Orthohantavirus

Orthohantavirus
Elektronmikrofotografi av Sin Nombre-virus
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:OrthornaviraeSorts:NegarnaviricotaUndertyp:PolyploviricotinaKlass:EllioviricetesOrdning:BunyaviralesFamilj:HantaviridaeSläkte:Orthohantavirus
Internationellt vetenskapligt namn
Orthohantavirus
Baltimore-gruppen
V: (-)ssRNA-virus
Systematik på Wikispecies Bilder på Wikimedia Commons NCBI   1980442

Orthohantavirus ( lat.  Orthohantavirus , tidigare Hantavirus ) är ett släkte av humana och animaliska virus från familjen Hantaviridae (hantavirus) av ordningen Bunyavirales . Sfäriska virioner som sträcker sig i storlek från 228 till 5051 nm är täckta med ett lipidmembran. Typstammen beskrevs första gången 1978. Som medlemmar av ordningen Bunyavirales har Orthohantavirus ett tredelat fragmenterat genom av negativt enkelsträngat RNA . Ett stort segment av genomet kodar för ett RNA-beroende RNA-polymeras (replikas ), det mellersta ett-tvåglykoproteinet i virusets yttre membran, och det lilla är nukleokapsidproteinet . Infektion med hantavirus hos invånare i Europa och Asien visar sig i en mild form av hemorragisk feber med njursyndrom , även om dödsfall under de senaste åren har rapporterats hos patienter med Dobrava - Belgrad ortohantavirus , varav fyra fall registrerades 2009 i Krasnodar-territoriet [2] . Namnen på virus tilldelas i enlighet med traditionen för taxonomi för arbovirus och robovirus  - i enlighet med det geografiska område där det hittades [3] . Sedan 2017, för att undvika förvirring i namnen på arter från en region för släktet Orthohantavirus , har ordet virus i dem ersatts av ortohantavirus [4] .

Symtom

Globalt kan två huvudkategorier särskiljas: Old World hantavirus och New World hantavirus .

Hemorragisk feber med njursyndrom

Hemorragisk feber med njursyndrom (HFRS) är en grupp av kliniskt likartade sjukdomar som orsakas av olika typer av hantavirus i den gamla världen. Bland dem finns: Hantaan orthohantavirus , Puumala orthohantavirus , Dobrava-Belgrade ortohantavirus och Khabarovsk orthohantavirus [5] . Dödligheten i denna sjukdom är i genomsnitt cirka 12 %.

Hantavirus kardiopulmonellt syndrom

Hantavirus kardiopulmonellt syndrom är en liknande grupp av kliniskt likartade sjukdomar som förekommer i Nord- och Sydamerika. Denna grupp av virus inkluderar arter som Andes orthohantavirus , Laguna Negra orthohantavirus , Rio Segundo virus och Sin Nombre orthohantavirus [6] . Dödligheten av denna sjukdom är i genomsnitt upp till 36 % [7] , även om den i vissa fall nådde 60 %.

Upptäcktshistorik

Det första stora mötet med hantavirus anses vara ett utbrott av en sjukdom som kallas "koreansk hemorragisk feber". Detta hände under Koreakriget 1950-1953. Då exponerades mer än 3 000 FN- soldater för ett okänt ämne som orsakade inre blödningar och nedsatt njurfunktion. Nivån av medicin vid den tiden tillät inte att fastställa orsaken till sjukdomen, så viruset förblev okänt fram till 1976.

Läkarna Lee och Johnson lyckades isolera det etiologiska medlet från en vanlig fältmus . Lungvävnaden hos fångade gnagare visade en specifik reaktion på blodserum hos patienter med koreansk hemorragisk feber. Senare gjordes en jämförelse mellan stammar av viruset som erhållits från möss och sjuka människor. En studie från samma år visade på ett samband mellan utbrott av en liknande sjukdom i Sovjetunionen [5] . För närvarande är koreansk hemorragisk feber känd som hemorragisk feber med njursyndrom och har visat sig vara orsakad av Hantaan orthohantavirus .

Ett sjukdomsutbrott och början av arbetet med studier av hantavirus i USA inträffade 1993 i Four Corners- regionen i Colorado . En ung och fysiskt frisk representant för Navajofolket mådde plötsligt illa, började kvävas och dog trots läkarnas bästa ansträngningar. Utredningen visade att även den unge mannens fästmö några dagar före händelsen dog av liknande symtom. På bara en kort tidsperiod registrerades fem liknande dödsfall. Forskare vid US Centers for Disease Control and Prevention använde en ny metod för molekylär analys av virus för att fastställa källan. Viruset visade sig vara en ny, hittills okänd art av hantavirus. Därefter fick viruset namnet Sin Nombre-viruset från spanskan för "namnlöst virus" [8] .

Klassificering

Arter registrerade med ICTV

Arter av släktet har liten likhet med andra grupper av virus. Den första klassificeringen av släktet Hantavirus föreslogs 1987 i en rapport till International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Därefter ändrades klassificeringen på grund av utvidgningen och korrigeringen av artsammansättningen. År 2017, i samband med beskrivningen av ordningen Bunyavirales , separerades släktet i den monotypiska familjen Hantaviridae , namnet ändrades till Orthohantavirus [9] och 41 arter ingick i det [4] :

Arter som väntar på registrering hos ICTV

Varje år ökar antalet upptäckta hantavirus. De erkänns antingen som typstammar av nya arter eller varianter av andra arter. Från och med mars 2017 är de virus som kan inkluderas i Orthohantavirus - släktet [4] :

• Altai virus
• Camp Ripley virus
• isla vista virus
• Jemez Springs virus
• Kilimanjaro virus
• Muleshoe virus
• Qian Hu Shan virus
• Rio Segundo-virus
• Shenyang virus
• Serang virus
• Uluguru virus
• Ussuri virus
• Xinyi virus
• xuan son virus
• Yuanjiang virus

Transportörer

Hantavirus är robovirus , vilket betyder att de sprids via gnagare . Dessutom är fall kända när infektion inträffade efter bett av vissa arter av insektsätande fladdermöss [12] . Olika typer av virus har nära band med sina bärare, vilket gör dem till naturliga reservoarer . Nu finns det inget exakt svar på om bärare av virus påverkar deras artbildning. Vissa studier tyder på att hantavirus anpassar sig till en ny värd och därigenom ändrar strukturen på deras RNA och bildar nya arter [13] [14] [15] . Andra studier visar att mutationshastigheten för RNA-virus motsvarar mutationer i andra virus med liknande struktur, varav man drar slutsatsen att hypotesen om ledutveckling är falsk [16] [17] .

I de flesta fall visar den naturliga reservoaren inga tecken på sjukdom från deras inhemska hantavirus [18] (undantaget är Puumala-viruset, som i vissa fall leder till att värden dör [19] ). När de infekteras med alternativa typer av hantavirus tar vuxna gnagare bort det fullständigt från kroppen inom 25-50 dagar, men för unga individer är infektionen oftast dödlig [20] .

En studie som genomfördes 2010 på Eurasiens, Nord- och Sydamerikas territorium visade att alla typer av hantavirus kan delas in i 3 globala grupper enligt underfamiljerna av gnagare som är deras bärare: möss , sorkar , bomullshamstrar [21] .

Överföra till en person

Oftast sker mänsklig infektion med hantavirus genom kontakt med gnagare eller deras avfallsprodukter (urin, saliv, lungsekret och spillning). Oftare uppstår infektion under varma och torra årstider, då människor går på promenader i skogen i stort antal. Viruset kommer in i människokroppen på olika sätt [22] :

• Inandning av mikropartiklar av spillning tillsammans med damm i luften, till exempel när man går in i övergivna eller malpåse lokaler, inklusive lador, garage och lager.
• Konsumtion av urinförorenat vatten och mat.
• Direktkontakt med en bärare (gnagarbett) är minst sannolikt att överföra detta virus.

Person-till-person överföring av sjukdomen är inte karakteristisk för hantavirus. Ändå förekommer sådana fall, men de har endast registrerats i Argentina [23] och Chile [24] .

Diagnostik

För närvarande används endast nukleokapsidproteinet för serologisk diagnos av hantavirusinfektioner . I klinisk praxis, för primär upptäckt av infektion och övervakning av den, används antikroppsserodiagnos i stor utsträckning i form av indirekt enzymkopplad immunosorbentanalys (ELISA).

Studie av hantavirus i Ryssland

Studien av hemorragisk feber med njursyndrom började i Ryssland för mer än 70 år sedan. De orsakande agenserna för denna sjukdom är Puumala- , Hantaan- , Seoul- och Dobrava-Belgrad- virus . Dessa inkluderar, förutom patogener för människor, även virus med epidemiologiska egenskaper som ännu inte har fastställts. På Rysslands territorium cirkulerar minst 8 hantavirusserotyper bland små däggdjur.

Den vanligaste naturliga fokala infektionen i Ryssland är hantavirusinfektion i form av hemorragisk feber med njursyndrom. Enligt Rospotrebnadzor, 2006, registrerades 7197 fall av sjukdomen hos dess folk i 48 regioner i Ryska federationen, incidensen  var 5 fall per 100 tusen av befolkningen, vilket är 1,4% mindre än 2005, men bland barn under fjorton år ökade incidensen med 17,3 %, det totala antalet sjuka personer i denna grupp är 195 personer; förekomsten av hantavirus är mer än 10-100 gånger högre än förekomsten av fästingburen encefalit , rabies och andra vanliga naturliga fokala infektioner [25] .

Förebyggande och infektionskontroll

För närvarande finns det ingen effektiv behandling för hantavirus, annat än att lindra symtomen, samt att stödja kroppens naturliga immunitet. Vid hantavirus hjärt-lungsyndrom förs patienter omedelbart till sjukhus och får hjälp att återställa andningsfunktionerna med flytande syre och mekanisk ventilation [26] .

Vid HFRS upprättas kontinuerlig övervakning av patienten - med hänsyn till injicerad och förlorad vätska (för att förhindra uttorkning ), kost nr 4 upprättas , varefter följande utförs: avgiftningsprofylax, antiviral terapi, antioxidantbehandling , samt förebyggande och behandling av infektiös-toxisk chock [27] .

Gnagarbekämpning är det bästa sättet att förhindra hantavirusinfektion, eftersom mänsklig infektion sker genom direktkontakt med kroppsvätskor och spillning. Det hjälper också till att förstöra gnagarbon, ta bort alla möjliga sprickor och hål i huset genom vilka gnagare kan ta sig in. Inhemska rovdjur som katter och illrar kan också vara en bra hjälp för att förebygga sjukdomar.

Under åren av Koreakriget (1949-1953) manifesterade sig hantavirusinfektionen tydligt, vilket tvingade forskare att påbörja arbetet med att skapa ett vaccin omedelbart efter upptäckten av hantavirus. Traditionellt utvecklade antivirala vacciner baserade på inaktiverade helvirionmaterial eller försvagade stammar användes under de första åren, men på grund av svårigheter att få fram hantaviruslysat med hög titer, användes okonventionella tillvägagångssätt även i kandidatvacciner mot hemorragisk feber med njursyndrom.[ vad? ] . Det mest beprövade och använda är det dödade vaccinet Hantavax , utvecklat av Institute of Viral Diseases i Sydkorea. I Kina testas fyra olika vacciner. I Europa skapade Institute of Medical Virology i Tyskland ett vaccin baserat på chimära partiklar av Puumala-viruset och vacciner baserade på rekombinanta proteiner [28] [29] . Sedan 1990-talet, Enterprise för produktion av bakteriella och virala preparat IPVE uppkallad efter. MP Chumakova utvecklar ett vaccin baserat på substratet av hjärnvävnaden hos syriska hamstrar [30] .

Anteckningar

1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
2. ↑ Boris Klempa, Evgeniy A. Tkachenko, Tamara K. Dzagurova, Yulia V. Yunicheva, Vyacheslav G. Morozov. Hemorragisk feber med njursyndrom orsakad av 2 härstamningar av Dobrava Hantavirus, Ryssland  // Nya infektionssjukdomar. — 2008-04. - T. 14 , nej. 4 . — S. 617–625 . — ISSN 1080-6059 1080-6040, 1080-6059 . - doi : 10.3201/eid1404.071310 . Arkiverad från originalet den 4 juli 2012.
3. ↑ Plusnin A. , Vaheri A. Saaremaa Hantavirus bör inte förväxlas med sin farliga släkting, Dobrava-virus  //  Journal of Clinical Microbiology : journal. - 2006. - April ( nr 44 ). — S. 1608 . - doi : 10.1128/JCM.44.4.1608-1611.2006 . .
4. ↑ 1 2 3 I släktet Hantavirus (föreslagen familj Hantaviridae , föreslagen ordning Bunyavirales ), skapa 24 nya arter, avskaffa 7 arter, ändra avgränsningskriterierna och ändra namnet på släktet till Orthohantavirus ; på samma sätt, byt namn på dess beståndsdelar  : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2016.023a-cM. - 2016. - P. 8, 14-15.
5. ↑ 1 2 Lee H. W. , Lee P. W. , Johnson K. M. Isolation of the etiologic agent of Korean Hemorrhagic fever  //  Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene : Journal. - 1978. - Mars ( nr 137 ). - s. 298-308 .
6. ↑ Padula P. J. , Colavecchia S. B. , Martinez V. P. , Gonzalez Della Valle M. O. , Edelstein A. , Miguel S. D. L. , Russi J. , Mora Riquelme J. , Colucci N. , Almiron M. , Rabinovich Distribution, R. D. Distribution, R. D. Hantavirusinfektion i fem länder i Sydamerika  (engelska)  // Journal of Clinical Microbiology : tidskrift. - 2000. - Augusti ( nr 38 ). - P. 3029-3035 .
7. ↑ Rapporterade fall av HPS: HPS i USA . Centers for Disease Control and Prevention (CDC) (21 april 2014). Hämtad 21 november 2015. Arkiverad från originalet 26 augusti 2017. (obestämd)
8. ↑ Fulhorst C. F. , Monroe M. C. , Salas R. A. , Duno G. , Utrera A. , Ksiazek T. G. , Nichol S. T. , de Manzione N. M. , Tovar D. , Tesh R. B. Isolation, karakterisering och geografisk spridning av det sydamerikanska Caño-viruset upptäckt hantavirus (familjen Bunyaviridae)  (engelska)  // Virusforskning: tidskrift. - 1997. - Oktober ( nr 51 ). - S. 159-171 .
9. ↑ Skapa en ny ordning, Bunyavirales , för att hysa nio familjer (åtta nya, en omdöpt) som omfattar tretton släkten  : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2016.030a-vM. - 2016. - S. 5, 13.
10. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Implementering av icke-latiniserade binomiska artnamn i familjen Bunyaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2015.003aM. - 2015. - S. 3-4.
11. ↑ Lista över mikroorganismer, toxiner, utrustning och teknologier som är föremål för exportkontroll  : [godkänd. Dekret från Ryska federationens president av den 20 augusti 2007 nr 1083]: tjänsteman. text: tillgänglig 1 juni 2016
12. ↑ Guo W. P. , Lin X. D. , Wang W. , Tian J. H. , Cong M. L. , Zhang H. L. , Wang M. R. , Zhou R. H. , Wang J. B. , Li M. H. , Xu J. , Holmes E. C. Z. Ursprung från Phylogeny-viruset från Phylogeny och  Zhangs harbor Y. Z. insektsätare och gnagare (engelska)  // PLoS Patogener : journal. - 2013. - Februari ( nr 9 ). - doi : 10.1371/journal.ppat.1003159 . .
13. ↑ Hughes A. L. , Friedman R. Evolutionär diversifiering av proteinkodande gener av hantavirus   // Molecular Biology and Evolution : tidning. - Oxford University Press , 2000. - Oktober ( nr 17 ). - P. 1558-1568 .
14. ↑ Plyusnin A. , Morzunov S. P. Virusutveckling och genetisk mångfald av hantavirus och deras gnagarvärdar  (engelska)  // Aktuella ämnen i mikrobiologi och immunologi: tidskrift. - 2001. - Nej . 256 . - S. 47-75 .
15. ↑ Jackson A. P. , Charleston M. A. A cofylogenetic perspective of RNA-virus evolution  //  Molecular Biology and Evolution : tidning. - Oxford University Press , 2004. - Januari ( nr 21 ). - S. 45-57 .
16. ↑ Ramsden C. , Melo F. L. , Figueiredo L. M. , Holmes E. C. , Zanotto P. M. , VGDN Consortium. Hög molekylär evolution i hantavirus   // Molecular Biology and Evolution : tidning. — Oxford University Press , 2008. — Juli ( nr 25 ). - P. 1488-1492 . - doi : 10.1093/molbev/msn093 . .
17. ↑ Ramsden C. , Holmes E. C. , Charleston M. A. Hantavirusutveckling i relation till dess gnagar- och insektsätare värdar  : inga bevis för kodivergens  // Molecular Biology and Evolution : tidning. - Oxford University Press , 2009. - Januari ( nr 26 ). - S. 143-153 . - doi : 10.1093/molbev/msn234 . .
18. ↑ B. Fildis , D. Knipe. Virologi. - M . : Mir, 1989. - T. 1. - S. 272-273. — ISBN 5-03-000283-9 . .
19. ↑ Kallio ER, Voutilainen L., Vapalahti O., Vaheri A., Henttonen H., Koskela E., Mappes T. Endemisk hantavirusinfektion försämrar vinteröverlevnaden för dess gnagarvärd  //  Ecology : journal. - 2007. - Augusti ( vol. 88 , nr 8 ). - P. 1911-1916 . - doi : 10.1890/06-1620.1 . — PMID 17824420 . . PMID 17824420 .
20. ↑ Schountz T. , Quackenbuch S. , Rovnak J. , Haddock E. , Black W. C. IV , Feldman H. , Prescott J. Differential Lymphocyte and Antibody Responses in Deer Mouse infected with Sin Nombre Hantavirus or Andes   Hantavirus // - 2014. - Augusti ( nr 88 ). - P. 8319-8331 .
21. ↑ Jonsson CB , Figueiredo LT , Vapalahti O. A Global Perspective on Hantavirus Ecology, Epidemiology, and Disease  //  Clinical Microbiology Reviews : journal. - 2010. - April ( nr 23 ). - s. 412-441 . - doi : 10.1128/CMR.00062-09 . .
22. ↑ Hur människor får Hantavirus lungsyndrom (HPS  ) . cdc.gov. Hämtad 24 november 2015. Arkiverad från originalet 21 mars 2021.
23. ↑ Padula P. J. , Edelstein A. , Miguel S. D. , López N. M. , Rossi C. M. , Rabinovich R. D. Hantavirus pulmonellt syndromutbrott i Argentina: molekylära bevis för person-till-person överföring av Andesvirus  //  Virology : journal. - 1998. - Februari ( nr 241 ). - s. 323-330 .
24. ↑ Toro J. , Vega J. D. , Khan A. S. , Mills J. N. , Padula P. , Terry W. , Yadón Z. , Valderrama R. , Ellis B. A. , Pavletic C. , Cerda R. , Zaki S. , Shieh W. J. . , Tapia M. , Mansilla C. , Baro M. , Vergara J.A. , Concha M. , Calderon G. , Enria D. , Peters C.J. , Ksiazek T.G. An outbreak of hantavirus pulmonary syndrome, Chile, 1997  (engelska)  // Virology : journal. - 1998. - 10-12 ( nr 4 ). - s. 687-694 .
25. ↑ Dekret från Ryska federationens överläkare av den 13 juni 2007 nr 33 "Om åtgärder för att förebygga sjukdomar hos personer med hemorragisk feber med njursyndrom" . Hämtad 29 november 2020. Arkiverad från originalet 24 juli 2018. (obestämd)
26. ↑ Safronetz D. , Ebihara H. , Feldmann H. , Hooper J. W. Den syriska hamstermodellen för hantavirus pulmonellt syndrom  (engelska)  // Antiviral Research : journal. - 2012. - September ( nr 95 ). - s. 282-292 . doi : 10.1016 / j.antiviral.2012.06.002 . .
27. ↑ Khunafina D.Kh., Galiyeva A.T. , Burganova A.N. , Syrtlanova G.R. Hemorragic fever with renal syndrome  (engelska)  // International Journal of Experimental Education: Journal. - 2010. - Nej . 12 . - S. 31-32 .
28. ↑ Maes P. , Clement J. , Van Ranst M. Nya tillvägagångssätt för utveckling av hantavirusvaccin  //  Emerging Infectious Diseases : tidning. - Centers for Disease Control and Prevention , 2009. - Januari ( nr 8 ). - S. 67-76 . - doi : 10.1586/14760584.8.1.67 . .
29. ↑ Schmaljohn C. Vacciner mot hantavirus  //  Vaccin: Journal. - 2009. - 5 november ( nr 27 ). - S. 61-64 . - doi : 10.1016/j.vaccine.2009.07.096 . .
30. ↑ Vacciner mot HFRS // Uppkomst och kontroll av gnagarburna virussjukdomar, Frankrike, Elsevier. 1999, 147-156.

Taxonomi	GBIF NCBI IRMNG