TPSB2

TPSB2 ( eng.  Tryptase beta-2 ; CF-kod 3.4.21.59) är ett enzym tryptas , en produkt av TPSB2 -genen [1] .

Struktur

Tryptas beta-2 består av 275 aminosyror och har en molekylvikt på 30,6 kDa.

Funktioner

Tryptaser är en del av S1 -familjen av trypsinliknande serinproteaser . De är katalytiskt aktiva i den heparinstabiliserade tetramera formen och är resistenta mot kända endogena proteashämmare. Flera tryptasgener är klustrade på kromosom 16p13.3 och delar några gemensamma egenskaper. Alla dessa gener har mycket konserverade 3' UTR och innehåller tandemupprepningar i 5'-änden, och deras 3' UTR spelar en roll för att reglera deras mRNA- stabilitet . Generna innehåller ett intron omedelbart efter start Met-kodonet, som separerar Met-kodonet från den proteinkodande sekvensen. Denna egenskap hos genstrukturen är karakteristisk huvudsakligen endast för tryptaser. TPSB2 - genen kännetecknas av sin mångfald av alleler, de två huvudsakliga, beta II och beta III, ansågs tidigare som separata proteiner. Beta-tryptaser är de huvudsakliga neutrala proteaserna som finns i mastceller som utsöndras från cellen under aktivering-degranuleringsprocessen. Kan spela en roll i medfödd immunitet [1] .

Även om de huvudsakliga fysiologiska substraten för beta-tryptaser inte har klarlagts, är det känt att dessa enzymer kan klyva flera potentiellt viktiga proteiner, inklusive fibrinogen , fibronektin , matrismetalloproteinasprekursorn pro -MMP-3 , den proteasaktiverade receptorn PAR2 och komplement komponent C3 [2] .

Se även

• Tryptas

Anteckningar

1. ↑ 1 2 Entrez-gen: tryptas beta 2 (gen/pseudogen) . (obestämd)
2. ↑ Fukuoka Y, Schwartz LB (2007). "Aktiva monomerer av humant beta-tryptas har utökade substratspecificiteter" . Int Immunopharmacol . 7 (14): 1900–8. DOI : 10.1016/j.intimp.2007.07.007 . PMC2278033  . _ PMID  18039527 .

Litteratur

• Miller JS, Moxley G, Schwartz LB (1990). "Kloning och karakterisering av ett andra komplementärt DNA för humant tryptas" . J.Clin. Investera . 86 (3): 864-70. DOI : 10.1172/JCI114786 . PMC296804  . _ PMID2203827  . _
• Hallgren J, Lindahl S, Pejler G (2005). "Strukturella krav och mekanism för heparinberoende aktivering och tetramerisering av humant betaI- och betaII-tryptas". J. Mol. biol . 345 (1): 129-39. DOI : 10.1016/j.jmb.2004.10.029 . PMID  15567416 .
• Sommerhoff CP, Bode W, Matschiner G, et al. (2000). "Den mänskliga mastcellen tryptase tetramer: en fascinerande gåta löst av struktur". biochim. Biophys. Acta . 1477 (1-2): 75-89. DOI : 10.1016/s0167-4838(99)00265-4 . PMID  10708850 .
• Huang C, Li L, Krilis SA, et al. (1999). "Humana tryptaser alfa och beta/II är funktionellt distinkta, delvis på grund av en enda aminosyraskillnad i en av ytslingorna som bildar den substratbindande klyftan." J Biol. Chem . 274 (28): 19670-6. DOI : 10.1074/jbc.274.28.19670 . PMID  10391906 .
• Caughey GH, Raymond WW, Blount JL, et al. (2000). "Karakterisering av mänskliga gamma-tryptaser, nya medlemmar av kromosom 16p mastcell tryptas och prostasin genfamiljer." J. Immunol . 164 (12): 6566-75. DOI : 10.4049/jimmunol.164.12.6566 . PMID  10843716 .
• Vanderslice P, Ballinger SM, Tam EK, et al. (1990). "Tryptas från mänskliga mastceller: flera cDNA och gener avslöjar en multigen serinproteasfamilj" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 87 (10): 3811-5. DOI : 10.1073/pnas.87.10.3811 . PMC  53993 . PMID2187193  . _
• Guida M, Riedy M, Lee D, Hall J (2000). "Karakterisering av två mycket polymorfa humana tryptasloki och jämförelse med en nyupptäckt aptryptasortolog." Farmakogenetik . 10 (5): 389-96. DOI : 10.1097/00008571-200007000-00002 . PMID  10898108 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121-7. DOI : 10.1101/gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
• Blom T, Hellman L (1993). "Karakterisering av ett tryptas-mRNA uttryckt i den humana basofila cellinjen KU812" . Scand. J. Immunol . 37 (2): 203-8. DOI : 10.1111/j.1365-3083.1993.tb01757.x . PMID  8434231 .
• Pallaoro M, Fejzo MS, Shayesteh L, et al. (1999). "Karakterisering av gener som kodar för kända och nya humana mastcelltryptaser på kromosom 16p13.3". J Biol. Chem . 274 (6): 3355-62. DOI : 10.1074/jbc.274.6.3355 . PMID  9920877 .
• Caughey G.H. (2002). "Ny utveckling inom genetik och aktivering av mastcellsproteaser". Mol. Immunol . 38 (16-18): 1353-7. DOI : 10.1016/S0161-5890(02)00087-1 . PMID  12217407 .
• Akin C, Soto D, Brittain E, et al. (2007). "Tryptashaplotyp i mastocytos: förhållande till sjukdomsvariant och diagnostisk användbarhet av totala tryptasnivåer" . Clin. Immunol . 123 (3): 268-71. DOI : 10.1016/j.clim.2007.02.007 . PMC  1949411 . PMID  17449330 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds cDNA-sekvenser för människor och mus" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 99 (26): 16899-903. DOI : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
• Sommerhoff CP, Bode W, Pereira PJ, et al. (1999). "Strukturen av den mänskliga betaII-tryptas-tetrameren: för (u)r bättre eller sämre" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 96 (20): 10984-91. DOI : 10.1073/pnas.96.20.10984 . PMC  34230 . PMID  10500112 .
• Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C, et al. (2001). "Sekvens, struktur och patologi för den fullständigt kommenterade terminalen 2 Mb av den korta armen av human kromosom 16". Brum. Mol. Genet . 10 (4): 339-52. DOI : 10.1093/hmg/10.4.339 . PMID  11157797 .
• Trivedi NN, Tamraz B, Chu C, et al. (2009). "Mänskliga försökspersoner är skyddade från mastcells-tryptasbrist trots frekvent nedärvning av mutationer med förlust av funktion" . J. Allergy Clin. Immunol . 124 (5): 1099-1105.e4. DOI : 10.1016/j.jaci.2009.07.026 . PMC2783561  . _ PMID  19748655 .
• Pereira PJ, Bergner A, Macedo-Ribeiro S, et al. (1998). "Humant beta-tryptas är en ringliknande tetramer med aktiva platser vända mot en central por." naturen . 392 (6673): 306-11. DOI : 10.1038/32703 . PMID  9521329 .
• Wu C, Ma MH, Brown KR, et al. (2007). "Systematisk identifiering av SH3-domänmedierade humana protein-protein-interaktioner genom peptidarray-målscreening". Proteomik . 7 (11): 1775-85. DOI : 10.1002/pmic.200601006 . PMID  17474147 .