Primer ( engelsk primer ) - ett kort fragment av nukleinsyra ( oligonukleotid ), komplementärt till DNA- eller RNA -mål; fungerar som en primer för syntesen av en komplementär sträng med användning av DNA-polymeras (under DNA-replikation ). Primern är nödvändig för att DNA-polymeraser ska initiera syntesen av en ny sträng, från 3'-änden (hydroxylgruppen) av primern. DNA-polymeras adderas sekventiellt till 3'-änden av primernukleotiderna som är komplementära till mallkedjan [1] [2] .
I de flesta fall av naturlig DNA-replikation är primern för DNA-syntes ett kort fragment av RNA (skapat på nytt). En sådan ribonukleotidprimer skapas av enzymet primas (primas i prokaryoter, DNA-polymeras i eukaryoter) och ersätts därefter av deoxiribonukleotider , ett polymeras som normalt utför reparationsfunktioner [2] .
Många laboratoriemetoder inom biokemi och molekylärbiologi som involverar användning av DNA-polymeras, såsom sekvensering eller polymeraskedjereaktion , kräver korta oligonukleotider (primers). Sådana primrar är vanligtvis 6 till 50 baser långa och är kemiskt syntetiserade oligonukleotider [3] .
DNA-replikation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Initiering |
| ||||||
Förlängning |
| ||||||
Uppsägning |