Histon deacetylas 5

Identifierare

HDAC5 ; HD5; NY-CO-9

Externa ID:n

OMIM: 605315 MGI : 1333784 HomoloGene : 3995 IUPHAR : ChEMBL : 2563 GeneCards : HDAC5-gen

3.5.1.98

Genontologi
Fungera	• transkriptionssampressoraktivitet • histondeacetylasaktivitet • proteinkinas C-bindning • proteinbindning • transkriptionsfaktorbindning • NAD-beroende histondeacetylasaktivitet (H3-K14-specifik) • transkriptionsreglerande region DNA-bindning • metalljonbindning • NAD-beroende histondeacetylasaktivitet (H3-K9) specifik) • NAD-beroende histon-deacetylasaktivitet (H4-K16-specifik) • undertrycker transkriptionsfaktorbindning • NAD-beroende histon-deacetylasaktivitet (H3-K18-specifik)
cellkomponent	• histondeacetylaskomplex • kärna • nukleoplasma • nukleolus • cytoplasma • Golgi-apparat • cytosol • kärnkraftskropp
biologisk process	• negativ reglering av transkription från RNA-polymeras II-promotor • osteoblastutveckling • kromatinorganisation • kromatinremodellering • kromatintystnad • transkription, DNA-mall • inflammatorisk respons • Notch-signalväg • hjärtutveckling • reglering av myotubdifferentiering • negativ reglering av myotubdifferentiering • kromatinmodifiering • histoncellsdifferentiering • Bhistoncellsdifferentiering cellulärt svar på insulinstimulans • multicellulärt organismsvar på stress • B-cellsaktivering • svar på kokain • svar på läkemedel • reglering av proteinbindning • negativ reglering av osteoblastdifferentiering • negativ reglering av transkription, DNA-templaterad • positiv reglering av transkription från RNA polymeras II-promotor • reglering av skelettmuskelfiberutveckling • positiv reglering av sekvensspecifik DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet • histon H3 deacetylering • histon H4 deacetylering • negativ reglering av cellmigration involverad i spirande angiogenes
Källor: Amigo / QuickGO

RNA-uttrycksprofil

Mer information

ortologer

Mänsklig

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 17:
42,15 - 42,2 Mb

Chr 11:
102,19 – 102,23 Mb

Sök i PubMed

[ett]

[2]

Histondeacetylas 5 är ett enzym som kodas hos människor av HDAC5 -genen [1] [2] [3] .

Funktion

Histoner spelar en avgörande roll i regleringen av transkription , cellcykel och utvecklingshändelser. Acetylering/deacetylering av histoner förändrar den kromosomala strukturen och påverkar transkriptionsfaktorernas tillgång till DNA . Proteinet som kodas av denna gen tillhör klass II av histondeacetylas /acuc/Apha-familjen. Det har histondeacetylasets förmåga att undertrycka transkription när det är bundet till en promotor . Det interagerar också med myocytförstärkarfaktor-2 (MEF2)-proteiner, vilket resulterar i undertryckande av MEF2-beroende gener. Dessa gener tros vara associerade med tjocktarmscancer. Två varianter av transkript som kodar för olika isoformer hittades för denna gen [3] .

AMP-aktiverat proteinkinas reglerar glukostransportören GLUT4 genom fosforylering vid HDAC5 [4] .

HDAC5 är involverat i minneskonsolidering och föreslår att HDAC5-inriktning [5] bör undvikas när man utvecklar HDAC-hämmare med större selektivitet för behandling av Alzheimers sjukdom .

Interaktioner

Histondeacetylas 5 har visats interagera med:

BCL6 [6] ,
CBX5 [7] ,
GATA1 [8] ,
HDAC3 [9] [10] [11] [12] ,
IKZF1 [13] ,
MEF2A [14] ,
NRIP1 [15] ,
NCOR1 [10] [16] ,
NCOR2 [16] ,
YWHAQ [17] och
ZBTB16 [6] [18] .

Se även

Histon deacetylas

Anteckningar

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tre proteiner definierar en klass av humana histondeacetylaser relaterade till jäst Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - Juni ( vol. 96 , nr 9 ). - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B., Gure AO, Stockert E., Gordan JD, Tureci O., Sahin U., Pfreundschuh M., Old LJ Karakterisering av humana koloncancerantigener som känns igen av autologa antikroppar // Int J Cancer : journal. - 1998. - Juni ( vol. 76 , nr 5 ). - s. 652-658 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P . — PMID 9610721 .
↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC5-histondeacetylas 5 . (obestämd)
↑ McGee SL, van Denderen BJ, Howlett KF, Mollica J., Schertzer JD, Kemp BE, Hargreaves M. AMP-aktiverat proteinkinas reglerar GLUT4-transkription genom att fosforylera histondeacetylas 5 // Diabetes ( journal) : journal. - 2008. - Vol. 57 , nr. 4 . - s. 860-867 . - doi : 10.2337/db07-0843 . — PMID 18184930 .
↑ Agis-Balboa RC, Pavelka Z., Kerimoglu C., Fischer A. Förlust av HDAC5 försämrar minnesfunktionen: implikationer för Alzheimers sjukdom // J Alzheimers Dis : journal. - 2013. - Januari ( vol. 33 , nr 1 ). - S. 35-44 . - doi : 10.3233/JAD-2012-121009 . — PMID 22914591 .
↑ 1 2 Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Histon-deacetylaser av klass II rekryteras direkt av BCL6-transkriptionsrepressor (engelska) // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
↑ Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN Association of klass II histon deacetylaser med heterochromatin protein 1: potentiell roll för histon metylering i kontroll av muskel differentiering // Mol . cell. Biol. : journal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 20 . - P. 7302-7312 . - doi : 10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
↑ Watamoto K., Towatari M., Ozawa Y., Miyata Y., Okamoto M., Abe A., Naoe T., Saito H. Ändrad interaktion mellan HDAC5 och GATA-1 under MEL- celldifferentiering // Onkogen : journal. - 2003. - Vol. 22 , nr. 57 . - P. 9176-9184 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206902 . — PMID 14668799 .
↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tre proteiner definierar en klass av humana histondeacetylaser relaterade till jäst Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ 1 2 Zhang J., Kalkum M., Chait BT, Roeder RG N-CoR-HDAC3 nukleära receptor-corepressorkomplex hämmar JNK-vägen genom den integrerade subenheten GPS2 // Mol . cell : journal. - 2002. - Vol. 9 , nej. 3 . - s. 611-623 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00468-9 . — PMID 11931768 .
↑ Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Enzymatisk aktivitet associerad med klass II HDAC är beroende av ett multiproteinkomplex som innehåller HDAC3 och SMRT/N -CoR // Mol. cell : journal. - 2002. - Vol. 9 , nej. 1 . - S. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
↑ Grozinger CM, Schreiber SL Reglering av histondeacetylas 4 och 5 och transkriptionsaktivitet genom 14-3-3-beroende cellulär lokalisering // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2000. - Vol. 97 , nr. 14 . - P. 7835-7840 . - doi : 10.1073/pnas.140199597 . — PMID 10869435 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. En molekylär dissektion av Ikaros repressionskretsar // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
↑ Lemercier C., Verdel A., Galloo B., Curtet S., Brocard MP, Khochbin S. mHDA1/HDAC5-histondeacetylas interagerar med och undertrycker MEF2A-transkriptionsaktivitet // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
↑ Castet A., Boulahtouf A., Versini G., Bonnet S., Augereau P., Vignon F., Khochbin S., Jalaguier S., Cavaillès V. Flera domäner av Receptor-Interacting Protein 140 bidrar till transkriptionshämning ( engelska) // Nucleic Acids Res. : journal. - 2004. - Vol. 32 , nr. 6 . - P. 1957-1966 . doi : 10.1093 / nar/gkh524 . — PMID 15060175 .
↑ 1 2 Huang EY, Zhang J., Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T., Lazar MA Nuclear receptor corepressors partner with class II histon deacetylases in a Sin3-obdependent repression pathway (eng.) // Genes Dev. : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 45-54 . — PMID 10640275 .
↑ Vega RB, Harrison BC, Meadows E., Roberts CR, Papst PJ, Olson EN, McKinsey TA Proteinkinaser C och D förmedlar agonistberoende hjärthypertrofi genom kärnexport av histondeacetylas 5 // Mol . cell. Biol. : journal. - 2004. - Vol. 24 , nr. 19 . - P. 8374-8385 . - doi : 10.1128/MCB.24.19.8374-8385.2004 . — PMID 15367659 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 förmedlar transkriptionell repression av det akuta promyelocytiska leukemi-associerade proteinet PLZF . ) / / Onkogen : journal. - 2004. - Vol. 23 , nr. 54 . - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Litteratur

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klass II histondeacetylaser: mångsidiga regulatorer // Trends Genet . : journal. - 2003. - Vol. 19 , nr. 5 . - s. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Huang EY; Zhang J; Miska EA; Guenther, M.G.; Kouzarides, T; Lazar, MA Nuclear receptor corepressors partner med klass II histon deacetylaser i en Sin3-oberoende repressionsväg // Genes Dev . : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 45-54 . — PMID 10640275 .
Lemercier C; Verdel A; Galloo B; Curtet, S; Brocard, MP; Khochbin, S. mHDA1/HDAC5-histondeacetylas interagerar med och undertrycker MEF2A-transkriptionsaktivitet // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
Grozinger CM, Schreiber SL Reglering av histondeacetylas 4 och 5 och transkriptionell aktivitet genom 14-3-3-beroende cellulär lokalisering (engelska) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2000. - Vol. 97 , nr. 14 . - P. 7835-7840 . - doi : 10.1073/pnas.140199597 . — PMID 10869435 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, en ny corepressor involverad i BCL-6-repression // Genes Dev . : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 14 . - P. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
Mahlknecht U ; Schnittger S; Ottmann OG; Schoch, C; Mosebach, M; Hiddemann, W; Hoelzer, D. Kromosomal organisation och lokalisering av den humana histondeacetylas 5-genen (HDAC5 ) // Biochim. Biophys. Acta : journal. - 2000. - Vol. 1493 , nr. 3 . - s. 342-348 . - doi : 10.1016/S0167-4781(00)00191-3 . — PMID 11018260 .
Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Association of COOH-terminal-bindende protein (CtBP) och MEF2-interagerande transkriptionsrepressor (MITR) bidrar till transkriptionell repression av MEF2-transkriptionsfaktorn // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 1 . - S. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
McKinsey TA, Zhang CL, Lu J., Olson EN Signalberoende kärnexport av ett histondeacetylas reglerar muskeldifferentiering // Nature . - 2000. - Vol. 408 , nr. 6808 . - S. 106-111 . - doi : 10.1038/35040593 . — PMID 11081517 .
McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN Aktivering av myocytförstärkaren faktor-2 transkriptionsfaktor genom kalcium/kalmodulin-beroende proteinkinas-stimulerad bindning av 14-3-3 till histon deacetylas 5 // Proceedings of the National Academy of Sciences of the Amerikas förenta stater : tidskrift. - 2001. - Vol. 97 , nr. 26 . - P. 14400-14405 . - doi : 10.1073/pnas.260501497 . — PMID 11114197 .
Fischle W; Dequiedt F; Fillion M; Hendzel, MJ; Voelter, W; Verdin, E. Human HDAC7-histondeacetylasaktivitet är associerad med HDAC3 in vivo // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN Identifiering av en signalreagerande kärnexportsekvens i klass II histondeacetylaser // Mol . cell. Biol. : journal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 18 . - P. 6312-6321 . - doi : 10.1128/MCB.21.18.6312-6321.2001 . — PMID 11509672 .
Ozawa Y; Towatari M; Tsuzuki S; Hayakawa, F; Maeda, T; Miyata, Y; Tanimoto, M; Saito, H. Histon deacetylas 3 associerar med och undertrycker transkriptionsfaktorn GATA- 2 // Blod : journal. — American Society of Hematology, 2001. - Vol. 98 , nr. 7 . - P. 2116-2123 . - doi : 10.1182/blod.V98.7.2116 . — PMID 11567998 .
Potter GB; Beaudoin GM; Derenzo CL; Zarach, JM; Chen, S.H.; Thompson, CC Den hårlösa genen muterad vid medfödda håravfallssjukdomar kodar för en ny nukleär receptor-corepressor // Genes Dev . : journal. - 2001. - Vol. 15 , nr. 20 . - P. 2687-2701 . - doi : 10.1101/gad.916701 . — PMID 11641275 .
Fischle W; Dequiedt F; Henzel MJ; Guenther, Matthew G; Lazar, Mitchell A; Voelter, Wolfgang; Verdin, Eric. Enzymatisk aktivitet associerad med klass II HDAC är beroende av ett multiproteinkomplex som innehåller HDAC3 och SMRT/N-CoR // Mol . cell : journal. - 2002. - Vol. 9 , nej. 1 . - S. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
Lemercier C; Brocard MP; Puvion-Dutilleul F; Kao, HY; Albagli, O; Khochbin, S. Klass II histondeacetylaser rekryteras direkt av BCL6 transkriptionsrepressor // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
Huang Y; Tan M; Gosink M; Wang, KK; Sun, Y. Histondeacetylas 5 är inte en p53-målgen, men dess överuttryck hämmar tumörcelltillväxt och inducerar apoptos , Cancer Res . : journal. - 2002. - Vol. 62 , nr. 10 . - P. 2913-2922 . — PMID 12019172 .