SDF-1 (protein)

SDF-1
Identifierare
Symboler pre-B-celltillväxtstimulerande faktor IRHkemokin (CXC-motiv) ligand 12CXCL12interkrin reducerad i hepatomasstromal cellhärledd faktor 1hIRHC-XC-motiv kemokin 12PBSFKemokin CXCL12CXCL12 proteinhuman
Externa ID:n GeneCards:
RNA-uttrycksprofil
Mer information
ortologer
Typer Mänsklig Mus
Entrez
Ensemble
UniProt
RefSeq (mRNA)

n/a

n/a

RefSeq (protein)

n/a

n/a

Locus (UCSC) n/a n/a
PubMed- sökning n/a
Redigera (människa)

SDF-1 ( stromal  cell-derived factor-1 ), eller CXCL12 ( kemokin (CXC-motiv) ligand 12 ) är en kemokin  från CXC-underfamiljen, som hos människor kodas av CXCL12 -genen . SDF-1 binder till CXCR4- och CXCR7-receptorer och spelar en viktig roll i embryonal utveckling och hematopoiesis [1] . SDF-1 fungerar inte bara som en kemoattraherande medel: i vissa fall kan den stimulera cellproliferation och främja deras överlevnad [2] .

Genstruktur och mRNA

Den humana CXCL12 -genen klonades första gången 1995 [3] . Genen finns i den långa armen av den 10:e kromosomen , har en storlek på mer än 88 000 baspar och innehåller 5 exoner [2] .

Alternativ splitsning leder till syntesen av mRNA som kodar för flera isoformer av SDF-1: SDF-1α (89 aminosyrarester ), SDF-1β (93 a.a.), SDF-1γ (119 a.a.), SDF-1δ (140 a.a.) , SDF-1ε (90 a.a.) och SDF-1φ (100 a.a.) [2] . De första tre exonerna som utgör alla mRNA-varianter är desamma; därför är de N-terminala regionerna för alla SDF-1-isoformer identiska.

Distribution

SDF-1 syntetiseras av många celltyper. mRNA som kodar för SDF-1α och SDF-1β finns i hjärta , njure , lever , lunga , bukspottkörtel , placenta , skelettmuskulatur , mjälte , lymfkörtlar , tymus , tonsiller och benmärg , men inte i perifera blodleukocyter . Till skillnad från SDF-1β-mRNA är SDF-1α-mRNA också närvarande i hjärnan . SDF-1α mRNA syntetiseras också i många embryonala vävnader, SDF-1β mRNA finns i en något smalare uppsättning av embryonala vävnader med en dominans i mjälten. SDF-1γ mRNA finns i små mängder i många vuxna vävnader, med en dominans i hjärtat. mRNA SDF-1δ, ε och φ detekteras i bukspottkörteln, hjärtat, levern, njurarna och vissa andra vävnader i den vuxna kroppen. SDF-1δ mRNA syntetiseras i många organ i embryot, medan SDF-1ε och φ mRNA endast finns i njuren [2] .

Funktioner

SDF-1 utför många funktioner både i den vuxna organismen och under embryonal utveckling. I första hand är SDF-1 en kemoattraktant för celler som har sina membranreceptorer, såsom B-lymfocyter och hematopoetiska stamceller . Benmärgsstromaceller syntetiserar SDF-1, vilket säkerställer lokaliseringen av hematopoetiska prekursorceller i deras cellnischer och förhindrar dem från att lämna benmärgen i förtid. I embryonal utveckling kontrollerar SDF-1 migrationen av olika celltyper och spelar en viktig roll i organbildningen [4] .

SDF-1 fungerar som en tillväxtfaktor för B-celler och stimulerar deras proliferation . Dessutom kan SDF-1 skydda maligna B-celler från apoptos vid kronisk lymfatisk leukemi [5] .

Anteckningar

  1. Rankin SM Chemokines och vuxna benmärgsstamceller // Immunol Lett. - 2012. - T. 145 , nr. 1-2 . - S. 47-54 . - doi : 10.1016/j.imlet.2012.04.009 . — PMID 22698183 .
  2. 1 2 3 4 Yu L., Cecil J., Peng SB, Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su EW, Wang J. Identifiering och uttryck av nya isoformer av faktor 1 härledd från mänskliga stromaceller // Gen. - 2006. - Vol. 7 , nummer. 374 . - S. 174-179 . — PMID 16626895 .
  3. Shirozu M., Nakano T., Inazawa J., Tashiro K., Tada H., Shinohara T., Honjo T. Struktur och kromosomal lokalisering av den humana stromacellshärledda faktor 1-genen (SDF1) // Genomics. - 1995. - T. 28 , nr. 3 . - S. 495-500 . — PMID 7490086 .
  4. Lewellis SW, Knaut H. Attraktiv vägledning: hur kemokinen SDF1/CXCL12 guidar olika celler till olika platser // Semin Cell Dev Biol. - 2012. - T. 23 , nr. 3 . - S. 333-340 . - doi : 10.1016/j.semcdb.2012.03.009 . — PMID 22414535 .
  5. Burger JA, Tsukada N., Burger M., Zvaifler NJ, Dell'Aquila M., Kipps TJ Blodhärledda sjuksköterskeliknande celler skyddar kronisk lymfatisk leukemi B-celler från spontan apoptos genom stromalcellshärledd faktor-1  // Blod . - 2000. - T. 96 , nr. 8 . - S. 2655-2663 . — PMID 11023495 .  (inte tillgänglig länk)