Poly(ADP-ribos)-polymeraser

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 7 mars 2022; kontroller kräver 2 redigeringar .

Poly(ADP-ribos) -polymeraser ( PARP ) är enzymer som katalyserar poly -ADP-ribosylering , en av typerna av post-translationell modifiering av proteiner.

Poly(ADP-ribos)-polymeraser ( EC 2.4.2.30 i den internationella klassificeringen av enzymer) tillhör underklassen pentosyltransferaser (EC 2.4.2) av klassen glykosyltransferaser (EC 2.4) [1] och katalyserar överföringsreaktionen av ADP -ribosyl ( adenosindifosfat- ribosrest ) på poly-ADP-ribosylkedjan associerad med proteinet, där ADP-ribosdonatorn är nikotinamidadenindinukleotid (NAD + ) [2] :

NAD + + (ADP-D-ribosyl) n -Acceptor (ADP-D-ribosyl) n + 1 + nikotinamid

Acceptorer för olika PARP är olika substratproteiner, som ett resultat av vilka dessa enzymer har olika fysiologiska funktioner [3] [4] [5] . Till skillnad från PARP, som använder flera NAD + -molekyler för att modifiera en acceptor och syntetisera poly-ADP-ribos, tillhör enzymer som katalyserar mono-ADP-ribosylering inte PARP-superfamiljen och har ett annat serienummer i enzymnomenklaturen.

Den mest kända medlemmen i superfamiljen är PARP-1-enzymet, som är involverat i DNA - skadareparation och kromatinremodellering genom histonpoly -ADP-ribosylering. Eftersom DNA klyvs under apoptos , klyver kaspaser och inaktiverar därigenom PARP-1, vilket förhindrar reparation av det klyvda DNA:t.

Klinisk signifikans och PARP-hämmare

I vissa fall leder störningar i DNA-reparationskomplexet till karcinogenes . Hos människor leder till exempel mutationer i BRCA1 och BRCA2 ( bröstcancerkänslighetsprotein ) tumörsuppressorgener , som kodar för proteiner involverade i DNA-reparation, till utvecklingen av bröstcancer . Undertryckande av PARP-1-aktivitet under kemoterapi leder i detta fall till apoptos av celler vars DNA är skadat av cytostatika [6] . Ett antal PARP-hämmare ( veliparib , iniparib , olaparib , rucaparib ) är för närvarande i kliniska prövningar som läkemedel mot cancer.  

Humana PARP-gener och enzymerna de kodar för

Hos människor finns det 16 gener som kodar för dessa enzymer, som bildar en superfamilj [7] [8] , som alla har en homolog katalytisk domän och verkar vara härledda från samma förfäders enzym.

Gen Kromosom Åtkomstkod i UniProt-databas Maximal polypeptidlängd (a.a.) * Maximal uppskattad produktmassa (kDa) * Alternativa produktnamn Andra domäner än katalytiska Anteckningar
PARP-1 1q41-42 P09874 Arkiverad 12 april 2011 på Wayback Machine 1014 113 ADPRT, PPOL BRCT, PARP-reglerande, DNA-bindande
PARP-2 14q11.2 Q9UGN5 Arkiverad 12 april 2011 på Wayback Machine 583 * 66 * ADPRT2, ADPRTL2 PARP-reglering
PARP-3 3p21 Q9Y6F1 Arkiverad 14 november 2010 på Wayback Machine 533 60 ADPRT3, ADPRTL3
PARP-4 13q11 Q9UKK3 Arkiverad 21 augusti 2011 på Wayback Machine 1724 193 ADPRTL1, KIAA0177, PARPL, VPARP BRCT, VIT, VWFA
PARP-5a 8p23.1 O95271 Arkiverad 19 januari 2011 på Wayback Machine 1327 * 142 * TNKS1, tankyrase 1 ankyric, SAM
PARP-5b 10q23.03 Q9H2K2 Arkiverad 21 juni 2010 på Wayback Machine 1166 127 TNKL, TNKS2, tankirase 2 ankyric, SAM
PARP-6 15q22.3 Q2NL67 Arkiverad 6 augusti 2010 på Wayback Machine 630 * 71 * transkript upptäckt, protein okarakteriserat
PARP-7 3q25.31 Q7Z3E1 Arkiverad 11 maj 2011 på Wayback Machine 657 76 TIPARP DNA-bindande, WWE
PARP-8 5q11.2 Q8N3A8 Arkiverad 4 november 2012 på Wayback Machine 854 * 96 *
PARP-9 3q13-q21 Q8IXQ6 Arkiverad 6 augusti 2010 på Wayback Machine 854 * 96 * BAL makro
PARP-10 8q24.3 Q53GL7 Arkiverad 3 november 2012 på Wayback Machine 1025 110
PARP-11 12p13.3 Q9NR21 Arkiverad 6 augusti 2010 på Wayback Machine 331 * 39 * C12orf6 WWE
PARP-12 7q34 Q9H0J9 Arkiverad 25 oktober 2012 på Wayback Machine 701 79 ZC3HDC1 DNA-bindande, WWE
PARP-14 3q21.1 Q460N5 Arkiverad 10 november 2012 på Wayback Machine 1720 * 194 * BAL2, KIAA1268 makro, WWE
PARP-15 3q21.1 Q460N3 Arkiverad 10 november 2012 på Wayback Machine 656 * 73 * BAL3 makro
PARP-16 15q22.2 Q8N5Y8 Arkiverad 10 november 2012 på Wayback Machine 322 * 36 * C15orf30 transkript upptäckt, protein okarakteriserat

* Betecknade genprodukter för vilka isoformer av mindre längd och molekylvikt också är kända.

Anteckningar

  1. ↑ EC 2.4.2.30 // IUBMB Enzyme Nomenclature . Hämtad 14 maj 2013. Arkiverad från originalet 20 juni 2013.
  2. ↑ Nilov, DC; Pushkarev, SV; Gushchina, I.V.; Manasaryan, GA; Kirsanov, KI; Shvyadas, VK (2020). "Modellering av enzym-substratkomplex av humant poly(ADP-ribos)polymeras 1". Biokemi . 85 : 116–125. DOI : 10.31857/S0320972520010091 .
  3. ↑ Piskunova TS, Yurova MN, Ovsyannikov AI, Semenchenko AV, Zabezhinski MA, Popovich IG, Wang ZQ, Anisimov VN. Brist på poly(ADP-ribos) polymeras-1 (PARP-1) påskyndar åldrande och spontan karcinogenes hos möss. Curr Gerontol Geriatr Res. 2008:754190. Epub 2008 14 april. PMID 19415146
  4. ↑ Espinoza LA, Smulson ME, Chen Z. Förlängd poly(ADP-ribos)-polymeras-1-aktivitet reglerar JP-8-inducerat fördröjt cytokinuttryck i alveolära makrofager. Free Radic Biol Med. 2007 maj 1;42(9):1430-40. Epub 2007 1 februari. PMID 17395016
  5. ↑ Zerfaoui M, Suzuki Y, Naura AS, Hans CP, Nichols C, Boulares AH. Nukleär translokation av p65 NF-kappaB är tillräcklig för VCAM-1, men inte ICAM-1, uttryck i TNF-stimulerade glatta muskelceller: Differentiella krav för PARP-1 uttryck och interaktion. cellsignal. 2008 Jan;20(1):186-94. Epub 2007 12 oktober. PMID 17993261
  6. ↑ Joseph A.; DeSoto; Chu Xia Deng. PARP-1-hämmare: är de de länge eftersökta genetiskt specifika läkemedlen för BRCA1/2-associerade bröstcancer? (engelska)  // International Journal of Medical Sciences   : journal. - 2006. - 15 juli ( vol. 3 , nr 4 ). - S. 117-123 . — ISSN 1449-1907 .
  7. ↑ Ame JC, Spenlehauer C., de Murcia G. PARP-superfamiljen. bioessays 2004; 26:882-893. . Hämtad 30 augusti 2010. Arkiverad från originalet 5 mars 2016.
  8. ↑ Manasaryan, G; Suplatov, D; Pushkarev, S; Drobot, V; Kuimov, A; Švedas, V; Nilov, D (2021). "Bioinformatisk analys av nikotinamidbindningsstället i poly(ADP-ribos) polymerasfamiljens proteiner". Cancer . 13 :1201 . doi : 10.3390/ cancers13061201 . PMID 33801950 . 


Länkar

 DNA-reparation
Excision reparation
Andra typer av reparationer
Andra proteiner
förordning