Ribozyviria
Ribozyviria |
---|
Strukturdiagram av hepatit delta virus virion |
Grupp:Virus [1]Rike:Ribozyviria |
Ribozyviria |
|
Ribozyviria (lat.) - rike [Com. 1] RNA-innehållande virus , isolerade 2020 och från 2020 innehållande den enda Kolmioviridae- familjen [2] . Representanter för Ribozyviria är satellitvirus som kan föröka sig i infekterade celler endast i närvaro av ett värdvirus . Ribozyviria rike-virus infekterar endast djurceller, och den mest studerade sfärens representant är den mänskliga patogenen hepatit delta-virus , som är en satellit av hepatit B-virus [3] [4] .
Beskrivning
Representanter för Ribozyviria- riket , varav endast hepatit delta-virus har studerats i detalj från och med 2022, infekterar endast djurceller. I genomen av dessa virus kodas ett enda protein , som genomgår posttranslationella modifieringar med bildandet av två funktionellt olika former av proteinet, som är involverade i reproduktionen av viruset och bildar nukleokapsiden inuti virionerna . I andra fastigheter är virus från Ribozyviria- riket mycket lika viroider och satellit -RNA . Liksom medlemmar av de två ovannämnda grupperna replikerar virus från Ribozyviria i en rullande ringmekanism , med reaktionen att lägga till nya nukleotider som katalyseras av värdcellens DNA-beroende RNA-polymeras . Skärningen av en mellanlång RNA- molekyl i separata virala genom utförs av ett speciellt ribozym , som är en del av viruset. Representanter för Ribozyviria använder flera typer av ribozymer, varav en är unik för virus från Ribozyviriaområdet [ 4] .
Eftersom medlemmarna av Ribozyviria är mycket mer komplexa än viroider och andra viroidliknande medel och har en enda strukturell gen , antas Ribozyviria ha utvecklats från viroider. Viroider är emellertid växtpatogener , så uppkomsten av Ribozyviria föregicks troligen av en horisontell överföring av dessa medel från växter till djur. Det antas att medlemmar av Ribozyviria under evolutionens gång förvärvade en proteinkodande gen under rekombination med det genetiska materialet i en djurcell [4] .
Klassificering
Från och med 2020 innehåller Ribozyviria- riket en enda familj, Kolmioviridae , som innehåller åtta släkten. Taxa av mellanrang mellan familj och släkt har inte särskiljts. Namnen på alla släkten som ingår i Kolmioviridae innehåller namnet på bokstaven D på olika språk i deras namn. Själva familjens namn kommer från sund. kolmio är en triangel, eftersom bokstaven Δ i det grekiska alfabetet, som motsvarar det latinska D, har en triangulär kontur [3] .
Följande är taxonomin för Ribozyviria- riket från och med 2020: [2]
- Rike: Ribozyviria
- Familj: Kolmioviridae
- Släkte Daazvirus
- Art: Daazvirus cynopis [även känd som CFBNV-1 (från kinesiskt eldbuksalamandervirus 1 och även amHDV] (värd: pygmésalamander ( Cynops orientalis )) [5]
- Släkte Dagazvirus
- Art: Dagazvirus schedorhinotermitis [även känd som RTV-1 (från engelska rhinotermitid virus 1 och även rHDV] (värd: Schedorhinotermes intermedius ) [5]
- Släkte Daletvirus
- Art: Daletvirus boae [även känd som SwSCV-1 (från engelska Swiss snake colony virus 1 ), tidigare sHDV] (värdar: vanlig boa constrictor ( Boa constrictor ), Liasis mackloti savuensis ) [6]
- Släkte Dalvirus
- Släkte Deevirus
- Art: Deevirus actinopterygii [även känd som RFFV-1 (från engelska ray-finned fish virus 1 ), tidigare fHDV] (värd: diverse ray-finned fish ) [5]
- Genus: Deltavirus [2]
- Art: Deltavirus cameroonense [humant hepatit deltavirus 7 (HDV-7)] (värd: Homo sapiens )
- Art: Deltavirus carense [humant hepatit deltavirus 6 (HDV-6)] (värd: H. sapiens )
- Art: Deltavirus italiense [humant hepatit deltavirus 1 (HDV-1)] (värd: H. sapiens )
- Art: Deltavirus japanense [humant hepatit deltavirus 2 (HDV-2)] (värd: H. sapiens )
- Art: Deltavirus peruense [humant hepatit deltavirus 3 (HDV-3)] (värd: H. sapiens )
- Art: Deltavirus senegalense [humant hepatit deltavirus 8 (HDV-8)] (värd: H. sapiens )
- Art: Deltavirus taiwanense [humant hepatit deltavirus 4 (HDV-4)] (värd: H. sapiens )
- Art: Deltavirus togense [humant hepatit deltavirus 5 (HDV-5)] (värd: H. sapiens )
- Släkte Dobrovirus
- Art: Dobrovirus bufonis [även känd som CITV-1 (från engelska Chusan Island toad virus 1 ), tidigare tfHDV] (värd: Far Eastern toad ( Bufo gargarizans )) [5]
- Släkte Thurisazvirus
- Art: Thurisazvirus myis [även känd som TSRV-1 (från Tome's spiny-rat virus 1 ) , tidigare RDev] (värd: mjukryggig borstråtta ( Proechimys semispinosus )) [8]
Studiens historia
Den första kända medlemmen av Ribozyviria- riket , hepatit delta-virus ( art Hepatit delta-virus , släktet Deltavirus ), upptäcktes 1993. Sedan dess har flera medlemmar av Ribozyviria som infekterar celler från olika djurarter beskrivits med hjälp av metagenomik [4] . Fram till 2018 förblev den taxonomiska positionen för släktet Deltavirus osäker, tills den internationella kommittén för virusets taxonomi (ICTV) felaktigt tilldelade det till det nybildade Riboviria- riket . Under 2019 korrigerades felet och Deltavirusets taxonomiska position blev återigen osäker. År 2020 upplöstes arten Hepatit delta-virus , istället för den identifierades åtta nya arter, tilldelade Ribozyviria- riket .
Anteckningar
Kommentarer
- ↑ För tillfället, den väletablerade ryskspråkiga termen som motsvarar engelska. rike i taxonomi, nej.
Källor
- ↑ Taxonomy of Viruses på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ 1 2 3 Taxonomy of Viruses (engelska) på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 27 april 2020) .
- ↑ 1 2 Skapa ett nytt rike ( Ribozyviria ) inklusive en ny familj ( Kolmioviridae ) inklusive släktet Deltavirus och sju nya släkten för totalt 15 arter (eng.) (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (6 december 2020). Hämtad 27 maj 2021. Arkiverad från originalet 16 maj 2021.
- ↑ 1 2 3 4 Lee Benjamin D. , Koonin Eugene V. Viroider och viroidliknande cirkulära RNA: härstammar de från primordiala replikatorer? (engelska) // Life. - 2022. - 12 januari ( vol. 12 , nr 1 ). — S. 103 . — ISSN 2075-1729 . - doi : 10.3390/life12010103 .
- ↑ 1 2 3 4 Chang WS , Pettersson JH , Le Lay C. , Shi M. , Lo N. , Wille M. , Eden JS , Holmes EC Nya hepatit D-liknande medel hos ryggradsdjur och ryggradslösa djur. (engelska) // Virus Evolution. - 2019. - Juli ( vol. 5 , nr 2 ). - P. 021-021 . - doi : 10.1093/ve/vez021 . — PMID 31321078 .
- ↑ Hetzel U. , Szirovicza L. , Smura T. , Prähauser B. , Vapalahti O. , Kipar A. , Hepojoki J. Identification of a Novel Deltavirus in Boa Constrictors. (engelska) // MBio. - 2019. - 2 april ( vol. 10 , nr 2 ). - doi : 10.1128/mBio.00014-19 . — PMID 30940697 .
- ↑ Wille M. , Netter HJ , Littlejohn M. , Yuen L. , Shi M. , Eden JS , Klaassen M. , Holmes EC , Hurt AC A Divergent Hepatitis D-Like Agent in Birds. (engelska) // Virus. - 2018. - 17 december ( vol. 10 , nr 12 ). doi : 10.3390 / v10120720 . — PMID 30562970 .
- ↑ Paraskevopoulou S. , Pirzer F. , Goldmann N. , Schmid J. , Corman VM , Gottula LT , Schroeder S. , Rasche A. , Muth D. , Drexler JF , Heni AC , Eibner GJ , Page RA , Jones TC . Müller MA , Sommer S. , Glebe D. , Drosten C. Däggdjursdeltavirus utan hepadnavirussaminfektion i den neotropiska gnagaren Proechimys semispinosus . (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States Of America. - 2020. - 28 juli ( vol. 117 , nr 30 ). - P. 17977-17983 . - doi : 10.1073/pnas.2006750117 . — PMID 32651267 .