Ett proteom är en uppsättning kroppsproteiner som produceras av en cell, vävnad eller organism under en viss tidsperiod. Eller, mer strikt, det är helheten av uttryckta proteiner i en given celltyp eller i en organism, vid en given tidsperiod under givna förhållanden. Termen är ett derivat av ordet "protein" (protein), som till sitt ursprung liknar ordet " genom " (helheten av alla gener i en organism).
Termen har tillämpats på flera olika typer av biologiska system. Ett cellproteom är en uppsättning proteiner som finns i en viss cell under vissa miljöförhållanden, till exempel under inverkan av vissa hormoner . En organisms kompletta proteom är den totala uppsättningen av proteomer för alla celler. Termen "proteom" hänvisar också till en uppsättning proteiner från en subcellulär organism, såsom ett virus (viralt proteom).
Proteomet, särskilt i eukaryoter , är större än genomet, vilket betyder att det finns fler proteiner än gener . Detta beror på alternativ splitsning , såväl som post-translationell modifiering av proteiner, såsom deras glykosylering och fosforylering .
Medan genomet definieras av sekvensen av nukleotider , är proteomet inte summan av aminosyrornas sekvenser . Proteomet inkluderar också de rumsliga strukturerna för alla proteiner den innehåller (se sekundär proteinstruktur , tertiär proteinstruktur ) och den funktionella interaktionen mellan dem.
Proteomics , vetenskapen om proteomer, har utvecklats till stor del genom separation av proteiner genom tvådimensionell elektrofores . Den första mätningen är separationen av proteiner baserat på deras elektriska laddning genom isoelektrisk fokusering . Den andra dimensionen är separationen av proteiner baserat på deras molekylvikt med en:SDS-PAGE-metoden .
Termen "proteom" föreslogs 1994 av den australiensiska vetenskapsmannen Mark Wilkins [1] vid symposiet 2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" i Siena , Italien . Termen dök upp i tryck 1995 [2] i publikationen av en del av Wilkins doktorsavhandling.
Proteomforskning är ett stort internationellt vetenskapligt projekt . År 2001 skapades den internationella Human Proteome Organization (HUPO ) för att arbeta med det . Deltagarna i projektet ägnar särskild uppmärksamhet åt proteinerna i blodet, levern och hjärnan.
| Personlig medicin | |
|---|---|
| Omix datasektioner | |
| Applikationssektioner | |
| Metoder | |
| Relaterade artiklar | |