IFITM3

Identifierare

IFITM3 , 1-8U, DSPA2b, IP15, interferoninducerat transmembranprotein 3

Externa ID:n

OMIM: 605579 MGI: 1913391 HomoloGene: 136199 GeneCards: 10410

Genontologi
Funktioner	• GO:0001948, GO:0016582 plasmaproteinbindning
cellkomponent	• membrandel • endosom • membran • sent endosommembran • cellmembran • lysosomalt membran • Lysosom • GO:0009327 proteininnehållande komplex
biologisk process	• negativ reglering av viralt inträde i värdcellen • svar på interferon-gamma • immunsystemets process • svar på virus • svar på interferon-beta • svar på biotisk stimulans • negativ reglering av virusgenomreplikation • typ I interferon signalväg • GO: 0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 immunsvar • svar på interferon-alfa • Medfödd immunitet • negativ reglering av viral transkription • försvarssvar mot virus
Källor: Amigo / QuickGO

ortologer

Typer

Mänsklig

Mus

Entrez


10410


66141

Ensemble


ENSG00000142089


ENSMUSG00000025492

UniProt


Q01628


Q9CQW9

RefSeq (mRNA)


NM_021034


NM_025378

RefSeq (protein)


NP_066362


NP_079654

Locus (UCSC)

Chr 11: 0,32 – 0,33 Mb

Chr 7: 140,59 – 140,59 Mb

PubMed- sökning

[ett]

[2]

Redigera (människa)

Redigera (mus)

IFITM3 ( Interferon-inducerat transmembranprotein 3; GGT1 ) är ett membranprotein från familjen av interferon - inducerade membranproteiner, en produkt av den mänskliga genen IFITM3 [1] [2] [3] .

Hos människor representeras IFITM- familjen av 4 gener på den 11:e kromosomen : IFITM1 , IFITM2, IFITM3 och IFITM5 [4] . Hos möss inkluderar familjen 7 proteiner (det finns även IFITM6 och IFITM7).

Funktioner

IFITM3 är, liksom andra medlemmar i denna familj, ett antiviralt protein som hämmar virusintrång i den cellulära cytoplasman. Protein stör kolesterolhomeostasen . Hämmar virusets inträde i värdcellens cytoplasma genom att förhindra fusion av viruset med kolesterolutarmade endosomer. Det kan inaktivera nybildade viruspartiklar som knoppar från membranet i en infekterad cell på grund av att de knoppar från ett kolesterolfattigt membran. Proteinet är aktivt mot influensa A-virus, SARS - coronavirus , Marburg -virus, Ebola-virus , denguefebervirus , West Nile-virus , HIV-1 och vesikulärt stomatitvirus. Spelar en viktig roll i den strukturella stabiliteten och funktionen av det vakuolära ATPaset ( v-ATPas ). Interagerar med endosomalt v-ATPas, vilket är avgörande för korrekt lokalisering av klatrin och som krävs för att ATPas ska fungera för att avsyra fagocytiska endosomer, vilket resulterar i ett antiviralt tillstånd i cellen.

Anteckningar

↑ Lewin AR, Reid LE, McMahon M., Stark GR, Kerr IM Molekylär analys av en mänsklig interferon-inducerbar genfamilj // Eur J Biochem : journal. - 1991. - August ( vol. 199 , nr 2 ). - s. 417-423 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb16139.x . — PMID 1906403 .
↑ Tanaka SS, Yamaguchi YL, Tsoi B., Lickert H., Tam PP IFITM / Mil/fragilis-familjens proteiner IFITM1 och IFITM3 spelar distinkta roller i mus primordiala könscellers målsökning och repulsion // Dev Cell : journal. - 2005. - December ( vol. 9 , nr 6 ). - s. 745-756 . - doi : 10.1016/j.devcel.2005.10.010 . — PMID 16326387 .
↑ Entrez-gen: IFITM3-interferoninducerat transmembranprotein 3 (1-8U) . (obestämd)
↑ Hickford D., Frankenberg S., Shaw G., Renfree MB Utveckling av interferoninducerbara transmembranproteiner från ryggradsdjur // BMC Genomics : journal. - 2012. - Vol. 13 . — S. 155 . - doi : 10.1186/1471-2164-13-155 . — PMID 22537233 .

Litteratur

Vaarala MH, Porvari K., Kyllönen A., Vihko P. Differentiellt uttryckta gener i två LNCaP prostatacancercellinjer som reflekterar förändringar under prostatacancerprogression // Lab . Investera. : journal. - 2000. - Vol. 80 , nej. 8 . - P. 1259-1268 . - doi : 10.1038/labinvest.3780134 . — PMID 10950117 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning med användning av in vitro platsspecifik rekombination // Genome Res . : journal. - 2001. - Vol. 10 , nej. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Simpson JC; Wellenreuther R; Postka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering // EMBO Rep . : journal. - 2001. - Vol. 1 , nej. 3 . - s. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C.M.; Schuler, GD Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C.M.; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Gammal, S; Rasooly, R. Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline // Genome Res . : journal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Kimura K; Wakamatsu A; Suzuki Y; Ota, T; Nishikawa, T; Yamashita, R; Yamamoto, J; Sekine, M; Tsuritani, K. Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener // Genome Res . : journal. - 2006. - Vol. 16 , nr. 1 . - S. 55-65 . - doi : 10.1101/gr.4039406 . — PMID 16344560 .
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. LIFEdb-databasen 2006 // Nucleic Acids Res . : journal. - 2006. - Vol. 34 , nr. Databasproblem . - P. D415-D418 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .