Omicron-stam SARS-CoV-2

Omicron-stam SARS-CoV-2 ( SARS-CoV-2 Omicron , SARS-CoV-2 B.1.1.529 ) är en stam av SARS-CoV-2 coronavirus [1] , som först identifierades i Botswana och Sydafrika i november 2021, kännetecknad av ett stort antal mutationer i askmätare .

Vid infektion med omicron-stammen är sjukdomen enligt Världshälsoorganisationen lindrigare eller densamma som när den infekteras med delta-stammen . Den snabba spridningen av en ny stam kan dock leda till en hög belastning på sjukvården, och den totala risken som orsakas av den bedöms av WHO som "mycket hög" [2] . Kan infektera återvunna och vaccinerade [3] .

I slutet av december 2021 ersatte den snabbt deltastammen i de länder där den började spridas [4] . Finns i mer än 100 länder .

I Ryssland, enligt information den 7 juni 2022, stod omicron-stammen för 98,29 % av fallen av covid-19 som upptäcktes i landet, deltastammen – 0,43 % och andra varianter – 1,28 % [5 ] .

Funktioner

SARS-CoV-2-stammen B.1.1.529 är en ättling (representativ för generationslinjen) B.1.1 [6] .

Det kännetecknas av ett stort antal mutationer i spikeproteinet , mer än 30 [7] : A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S3731P, S37NF, S37NF, S37NF , N440K enligt subvarianten AY delta, som är utbredd i Europa [6] .

Omicron-stammen har många unika egenskaper. Vissa av dess mutationer liknar dem för delta- och beta-stammarna , men i slutet av november 2021 har stammar med mellanliggande mutationer, som vanligtvis uppstår under utvecklingen av det "vilda" viruset, inte tidigare identifierats. Frånvaron av mellanliggande virusmutationer i en population är ovanlig och oväntad för virologer [8] .

Det finns tre huvudhypoteser som förklarar uppkomsten av en ny stam [9] :

  1. Omicron-stammens förfäder gick helt enkelt obemärkt förbi i en population där det nya coronaviruset var dåligt övervakat och dess genom sällan sekvenserades (vi pratar inte om Sydafrika, som lade mycket ansträngning på att sekvensera genomerna av coronaviruset ). Även om vissa experter avvisar denna version som osannolik, eftersom det är svårt att föreställa sig det territorium inom vilket viruset kommer att utvecklas under en lång tid, förbli utanför forskarnas synfält och inte bryta sig ur det, kan en sådan möjlighet ändå inte uteslutas på grund av otillräckligt noggrann insamling och analys av genomet av det nya coronaviruset i många länder [9] [10] .  
  2. Viruset utvecklades hos en patient med nedsatt immunförsvar. Immunsystemet hos personer med immunsuppression orsakad av en viss sjukdom eller behandling kan inte snabbt undertrycka viruset, vilket resulterar i att det hinner mutera och förvärva förmågan att undgå immunsvaret; som ett resultat måste immunsystemet anpassa sig till en ny variant av viruset - denna kamp kan pågå i många månader, även om det för de flesta infekterade tar flera dagar [11] . Studier har visat att det nya coronaviruset, efter att ha utvecklats under flera månader i kropparna på människor som lider av HIV [12] och cancer [13] , har förvärvat ett antal mutationer som har observerats i oroande koronavirusstammar. Samtidigt avvisade en av virologerna som intervjuades av tidskriften Science denna hypotes, eftersom, enligt hans åsikt, mutationer som gör att viruset framgångsrikt kan överleva i en infekterad person skiljer sig mycket från mutationer som gör att det kan överföras mellan människor [ 9] .
  3. Viruset har gått från människa till djur och vice versa. Medan 6 miljoner nya mänskliga genetiska sekvenser för coronavirus har laddats upp till GISAID EpiCoV- , är endast 1 500 genetiska djursekvenser av det nya coronaviruset tillgängliga [14] . Detta är en "blind fläck" och kan dölja en ledtråd till ursprunget till omicron-stammen. I en studie studerades mutationer i spikeproteinet av omicron-stammen, och det visade sig att några av dem observerades i koronavirus som hittats hos möss och förbättrade spikproteinets förmåga att binda till musens ACE2 -receptorprotein [15] .

Symtom

Enligt data som erhållits från resultaten av ryska specialisters resa till Sydafrika liknar symtomen på infektion med omicron-stammen influensa [16] .

Sjukdomens svårighetsgrad och dödlighet

Frankrikes solidaritets- och hälsominister Olivier Veran meddelade i början av januari 2022 att omicron-stammen står för majoriteten av de inlagda patienterna på vanliga avdelningar, medan patienter på intensivvårdsavdelningar och intensivvårdsavdelningar huvudsakligen är infekterade med deltastammen [17] .

Det mildare förloppet av sjukdomen bevisas också av informationen som släpptes den 18 januari 2022 av Moskvas borgmästare Sergei Sobyanin: fördubblingen av incidensen av covid-19 på en vecka, som inträffade i samband med spridningen av en ny stam i Moskva, hade nästan ingen effekt på antalet sjukhusinläggningar [18] .

Den 24 december 2021 bedömde Världshälsoorganisationen (WHO) svårighetsgraden av sjukdomen i omicron-stammen som lägre eller samma som i delta-stammen [2] . Den 28 december 2021 uppgav chefen för Rospotrebnadzor, Anna Popova, baserat på data som erhållits i Sydafrika, att ett allvarligt sjukdomsförlopp vid infektering av en ny stam endast observeras hos ovaccinerade individer och de som förvärras av samtidiga sjukdomar - en svår form av diabetes och en svår form av onkologiska sjukdomar [19] .

Den belgiske virologen Mark Van Ranst , baserat på tillgängliga data i slutet av december 2021, konstaterade att unga människor inte påverkas eller påverkas i mindre utsträckning av den nya stammen, men dess effekt på äldre ska fortfarande studeras [20] .

I slutet av december 2021 blev uppskattningarna publicerade av UK Health Security Agency (UKHSA) kända , enligt vilka de som är infekterade med omicron-stammen löper 50-70 % mindre risk att åka till sjukhuset jämfört med de som är infekterade med deltastammen har forskare från Imperial College London dock fått lägre uppskattningar, enligt vilka denna risk minskas med endast 15-20% [21] .

Enligt data som erhållits i Sydafrika av National Institute of Infectious Diseases i Sydafrika och University of Pretoria , har dödligheten från omicron-stammen minskat med 75 % jämfört med tidigare vågor av covid-19. Uppgifterna erhölls genom att övervaka patienter på ett sjukhus i stadsdelen Tswane (provinsen Gauteng ): bland de som togs in med denna stam dog 4,5 % av patienterna, och innan andelen dödsfall var 21,3 %. Dessutom skrevs de infekterade med omicron-stammen ut från sjukhuset snabbare: i genomsnitt redan fyra dagar efter sjukhusvistelsen och lunginflammation utvecklades hos endast en tredjedel av patienterna [22] .

Å andra sidan har tidiga uppskattningar av virulensen av omicron-stammen betydande metodologiska brister [23] [24] . Det är nödvändigt att separera den verkliga minskningen av virusets virulens från effekten av tidigare immunitet: omicron-stammen slipper immunsvaret bättre, varför det är mer sannolikt att infektera vaccinerade och tillfrisknade patienter, som är mer benägna att tolerera infektion med denna stam. Även om forskare försöker redogöra för återinfektioner och tillgången på vaccinationer, kan en stor del av återinfektionerna fortfarande gå obemärkt förbi. Således medgav författarna till en tidig studie från Sydafrika, som visade en 80-procentig minskning av risken för sjukhusvistelse efter infektion med omicron jämfört med risken efter infektion med delta-stammen, att ofullständiga vaccinationsdata och ett stort antal obemärkta reklamationer. -infektioner svarar inte fullt ut för effekten av tidigare immunitet [25] . Författarna till den brittiska analysen från UKHSA erkände också att deras justeringar kanske inte fullt ut tar hänsyn till effekten av återinfektioner på grund av deras underskattning [26] . Data från Danmark, ett land med ett stort befolkningstestsystem och en låg andel oupptäckta covid-19-fall, visade en 36 % minskning av risken för sjukhusvistelse på grund av omicron-stammen jämfört med risken för sjukhusvistelse på grund av deltastammen [ 27] .

Det är troligt att både förvärvad immunitet och minskad omikronvirulens i sig står för den minskade risken för sjukhusvistelse hos omikroninfekterade individer. Minskad sjukdomsgrad med omicroninfektion observerades också hos laboratoriedjur [28] , dessutom visade studien att omicron förökade sig sämre i mänskliga lungor än den ursprungliga stammen av SARS-CoV-2 [29] .

Spridningshastighet

Enligt WHO sprider sig den nya stammen snabbare än de tidigare [2] . Data från ryska specialister [16] talar också om en betydligt högre fortplantningshastighet . Detta kan bero på den höga hastigheten av virusreproduktion i bronkierna och näsans epitel och dess förmåga att kringgå immunförsvaret [30] .

Den snabba spridningen av omicron-stammen [19]och risken för dess överbelastning[2]leder till en ökad belastning på sjukvården[31]och ökningen av antalet fall[2] [32] . Så i ett antal länder, till exempel USA, Israel och Danmark, har vågen av infektioner med omicron redan orsakat rekordmånga sjukhusinläggningar.

Sjuklighet bland barn och ungdomar

Barn infekteras med omicron-stammen oftare än i tidigare vågor av sjuklighet [16] [32] och kräver intensivvård oftare; ungdomar är också oftare sjuka [32] .

Upptäckt och distribution

Antal länder med identifierade infektionsfall
datumet Antal länder
30 november 2021 [33] cirka 20
2 december 2021 [34] 32
12 december 2021 [3] 63
24 december 2021 [2] 110

Omicron-stammen identifierades först den 9 november 2021 i Botswana och några dagar senare i Sydafrika [35] . Den 11 november infördes först SARS-CoV-2 B.1.1.529-stammen i databaserna. Sedan identifierades flera fall i Sydafrika [7] .

Det första fallet av infektion med en ny stam i Europa registrerades i Belgien hos en resenär som återvände från Egypten den 11 november ; de första symtomen dök upp den 22 november [36] .

Senast den 26 november 2021 hittades B.1.1.529 även i länder som Israel , Storbritannien , Nederländerna , Hongkong och myndigheterna i Tjeckien och Tyskland meddelade att deras medborgare som återvänt från Egypten och Sydafrika var troligen infekterad med en ny stam ) [7] .

Den 2 december 2021 registrerades 514 fall av infektion i 32 länder, varav 227 i Sydafrika [34] .

I slutet av december 2021, i de länder där den började sprida sig, ersätter den nya stammen snabbt deltastammen [4] (särskilt detta händer i Danmark, Norge, Storbritannien och USA) [37] , men i Ryssland har denna process ännu inte observerats [4] . Tidigare, i slutet av november 2021, uppgav Världshälsoorganisationen att den anser att ytterligare spridning av en ny stam av coronavirus runt om i världen är trolig [38] .

Australien

I slutet av december 2021 registrerades det första fallet av dödsfall från infektion med omicron-stammen i Australien [39] .

Belgien

Den 28 december 2021 står omicron-stammen för 60 % av infektionerna i Belgien. Trots att lokala experter anser att den nya stammen är mindre farlig, anser de att en boosterdos av vaccinet (revaccination) är viktig [20] .

Bulgarien

Den 3 januari 2022 blev det känt att de första 12 fallen av infektion med omicron-stammen upptäcktes i Bulgarien, som hittades hos 9 män och 3 kvinnor som bor i Sofia (11 personer) och dess förorter (1 person). Bland dem var 5 personer helt vaccinerade mot COVID-19 för nio månader sedan med läkemedel från Pfizer, Moderna och Johnson & Johnson, men ingen av dem fick omvaccination. Endast en person bland de smittade har nyligen rest utomlands. Ingen av patienterna behöver sjukhusvård [40] .

Storbritannien

Den 2 december 2021 har 75 fall av infektion med omicron-stammen rapporterats i Storbritannien [34] .

Men snart, den 13 december 2021, rapporterade BBC att omicron-stammen redan står för 20 % av fallen av covid-19-infektion i England och 44 % i London. Dessutom har dödsfallet för minst en person som smittats med denna stam bekräftats. Den brittiske premiärministern Boris Johnson rekommenderade att hans landsmän fick en boosterdos av vaccinet och inte anser att omicron-stammen är mindre farlig än sina föregångare [41] .

Dessutom har BBC rapporterat att antalet infektioner med en ny stam fördubblas varannan eller var tredje dag, så att ett litet antal infektioner på kort tid kan bli enorma [41] .

Danmark

Den 28 november 2021 upptäcktes två fall av infektion med omicron-stammen i Danmark [42] .

Irland

I Irland registrerades den 25 december 2021 över 13,7 tusen nya fall av covid-19-infektion, vilket är 2,5 tusen fler än dagen innan. Det antas att omicron-stam står för 83% av dem [43] .

Kina

Den 14 december 2021 upptäcktes de två första fallen av infektion med omicron-stammen i Kina [44] .

Ryssland

Antalet upptäckta fall av infektion med omicron-stammen i Ryssland
datumet Antal infektioner
6 december 2021 [45] 2
16 december 2021 [46] 25
21 december 2021 [47] 41
30 december 2021 [48] 103
11 januari 2022 [49] 305
12 januari 2022 [50] 698
18 januari 2022 [51] 1682

Den 6 december 2021 upptäcktes omicron-stammen hos två ryssar som anlände från Sydafrika [45] .

Den 22 december 2021 blev det känt om förekomsten av lunginflammation hos en av de smittade ryssarna. Patienten var i ett tillstånd av måttlig svårighetsgrad [52] .

Enligt officiella uppgifter, från och med den 25 december 2021, importeras alla bekräftade fall av infektion med omicron-stammen i Ryssland [53] [Komm. 1] ; Från och med den 30 december upptäcktes alla fall av infektion med omicron-stammen antingen bland ankomster utanför Ryssland eller bland de som hade nära kontakt med ankomsterna [55] .

Den 6 januari 2022 bekräftade hälsominister Mikhail Murashko att fall av infektion med omicron-stammen av det nya coronaviruset hittades bland människor som inte lämnade Ryska federationen [56] .

Geografi för upptäckt av omicron-stammen i Ryssland:

16 december 2021 – Moskva, Moskvaregionen, St. Petersburg, Rostov-on-Don [46]

11 januari 2022 - 13 regioner [49] [Komm. 2]

18 januari 2022 – 42 regioner [51] [57]

20 januari 2022 – 55 regioner [58]

24 januari 2022 – 64 regioner [59]

25 januari 2022 – 68 regioner [59]

Den 11 januari 2022 sa chefen för Rospotrebnadzor, Anna Popova , att mot bakgrund av spridningen av omicron-stammen kan den dagliga ökningen av incidensen av covid-19 bli sexsiffrig (i hundratusentals). Popova rapporterade också att omicron-stammen importerades till Ryssland från 25 länder och att det största antalet fall av dess import inträffade i Förenade Arabemiraten , Storbritannien och Turkiet [49] .

Från och med den 12 januari 2022 var majoriteten av fallen i Moskvaregionen [50] .

Enligt uppgifter som publicerades samma dag av Veronika Skvortsova översteg andelen av de som var infekterade med omicron-stammen i Moskva 76%. Dessa data erhölls av Federal Medical and Biological Agency (FMBA), ledd av henne, medan de undersökte deras testsystem utformat för att detektera omicron-stammen [60] [Comm. 3] .

Senast den 18 januari 2022, enligt Tatyana Golikova , den ryska regeringens vice premiärminister , dominerade omicron-stammen i Moskva, Moskvaregionen och St. Petersburg [51] .

Samma dag publicerades en intervju med epidemiologen Alexander Gorelov , enligt vilken situationen i den europeiska delen av Ryssland och bortom Ural inte var densamma, och deltastammen fortsatte att dominera i Rysslands Fjärran Östern [31] .

Enligt information som släpptes den 20 januari 2022 av det operativa huvudkontoret för kampen mot en ny coronavirusinfektion stod omicron-stammen för 42,8 % av fallen av covid-19 som upptäcktes i landet, och deltastammen stod för 56,2 % [ 58] .

Därefter ersatte omicron-stammen nästan helt delta-stammen, och den 7 juni 2022 stod 98,29 % av fallen av covid-19 som upptäckts i Ryssland för omicron-stammen (0,43 % för delta-stammen, 0,43 % för den andra alternativ - 1,28%) [5] .

USA

Den 1 december 2021 upptäcktes det första fallet av infektion med omicron-stammen i USA [61] .

Det första fallet av dödsfall från infektion med en ny stam registrerades den 21 december 2021. Enligt lokala hälsomyndigheter var mannen inte vaccinerad och förvärrades av samsjukligheter [61] .

Enligt U.S. Centers for Disease Control and Prevention stod omicron-stammen för veckan från 26 december 2021 till 1 januari 2022 för 95,4 % av nya infektioner, medan deltastammen stod för de återstående 4,6 %. Under föregående vecka (som avslutades den 25 december) stod dessa stammar för 77 % respektive 22,8 % av det totala antalet infektioner [61] .

Den 4 januari 2022 blev det känt att mer än 1 miljon fall av covid-19-infektion upptäcktes i USA under det senaste dygnet (detta är uppgifter från Johns Hopkins University). Således uppdaterades det maximala antalet infektioner sedan pandemins början [62] .

Denna siffra överskreds betydligt den 11 januari 2022, då antalet upptäckta infektioner var 1,35 miljoner [63] .

Portugal

Den 29 november 2021 upptäcktes 13 fall av infektion med omicron-stammen i Portugal [64] . Mindre än en månad senare blev denna stam dominerande och stod för 61,5 % av covid-19-infektionerna den 22 december 2021. Det absoluta antalet personer som smittades av covid-19 i Portugal den 25 december 2021 var 12,9 tusen personer, vilket motsvarar nivåerna i januari 2021 [43] .

Från den 25 december 2021 trädde restriktiva åtgärder i kraft i Portugal: skolor, barer och nattklubbar planeras vara stängda till den 10 januari 2022, portugiserna uppmanades att arbeta på distans, och masker blev obligatoriska i lokalerna [ 43] .

Frankrike

Mot bakgrund av den snabba spridningen av omicron-stammen, i början av januari 2022, översteg det dagliga antalet infektioner i Frankrike rekord 200 000 personer per dag [17] .

Sydkorea

I slutet av december 2021 registrerades döden av två 90-åriga män infekterade med omicron-stammen i landet; den exakta dödsorsaken specificeras [65] .

Konsekvenser

Inträdesbegränsningar

Tyskland , Italien och Storbritannien har förbjudit inresa för personer från Sydafrika [66] . Sedan den 28 november 2021 har Ryssland begränsat inresan för utländska medborgare från nio afrikanska länder och Hongkong [67] .

Stoppa produktionen

Toyota har tagit det påtvingade beslutet att stänga 11 av sina 15 stora fabriker i Japan på grund av en hög ökning av antalet omicron-infektioner bland anställda. Förmodligen kommer stilleståndstiden för 21 rader av bilfabriker att pågå åtminstone från 21 januari till 24 januari 2022 [68] .

Inställda flyg

Infektion av piloter, observerad i länder med en intensiv spridning av omicron-stammen, leder till inställda flygningar [32] .

Inställda massevenemang

Den 29 november 2021, på grund av spridningen av en ny stam, ställdes World Winter Universiaden 2021 in , som var tänkt att hållas i december i Schweiz . Det var tidigare omplanerat från januari 2021 [69] .

Den 2 december 2021 ställdes finalen av Konståknings Grand Prix i Osaka , Japan, som var tänkt att äga rum den 9 till 12 december, på grund av att landets regering stängde inträde för utlänningar från den 30 november [70] .

Övergång till fjärrarbetsläge

Från den 21 januari 2022 bör Ryska federationens regering, federala departement och deras territoriella divisioner, i enlighet med premiärministerns instruktioner, om möjligt byta till ett avlägset arbetssätt; lösningen orsakas av spridningen av omicron-stammen. Vid denna tidpunkt började även stora ryska företag att öka antalet anställda som arbetar på distans [71] .

Isolering av Shanghai

I slutet av mars 2022, som ett resultat av spridningen av en undertyp av omicronvirus, kallad stealth omicron (BA.2), tillkännagavs den största karantänen i Kina på två år i Shanghai [72] . Hela staden, vars befolkning är cirka 26 miljoner människor, sattes i karantän [73] . Kollektivtrafiken har slutat fungera i staden. Många organisationer har, för att fortsätta arbeta under karantänperioden, låst in arbetare på företag, eftersom förflyttning runt staden är förbjuden. Lockdownen i Shanghai påbörjades den 28 mars 2022 [74] och den totala lockdownen infördes den 5 april [73] . Anledningen till införandet av en sådan masslåsning var det stora antalet asymtomatiska bärare av en ny variant av virusstammen [75] .

Immunsvar mot omicron-stammen

Även om de vaccinerade är bättre skyddade mot den nya stammen än de ovaccinerade [76] , kan omicron-stammen infektera tillfrisknade och vaccinerade personer.

Både laboratorieförsök och epidemiologiska data tyder på möjligheten av infektion med omicron-stammen hos vaccinerade och vaccinerade [21] .

Å andra sidan kommer de vaccinerade, infekterade med omicron-stammen, enligt preliminära data, att få immunitet som skyddar mot infektion med delta-stammen. Detta bevisas av resultaten från forskare från Sydafrika, som studerade neutraliseringen av viruspartiklar med antikroppar från blodet hos de som varit sjuka (eller de som varit sjuka och samtidigt vaccinerade). Studien omfattade 23 personer (varav 10 vaccinerade) som nyligen hade haft en sjukdom orsakad av omicron-stammen. Forskarna fann att omicron-infektion ökade nivån av antikroppar mot delta-stammen 6-faldigt hos de vaccinerade, men bara 2,5-faldigt hos de ovaccinerade, och hos dem var denna ökning inte statistiskt signifikant. Provstorleken är dock liten, och författarna varnar för att vissa ovaccinerade deltagare kan ha haft en oupptäckt tidigare deltainfektion som gav dem viss immunitet mot deltastammen redan innan studiens start [77] .

En annan studie på möss som uttrycker humant ACE2 visar att sera från omicron-infekterade möss inte neutraliserade andra stammar väl, även om sera från människor som vaccinerades och infekterades med omicron klarade sig bra på att neutralisera alla studerade stammar [78] .

Forskning om vacciner

I slutet av december 2021 publicerade UK Health Safety Authority (UKHSA) data från en studie som visar att skyddet mot omicron-stammen som erhålls under vaccination och omvaccination minskar snabbt över tiden [21] .

Studien jämförde andelen vaccinerade bland individer som fick positiva respektive negativa PCR-testresultat för COVID-19. 68,5 tusen fall av infektion med omicron-stammen och ungefär dubbelt så många fall av infektion med delta-stammen beaktades. Deltagarna fick två doser av AstraZeneca, BioNTech/Pfizer eller Moderna under primärvaccinationen och en dos av BioNTech/Pfizer eller Moderna under boostern [21] .

Bland dem som först vaccinerades med AstraZeneca-vektorvaccinet och sedan med ett av mRNA-vaccinerna var effektiviteten av skyddet mot omicron-stammen cirka 60 % två till fyra veckor efter revaccinationen och sjönk till 35 % efter två månader (revaccination) med BioNTech /Pfizer) och 45% (revaccination med Moderna) [21] .

Bland de som först vaccinerades med BioNTech/Pfizer var skyddet 70 % kort efter revaccination (booster med BioNTech/Pfizer) och sjönk sedan till 45 %. Efter revaccination med Moderna hölls skyddet på 70–75 % i nio veckor [21] .

Den lilla mängden data om de som vaccinerats med Moderna-vaccin och sedan omvaccinerats tillät inte beräkningar, men efter 20-24 veckor efter primärvaccinationen sjönk effektiviteten av skyddet mot infektion till nästan noll [21] .

Den publicerade artikeln anger att de gjorda beräkningarna kan vara felaktiga och bör tas med försiktighet [21] .

En nyare rapport från UKHSA, publicerad den 27 januari, innehåller också data om effektiviteten av vacciner mot sjukhusvistelse och dödsfall. Upp till 25 veckor efter vaccination var effekten av de två primära doserna av Pfizer och AstraZeneca mot sjukhusvistelse 50-80 %, för de mer än 25 veckorna efter vaccination sjönk den till 25-35 %. Boosterdosen av Pfizer återställde effektiviteten av vacciner mot sjukhusvistelse till 90 %, efter 10-14 veckor sjönk den till 75 %. Effektiviteten av vacciner mot sjukhusvistelse hos dem som vaccinerats med en boosterdos av Moderna bibehölls på 90-95 % i 9 veckor.

Vaccinets effekt mot dödsfall mer än 25 veckor efter två doser av vaccinet visade sig vara 59 % (med ett brett konfidensintervall på 4-82 %), och nådde 95 % hos dem som vaccinerades med tre doser [79] .

Data från USA visade att 6 månader efter den andra dosen av mRNA-vaccinet inte fanns någon signifikant effekt på infektionsrisken. Effektiviteten av tre doser vaccin var i genomsnitt 67 % [80] . En annan studie utvärderade effektiviteten av mRNA-vacciner mot akutbesök och sjukhusvistelser [81] .

Effektiviteten av mRNA-vacciner mot olika utfall av infektion med omicron-stammen av coronavirus
Dos Intervall efter 2 doser Effekt mot akutbesök Effektivitet kontra sjukhusvistelse
2 14-179 dagar 52 % 81 %
2 ⩾179 dagar 38 % 57 %
3 ⩾14 dagar 82 % 90 %

Tidiga data från Danmark visade att effekten av omicron-vaccination blev negativ 3 månader efter den andra dosen [82] . Antivaccinatorer har därför hävdat att vaccination ger människor en ökad risk för omicroninfektion. Detta beror dock med största sannolikhet på att resenärer som vaccinerades kan vara de första att bli infekterade med omikroner, vilket förvrängde resultaten av att studera tidiga fall av infektion. Dessutom har alla observationsstudier av vaccinationens effektivitet vissa nackdelar: de tar inte hänsyn till eventuella skillnader i beteende och testfrekvens mellan vaccinerade och ovaccinerade [83] .

WHO noterar att inför minskande vaccineffektivitet är skyddsbeteenden som att hålla avstånd, bära masker och ventilera rum viktigt för att förhindra spridning av infektion [84] .

Modifiering av vacciner

Den 29 november 2021, chef för NICEM uppkallad efter N. F. Gamalei, akademiker vid Ryska vetenskapsakademin Alexander Gintsburg uppgav att hans anställda kan utveckla ett vaccin mot omicron-stammen på tio dagar, och tillstånd för dess användning kan erhållas inom minst 45 dagar [85] , och den 14 december, 2021 meddelade han att centret redan har utvecklat en modifierad version av vaccinet för den nya stammen [86] .

Den 23 december 2021 uppgav Alexander Gintsburg dock att modifiering av Sputnik V -vaccinet för omicron-stammen inte skulle behövas förrän det fanns kliniska bevis på ett allvarligt sjukdomsförlopp hos dem som vaccinerades med detta vaccin enligt " fullt schema, dubbelvaccination plus revaccination" [87] .

Anteckningar

Kommentarer

  1. ↑ Detta överensstämmer inte med inofficiella data, enligt vilka fall av inhemsk infektion med en ny stam registrerades av specialister från Research Institute of Influenza. A.A. Smorodintsev i mitten av december 2021 [54] .
  2. ↑ Vid denna tidpunkt var omicron-stammen registrerad i Moskva, St. Petersburg, Perm-territoriet, Leningrad, Moskva, Murmansk, Nizhny Novgorod, Oryol, Orenburg, Rostov och Ryazan-regionerna, Republiken Basjkirien och Republiken Ingusjien [49] .
  3. ↑ FMBA tillkännagav utvecklingen av sitt eget testsystem för att detektera omicron-stammen dagen innan, den 11 januari. Det tillkännagavs att testsystemets uppsättning reagens gör det möjligt att detektera och skilja mellan omicron- och delta-stammar [60] .

Länkar

  1. ↑ Kraftigt muterad variant av coronavirus sätter forskare på beredskap  (  25 november 2021). Arkiverad från originalet den 26 november 2021. Hämtad 26 november 2021.
  2. ↑ 1 2 3 4 5 6 Omicron har identifierats i 110 länder runt om i världen . Kommersant (24 december 2021). Hämtad 24 december 2021. Arkiverad från originalet 24 december 2021.
  3. ↑ 1 2 Isakova E. WHO anser att omicron-stammen av coronavirus är mindre farlig än delta . RIA Novosti . Hämtad 12 december 2021. Arkiverad från originalet 12 december 2021.
  4. ↑ 1 2 3 Anastasia Selivanova. Popova förutspådde förskjutningen av "delta" -stammen av " omicron"
  5. ↑ 1 2 Rospotrebnadzor rapporterade att omicron står för 98,29 % av fallen av covid som upptäckts i Ryska federationen // TASS , 06/07/2022.
  6. ↑ 1 2 B.1.1 avkomling associerad med södra Afrika med högt antal Spike-mutationer #  343 . cov-lineages/pango-designation (24 november 2021). Hämtad 26 november 2021. Arkiverad från originalet 26 november 2021.
  7. ↑ 1 2 3 Vad är känt om omicron-stammen av coronavirus  : [ arch. 26 november 2021 ] // TASS . - 2021. - 26 november.
  8. ↑ Tomova, E. Immunolog Kryuchkov talade om egenskaperna hos "omicron" // Gazeta.ru. - 2021. - 29 november.
  9. ↑ 1 2 3 Var kom "konstiga" Omicron ifrån?  (engelska) . www.science.org . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 22 december 2021.
  10. ↑ Wentai Ma, Jing Yang, Haoyi Fu, Chao Su, Caixia Yu. Genomiska perspektiv på den framväxande SARS-CoV-2 omicron-varianten  //  Genomics, Proteomics & Bioinformatics. — 2022-01-13. — ISSN 1672-0229 . - doi : 10.1016/j.gpb.2022.01.001 . Arkiverad från originalet den 1 februari 2022.
  11. ↑ Talha Burki. Ursprunget till SARS-CoV-2-varianter av oro  //  The Lancet Infectious Diseases. — 2022-02-01. - T. 22 , nej. 2 . — S. 174–175 . — ISSN 1474-4457 1473-3099, 1474-4457 . - doi : 10.1016/S1473-3099(22)00015-9 .
  12. ↑ Sandile Cele, Farina Karim, Gila Lustig, James Emmanuel San, Tandile Hermanus. SARS-CoV-2 avancerad infektion under avancerad HIV-sjukdom utvecklar omfattande immunflykt  //  Cell Host & Microbe. — 2022-01-14. — ISSN 1931-3128 . - doi : 10.1016/j.chom.2022.01.005 . Arkiverad från originalet den 1 februari 2022.
  13. ↑ En canceröverlevande hade den längsta dokumenterade covid-19-infektionen.  Här är vad forskarna lärde sig . www.science.org . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 1 februari 2022.
  14. ↑ Uttalande från den rådgivande gruppen om SARS-CoV-2-evolution hos  djur . Världsorganisationen för djurhälsa . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 11 januari 2022.
  15. ↑ Changshuo Wei, Ke-Jia Shan, Weiguang Wang, Shuya Zhang, Qing Huan. Bevis för ett musursprung av SARS-CoV-2 Omicron-varianten  //  Journal of Genetics and Genomics. — 2021-12-01. — Vol. 48 , iss. 12 . — S. 1111–1121 . — ISSN 1673-8527 . - doi : 10.1016/j.jgg.2021.12.003 . Arkiverad från originalet den 30 januari 2022.
  16. ↑ 1 2 3 Murashko talade om resultaten av ryska specialisters resa till Sydafrika Arkivkopia daterad 29 december 2021 på Wayback Machine // TASS , 2021-12-25.
  17. ↑ 1 2 Vladislav Gordeev. Chefen för det franska hälsoministeriet kallade "omicron" en möjlig "sista våg" Arkivkopia daterad 10 januari 2022 på Wayback Machine
  18. ↑ Sobyanin såg ingen ökning av antalet sjukhusinläggningar mot bakgrund av spridningen av "omicron" Arkivkopia av 18 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 2022-01-18.
  19. ↑ 1 2 Popova: coronavirus visar säsongsvariationer och kommer att fortsätta att mutera
  20. ↑ 1 2 Belgiska experter uttryckte optimism om konsekvenserna av "omicron" Arkiverad 29 december 2021 på Wayback Machine // Interfax , 2021-12-28.
  21. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Marat Kuzaev. "Omicron": skydd mot "delta" och fördelarna med boosters. Huvudsaken om pandemin från utländska medier Arkivexemplar av 5 januari 2022 på Wayback Machine // TASS-Nauka, 2021-12-30.
  22. ↑ Forskare från Sydafrika avslöjade data om dödlighet från omicron-stammen Arkivkopia daterad 2 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 12/30/2021.
  23. ↑ Är Omicron verkligen mindre allvarlig än tidigare COVID-19-varianter?  (engelska) . www.gavi.org . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 1 februari 2022.
  24. ↑ Så är omicron mjukare än delta, eller inte? Forskare har äntligen data som gör att vi kan dra tillförlitliga slutsatser Hur infektionen skiljer sig på cellnivå har också blivit tydligare . Medusa. Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 1 februari 2022.
  25. ↑ Nicole Wolter, Waasila Jassat, Sibongile Walaza, Richard Welch, Harry Moultrie. Tidig bedömning av den kliniska svårighetsgraden av SARS-CoV-2 omicron-varianten i Sydafrika: en datakopplingsstudie  //  The Lancet. — 2022-01-29. - T. 399 , nr. 10323 . — S. 437–446 . — ISSN 1474-547X 0140-6736, 1474-547X . - doi : 10.1016/S0140-6736(22)00017-4 .
  26. ↑ Teknisk information: Uppdatering om sjukhusvistelse och vaccinets effektivitet för Omicron VOC-21NOV-01 (B.1.1.529  ) . UK Health Security Agency 4 (2021-31-12). Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 27 januari 2022.
  27. ↑ Peter Bager, Jan Wohlfahrt, Samir Bhatt, Sofie Marie Edslev, Raphael Niklaus Sieber. Minskad risk för sjukhusvistelse i samband med infektion med SARS-CoV-2 Omicron i förhållande till Delta: En dansk  kohortstudie . — Rochester, NY: Social Science Research Network, 2022-01-14. — Nej . ID 4008930 .
  28. ↑ Alex Sigal. Mildare sjukdom med Omicron: är det viruset eller den redan existerande immuniteten?  (engelska)  // Nature Reviews Immunology. — 2022-02. — Vol. 22 , iss. 2 . — S. 69–71 . - ISSN 1474-1741 . - doi : 10.1038/s41577-022-00678-4 . Arkiverad från originalet den 1 februari 2022.
  29. ↑ HKUMed finner att Omicron SARS-CoV-2 kan infektera snabbare och bättre än Delta i mänsklig bronk men med mindre allvarlig infektion i  lungan . www.med.hku.hk. _ Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 10 januari 2022.
  30. ↑ Kenneth McIntosh. COVID-19: Epidemiologi, virologi och förebyggande . www.update.com . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 1 februari 2022.
  31. ↑ 1 2 Veronika Kulakova. "Så länge viruset har utrymme att utvecklas kommer det att fortsätta att mutera" Arkivkopia daterad 20 januari 2022 på Wayback Machine // Izvestia , 2022-01-18.
  32. ↑ 1 2 3 4 Irina Tumakova. "Omicron är det sista stora utbrottet av coronaviruset." Om chanserna att dö av en ny stam eller att bli "vaccinerad" med en sjukdom - molekylärbiolog Olga Matveeva
  33. ↑ Volkov, K. "Omicron" hittades i nästan 20 länder och regioner i världen  : [ arch. 30 november 2021 ] // Rossiyskaya Gazeta. - 2021. - 30 november.
  34. ↑ 1 2 3 VOC Omicron: Spårning av  varianter . GISAID (2021-12-1). Hämtad 4 december 2021. Arkiverad från originalet 23 juni 2021.
  35. ↑ s : S371L Mutationsrapport  . outbreak.info . Hämtad 26 november 2021. Arkiverad från originalet 28 november 2021.
  36. ↑ Belgien upptäcker det första fallet av ny COVID-19-variant i Europa , Reuters  ( 26 november 2021). Arkiverad från originalet den 26 november 2021. Hämtad 26 november 2021.
  37. ↑ Experten sa att den nya stammen "omicron" börjar förskjuta "delta" mycket snabbt
  38. ↑ WHO kallade den globala risken på grund av omicron-stammen av COVID-19 för mycket hög . " Kommersant " (29 november 2021). Hämtad 29 november 2021. Arkiverad från originalet 1 december 2021.
  39. ↑ Australien rapporterar första dödsfall från omicron-stammen . Lenta.RU . Hämtad 3 januari 2022. Arkiverad från originalet 3 januari 2022.
  40. ↑ De första 12 fallen av omicroninfektion upptäcktes i Bulgarien
  41. ↑ 1 2 Becky Morton, Doug Faulkner. Covid: Första dödsfall i Storbritannien registrerat med Omicron-variant  (engelska) . BBC (13 december 2021). Hämtad 26 december 2021. Arkiverad från originalet 20 december 2021.
  42. ↑ I Danmark hittades två fall av infektion med omicron-stammen av coronavirus . " Kommersant " (28 november 2021). Hämtad 29 november 2021. Arkiverad från originalet 28 november 2021.
  43. ↑ 1 2 3 Rekordhöga nivåer av covid-19-infektion i Europa på grund av "omicron" Arkivexemplar av 26 december 2021 på Wayback Machine // Interfax , 2021-12-25.
  44. ↑ Kina rapporterar första fall av Omicron-infektion . " Kommersant " (14 december 2021). Hämtad 14 december 2021. Arkiverad från originalet 14 december 2021.
  45. ↑ 1 2 Omicron-stammen upptäcktes hos två ryssar som anlände från Sydafrika . " Kommersant " (6 december 2021). Hämtad 6 december 2021. Arkiverad från originalet 6 december 2021.
  46. ↑ 1 2 Antalet fall av "omicron" i Ryska federationen har ökat till 25 personer Arkivkopia daterad 26 december 2021 på Wayback Machine // Interfax , 12/16/2021.
  47. ↑ Putin: nya stammar av coronavirus dyker upp där det finns hälsoproblem Arkiverad 25 december 2021 på Wayback Machine // TASS , 2021-12-23.
  48. ↑ 103 fall av Omicron-stam COVID-19 registrerades i Ryska federationen Arkiverad 30 december 2021 på Wayback Machine // Izvestia , 12/30/2021.
  49. ↑ 1 2 3 4 I Ryssland har antalet personer som smittats med "omicron" nått 305 Arkivexemplar daterat 11 januari 2022 på Wayback Machine // Interfax , 01/11/2022.
  50. ↑ 1 2 Golikova tror att Moskva kommer att bli först med en ökning av incidensen på grund av "omicron" Arkivexemplar daterad 12 januari 2022 på Wayback Machine // TASS , 01/12/2022.
  51. ↑ 1 2 3 Golikova tillkännagav dominansen av "omicron" i Moskva och St. Petersburg Arkivkopia daterad 20 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 2022-01-18.
  52. ↑ En ryss med "omicron" utvecklade lunginflammation, han är i ett tillstånd av måttlig svårighetsgrad Arkivexemplar av 26 december 2021 på Wayback Machine // Interfax , 2021-12-22.
  53. ↑ Egor guvernörer, Natalia Anisimova. Hälsoministeriet klargjorde uppgifterna om fall av infektion med " omicron " i Ryssland
  54. ↑ Maria Nedyuk, Yulia Ignatieva. Stam betyder: hur "Omicron" spred sig i Ryska federationen under semestern
  55. ↑ Antalet fall av infektion med "omicron" i Ryssland översteg 100 Arkivexemplar daterat 2 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 12/30/2021.
  56. ↑ I Ryssland upptäcktes fall av infektion med "omicron" hos personer som inte lämnade landet Arkivkopia daterad 9 januari 2022 på Wayback Machine // TASS , 01/06/2022.
  57. ↑ Ilya Furseev, Natalia Anisimova. I Ryssland reducerades karantänperioden för coronavirus till sju dagar Arkivexemplar daterad 18 januari 2022 på Wayback Machine
  58. ↑ 1 2 Evgenia Voropaeva. Omicron-stam av coronavirus identifierad i 55 regioner i Ryssland Arkivkopia av 20 januari 2022 på Wayback Machine
  59. ↑ 1 2 I Ryssland upptäcktes 67 809 nya fall av COVID-19-infektion under det senaste dygnet Arkivkopia daterad 26 januari 2022 på Wayback Machine // Interfax , 2022-01-25.
  60. ↑ 1 2 Skvortsova namngav andelen fall av "omicron" i Moskvas arkivkopia daterad 13 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 01/12/2022.
  61. ↑ 1 2 3 I USA upptäcktes Omicron i 95 % av nya fall av COVID-19-infektion per vecka Arkivkopia daterad 10 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 01/05/2022.
  62. ↑ Konstantin Volkov. I USA upptäcktes mer än 1 miljon fall av coronavirusinfektion per dag
  63. ↑ Natalya Kostarnova. Omicron-storm Arkivexemplar daterad 21 januari 2022 på Wayback Machine // Kommersant tidningen, nr 3, 01/12/2022, s. 1
  64. ↑ I Portugal upptäcktes fall av infektion med omicron-stammen . " Kommersant " (29 november 2021). Hämtad 29 november 2021. Arkiverad från originalet 29 november 2021.
  65. ↑ Ett annat land rapporterar första dödsfall från omicron-stammen . Lenta.RU . Hämtad 3 januari 2022. Arkiverad från originalet 3 januari 2022.
  66. ↑ Ny omicron-variant av coronavirus väcker allvarliga farhågor i Europa och WHO , Deutsche Welle  (26 november 2021). Arkiverad från originalet den 27 november 2021. Hämtad 27 november 2021.
  67. ↑ Ryssland begränsar tillträde till medborgare i nio länder . ura.news . Hämtad 27 november 2021. Arkiverad från originalet 27 november 2021.
  68. ↑ Yaroslav Gronsky. Toyota stänger 11 fabriker i Japan på grund av omicron Arkiverad 21 januari 2022 på Wayback Machine
  69. ↑ Winter Universiaden 2021 inställd på grund av ny stam av coronavirus . RBC Sport (29 november 2021). Hämtad 29 november 2021. Arkiverad från originalet 1 december 2021.
  70. ↑ Japan ställer in finalen i konståkningens Grand Prix på grund av covid . RBC Sport (2 december 2021). Hämtad 2 december 2021. Arkiverad från originalet 2 december 2021.
  71. ↑ Georgy Tadtaev. Den ryska regeringen kommer att överföras till en avlägsen plats Arkivkopia daterad 21 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 2022-01-21.
  72. ↑ Deutsche Welle (www.dw.com). COVID: Frustrationen ökar över Shanghais hårda låsning | dw | 04/04/2022  (engelska)  ? . DW.COM . Hämtad 8 april 2022. Arkiverad från originalet 8 april 2022.
  73. ↑ 12 Press, The Associated . 26 miljoner människor i Shanghai är inlåsta på grund av en ökning av COVID-fall , NPR  (5 april 2022). Arkiverad från originalet den 8 april 2022. Hämtad 8 april 2022.
  74. ↑ [ https://www.interfax.ru/world/831617 ↑ �� ����] . Interfax.ru . Hämtad 8 april 2022. Arkiverad från originalet 1 april 2022.
  75. ↑ Stanway, David . Hela Shanghai går in i COVID-lockdown trots lägre symtomatiska fall , Reuters  (6 april 2022). Arkiverad från originalet den 7 april 2022. Hämtad 8 april 2022.
  76. ↑ Österrikes hälsoministerium: vaccinerade två gånger är bättre skyddade från omicron-stammen än ovaccinerade // TASS . - 2021. - 30 november.
  77. ↑ Khadija Khan, Farina Karim, Sandile Cele, James Emmanuel San, Gila Lustig. Omicron-infektion hos vaccinerade individer ökar den neutraliserande immuniteten mot Delta-  varianten . — 2022-01-28. — P. 2021.12.27.21268439 . - doi : 10.1101/2021.12.27.21268439v2 . Arkiverad från originalet den 1 februari 2022.
  78. ↑ Rahul K. Suryawanshi, Irene P. Chen, Tongcui Ma, Abdullah M. Syed, Camille R. Simoneau. Begränsad korsvariant immunitet efter infektion med SARS-CoV-2 Omicron-varianten utan vaccination  (engelska) . — 2022-01-17. - P. 2022.01.13.22269243 . - doi : 10.1101/2022.01.13.22269243v1 . Arkiverad från originalet den 1 februari 2022.
  79. ↑ Covid-19-vaccinövervakningsrapport Vecka  4 . UK Health Security Agency . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 27 januari 2022.
  80. ↑ Emma K. Accorsi, Amadea Britton, Katherine E. Fleming-Dutra, Zachary R. Smith, Nong Shang. Samband mellan 3 doser av mRNA COVID-19-vaccin och symtomatisk infektion orsakad av SARS-CoV-2 Omicron och Delta-varianter  // JAMA. — 2022-01-21. — ISSN 0098-7484 . doi : 10.1001 / jama.2022.0470 .
  81. ↑ Mark G. Thompson. Effektiviteten av en tredje dos mRNA-vaccin mot covid-19–associerad akutmottagning och akutvård och sjukhusvistelser bland vuxna under perioder av delta- och omicronvariantpredominans – VISION Network, 10 stater, augusti 2021–januari   2022 // Veckorapport om sjuklighet och dödlighet. - 2022. - T. 71 . — ISSN 1545-861X 0149-2195, 1545-861X . - doi : 10.15585/mmwr.mm7104e3 . Arkiverad från originalet den 2 februari 2022.
  82. ↑ Christian Holm Hansen, Astrid Blicher Schelde, Ida Rask Moustsen-Helm, Hanne-Dorthe Emborg, Tyra Grove Krause. Vaccinets effektivitet mot SARS-CoV-2-infektion med Omicron- eller Delta-varianterna efter en vaccinationsserie med två doser eller booster BNT162b2 eller mRNA-1273: En dansk  kohortstudie . — 2021-12-23. — P. 2021.12.20.21267966 . - doi : 10.1101/2021.12.20.21267966v3.full . Arkiverad från originalet den 29 januari 2022.
  83. ↑ Nej, en studie från Danmark fann inte att covid-19-vacciner gör människor mer infektionsbenägna; fördomar i studien ledde sannolikt till underskattad   vaccineffektivitet ? . Hälsofeedback (17 januari 2022). Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 31 januari 2022.
  84. ↑ Förbättrad respons på Omicron SARS-CoV-2-  variant . www.who.int . Hämtad 1 februari 2022. Arkiverad från originalet 29 november 2021.
  85. ↑ Gunzburg tillkännagav tidpunkten för utvecklingen av ett vaccin mot omicron-stammen av coronavirus // RIA Novosti. - 2021. - 29 november.
  86. ↑ Gamaleya Center skapade en modifiering av Sputnik V för omicron-stammen . " Kommersant " (14 december 2021). Hämtad 14 december 2021. Arkiverad från originalet 14 december 2021.
  87. ↑ Gunzburg ansåg att det inte finns något behov av att ändra Sputnik V under omicron ännu