Fragment av Okazaki

Okazaki - fragment är relativt korta DNA- fragment ( med en RNA-  primer vid 5'-änden) som bildas på den eftersläpande strängen under DNA -replikation . Längden på Okazaki-fragment i E. coli är cirka 1000-2000 nukleotider , medan den i eukaryoter  vanligtvis är 100-200 nukleotider.

Okazaki-fragment beskrevs 1968 av Reiji Okazaki , Tsuneko Okazaki och medförfattare medan de studerade bakteriofag -DNA-replikation i E. coli [1] [2] .

Mekanism

Varje Okazaki-fragment bildas bredvid replikationsgaffeln efter en RNA- primer bildad av primas , och fortsätter vidare av DNA-polymeras III i fallet med prokaryoter. I eukaryoter syntetiseras den eftersläpande strängen av DNA-polymeras α. Primern avlägsnas senare av ett enzym med endonukleasaktivitet som RNase H , flap-endonukleas och DNA2L-helikas /nukleas [ en .

Anteckningar

  1. ↑ Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. Mekanism för DNA-replikation möjlig diskontinuitet av DNA-kedjans tillväxt. Jpn J Med Sci Biol. 1967 Jun;20(3):255-260. PMID 4861623
  2. ↑ Ogawa T, Okazaki T, diskontinuerlig DNA-replikation. Annu. Varv. Biochem. 49:421-457, 1980. doi : 10.1146/annurev.bi.49.070180.002225

Litteratur

  1. Inman RB, Schnos M. Struktur av förgreningspunkter i replikerande DNA: Förekomst av enkelsträngade anslutningar i lambda-DNA-förgreningspunkter. J. Mol Biol. 56:319-325, 1971. doi : 10.1016/0022-2836(71)90467-0 . PMID 4927949
  2. Thommes P, Hubscher U. Eukaryot DNA-replikation. Enzymer och proteiner som verkar vid gaffeln. Eur. J Biochem. 194(3):699-712, 1990. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19460.x . PMID 2269294