NLRC4

NLRC4 ( NLR-  familjen, CARD-domän som innehåller 4 ) är ett cytosoliskt protein , en Nod-liknande receptor från NOD - underfamiljen , en produkt av NLRC4 -genen . Genen klonades 2001. [1] Spelar en roll i aktiveringen av apoptos .

Funktioner

Spelar en roll i kaspas-1-aktivering som svar på bakteriella patogener ( lipopolysackarid , flagellin , PrgJ).

Struktur

Moget protein består av 1024 aminosyror , molekylvikt - 116,2 kDa . Molekylen inkluderar en CARD-domän, en NACHT-domän med ett ATP -bindningsställe och 14 LRR ( leucinrika ) upprepningar.

Som ett resultat av alternativ skarvning bildas 4 isoformer.

Interagerar via CARD-domäner med ASC, NOD2 , BCL10, NALP1 , caspase-1 och CARD15 . [2]

Anteckningar

1. ↑ Damiano JS, Stehlik C., Pio F., Godzik A., Reed JC CLAN, en ny human CED-4-liknande gen  (neopr.)  // Genomics . - Academic Press , 2001. - Juli ( vol. 75 , nr 1-3 ). - S. 77-83 . - doi : 10.1006/geno.2001.6579 . — PMID 11472070 .
2. ↑ UniProt Q9NPP4 . Datum för åtkomst: 15 maj 2012. Arkiverad från originalet den 6 november 2012. (obestämd)

Litteratur

• Kofoed EM, Vance RE Medfödd immunigenkänning av bakteriella ligander av NAIPs bestämmer inflammasomspecificitet  //  Nature : journal. - 2011. - September ( vol. 477 , nr 7366 ). - s. 592-595 . - doi : 10.1038/nature10394 . — PMID 21874021 .
• Poyet JL, Srinivasula SM, Tnani M., et al. Identifiering av Ipaf, ett humant kaspas-1-aktiverande protein relaterat till Apaf-1. (engelska)  // Journal of Biological Chemistry  : tidskrift. - 2001. - Vol. 276 , nr. 30 . - P. 28309-28313 . - doi : 10.1074/jbc.C100250200 . — PMID 11390368 .
• Damiano JS, Stehlik C., Pio F., et al. CLAN, en ny human CED-4-liknande gen. (neopr.)  // Genomics . - Academic Press , 2001. - V. 75 , nr 1-3 . - S. 77-83 . - doi : 10.1006/geno.2001.6579 . — PMID 11472070 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser. (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidskrift. - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
• Fu WN, Bertoni F., Kelsey SM, et al. Roll av DNA-metylering i undertryckandet av Apaf-1-protein vid human leukemi. (engelska)  // Oncogene : journal. - 2003. - Vol. 22 , nr. 3 . - S. 451-455 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206147 . — PMID 12545166 .
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E., et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), en storskalig ansträngning för att identifiera nya mänskliga utsöndrade och transmembranproteiner: en bioinformatisk bedömning. (engelska)  // Genome Research : journal. - 2003. - Vol. 13 , nr. 10 . - P. 2265-2270 . - doi : 10.1101/gr.1293003 . — PMID 12975309 .
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNA. (engelska)  // Nature Genetics  : tidskrift. - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
• Agostini L., Martinon F., Burns K., et al. NALP3 bildar en IL-1beta-bearbetande inflammasom med ökad aktivitet vid Muckle-Wells autoinflammatoriska sjukdom. (engelska)  // Immunity : journal. - Cell Press , 2004. - Vol. 20 , nej. 3 . - s. 319-325 . - doi : 10.1016/S1074-7613(04)00046-9 . — PMID 15030775 .
• Damiano JS, Oliveira V., Welsh K., Reed JC Heterotypiska interaktioner mellan NACHT-domäner: konsekvenser för reglering av medfödda immunsvar. (engelska)  // Biochemical Journal : journal. - 2004. - Vol. 381 , nr. Pt 1 . - S. 213-219 . - doi : 10.1042/BJ20031506 . — PMID 15107016 .
• Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet och expansion av NIH-cDNA-projektet i full längd: Mammalian Gene Collection (MGC). (engelska)  // Genome Research : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
• Damiano JS, Newman RM, Reed JC Flera roller av CLAN (kaspasassocierad rekryteringsdomän, leucinrik upprepning och NAIP CIIA HET-E och TP1-innehållande protein) i det medfödda immunsvaret hos däggdjur. (engelska)  // Journal of Immunology : journal. - 2004. - Vol. 173 , nr. 10 . - P. 6338-6345 . — PMID 15528373 .
• Sadasivam S., Gupta S., Radha V., et al. Caspase-1 aktivator Ipaf är en p53-inducerbar gen involverad i apoptos. (engelska)  // Oncogene : journal. - 2005. - Vol. 24 , nr. 4 . - s. 627-636 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208201 . — PMID 15580302 .
• Lu C., Wang A., Wang L., et al. Nukleotidbindning till CARD12 och dess roll i CARD12-medierad kaspas-1-aktivering. (engelska)  // Biokemiska och biofysiska forskningskommunikationer : journal. - 2005. - Vol. 331 , nr. 4 . - P. 1114-1119 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2005.04.027 . — PMID 15882992 .
• Rual JF, Venkatesan K., Hao T., et al. Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket. (engelska)  // Natur: journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
• Thalappilly S., Sadasivam S., Radha V., Swarup G. Involvering av kaspas 1 och dess aktivator Ipaf uppströms om mitokondriella händelser i apoptos. (engelska)  // FEBS Journal : journal. - 2006. - Vol. 273 , nr. 12 . - P. 2766-2778 . - doi : 10.1111/j.1742-4658.2006.05293.x . — PMID 16817903 .