkel som Escherichia coli .

Delta-proteobacteria

Denna grupp inkluderar sådana välkända bakterier som myxobakterier , som kan glida i rörelse och bilda flercelliga fruktkroppar , såväl som välkända sulfatreducerande bakterier ( Desulfovibrio , Desulfobacter , Desulfococcus , Desulfonema ) och svavelbakterier ( Desulfuromonas ). Detta inkluderar även anaeroba järnbakterier ( Geobacter ). Det inkluderar också kända rovdjursbakterier av släktet Bdellovibrio , obligata intracellulära bakterier av släktet Lawsonia , kemolitotrofer av släktet Hippea , som kan använda svavel och väte som energikälla. Klassen omfattar både aeroba och anaeroba bakterier, fakultativa anaerober är inte kända i denna klass. De flesta anaerober kan använda oorganiska elektronacceptorer och på så sätt utföra anaerob andning . Representanter för klassen spelar en viktig roll i kretsloppet av element i naturen.

Epsilon Proteobacteria

Detta inkluderar ordningen Campylobacterales med familjerna Campylobacteraceae och Helicobacteraceae , inklusive det geokemiskt viktiga släktet Sulfurospirillum [11] , det orsakande medlet för mänskliga sår , Helicobacter pylori . Också inkluderade är Wolinella idisslares matsmältningskanal symbionter .

Phylogeny of Proteobacteria

Anteckningar

  1. ↑ Jordlivsnätet, proteobakterierna . Hämtad 16 augusti 2008. Arkiverad från originalet 11 oktober 2008.
  2. ↑ Woese CR Bakteriell evolution  //  Microbiology and Molecular Biology Reviews. — American Society for Microbiology, 1987. - Vol. 51 , nr. 2 . - S. 221-271 . — PMID 2439888 .
  3. ↑ Beställningar av nomenklaturtyp: nödvändiga korrigeringar enligt reglerna 15 och 21a i den bakteriologiska koden (1990 års revision), och beteckning av lämplig nomenklaturtyp ... (länk otillgänglig) . Hämtad 16 augusti 2008. Arkiverad från originalet 7 september 2008. 
  4. ↑ Noel R. Krieg, Don J. Brenner, James T. Staley. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Proteobacteria  (engelska) . - Springer, 2005. - ISBN 978-0-387-95040-2 .
  5. ↑ Ciccarelli, F.D.; Doerks, T; Von Mering, C; Creevey, CJ; Snel, B; Bork, P. Mot automatisk rekonstruktion av ett högt upplöst livsträd  (engelska)  // Science : journal. - 2006. - Vol. 311 , nr. 5765 . - P. 1283-1287 . - doi : 10.1126/science.1123061 . — PMID 16513982 .
  6. ↑ Yarza, P; Ludwig, W; Euzéby, J; Amann, R; Schleifer, KH; Glöckner, F.O.; Rosselló-Móra, R. Uppdatering av All-Species Living Tree Project baserat på 16S och 23S rRNA-sekvensanalyser  //  Systematisk och tillämpad mikrobiologi: tidskrift. - 2010. - Vol. 33 , nr. 6 . - S. 291-299 . - doi : 10.1016/j.syapm.2010.08.001 . — PMID 20817437 . .
  7. ↑ Williams, KP; Kelly, DP Förslag till en ny klass inom phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., med typordningen Acidithiobacillales, och ändrad beskrivning av klassen Gammaproteobacteria  //  International journal of systematic and evolutionary microbiology: journal. - 2013. - Vol. 63 , nr. Pt 8 . - P. 2901-2906 . - doi : 10.1099/ijs.0.049270-0 . — PMID 23334881 .
  8. ↑ Williams, KP; Gillespie, JJ; Sobral, BWS; Nordberg, E.K.; Snyder, EE; Shallom, JM; Dickerman, A.W.  Phylogeny of Gammaproteobacteria  // American Society for Microbiology. — American Society for Microbiology, 2010. - Vol. 192 , nr. 9 . - P. 2305-2314 . - doi : 10.1128/JB.01480-09 . — PMID 20207755 .
  9. ↑ Genus Mariprofundus  : [ eng. ]  // LPSN .
  10. ↑ Emerson D. , Moyer CL Neutrofila Fe-oxiderande bakterier är rikliga vid Loihi Seamount hydrotermiska ventiler och spelar en viktig roll i Fe-oxidavsättning.  (engelska)  // Tillämpad och miljömikrobiologi. - 2002. - Vol. 68, nr. 6 . - P. 3085-3093. — PMID 12039770 .
  11. ↑ [https://web.archive.org/web/20080502223344/http://www.nature.com/nrmicro/journal/v4/n6/abs/nrmicro1414.html Arkiverad 2 maj 2008 på Wayback Machine Den mångsidiga [epsi]-proteobacteria: nyckelspelare i sulfidiska livsmiljöer: Sammanfattning: Naturrecensioner Mikrobiologi]

Se även

Länkar