Histon deacetylas 7

Tillgängliga strukturer

Ortologisk sökning: PDBe RCSB

Lista över PDB-ID
3C0Y , 3C0Z , 3C10 , 3ZNR , 3ZNS

Identifierare

Symboler

HDAC7 , HD7A, HDAC7A, HD7, histondeacetylas 7

Externa ID:n

OMIM: 606542 MGI: 1891835 HomoloGene: 9124 GeneCards: 51564

Relaterade ärftliga sjukdomar

Sjukdomens namn

Länkar

fetma


[ett]

Genontologi
Funktioner	• metalljonbindning • GO:0001106 transkriptionskorepressoraktivitet • proteinkinasbindning • 14-3-3-proteinbindning • hydrolasaktivitet • proteinkinas C-bindning • kromatinbindning • histondeacetylasaktivitet • NAD-beroende histondeacetylasaktivitet (H3-K14-specifik ) • GO:0001948, GO:0016582 plasmaproteinbindning • SUMO-transferasaktivitet
cellkomponent	• nukleoplasma • cytoplasma • cellkärna • histondeacetylaskomplex • cytosol
biologisk process	• transkription, DNA-beroende • negativ reglering av NIK/NF-kappaB-signalering • positiv reglering av cellmigration involverad i spirande angiogenes • cell-cellövergångssammansättning • vaskulogenes • GO:1901227 negativ reglering av transkription av RNA-polymeras II • histon H3-deacetylering • negativ reglering av osteoblastdifferentiering • negativ reglering av interleukin-2-produktion • GO:0009373 DNA-beroende reglering av transkription • histondeacetylering • GO:0045996 negativ reglering av transkription, DNA-mallerad • GO:0031497, GO:0006336, GO:0006336, GO:0006336 0034724 , GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 kromatinorganisation • proteinsumoylering
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Typer

Mänsklig

Mus

Entrez


51564


56233

Ensemble


ENSG00000061273


ENSMUSG00000022475

UniProt


Q8WUI4


Q8C2B3

RefSeq (mRNA)


NM_001098416 NM_001308090 NM_015401 NM_016596 NM_001368046

NM_001204275 NM_001204276 NM_001204277 NM_001204278 NM_001204279
NM_001204280 NM_001204281 NM_019572 NM_001378971

RefSeq (protein)


NP_001091886 NP_001295019 NP_056216 NP_001354975

NP_001191204 NP_001191205 NP_001191206 NP_001191207 NP_001191208
NP_001191209 NP_001191210 NP_062518 NP_001365900

Locus (UCSC)

Chr 12: 47,78 – 47,83 Mb

Chr 15: 97,69 – 97,74 Mb

PubMed- sökning

[2]

[3]

Redigera (människa)

Redigera (mus)

Histoneacetylas 7 ( Histoneacetylas 7 ) är ett enzym som kodas hos människor av HDAC7 -genen [1] [2] [3] .

Funktion

Histoner spelar en avgörande roll i regleringen av transkription , cellcykeln och utvecklingsprocesser. Acetylering/deacetylering av histoner förändrar kromosomernas struktur och påverkar transkriptionsfaktorernas tillgång till DNA . Proteinet som kodas av denna gen delar sekvenshomologi med medlemmar av histon-deacetylasfamiljen. Denna gen är ortolog mot mus-HDAC7-genen, ett protein som stimulerar undertryckandet av medieringen av den transkriptionella corepressorn SMRT. Flera alternativa splitsningsvarianter som kodar för flera isoformer har hittats för denna gen [3] .

Interaktioner

HDAC7A har visat sig interagera med:

BCL6 [4] ,
Endotelin typ A-receptor [5] ,
HDAC3 [6] ,
HTATIP [7] ,
IKZF1 [8] och
NCOR1 [6] .

Se även

Histon deacetylaser

Anteckningar

↑ Marks PA, Richon VM, Rifkind RA Histondeacetylashämmare: inducerare av differentiering eller apoptos av transformerade celler // Journal of the National Cancer Institute : journal. - 2000. - Augusti ( vol. 92 , nr 15 ). - P. 1210-1216 . doi : 10.1093 / jnci/92.15.1210 . — PMID 10922406 .
↑ Kao HY, Downes M., Ordentlich P., Evans RM Isolering av ett nytt histondeacetylas avslöjar att klass I och klass II deacetylaser främjar SMRT-medierad repression // Genes & Development : journal . - 2000. - Januari ( vol. 14 , nr 1 ). - S. 55-66 . - doi : 10.1101/gad.14.1.55 . — PMID 10640276 .
↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC7A-histondeacetylas 7A . (obestämd)
↑ Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Histon-deacetylaser av klass II rekryteras direkt av BCL6-transkriptionsrepressor // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Juni ( vol. 277 , nr 24 ). - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
↑ Lee HJ, Chun M., Kandror KV Tip60 och HDAC7 interagerar med endotelinreceptorn a och kan vara involverade i nedströms signalering // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - Maj ( vol. 276 , nr 20 ). - P. 16597-16600 . - doi : 10.1074/jbc.C000909200 . — PMID 11262386 .
↑ 1 2 Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7-histondeacetylasaktivitet är associerad med HDAC3 in vivo // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - September ( vol. 276 , nr 38 ). - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
↑ Xiao H., Chung J., Kao HY, Yang YC Tip60 är en co-repressor för STAT3 // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Mars ( vol. 278 , nr 13 ). - P. 11197-11204 . - doi : 10.1074/jbc.M210816200 . — PMID 12551922 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. En molekylär dissektion av Ikaros repressionskretsar // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Augusti ( vol. 277 , nr 31 ). - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .

Litteratur

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klass II histon-deacetylaser: mångsidiga regulatorer // Trends in Genetics : journal. - Cell Press , 2003. - Maj ( vol. 19 , nr 5 ). - s. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider (engelska) // Gen : journal. - Elsevier , 1994. - Januari ( vol. 138 , nr 1-2 ). - S. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändeberikat cDNA - bibliotek // Gene : journal. - Elsevier , 1997. - Oktober ( vol. 200 , nr 1-2 ). - S. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
Lee HJ, Chun M., Kandror KV Tip60 och HDAC7 interagerar med endotelinreceptorn a och kan vara involverade i nedströms signalering // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - Maj ( vol. 276 , nr 20 ). - P. 16597-16600 . - doi : 10.1074/jbc.C000909200 . — PMID 11262386 .
Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7-histondeacetylasaktivitet är associerad med HDAC3 in vivo // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - September ( vol. 276 , nr 38 ). - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Histon-deacetylaser av klass II rekryteras direkt av BCL6-transkriptionsrepressor // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Juni ( vol. 277 , nr 24 ). - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
Bryant H., Farrell PJ Signaltransduktion och transkriptionsfaktormodifiering under reaktivering av Epstein-Barr-virus från latens // Journal of Virology : journal. - 2002. - Oktober ( vol. 76 , nr 20 ). - P. 10290-10298 . doi : 10.1128/ JVI.76.20.10290-10298.2002 . — PMID 12239305 .
Xiao H., Chung J., Kao HY, Yang YC Tip60 är en co-repressor för STAT3 // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Mars ( vol. 278 , nr 13 ). - P. 11197-11204 . - doi : 10.1074/jbc.M210816200 . — PMID 12551922 .
Dequiedt F., Kasler H., Fischle W., Kiermer V., Weinstein M., Herndier BG, Verdin E. HDAC7, en tymusspecifik klass II-histondeacetylas , reglerar Nur77-transkription och TCR-medierad apoptos / Immunitet: journal. - Cell Press , 2003. - Maj ( vol. 18 , nr 5 ). - s. 687-698 . - doi : 10.1016/S1074-7613(03)00109-2 . — PMID 12753745 .
Lee CH, Chawla A., Urbiztondo N., Liao D., Boisvert WA, Evans RM, Curtiss LK Transcriptional repression of aterogenic inflammation: modulering by PPARdelta // Science : journal. - 2003. - Oktober ( vol. 302 , nr 5644 ). - s. 453-457 . - doi : 10.1126/science.1087344 . — PMID 12970571 .
Li X., Song S., Liu Y., Ko SH, Kao HY Fosforylering av histondeacetylas 7 modulerar dess stabilitet och association med 14-3-3-proteiner // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Augusti ( vol. 279 , nr 33 ). - P. 34201-34208 . - doi : 10.1074/jbc.M405179200 . — PMID 15166223 .
Kato H., Tamamizu-Kato S., Shibasaki F. Histondeacetylas 7 associerar med hypoxiinducerbar faktor 1alfa och ökar transkriptionsaktiviteten // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Oktober ( vol. 279 , nr 40 ). - P. 41966-41974 . - doi : 10.1074/jbc.M406320200 . — PMID 15280364 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M., Schwartz D., Elias JE, Villén J., Li J., Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner // Proceedings of the National Academy of Sciences of the Amerikas förenta stater : tidskrift. - 2004. - Augusti ( vol. 101 , nr 33 ). - P. 12130-12135 . - doi : 10.1073/pnas.0404720101 . — PMID 15302935 .
Jin J., Smith FD, Stark C., Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S., Metalnikov P., O'Donnell P., Taylor P., Taylor L., Zougman A., Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T. Proteomisk, funktionell och domänbaserad analys av in vivo 14-3-3-bindande proteiner involverade i cytoskelettreglering och cellulär organisation // Current Biology : journal . - Cell Press , 2004. - Augusti ( vol. 14 , nr 16 ). - P. 1436-1450 . - doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . — PMID 15324660 .

Länkar

MeSH HDAC7A+protein,+människa