Mänskligt coronavirus OC43

Mänskligt coronavirus OC43
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:OrthornaviraeSorts:PisuviricotaKlass:PisoniviricetesOrdning:NidoviralesUnderordning:CornidovirineaeFamilj:CoronavirusUnderfamilj:CoronavirusSläkte:betacoronavirusSubgenus:EmbecovirusSe:Betacoronavirus 1Ingen rang:Mänskligt coronavirus OC43
Internationellt vetenskapligt namn
mänskligt coronavirus OC43
Synonymer
  • HCoV-OC43
Baltimore-gruppen
IV: (+)ssRNA-virus

Humant coronavirus OC43 [2] ( Eng.  Human coronavirus OC43 ) är ett virus från familjen coronavirus , en representant för arten Betacoronavirus 1 , smittsamt för människor och nötkreatur [3] [4] . Ett hölje (+) enkelsträngat RNA-virus som kommer in i cellen genom att binda till N-acetyl-9-O-acetylneuraminsyrareceptorn [5] . Den har, liksom andra koronavirus från undersläktet Embecovirus , ett kort spikprotein, det så kallade hemagglutininesteraset (HE) [6][3] .

OC43 är ett av sju kända coronavirus som infekterar människor och är ansvarig för cirka 10-15 % av SARS- fallen [7] [8] . Forskare föreslår att alla fyra förkylningsorsakande koronavirus har gått över för att infektera människor under de senaste århundradena, och därigenom orsakade de troligen pandemier vid tidpunkten för övergången [9] .

Virologi

Fyra HCoV-OC43- genotyper (A till D) har identifierats, med D-genotypen troligen ett resultat av genetisk rekombination . Helgenomsekvensering av två stammar av genotyp C och D och bootscan-analys visar tecken på rekombination mellan genotyp B och C för att bilda genotyp D. Av de 29 identifierade stammarna tillhör ingen den äldre genotypen A. Spike- och nukleokapsidmolekylklockmetoden tilldelar den närmaste en gemensam förfader till alla genotyper på 1950-talet, genotyp B på 1990-talet och genotyp C i slutet av 1990-talet och början av 2000-talet. Rekombinanta stammar av genotyp D upptäcktes redan 2004 [7] .

Jämförelse av HCoV-OC43 med dess närmaste stam av Betacoronavirus 1- arten , Bovint coronavirus , visade att de hade den närmaste gemensamma förfadern i slutet av 1800-talet, med flera metoder som daterade separationen till omkring 1890, vilket fick forskare att spekulera i att inträde av den första stammen i den mänskliga befolkningen orsakade influensapandemin 1889-1890 [10] [9] . HCoV-OC43 har troligen sitt ursprung i gnagare [11] .

Patogenes

Tillsammans med HCoV-229E , en art i släktet Alphacoronavirus , är HCoV-OC43 bland de kända virus som orsakar förkylning . Båda virusen kan orsaka allvarliga nedre luftvägsinfektioner, inklusive lunginflammation hos spädbarn, äldre och de som är immunsupprimerade, såsom de som genomgår kemoterapi, och personer med HIV/AIDS [12] [13] [14] .

Epidemiologi

Coronavirus är allestädes närvarande över hela världen och orsakar upp till 20-30 % av förkylningarna [9] (det vanligaste förkylningsviruset är rhinovirus , som finns i 30-50 % av fallen). Infektioner är säsongsbetonade , med de flesta fall som inträffar under vintermånaderna [15] [16] [17] .

Virusets rutinmässiga karaktär tilldrog sig inte forskarnas uppmärksamhet under lång tid: som 229E var det ett "föräldralöst virus" som, till skillnad från SARS och MERS , inte ens hade ett "invecklat" namn. Emellertid kan antaganden om dess samband med den ryska influensapandemin 1889-1890 - baserat på ovanstående studie av genomet och likheten mellan symptom på skador på nervsystemet  - indikera en betydande och relativt snabb försvagning av patogeniciteten av coronavirus. Om Covid-19 följer samma bana kommer det med tiden att förvandlas till ytterligare ett förkylningsvirus [9] .

Anteckningar

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ Popov N. N., Kolotova T. Yu. Molekylär utveckling av särskilt farliga framväxande virusinfektioner Arkivexemplar av 4 december 2021 på Wayback Machine // Annals of the Mechnikov Institute. - 2016. - Nr 1. - S. 38-47 [38].
  3. ↑ 1 2 Taxonomy-webbläsare (Betacoronavirus 1) . www.ncbi.nlm.nih.gov . Hämtad 29 februari 2020. Arkiverad från originalet 5 november 2020.
  4. ↑ Lim, Yvonne Xinyi (2016-07-25). "Human Coronaviruses: En översyn av virus-värdinteraktioner." sjukdomar . 4 (3):26 . doi : 10.3390/sjukdomar4030026 . PMID  28933406 . Se tabell 1.
  5. ↑ Li, Fang (2016-09-29). "Struktur, funktion och utveckling av spikproteiner från Coronavirus." Årlig granskning av virologi . 3 (1): 237-261. DOI : 10.1146/annurev-virology-110615-042301 . PMID27578435  . _ BCoV S1-NTD känner inte igen galaktos som galectiner gör. Istället känner den igen 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminsyra (Neu5,9Ac2) (30, 43). Samma sockerreceptor känns också igen av humant coronavirus OC43 (43, 99). OC43 och BCoV är nära besläktade genetiskt, och OC43 kan ha orsakats av zoonotisk spridning av BCoV (100, 101).
  6. ↑ Woo, Patrick CY (2010-08-24). "Coronavirus genomik och bioinformatikanalys". Virus . 2 (8): 1804-1820. DOI : 10.3390/v2081803 . PMID21994708  . _ I alla medlemmar av Betacoronavirus-undergrupp A finns en hemagglutininesteras-gen (HE), som kodar för ett glykoprotein med neuraminat O-acetyl-esterasaktivitet och det aktiva stället FGDS, nedströms ORF1ab och uppströms till S-genen (Figur 1).
  7. ↑ 1 2 Lau, Susanna KP (2011). "Molekylär epidemiologi av mänskligt coronavirus OC43 avslöjar utvecklingen av olika genotyper över tid och nyligen uppkomsten av en ny genotyp på grund av naturlig rekombination" . Journal of Virology . 85 (21): 11325-11337. DOI : 10.1128/JVI.05512-11 . PMID21849456  . _
  8. ↑ Gaunt, ER (2010). "Epidemiologi och kliniska presentationer av de fyra mänskliga coronavirusen 229E, HKU1, NL63 och OC43 upptäckts under 3 år med en ny multiplex realtids-PCR-metod . " J Clinic Microbiol . 48 (8): 2940-2947. DOI : 10.1128/JCM.00636-10 . PMID20554810  . _
  9. ↑ 1 2 3 4 King A. En ovanlig förkylning Arkiverad 7 januari 2021 på Wayback Machine // New Sci. 2020;246(3280):32-35. doi : 10.1016/S0262-4079(20)30862-9
  10. ↑ Vijgen, Leen (2005). "Fullständig genomisk sekvens av mänskligt coronavirus OC43: molekylär klockanalys tyder på en relativt nyligen zoonotisk överföringshändelse av coronavirus" . Journal of Virology . 79 (3): 1595-1604. DOI : 10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005 . PMID  15650185 .
  11. ↑ Fung, To Sing (2019). "Mänskligt Coronavirus: Interaktion mellan värd och patogen". Årlig översyn av mikrobiologi . 73 : 529-557. DOI : 10.1146/annurev-micro-020518-115759 . PMID  31226023 .
  12. ↑ Wevers, Brigitte A. (2009). "Nyligen upptäckta mänskliga Coronaviruses". Kliniker i laboratoriemedicin . 29 (4): 715-724. DOI : 10.1016/j.cll.2009.07.007 . PMID  19892230 .
  13. ↑ Manual of Clinical Microbiology. - American Society for Microbiology, 2007. - ISBN 978-1-55581-371-0 .
  14. ↑ Pyrc, K. (2007). "Antivirala strategier mot mänskliga Coronaviruses". Infektionssjukdomar Läkemedelsmål . 7 (1): 59-66. DOI : 10.2174/187152607780090757 . PMID  17346212 .
  15. ↑ Van Der Hoek, L (2007). "Mänskliga coronavirus: vad orsakar de?" . Antiviral terapi . 12 (4 Pt B): 651-658. PMID  17944272 . Arkiverad från originalet 2022-01-28 . Hämtad 2020-08-09 . Utfasad parameter används |deadlink=( hjälp )
  16. ↑ Wat, Dennis (2004). "Förkylningen: En genomgång av litteraturen". European Journal of Internal Medicine . 15 (2): 79-88. DOI : 10.1016/j.ejim.2004.01.006 . PMID  15172021 .
  17. ↑ Kissler, Stephen M. (14 april 2020). "Projektera överföringsdynamiken för SARS-CoV-2 genom den postpandemiska perioden". Vetenskap : eabb5793. doi : 10.1126/science.abb5793 . PMID  32291278 .