CF-koden ("klassificering av enzymer") eller enzymkoden är enzymets klassificeringsnummer enligt den internationella hierarkiska klassificeringen. Det antagna systemet klassificerar enzymer i grupper och indexerar enskilda enzymer, vilket är viktigt för forskningsstandardisering.
Klassificeringen av enzymer är baserad och uppdateras periodiskt av Enzyme Commission ( eng. Enzyme commission , därav termen "EC number", antagen i den engelska litteraturen) vid International Union of Biochemistry and Molecular Biology . Varje CF-kod är också associerad med det rekommenderade namnet på motsvarande enzym. Mer än 3500 enzymer har klassificerats.
Klassificeringen av enzymer tar hänsyn till enzymers reaktion och substratspecificitet, och inte deras proteinstruktur . CF-koden definierar den kemiska reaktion som katalyseras av enzymet. Av denna anledning har liknande enzymer (ibland dussintals) från olika organismer samma CF, trots strukturella skillnader.
Ibland har olika enzymer från samma organism samma CF. Till exempel hör bukspottkörtellipas och leverlipas båda till EC 3.1.1.3 , eftersom de katalyserar samma kemiska reaktion ( hydrolys av en esterbindning i triglycerid ), även om det första enzymet är ett matsmältningsenzym och verkar i tarmen , och det andra enzymet. hänvisar till lipoproteinmetabolism enzymer i blod .
Det finns en UniProt- databas [1] som identifierar varje protein genom dess primära sekvens. Båda databaserna kompletterar varandra.
Varje klassificeringsnummer innehåller förkortningen KF och en följd av fyra siffror åtskilda med punkter, och är sammanställt enligt en viss princip. Varje successivt nummer representerar en mer och mer exakt klassificering av enzymet. Eftersom databasen ständigt uppdateras kan koderna ändras, och koderna för vissa nivåer kan förbli tomma.
Slutligen får alla enzymer som tillhör denna underklass sitt serienummer ( det fjärde numret i koden).
| Klass | katalyserad reaktion | Reaktionstyp | Exempel |
|---|---|---|---|
| CF 1 Oxidoreduktas |
Redoxreaktioner. Överföring av H- och O-atomer eller elektroner från ett substrat till ett annat | AH + B → A + BH ( reduktion ) A + O → AO ( oxidation ) |
dehydrogenas , oxidas |
| CF 2 transferaser |
Överföring av en funktionell grupp från ett substrat till ett annat. Det kan vara en metyl-, acyl-, fosfat- eller aminogrupp. | AB+C→A+BC | aminotransferas , kinaser |
| KF 3 hydrolaser |
Bildning av två produkter från ett substrat genom hydrolys . | AB + H2O → AOH + BH | lipas , amylas , proteas , fosfatas |
| KF 4 lyaser (syntaser) |
Den icke-hydrolytiska tillsatsen eller avlägsnandet av en grupp till eller från ett substrat. Bildning av CC-, CN-, CO- eller CS-bindningar. | RCOCOOH → RCOH + CO2 | karboxylas |
| KF 5 isomeraser |
Intramolekylär omlagring, dvs isomerisering av substratmolekylen. | AB→BA | isomeraser , mutaser , etc. |
| CF 6 -ligaser (syntetaser) |
Kopplingen av två molekyler som ett resultat av syntesen av en ny CO-, CS-, CN- eller CC- bindning , kopplad till den samtidiga hydrolysen av ATP . | X + Y + ATP → XY + ADP + Pi | syntetas |
| KF 7 | Transport av joner eller molekyler över membran eller deras separation i membran. | membrantransportproteiner [2] |
Enzyme Nomenclature Scheme utvecklades först 1955 när Internationella kongressen för biokemi i Bryssel inrättade Enzyme Commission . Den första versionen av nomenklaturen dök upp 1961 och omfattade cirka 900 enzymer, i 1978 års version fanns det mer än 2000 enzymer. 1995 års version innehåller över 3500 enzymer.
| Enzymer | |
|---|---|
| Aktivitet | |
| förordning | |
| Klassificering | |
| Typer |
|