Haplogrupp E (Y-DNA)

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 24 november 2020; kontroller kräver 17 redigeringar .
Haplogrupp E
Sorts Y-DNA
Utseendetid 55000-50000 f.Kr e. [ett]
Spawn plats Östafrika [ 2] eller Asien [3]
Anfäders grupp Haplogrupp DE
systergrupper D
Subklader El, E2
Markörmutationer SRY4064, M96, M40, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162, P168, P169, P170, P171, P172, P173, P174, P175, P176)

Haplogrupp E (M96) är en human Y-kromosom haplogrupp . Tillsammans med haplogrupp D är den en av två linjer i den gamla haplogruppen DE för 68 500 år sedan. I sin tur haplogrupp E 65 200 l. n. är uppdelad i två undergrupper: E1-P147 och E2-M75 .

Ursprung

Haplogrupp E kommer från en mutation av den Y-kromosomala haplogruppen DE , som inträffade hos en man som levde för 65,2 tusen år sedan. Livstiden för den gemensamma förfadern för alla levande bärare av Y-kromosomala haplogruppen E är 53,1 tusen år sedan (datumen bestäms av SNPs av YFull [4] ).

Enligt Semino et al.s tidiga hypotes (Semino et al. 2004) har haplogrupp E sitt ursprung i Östafrika, vilket framgår av koncentrationstätheten av dess underkläder i Afrika idag [5] . Å andra sidan anser Chandrasekar et al (2007) att det faktum att alla stora Y-haplogrupper härrörande från CT-M168 inte har sitt ursprung i Afrika (inklusive Haplogrupp E:s syster haplogrupp D , som bara finns i Asien) antyder att E ursprungligen har sitt ursprung i Asien och fördes senare till Afrika av en våg av återvandring från Levanten . Åtminstone delvis är hans slutsatser baserade på publiceringen av Hammer et al., 1997 [3] . Å andra sidan framtvingade data från Hammer, Karafet et al. (2008) en betydande revidering av kronologin för uppkomsten av Y-haplogrupper, vilket "tvingar oss att tolka det geografiska ursprunget för forntida underklasser på ett nytt sätt" [ 1] . I synnerhet tror de att haplogrupp E har sitt ursprung i Afrika för cirka 50 tusen år sedan (det vill säga äldre än man tidigare trott), trots att en del av dess moderhaplogrupp DE (som blev stamfader till grupp D) lämnade Afrika för cirka 65 tusen år sedan, vilket sammanfaller med migrationen av moderna människor från Afrika [6] . Enligt en annan uppskattning är livslängden för en gemensam förfader för alla levande bärare av Y-kromosomhaplogruppen E (TMRCA) inte 54,2 tusen, utan ca. 43,8 tusen år sedan (Chuan-Chao Wang och Li Hui. 2014), medan DE-haplogruppen och CT-superhaplogruppen dök upp utanför Afrika [7] .

2016 visade Poznick och Underhill att den Y-kromosomala haplogruppen E har sitt ursprung utanför Afrika, och den gemensamma förfadern till alla icke-afrikanska linjer (TMRCA), inklusive haplogrupperna DE och CF , levde ~76 kb. n. Efter att bärarna av haplogrupp E anlände till Afrika började dess differentiering på den svarta kontinenten för 58 tusen år sedan [8] , enligt andra uppskattningar - för 65,5 ± 8,5 tusen år sedan [9] .

En explosiv tillväxt i antalet bärare av två oberoende härstamningar av subclade E1b1a1a1-M180/P88 (CTS1847, V43) inträffade för cirka 5 tusen år sedan i Afrika söder om Sahara. Med tiden sammanfaller denna händelse med den skarpa spridningen av bantutalande stammar som registrerats av arkeologer , där haplogrupp E råder [8] [10] . Expansionen av bärare av haplogrupp E raderade en betydande del av spåren av paleolitiska och tidigneolitiska händelser på nivån av genetisk mångfald av Y-kromosomala linjer (haplogroups A och B ) och på nivån av antropologiska egenskaper hos befolkningen [11] .


total;

1) Ättlingarna till DE under perioden 68500-65200 levde i Mellanöstern. Detta antagande är rent hypotetiskt. Endast två lovande ättlingar överlevde krisen 65200.

2) D:s förfäder från Mellanöstern gick långt österut, till Östasien.

3) Yes förfäder gick in i Afrika. E-mutationsbäraren levde troligen i Afrika för 65 200 år sedan.

4) För 52 300 år sedan inträffade en annan kris och av alla ättlingar till E överlevde bara två, vars ättlingar började spridas över fastlandet från Östafrika.

Paleogenetik

Subclade E1b1b1a1 (M-78) hittades i mechtoider från den marockanska Taforalt (inklusive subclade E1b1b1a1b1 i prov TAF009, för 14,8–13,9 tusen år sedan) [12] .

E1b1 subclade finns i representanter för den epipaleolitiska Natufian kulturen , en pre-keramik neolitisk B-kultur [13] .

E1b1b1b2 bestämdes från det eneolitiska (4500-3900/3800 f.Kr.) provet I1171 från den israelitiska Peqi'in-grottan [14] .

Haplogrupp E hittades i två representanter för Cardiac Pottery-kulturen : från Avellanergrottan i Katalonien (Spanien) - subclade E-V13 (E1b1b1a1b1a) i åldern 5000 f.Kr. [ 15] och från den kroatiska Zemunica-grottan - subclade E1b1b1a1b år 501 år BC 16] .

Haplogrupp E identifierades i en representant för Trypillia-kulturen från Verteba- grottan (Ternopil-regionen) [16] .

Haplogrupp E1b1a2 [16] hittades i en invånare i den etiopiska grottan Mota, som levde för 4500 år sedan [17] .

Hos farao Ramesses III uppskattades den Y-kromosomala haplogruppen med hög grad av säkerhet enligt prediktorprogrammet som E1b1a (M2) [18] .

Subclade E1b1b1 (M35/78 [19] ) hittades i en mumie från egyptiska Abusir [20] .

E1b1b1-M35 identifierades i två neolitiska invånare i Marocko (5300-4800 f.Kr.) [21] .

E1b1b1a1b1 identifierades i en representant för El Argar-kulturen (BAS025, 2000-1750 f.Kr.) [22] .

E1b1b1b1 identifierades i provet UE2298/MS060 från en islamisk begravningsplats från 1000-talet i staden Segorbe (Castellón, Valencia, Spanien) [23] .

E1b1b1-M35.1 (enligt NGS) eller E1b1b1a1a2-V13 (prediktor för Y-haplogruppen enligt NevGen ) identifierades hos en man från Chopped City i Yaroslavl (individ nr 7 från massgrav nr 76, 1238) [24] .

E1b1b1a1b1a5a1~-L540 identifierades i exemplaret KRA005 från Krakauer Berg i Östtyskland, som är den mest väst-centraleuropeiska/germanska förskjutna individen i Krakauer Berg-gruppen och dateras till omkring 1400 [25] .

E1b1b1b2-PF1961/Z830 identifierades hos en afrikan från Kenya som levde för 400 år sedan [26] .

E1b1a1a1c1b-M263.2, E1b1a1a1d1-P278.1 (E-M4254), E1b1a1a1c1a1c-CTS8030 identifierades i tre slavar (SJN001, SJN002 och SJN002 och SJN002 och SJN002 som levde i 2700-talet) [2700-talet ] i Mexico City .

Distribution

E1a och E2 förekommer nästan uteslutande i Afrika, med endast E1b1b1 -M35.1/PF1944.1 som förekommer vid hög frekvens i Europa och västra Asien, tillsammans med Afrika. De flesta afrikaner i regionen söder om Sahara (söder om Saharaöknen ) tillhör andra underklasser av haplogruppen E1 än E1b1b1, medan de flesta icke-afrikanska E1-bärare tillhör underklassen E1b1b1 [28] .

E*

En oklassificerad haplogrupp E* hittades i en sydafrikan [1] och en hane från västra Indien. [3]

E1

E1a

Även om inga exempel på E1* ännu har hittats, är dess underklass E1a (M33) vanligast i Västafrika, och är nu vanligast i Mali- regionen . Enligt en studie är haplogruppen E1a-M33 representerad i 34 % (15 personer av ett urval på 44 personer) av den manliga befolkningen i Mali. Haplogrupp E1a har också hittats bland exemplar insamlade från marockanska berber , saharawier , människor från Burkina Faso , norra Kamerun , Senegal , Sudan , Egypten och Kalabrien (både italienare och albaner ). [5] [29]

En liten närvaro (<4%) av E1a-haplogruppen i Nordafrika och Europa förknippas vanligtvis med den afrikanska slavhandeln. [5]

E1b

Hittills har inga fall av E1b* hittats. Denna klass domineras av underklassen E1b1 (E-P2 eller E-PN2), som är mycket vanligare än de andra underklasserna. En annan underklass, E1b2 (P75), en underklass till E1b, är mycket sällsyntare.

E1b1

E1b1, även känd som E-P2 eller E-PN2, utgör majoriteten av nuvarande ättlingar till haplogrupp E. Den delas upp i två haplogrupper: E1b1b (M215) för cirka 24-27 tusen år sedan (Cruciani et al. 2004), och senare E1b1a (L222.1) cirka 10 tusen år senare. De viktigaste underklasserna listas nedan.

E1b1a

E1b1a finns nästan uteslutande i västra, centrala och södra Afrika. Detta är den enda Y-haplogruppen som är gemensam för hela Afrika söder om Sahara, såväl som för ättlingar till afrikanska slavar i Amerika och Karibien. På andra håll förekommer den med försvinnande låg frekvens, och dess närvaro förklaras vanligtvis av den slavhandel som araberna bedrev under medeltiden.

Enligt YFulls beräkningar bildades E1b1a-V38 för 41 300 år sedan [30] .

Rosa et al. (2007) föreslår att haplogruppen E1b1a har sitt ursprung i Västafrika [31] , där dess största genetiska mångfald observeras. Andelen av haplogruppen E1b1a i befolkningarna i Västafrika når nu 80%, där den representeras av undergruppen E1b1a1 (M2) .

Haplogrupp E1b1a2 (M329) är en av två fallande undergrupper av haplogrupp E1b1a och finns bland 1-3% av invånarna i Etiopien och Qatar .

E1b1b

E1b1b (M215)  - den vanligaste Y-kromosomhaplogruppen bland invånarna i Etiopien , Somalia , Eritrea och nordafrikanska berber och araber , är samtidigt den tredje vanligaste haplogruppen i Västeuropa. [32] Den är också vanlig i Mellanöstern , varifrån den spred sig till Balkan och vidare in i Europa .

Enligt YFulls beräkningar bildades E1b1b-M215 för 41 500 år sedan [33] .

Haplogrupp E1b1b1-M35 är den huvudsakliga undergruppen av haplogrupp E1b1b . En ovanligt hög koncentration av E1b1b1 för Europa (41%) finns i sub- etnos Pasiego ( Kantabrien ).

E1b2

E1b2 (P75) förmodligen väldigt få. Upptäckten av haplogrupp E1b2 (P75) tillkännagavs av Hammer et al. 2003 [34] och bekräftades av Karafet et al. 2007. [35]

E2

E2 (M75) finns i Afrika söder om Sahara, både öster och väster. Den högsta koncentrationen av haplogrupp E2 hittades bland bantufolken som bodde i Kenya och Sydafrika. Med en genomsnittlig frekvens observerades denna haplogrupp i befolkningen i Burkina Faso , hutuerna och tutsierna i Rwanda , de madagaskiskaMadagaskar , de Fon- folket från Benin , det irakiska folket från Tanzania , [36] mindre ofta - i separata Khoisan- befolkningar , i Sudan , i norra Kamerun och i Senegal , och även med en liten frekvens - i Qatar , Oman och bland oromofolket i Etiopien ). [5] [29] [37]

Haplogroup E2 finns med låg frekvens i Oman och Qatar (<5%), liksom bland Oromo (<2%), vilket kan förklaras av slavhandeln som bedrivs av araberna, samt bantuernas expansion . [29] [38]

Kända medlemmar av haplogrupp E

Anteckningar

  1. 1 2 3 Karafet et al. (2008), Abstrakt nya binära polymorfier omformar och ökar upplösningen av det mänskliga Y-kromosomala haplogruppsträdet Arkiverad 7 juni 2008 på Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  2. Semino et al. (2004), "Ursprung, diffusion och differentiering av Y-kromosomhaplogrupper E och J: slutsatser om neolitisering av Europa och senare migrerande händelser i Medelhavsområdet," American Journal of Human Genetics 74:1023–1034, 2004.
  3. 1 2 3 Chandrasekar et al. (2007), YAP-insättningssignatur i Sydasien Arkiverad 7 november 2017 på Wayback Machine , 1: Ann Hum Biol. 2007 sep-okt;34(5):582-6.
  4. E YTree . Hämtad 23 juli 2016. Arkiverad från originalet 9 oktober 2020.
  5. 1 2 3 4 Semino et al. 2004
  6. Forskare omformar Y-kromosom-haplogruppträdet och får nya insikter om mänskliga härkomst Arkiverad 22 november 2008 på Wayback Machine . Publiceringsdatum: 1 april 2008
  7. Chuan-Chao Wang , Li Hui . Jämförelse av Y-kromosomala härstamningsdatering med antingen evolutionära eller genealogiska Y-STR-mutationshastigheter , bioRxiv publicerad online 3 maj 2014
  8. 1 2 Posnik GD et al. (2016) Punkterade utbrott i mänsklig manlig demografi härleddes från 1 244 världsomspännande Y-kromosomsekvenser Arkiverade 28 maj 2017 på Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 .
  9. Vicente M Cabrera et al. Bärare av mitokondrie-DNA-makrohaplogrupp L3-grundlinjer migrerade tillbaka till Afrika från Asien för cirka 70 000 år sedan Arkiverad 14 januari 2018 på Wayback Machine 13 december 2017
  10. Genetiker har upptäckt fem forntida fäder av hela mänskligheten . Datum för åtkomst: 17 september 2016. Arkiverad från originalet 24 september 2016.
  11. Stepanov V. A., Kharkov V. N., Puzyrev V. P. Evolution och fylogeografi av mänskliga Y-kromosomlinjer Arkivkopia daterad 20 oktober 2016 på Wayback Machine // VOGiS Bulletin, 2006, Vol. Research Institute of Medical Genetics, Tomsk Scientific Branch, Tomsk Scientific Branch vid Ryska akademin för medicinska vetenskaper, Tomsk, Ryssland
  12. M. van de Loosdrecht el al. Pleistocena nordafrikanska genom länkar samman afrikanska mänskliga populationer i Mellanöstern och söder om Sahara , Science (2018).
  13. Iosif Lazaridis et al. Den genetiska strukturen för världens första bönder, 2016. Arkiverad 16 juli 2018 på Wayback Machine
  14. Éadaoin Harney et al. Forntida DNA från det kalkolitiska Israel avslöjar betydelsen av befolkningsblandning i kulturell transformation Arkiverad 20 augusti 2018 på Wayback Machine , 2018
  15. Lacan et al. (31 oktober 2011). "Forntida DNA tyder på den ledande rollen som spelas av män i den neolitiska spridningen" Arkiverad 21 februari 2014 på Wayback Machine
  16. 1 2 3 Iain Mathieson et al. Sydöstra Europas genomiska historia   // bioRxiv . - 2017. - 9 maj. - doi : 10.1101/135616 .
  17. ↑ Det forntida etiopiska genomet avslöjar omfattande eurasisk blandning över hela den afrikanska kontinenten, 2015. . Hämtad 9 oktober 2015. Arkiverad från originalet 10 oktober 2015.
  18. 1 2 Zahi Hawass et al. Återbesök Ramesses III:s haremskonspiration och död: antropologisk, kriminalteknisk, radiologisk och genetisk studie (Publicerad 17 december 2012) Arkiverad 2 februari 2013 på Wayback Machine
  19. Jean-Philippe Gourdine, SOY Keita, Jean-Luc Gourdine, Alain Anselin . Forntida egyptiska genom från norra Egypten: Ytterligare diskussion Arkiverad 18 augusti 2018 på Wayback Machine
  20. Verena J. Schuenemann et al. Forntida egyptiska mumiegenom tyder på en ökning av afrikanska härkomster söder om Sahara under postromerska perioder Arkiverad 30 september 2019 på Wayback Machine , 30 maj 2017
  21. Rosa Fregel et al. Neolitisering av Nordafrika involverade migration av människor från både Levanten och Europa Arkiverad 22 september 2017 på Wayback Machine , 2017
  22. Vanessa Villalba-Mouco et al. Genomisk transformation och social organisation under övergången kopparålder till bronsålder i södra Iberia Arkiverad 20 november 2021 på Wayback Machine , 17 november 2021
  23. Marina Silva et al. Biomolekylära insikter i Nordafrika-relaterade härkomst, rörlighet och kost i 1000-talets Al-Andalus Arkiverad 25 september 2021 på Wayback Machine 13 september 2021
  24. Mustafin Kh. Kh., Engovatova A. V., Alborova I. E., Tarasova A. A. Paleogenetisk undersökning av kvarlevorna från en massgrav från 1238 i Yaroslavl Arkivkopia daterad 7 mars 2022 på Wayback Machine // Archaeology of the Moscow Region. Material från vetenskapligt seminarium. Nummer 18. M.: Arkeologiska institutet RAS, 2022. S. 111
  25. Cody Parker et al. En systematisk undersökning av mänskligt DNA-bevarande i medeltida skelett Arkiverad 22 december 2021 på Wayback Machine , 26 oktober 2020 ( bioRxiv Arkiverad 22 april 2021 på Wayback Machine , 22 maj 2020)
  26. Pontus Skoglund et al. Rekonstruktion av förhistorisk afrikansk befolkningsstruktur Arkiverad 31 januari 2019 på Wayback Machine 21 september 2017
  27. Rodrigo Barquera et al. Ursprung och hälsostatus för första generationens afrikaner från det tidiga koloniala Mexiko Arkiverad 10 maj 2020 på Wayback Machine 30 april 2020
  28. Fulvio Cruciani et al., Phylogeographic Analysis of Haplogroup E1b1b (E-M215) Y-kromosomer avslöjar flera migrerande händelser inom och utanför Afrika, Am. J. Hum. Genet, sid. 74
  29. 1 2 3 J. R. Luis, DJ Rowold, M. Regueiro, B. Caeiro, C. Cinnioğlu, C. Roseman, PA Underhill, LL Cavalli-Sforza och RJ Herrera, "The Levant versus the Horn of Africa: Evidence for Bidirectional Corridors of Human Migrations, " American Journal of Human Genetics 74:532-544, 2004.
  30. E-V38 . Hämtad 8 februari 2020. Arkiverad från originalet 2 juli 2021.
  31. Rosa et al. (2007 )
  32. The Britton Efternamn Project på DNA Heritage . Hämtad 27 maj 2009. Arkiverad från originalet 19 december 2007.
  33. E-M215 . Hämtad 8 februari 2020. Arkiverad från originalet 26 maj 2019.
  34. Hammer et al. (2003 )
  35. Karafet et al. (2007 )
  36. i Luis et al. (2004) hänvisas till som "Wairak" och identifieras felaktigt som en bantu.
  37. Matthew E. Hurles, Bryan C. Sykes, Mark A. Jobling och Peter Forster, "The Dual Origin of the Malagasy in Island Southeast Asia and East Africa: Evidence from Maternal and Paternal Lineages," American Journal of Human Genetics 76: 894-901, 2005.
  38. Sanchez et al. (2005). "Höga frekvenser av Y-kromosomlinjer kännetecknade av E3b1, DYS19-11, DYS392-12 hos somaliska män". European Journal of Human Genetics; 13:856-866
  39. NAPOLEON-DNA-PROJEKTET - Sökandet efter ättlingar till Napoleon . Tillträdesdatum: 20 maj 2014. Arkiverad från originalet 21 februari 2014.

Litteratur

Det evolutionära trädetför mänskliga Y-kromosomhaplogrupper
Y-kromosomal Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
I J K
jag J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) F R  


Länkar

Filogenetiska träd och distributionskartor för haplogrupp E (Y-DNA)

Projekt