Autonom replikeringssekvens

En autonomt replikerande sekvens ( ARS) är en DNA-  sekvens av jästgenomet som innehåller replikationsursprunget (ori) och är ansvarig för initieringen av replikationen .

Funktion och struktur

Inledningsvis beskrevs ARS-sekvenser i den spirande jästen Saccharomyces cerevisiae som fragment av kromosomalt DNA som ökar transformationsfrekvensen och säkerställer stabiliteten hos plasmider . Således transformerade plasmider som innehöll dem jästceller med en hög frekvens [1] . Därefter hittades liknande element i jästen Schizosaccharomyces pombe [2] .

Vid ytterligare studier visade det sig att ARS innehåller ett replikationsursprung, det vill säga de är element som är ansvariga för att initiera replikations- replikatorer . På en DNA-sträcka 5 tusen bp lång. n. det finns tre separata delar av ARS. Deras initiering sker en gång i varje S-fas av cellcykeln , även om effektiviteten och aktiveringstiden (i början eller slutet av S-fasen) kan skilja sig åt för olika ARS [3] .

Hos S. cerevisiae är längden på ARS 100–200 nt. n. ARS inkluderar följande två obligatoriska element: domän A , som innehåller en konservativ sekvens på 11 n. n. - ACS, som binder till ett komplex av 6 proteiner - ursprungsigenkänningskomplexet  (ORC ), och en stor B-domän rik på A - T - par intill A-elementet, men det finns ingen likhet mellan deras sekvenser. ACS-sekvensen är: där Y är pyrimidin och R är purin . ORC har homologer i andra eukaryoter , såsom Drosophila , Xenopus , möss och människor. Hos S. cerevisiae har bindningen av initieringsfaktorer till ORC studerats väl hittills [1] . 5'-T/ATTTAYRTTTT/A-3'

Det bör noteras att, trots likheten mellan eukaryota replikationsmekanismer och proteinerna som är involverade i detta , kan deras replikationsursprung visa betydande skillnader. Till exempel, i jästen S. pombe , som har många likheter med högre eukaryota celler, är ARS mycket längre än i S. cerevisiae och innehåller 600–1500 bp. n., och likheten i deras DNA-sekvenser ligger endast i närvaron av A-T-rika regioner i båda [1] .

Det har fastställts att mutationer i domän B minskar aktiviteten av ARS-elementet, men när domän A muteras blir hela elementet helt inaktivt.

Anteckningar

  1. 1 2 3 VINAY KUMAR SRIVASTAVA, DHARANI DHAR DUBEY. Kartläggning av autonomt replikerande sekvenselement i en 73-kb-region av kromosom II i fissionsjästen, Schizosaccharomyces pombe  // Journal of Genetics. - 2007. - T. 86 , nr 2 . - S. 139-148 .
  2. Clyne RK, Kelly TJ Identifiering av autonomt replikerande sekvens (ARS) element i eukaryota celler. // Metoder .. - 1997. - T. 13 , nr 3 . - S. 221-233 .
  3. Konichev, Sevastyanova, 2012 , sid. 230.

Litteratur