Shikimatkinas

Shikimatkinas

Shikimatkinase från "Erwinia chrysanthemi".
Identifierare
Symbol ÅKA SKIDOR
Pfam PF01202
Pfam klan CL0023
PROSITE PDOC00868
SCOP 2shk
SUPERFAMILJ 2shk
OPM superfamilj 124
OPM-protein 1e6c
Tillgängliga proteinstrukturer
Pfam strukturer
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma 3D-modell
 Mediafiler på Wikimedia Commons
Shikimatkinas

Tecknad bild av shikimatkinas från Mycobacterium tuberculosis . α-geler visas i rött, det centrala β-arket i gult och slingor i grönt.
Identifierare
Kod KF 2.7.1.71
CAS-nummer 9031-51-0
Enzymdatabaser
IntEnz IntEnz-vy
BRENDA BRENDA inträde
ExPASy NiceZyme-vy
MetaCyc Metabolisk väg
KEGG KEGG inträde
PRIAM profil
PDB- strukturer RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Genontologi AmiGO  • EGO
Sök
PMC artiklar
PubMed artiklar
NCBI NCBI-proteiner
CAS 9031-51-0
 Mediafiler på Wikimedia Commons

Shikimatkinas ( EG-kod 2.7.1.71 ) är ett enzym som katalyserar den ATP - beroende fosforyleringen av shikimat med bildning av shikimat-3-fosfat [1] . Denna reaktion är det femte steget i shikimatvägen [2] , som används av växter och bakterier för att syntetisera en vanlig aromatisk aminosyraprekursor och sekundära metaboliter. Det systematiska namnet för denna klass av enzymer är ATP: shikimat-3-fosfotransferas . Andra vanligt använda namn inkluderar shikimatkinas (fosforylering) och shikimatkinas II .

Allmän beskrivning

Shikimatvägen består av sju enzymatiska reaktioner genom vilka fosfoenolpyruvat och erytros-4-fosfat omvandlas till korismat , en vanlig föregångare till de aromatiska aminosyrorna fenylalanin , tyrosin och tryptofan . Aromatiska aminosyror används i proteinsyntes och i växter, svampar och bakterier ger upphov till ett antal andra specialiserade metaboliter såsom fenylpropanoider och alkaloider . Horismat och flera andra intermediärer av denna väg fungerar som prekursorer för ett antal andra metaboliter såsom folater, kinater och kinoner. De fyra enzymerna som föregår shikimatkinas i denna väg är DAHP-syntas, 3-dehydrokinatsyntas, 3-dehydrokinatdehydratas och shikimatdehydrogenas, och de två efter det är EPSP-syntas och korismatsyntas. Hos svampar och protozoer är den en del av AROM-komplexet, som samlokaliserar de fem centrala stegen i shikimatvägen [3] . Vägen finns inte hos människor och andra djur, som måste få aromatiska aminosyror från mat.

Aktivitet

Reaktionen katalyserad av shikimatkinas visas nedan:

Denna reaktion involverar överföring av en fosfatgrupp från ATP till 3-hydroxylgruppen i shikimat. Således har shikimatkinas två substrat , shikimat och ATP , och två produkter, shikimat-3-fosfat och ADP [4] .

Exempel

Humana proteiner som innehåller denna domän inkluderar: MAPK7 och THNSL1.

Referenser

  1. ^ "Shikimate kinase isoenzymes in Salmonella typhimurium". Journal of Biological Chemistry . 243 (3): 676-7. Februari 1968. PMID  4866525 .
  2. "The Shikimate Pathway". Årlig översyn av växtfysiologi och växtmolekylärbiologi . 50 : 473-503. Juni 1999. doi : 10.1146/annurev.arplant.50.1.473 . PMID  15012217 .
  3. ^ "Arkitektur och funktionell dynamik i det pentafunktionella AROM-komplexet". Naturens kemiska biologi . 16 (9): 973-978. Juli 2020. doi : 10.1038/ s41589-020-0587-9 . PMID 32632294 . 
  4. ^ "Mekanism för fosforylöverföring katalyserad av shikimatkinas från Mycobacterium tuberculosis". Journal of Molecular Biology . 364 (3): 411-23. December 2006. doi : 10.1016/j.jmb.2006.09.001 . PMID  17020768 .