Membranproteiner
Membranproteiner är proteiner som är inbäddade i eller associerade med cellmembranet eller membranet i en cellorganell . Cirka 25 % av alla proteiner är membranproteiner. [ett]
Klassificering
Membranproteiner kan klassificeras enligt topologiska eller biokemiska principer. Den topologiska klassificeringen baseras på hur många gånger proteinet passerar lipiddubbelskiktet. Enligt detta kriterium klassificeras proteiner i monotopa , bitopiska och polytopiska :
- monotopa proteiner interagerar med en membranyta och korsar den inte;
- bitopiska penetrerar membranet genom och interagerar med båda dess ytor;
- polytopisk penetrera membranet flera gånger (multipel interaktion med lipider).
Monotopiskt hänvisar till perifera proteiner, medan andra är integrerade.
Topologisk klassificering
I förhållande till membranet delas membranproteiner in i poly- och monotopa.
- Polytopa eller transmembrana proteiner spänner helt över membranet och interagerar således med båda sidor av lipiddubbelskiktet. Som regel är det transmembrana fragmentet av ett protein en alfahelix , bestående av hydrofoba aminosyror (möjligen från 1 till 20 sådana fragment). Endast i bakterier , såväl som i mitokondrier och kloroplaster , kan transmembranfragment organiseras som en beta-arkstruktur (från 8 till 22 varv av polypeptidkedjan).
- Integrala monotopa proteiner är permanent inbäddade i lipiddubbelskiktet, men är anslutna till membranet endast på ena sidan utan att penetrera till den motsatta sidan.
Biokemisk klassificering
Enligt den biokemiska klassificeringen delas membranproteiner in i integrala och perifera .
- Integrerade membranproteiner är fast inbäddade i membranet och kan endast avlägsnas från lipidmiljön med rengöringsmedel eller opolära lösningsmedel. I förhållande till lipiddubbelskiktet kan integrala proteiner vara transmembranpolytopa eller integrala monotopa.
- Perifera membranproteiner är monotopa proteiner. De är antingen bundna av svaga bindningar till lipidmembranet eller är associerade med integrala proteiner genom hydrofoba, elektrostatiska eller andra icke-kovalenta krafter. Sålunda, till skillnad från integrala proteiner, dissocierar de från membranet när de behandlas med en lämplig vattenlösning (t.ex. lågt eller högt pH, hög saltkoncentration eller kaotropt medel). Denna dissociation kräver inte förstörelse av membranet.
Membranproteiner kan byggas in i membranet på grund av fettsyra- eller prenylrester eller glykosylfosfatidylinositol fäst vid proteinet under deras post-translationella modifiering .
Länkar
- ↑ Stevens TJ och Arkin IT (2000) Har mer komplexa organismer en större andel membranprotein i sina genom?, Proteins , vol. 39 (4):417-420
- [www.xumuk.ru/encyklopedia/2502.html Biologiska membran]