SARS-CoV-2-stammar

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 5 juni 2022; kontroller kräver 3 redigeringar .

SARS-CoV-2-stammar  är varianter av SARS-CoV-2- coronaviruset som anses vara av särskild betydelse [1] . Den genetiska sekvensen WIV04/2019 är sannolikt den ursprungliga stammen som infekterar människor, känd som "genetisk sekvens noll" [2] .

De betecknas med bokstäverna i det grekiska alfabetet .

Namnsystem

Världshälsoorganisationen , som försökte att inte använda georeferenser i namnen på stammarna av det nya coronaviruset [3] , beslutade i maj 2021 att beteckna dem med bokstäverna i det grekiska alfabetet. Detta utesluter namnen "brittiska", "brasilianska" etc., som är associerade med namnen på de länder där motsvarande stammar först upptäcktes [4] . I synnerhet fick en ny SARS-CoV-2-stam som upptäcktes i november 2021 namnet "omicron" [5] .

Samtidigt övergavs användningen av bokstäverna " nu " och " xi " [6] : det första liknar det engelska ordet new (nytt), och det andra - det kinesiska efternamnet Xi, vilket i synnerhet är Xi Jinping [7] [8] .

Pivottabell

Risk:   väldigt lång   hög   medel   kort

namn Första upptäckten Betydande mutationer Kliniska förändringar
VEM myrkott Plats datumet Överförbarhet Dödlighet
Beta B.1.351
Sydafrika 		maj 2020 N501Y, K417N, E484K +25 % (20–30 %) [9] Möjligen ökar
Epsilon B.1.427,
B.1.429
USA 		juli 2020 +20 % (19–24 %)
lambda C.37
Peru 		augusti 2020
Alfa B.1.1.7
Storbritannien 		20 september 2020 [10] N501Y, 69-70del, P681H +29 % (24–33 %) [9] +59 % (44–74 %)
Delta B.1.617.2
Indien 		oktober 2020 L452R, T478K, P681R +97 % (76-117 %) [9] [11] +137 % (50-230 %) [12]
Gamma B.1.1.28
(P.1)
Brasilien 		november 2020 K417T, E484K, N501Y +38 % (29–48 %) [9] +50 % (20-90 %)
Zeta B.1.1.28
(P.2)
Brasilien 		november 2020
Iota B.1.526
USA 		november 2020
Detta B.1.525
Storbritannien Nigeria

december 2020
Kappa B.1.617.1
Indien 		december 2020
Mu B.1.621
Colombia 		januari 2021
Theta B.1.1.28
(P.3)
Filippinerna 		februari 2021
Omicron B.1.1.529
Sydafrika Botswana

8 november 2021 [13] Ökade [14] [15] −75 % [16] [Komm. ett]

Hoards

Korrespondenstabell för olika namn på sorter av SARS-CoV-2
Linjer enligt Rambaut och andra. Anteckningar om Rambaut et al. Nextstrain clades GISAID clades Betydande stammar eller mutationer
A.1-A.6 19B S
B.3–B.7 , B.9 , B.10 , B.13 –B.16 19A L
O
B.2 V
B.1 B.1.5–B.1.72 20A G Linje B.1 av Rambaut et al inkluderar stammar med mutation D614G
B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37 GH
B.1.3–B.1.66 20C Inkluderar stam 501.V2
B.1.1 20B GR Inkluderar stam 202012/01 , stam B.1.1.207 och B.1.1.284
B.1.177 20A.EU1 [17] GV

Det finns flera tusen stammar av SARS-CoV-2-viruset i naturen. De är vanligtvis grupperade i stora grupper som kallas clades . Flera olika kladnomenklaturer för SARS-CoV-2 har föreslagits.

Betydande virusstammar

Strains of Concern (VOC)

Nedan är de stammar som WHO listat som oroande (Variants of Concern) [18] .

Alfa (rad B.1.1.7)

Stam 202012/01 (VOC-202012/01), tidigare känd som den första stammen som granskades i december 2020 (VUI - 202012/01) och även som härstamning B.1.1.7 eller 20B/501Y.V1, upptäcktes först i oktober 2020 under den brittiska covid-19-pandemin från ett prov taget föregående månad. Sedan dess har chanserna att bli dominerande fördubblats var 6,5 dag (uppskattat generationsintervall). Detta korrelerar med en betydande ökning av förekomsten av covid-19 i Storbritannien. Denna ökning tros åtminstone delvis bero på en förändring i N501Y inom den receptorbindande domänen av spike-glykoproteinet, vilket krävs för att binda till ACE2 i mänskliga celler.

Det finns vissa bevis för att denna variant har en 30-70% ökad transmissibilitet, och preliminära studier tyder på en ökad dödlighet [19] .

Den 2 februari 2021 rapporterade brittiska tjänstemän att bland 214 000 genetiskt sekvenserade prover av denna stam hade 11 också E484K-mutationen [20] [21] . En av mutationerna (N501Y) finns också i beta- och gamma-stammarna.

Den 31 maj 2021 meddelade Världshälsoorganisationen att den brittiska stammen för användning i offentlig kommunikation skulle kallas "alfa" [22] [23] .

Beta (rad B.1.351)

501.V2-stammen, även känd som 501.V2, 20C/501Y.V2 eller B.1.351 härstamning, identifierades först i Sydafrika som rapporterades av det sydafrikanska hälsoministeriet den 18 december 2020. Forskare och tjänstemän rapporterade att förekomsten av denna stam var högre bland unga vuxna utan någon underliggande sjukdom, och jämfört med andra stammar är det mer sannolikt att den orsakar allvarlig sjukdom i dessa fall. Det sydafrikanska hälsoministeriet har också indikerat att denna stam kan driva den andra vågen av covid-19-pandemin i landet på grund av det faktum att stammen sprider sig i en snabbare takt än andra, tidigare stammar av viruset.

Forskarna noterade att denna stam innehåller flera mutationer som gör att den lättare kan fästa på mänskliga celler. Dessa är tre mutationer i den receptorbindande domänen (RBD) i virusets spikglykoprotein: N501Y [24] [25] (istället för aminosyran asparagin (N) aminosyran tyrosin (Y) [26] i position 501), K417N och E484K [27] [28] . Två av dessa mutationer (E484K och N501Y) finns i det receptorbindande motivet (RBM) av den receptorbindande domänen (RBD) [29] .

Den nya stammen upptäcktes genom genomsekvensering . Flera genomiska sekvenser från denna härstamning har skickats till GISAID ( Global I nitiative on Sharing A vian Influenza D ata ) [ sekvensdatabas, till exempel sekvensen EPI_ISL_678597 [30] .

Den 4 januari 2021 rapporterade The Telegraph att Oxford-immunologen Sir John Bell tror att den nya sydafrikanska stammen väcker en "stor fråga" eftersom den kan vara resistent mot vacciner och därmed krossa förhoppningar och ersätta dem med rädsla [31] . Samma dag sa vaccinologiprofessor Shabir Madhi till CBS News att det inte är säkert att den nya 501.V2-stammen kommer att kunna "förbigå" skyddet av vaccinet, men han tror att det "kan vara mindre effektivt" [32 ] . Ytterligare mutationer i spikeproteinet i 501.V2-stammen citerades av University of Reading docent i cellulär mikrobiologi Simon Clarke som ett problem eftersom de "kan göra viruset mindre mottagligt för immunsvaret som framkallas av vaccinet." Lawrence Young, en virolog vid University of Warwick, noterade också att multipla spikemutationer i denna stam "kan resultera i en viss flykt från immunförsvaret" [33] .

Ugur Sahin, vd för BioNTech , uppgav att ytterligare forskning behövs för att säkerställa att företagets nuvarande vaccin fungerar mot 501.V2-stammen, men om vaccinet behöver justeras kan företaget göra det om cirka 6 veckor [ 34] . Den 8 januari 2021 rapporterade Guardian att Pfizer och BioNTechs COVID-19-vaccin har visat i tester som involverar 20 blodprover att det kan ge skydd mot 501.V2-stammen. Ytterligare forskning behövs för att fastställa den exakta skyddsgraden [35] .

Gamma (rad B.1.1.248)

B.1.1.248-linjen upptäcktes i Tokyo den 6 januari 2021 av National Institute of Infectious Diseases (NIID). Den nya stammen hittades hos fyra personer som anlände till Tokyo från Amazonas den 2 januari 2021. Brazilian State Foundation Oswaldo Cruz bekräftade deras antagande att denna stam var vanlig i Amazonas regnskog. Denna stam av SARS-CoV-2 har 12 mutationer i spikeproteinet, inklusive N501Y och E484K.

Ett förtryckt papper av Caroline M. Voloch et al identifierade en ny linje av SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', distribuerad i Brasilien, härledd från stam B.1.1.28. Den beskriver att den nya stammen först dök upp i juli och upptäcktes först i oktober, men vid tidpunkten för publiceringen (december 2020), även om dess frekvens har ökat avsevärt, var dess distribution fortfarande mestadels begränsad till delstatens huvudstad Rio de Janeiro.

Denna stam orsakade ett utbrott i staden Manaus , trots att staden redan hade upplevt en massiv infektion i maj [36] och en studie visade [37] en hög prevalens av SARS-CoV-2 antikroppsserotyper [38] .

Den 11 februari 2021 meddelade chefen för det brasilianska hälsoministeriet, Eduardo Pazuello, att denna stam är tre gånger mer smittsam än den "ursprungliga" SARS-CoV-2 [39] .

Delta (rad B.1.617.2)

I oktober 2020 upptäcktes B.1.617.2-linjen för första gången i Indien [40] [41] [42] . Under andra halvan av april 2021 kom Indian Delta-stammen till Ryssland [43] .

Den 14 juni 2021 upptäcktes en muterad variant B.1.617.2 i Indien, som är känd som AY.1 eller delta plus-varianten [44] . "Delta plus" kännetecknas av närvaron av K417N-mutationen i spikeproteinet, vilket kan minska aktiviteten av antikroppar hos återhämtade och vaccinerade personer [45] . Indiens hälsoministerium har nämnt tre kännetecken för "delta plus": ökad smittsamhet, ökad förmåga att binda till lungcellsreceptorer och potentiell resistens mot monoklonal antikroppsterapi [46] .

I oktober 2021, medan de spårade utvecklingen av deltastammen, upptäckte brittiska virologer en ny stam, AY.4.2, som är mer smittsam än tidigare stammar. AY.4.2 är 10-15 % mer smittsam än deltastammen. I Storbritannien står det för ett av tio fall av coronavirusinfektion i landet [47] [48] .

Omicron (rad B.1.1.529)

I november 2021 upptäcktes B.1.1.529 härstamning för första gången i Botswana och Sydafrika. Skiljer sig i ett stort antal mutationer i askmätare [49] . Enligt den brittiska hälsosäkerhetsmyndigheten har denna variant ett spikprotein som skiljer sig väsentligt från det ursprungliga coronaviruset (varianten som vaccinerna är baserade på), vilket ger upphov till oro över effektiviteten hos befintliga vacciner. Upptäckten av en ny stam orsakade global panik den 26 november 2021. Många länder har avbrutit resor från Sydafrika, och börserna på båda sidor om Atlanten har upplevt sina värsta nedgångar på mer än ett år [50] . Storbritanniens premiärminister Boris Johnson meddelade att landet inför ett obligatoriskt PCR-test för alla som kommer in i landet och självisolering tills ett negativt resultat erhålls. Obligatorisk tiodagarsisolering införs även för de som misstänks vara smittade med omicron-stammen [51] .

Stammar av intresse (VOI)

Nedan är de stammar som listas av WHO som varianter av intresse [18] .

Lambda (rad C.37)

I augusti 2020 upptäcktes linjen C.37 för första gången i Peru [52] . I juni 2021, i Peru, stod lambda-stammen för 81 % av alla fall som rapporterades i landet. I Argentina och Chile är andelen "lambda" ungefär en tredjedel [53] .

Andra

Detta (rad B.1.525)

Linje B.1.525, även känd som VUI-202102/03 eller UK1188, liknar delvis stam 501.V2, men skiljer sig i närvaro av både E484K-mutationen och den nya F888L-mutationen (ersättning av fenylalanin (F) mot leucin ( L) i domänen S2 spikprotein). Den 16 februari har stammen upptäckts i 15 länder, inklusive Storbritannien, Danmark, Finland, Nederländerna, Belgien, Frankrike, Spanien, Nigeria, Ghana, Jordanien, Japan, Singapore, Australien, Kanada och USA. De första fallen identifierades i december 2020 i Storbritannien och Nigeria, och från och med den 15 februari är detta den vanligast isolerade stammen i Nigeria. Den 15 februari har 38 fall av infektion med det identifierats i Storbritannien. Danmark identifierade 55 fall av infektion med denna stam från 14 januari till 9 februari, sju av dem var direkt relaterade till utlandsresor.

Brittiska experter studerar riskerna med denna stam. Det betraktas för närvarande som en "stam under utredning", men när mer data blir tillgänglig kan det bli en "stam av oro". Professor Ravi Gupta vid University of Cambridge sa till BBC att B.1.525 verkar ha "betydande mutationer" som redan setts i några andra nya stammar, vilket är något lugnande eftersom deras sannolika effekt i viss mån är mer förutsägbar.

Mutationer i denna stam inkluderar E484K, en deletion i positionerna 69-70, nya mutationer Q677H (glutamin till histidin i position 677) och F888L (fenylalanin till leucin i position 888) [54] .

Kluster 5

Kluster 5, även kallad ΔFVI-spike av Danish Serum State Institute (SSI) , hittades i Nordjylland , Danmark . Det tros ha gått i arv från minkar till människor på minkfarmer. Den 4 november 2020 tillkännagavs att minkpopulationen i Danmark skulle avlivas för att förhindra eventuell spridning av denna mutation och minska risken för att nya mutationer ska uppstå. Avspärrningar och reserestriktioner har införts i sju kommuner på Nordjylland för att förhindra spridning av en mutation som kan äventyra effektiviteten hos nationella eller internationella svar på covid-19-pandemin.

Världshälsoorganisationen (WHO) har konstaterat att kluster 5 har "måttligt minskad känslighet för neutraliserande antikroppar". SSI varnade för att mutationen kan minska effekten av covid-19-vacciner under utveckling, även om det är osannolikt att de kommer att bli oanvändbara.

Efter karantän och masstester meddelade SSI den 19 november 2020 att kluster 5 med all sannolikhet är utdött [55] .

Betydande mutationer

D614G

D614G är en mutation som påverkar SARS-CoV-2 spikproteinet. Stam G ( glycin i position 614) ökade under pandemin, troligen efter att ha ursprungligen ursprung i Kina och sedan spridit sig till Italien i januari och därifrån över hela världen. G har ersatt D ( asparaginsyra ) i många länder, särskilt i Europa, och något långsammare i Kina och resten av Östasien, vilket stöder hypotesen att G ökar överföringshastigheten, i överensstämmelse med högre virustitrar och in vitro smittsamhet [ 56] .

I juli 2020 rapporterades den mer smittsamma D614G-stammen av SARS-CoV-2 ha blivit den dominerande formen av pandemin [57] [58] [59] .

Den globala prevalensen av D614G korrelerar med förekomsten av luktförlust ( anosmi ) som ett symptom på COVID-19, möjligen förmedlat av högre bindning av denna stam till ACE2-receptorn eller högre stabilitet hos motsvarande protein och därmed högre infektivitet för lukten. epitel [60] .

Virus som innehåller G-mutationen anses av GISAID som en del av G-kladen [56] , och med hjälp av[ förtydliga ] PANGOLIN ( Phylogenetic A signment of N amed G lobal O utbreak LIN eages)  — tillhör klassen B1 [61] .

E484K

E484K rapporteras vara en mutation som ger resistens mot minst en form av anti-SARS-CoV-2 monoklonala antikroppar, vilket indikerar en "möjlig förändring i antigenicitet". Stammarna B.1.1.248 (Brasilien/Japan) och 501.V2 (Sydafrika) innehåller denna mutation. Namnet på mutationen, E484K, betecknar ersättningen av glutaminsyra (E) med lysin (K) vid aminosyraposition 484. Monoklonala antikroppar och serumantikroppar rapporteras vara 10-60 gånger mindre effektiva för att neutralisera viruset som bär på E484K-mutationen [62] [63] .

N501Y

N501Y representerar en förändring från asparagin (N) till tyrosin (Y) vid aminosyraposition 501. Public Health England anser att denna förändring ökar receptorbindningsaffiniteten på grund av dess position inom den receptorbindande domänen av spike-glykoproteinet, som binder till ACE2-receptor vid mänskliga celler; data stöder också hypotesen om ökad bindningsaffinitet som ett resultat av denna förändring. Stammar med N501Y inkluderar B.1.1.248 (Brasilien/Japan), "strain of concern" 202012/01 (UK), 501.V2 (Sydafrika) och Columbus, Ohio-stammen som blev den dominerande formen av viruset i Columbus i slutet av december 2020 och i januari. Den senare fick namnet COH.20G/501Y och verkar ha utvecklats oberoende av andra stammar.

Ny stamutvärderingsplattform

Den 26 januari 2021 sa den brittiska regeringen att de skulle dela sina genomsekvenseringsförmåga med andra länder för att öka sekvenseringshastigheten och spåra nya stammar [64] . Från och med januari 2021 gjordes mer än hälften av all COVID-19-genomsekvensering i Storbritannien [65] .

Vaccinets effektivitet

En preliminär studie av Pfizer, Inc. visade att det bara fanns en liten minskning av effektiviteten av deras mRNA-vaccin mot nya stammar av SARS-CoV-2 [66] . Enligt en artikel publicerad den 28 januari 2021 på US Centers for Disease Controls webbplats anses uppkomsten av mutantstammar som helt undviker immunsvaret osannolikt på grund av virusets natur [67] .

Möjligen kan T- cellsimmunitet vara en lösning på problemet med minskad effektivitet av vacciner mot nya stammar. Bioteknikföretaget Gritstone Oncology i Emeryville, Kalifornien, USA utvecklar ett vaccin speciellt utformat för att inducera T-cellsimmunitet [68] . Peptidvaccinet som utvecklas av universitetet i Tübingen i Tyskland försöker inducera T-cellsimmunitet snarare än antikroppar [69] .

Den 29 januari 2021 vände sig vice Daria Besedina i Moskvas stadsduma till Ryska federationens hälsominister med en begäran om att finansiera studien av nya stammar och genomföra studier om effektiviteten av ryska vacciner mot dessa stammar [70][ betydelsen av faktum? ] . Den 10 februari 2021 utfärdade Europeiska läkemedelsmyndigheten en liknande uppmaning till vaccintillverkare [71] . Den 15 februari instruerade Rysslands president Vladimir Putin regeringen att implementera genomsekvensering av ryska stammar av SARS-CoV-2 inom en månad, avsätta medel för dessa studier och även kontrollera om ryska vacciner mot nya stammar är effektiva [72] .

Den 19 februari 2021 meddelade Pfizer att dess vaccin producerar cirka 66 % färre antikroppar som är aktiva mot den sydafrikanska stammen 501.V2 jämfört med den "klassiska" stammen, medan immunsystemet fortfarande kan neutralisera viruset [73] .

Uppgifterna från det israeliska hälsoministeriet för juli 2021 indikerar en minskning av effektiviteten av vaccinet från det amerikanska företaget Pfizer till 39% under månaden för att förhindra infektion med delta-stammen av coronavirus, men vaccinet fortsätter att skydda 88% från sjukhusvistelse och 91,4 % från allvarliga fall av sjukdomen. [74]

Kommentarer

  1. ↑ Data erhållna genom att övervaka patienter på ett sjukhus i stadsdelen Tswane ( Gautengprovinsen , Sydafrika) av National Institute of Infectious Diseases och University of Pretoria . Se: Forskare från Sydafrika avslöjar data om dödlighet från omicron-stammen Arkivkopia daterad 2 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 2021-12-30.

Anteckningar

  1. ↑ VEM | SARS-CoV-2-varianter (inte tillgänglig länk) . VEM . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 5 januari 2021. 
  2. ↑ Anna Zhukova, Luc Blassel, Frederic Lemoine, Marie Morel, Jakub Voznica. Ursprung, utveckling och global spridning av SARS-CoV-2  // Comptes Rendus. Biologier. - 0. - T. 0 , nej. 0 . - doi : 10.5802/crbiol.29 . Arkiverad från originalet den 21 februari 2021.
  3. ↑ Redogörelse för arbetet vid det sjätte mötet i kommittén för internationella hälsoföreskrifter (2005) om nödsituationen i samband med pandemin ‎coronavirusinfektion ( COVID 4 december 2021 på Wayback Machine // Artikel daterad 2021-01-15 // Världshälsoorganisationen, officiell webbplats, 2021-01-15.
  4. ↑ Coronavirus- stammar kommer att få grekiska bokstäver _
  5. ↑ Ny stam av coronavirus med namnet "Omicron" Arkivkopia daterad 27 februari 2022 på Wayback Machine // United Nations, officiell webbplats, 2021-11-26
  6. ↑ "Nu" föll, "Xi" försvann Arkivexemplar daterad 1 december 2021 på Wayback Machine // " Moscow 24 ", 2021-11-29.
  7. ↑ WHO förklarade namnet på stammen " omicron " och utelämnandet av två bokstäver i alfabetet
  8. ↑ Bokstäver saknas: varför WHO döpte den nya stammen till " omicron "
  9. ↑ 1 2 3 4 Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (juni 2021). "Ökad överföringsförmåga och global spridning av SARS-CoV-2-varianter av oro i juni 2021". Euroövervakning . 26 (24): 2100509. DOI : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  10. ↑ Preliminär genomisk karakterisering av en framväxande SARS-CoV-2-linje i Storbritannien definierad av en ny uppsättning spikmutationer . Virologisk (18 december 2020). Hämtad 14 juni 2021. Arkiverad från originalet 21 december 2020.
  11. ↑ Finlay Campbell, Brett Archer, Henry Laurenson-Schafer, Yuka Jinnai, Franck Konings. Ökad överföringsbarhet och global spridning av SARS-CoV-2-varianter av oro i juni 2021  // Eurosurveillance. — 2021-06-17. - T. 26 , nej. 24 . — ISSN 1025-496X . - doi : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  12. ↑ David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite. Progressiv ökning av virulens av nya SARS-CoV-2-varianter i Ontario, Kanada   // medRxiv . — 2021-08-04. — P. 2021.07.05.21260050 . - doi : 10.1101/2021.07.05.21260050 . Arkiverad från originalet den 2 september 2021.
  13. ↑ Omicron blir en dominerande variant i Sydafrika  (2 december 2021). Arkiverad från originalet den 2 december 2021. Hämtad 21 december 2021.
  14. ↑ "Omicron" identifierad i 110 länder runt om i världen . " Kommersant " (24 december 2021). Hämtad 24 december 2021. Arkiverad från originalet 24 december 2021.
  15. ↑ Murashko talade om resultaten av ryska specialisters resa till Sydafrika Arkivkopia daterad 29 december 2021 på Wayback Machine // TASS , 2021-12-25.
  16. ↑ Forskare från Sydafrika avslöjade data om dödlighet från omicron-stammen Arkivkopia daterad 2 januari 2022 på Wayback Machine // RBC , 12/30/2021.
  17. ↑ COG-UK-uppdatering om SARS-CoV-2 Spike-mutationer av särskilt intresse: Rapport 1, COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), 20 december 2020, s. 2 , < https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2 -Mutations_final_updated2.pdf > . Hämtad 18 januari 2021. . 
  18. ↑ 1 2 Spårning av SARS-CoV-2-varianter . Hämtad 29 november 2021. Arkiverad från originalet 6 juni 2021.
  19. ↑ Coronavirus: Storbritanniens variant "kan vara mer dödlig" , BBC News  (22 januari 2021). Arkiverad 23 maj 2021. Hämtad 3 februari 2021.
  20. ↑ Rachael Rettner-Senior Writer 2 februari 2021. Storbritanniens coronavirusvariant utvecklar vaccinundvikande mutation  . livescience.com . Hämtad 3 februari 2021. Arkiverad från originalet 2 februari 2021.
  21. ↑ Achenbach, Joel . Oroväckande koronavirusmutation sett i brittisk variant och i vissa amerikanska prover , Washington Post . Arkiverad från originalet den 2 februari 2021. Hämtad 3 februari 2021.
  22. ↑ Förklarat: Varför WHO namngav Covid-19-varianter som först hittades i Indien som "Kappa" och "Delta" | India News - Times of India  (engelska) . The Times of India . Hämtad 2 juni 2021. Arkiverad från originalet 25 november 2021.
  23. ↑ WHO tillkännager enkla, lätta att säga etiketter för SARS-CoV-2-varianter av intresse och  oro . www.who.int . Hämtad 6 juni 2021. Arkiverad från originalet 6 december 2021.
  24. ↑ Fink, Sheri . Sydafrika tillkännager en ny variant av coronaviruset. , The New York Times  (18 december 2020). Arkiverad från originalet den 21 december 2020. Hämtad 5 januari 2021.
  25. ↑ Fullständig presentation av SSAK - 18 december | virus | Mutation . Scribd . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 6 januari 2021.
  26. ↑ 3AA-1 och 3AA-2 . web.archive.org (9 oktober 2008). Hämtad: 5 januari 2021.
  27. ↑ Uttalande från WHO:s arbetsgrupp för COVID-19-djurmodeller (WHO-COM) om de nya varianterna av SARS-CoV-2 i Storbritannien och Sydafrika (PDF), Världshälsoorganisationen . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 7 oktober 2021.
  28. ↑ Derek Lowe 22  december 2020. The New Mutations  ? . I pipeline (22 december 2020). Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 29 januari 2021.
  29. ↑ expertreaktion på sydafrikansk variant av SARS-CoV-2, som nämndes av Matt Hancock vid presskonferensen på Downing Street | Science Media   Center ? . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 8 oktober 2021.
  30. ↑ "COVID-19 GISAID Acknowledgement Threat Assessment UK variant" (PDF) . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 28 oktober 2021.
  31. ↑ Knapton, Sarah . Sydafrikansk variant kan undvika vacciner och tester, varnar forskare , The Telegraph  (4 januari 2021). Arkiverad från originalet den 15 december 2021. Hämtad 5 januari 2021.
  32. ↑ Covid-vacciner "kanske inte" fungerar lika bra på sydafrikanska stam,   varnar forskare ? . www.cbsnews.com . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 3 december 2021.
  33. ↑ Brittiska forskare oroar sig för att vaccin inte kan skydda mot en variant av coronavirus som finns i Sydafrika | CBC News , CBC . Arkiverad från originalet den 5 januari 2021. Hämtad 5 januari 2021.
  34. ↑ BioNTech-vaccin för ny COVID-19-variant kan vara klart om 6  veckor . euronews (22 december 2020). Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 8 januari 2021.
  35. ↑ Geddes, Linda . Pfizer-vaccin skyddar mot nya Covid-varianter, antyder studie , The Guardian  (8 januari 2021). Arkiverad från originalet den 8 januari 2021. Hämtad 9 januari 2021.
  36. ↑ Matt Rivers CNN. Är en ny variant av coronaviruset att skylla på den brasilianska stadens kollaps? . CNN . Hämtad 2 februari 2021. Arkiverad från originalet 6 november 2021.
  37. ↑ Lewis F. Buss, Carlos A. Prete, Claudia MM Abrahim, Alfredo Mendrone, Tassila Salomon. Tre fjärdedels attackhastighet av SARS-CoV-2 i den brasilianska Amazonas under en i stort sett oförmättad epidemi   // Science . — 2021-01-15. — Vol. 371 , utg. 6526 . — S. 288–292 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.abe9728 . Arkiverad från originalet den 2 februari 2021.
  38. ↑ Ester C. Sabino, Lewis F. Buss, Maria PS Carvalho, Carlos A. Prete, Myuki AE Crispim. Covid-19 återuppstår i Manaus, Brasilien, trots hög seroprevalens  //  The Lancet. — 2021-01-27. - T. 0 , nej. 0 . — ISSN 1474-547X 0140-6736, 1474-547X . - doi : 10.1016/S0140-6736(21)00183-5 .
  39. ↑ Den "brasilianska" stammen av coronavirus är tre gånger mer smittsam än den allra första versionen av COVID-19 - landets hälsoministerium . nv.ua. _ Tillträdesdatum: 12 februari 2021.
  40. ↑ PANGO härstamningar . cov-lineages.org . Hämtad 18 april 2021. Arkiverad från originalet 3 juni 2021.
  41. ↑ Coronavirus | Indisk "dubbelmutant"-stam med namnet B.1.617 (en-IN), The Hindu  (8 april 2021). Arkiverad 26 maj 2021. Hämtad 18 juni 2021.
  42. ↑ Indiens variantdrivna andra våg sammanföll med en ökning av infekterade flyg som landade i Kanada , Toronto Sun (10 april 2021). Arkiverad från originalet den 2 juni 2021. Hämtad 18 juni 2021.
  43. ↑ Skaparen av Sputnik V talade om den modifierade indiska stammen i Moskva. Den tredje vågen av covid-19 förklaras för dem Arkiverad 16 juni 2021 på Wayback Machine , 2021-06-16
  44. ↑ Sharma, Milano Ny "Delta Plus"-variant av SARS-CoV-2 identifierad;  här är vad vi vet hittills . Indien idag . Hämtad 16 juni 2021. Arkiverad från originalet 17 juni 2021.
  45. ↑ En ny stam av delta plus coronavirus har identifierats i Indien Arkiverad 23 juni 2021 på Wayback Machine 21 juni 2021
  46. ↑ Ny superinfektiös stam av Covid upptäcktes i Indien Arkivkopia av 25 juni 2021 på Wayback Machine
  47. ↑ Ny Delta-ättling kan vara mer smittsam än sin förfader . Hämtad 23 oktober 2021. Arkiverad från originalet 23 oktober 2021.
  48. ↑ Storbritannien avslöjar detaljer om nya coronavirus-stam Arkiverad 23 oktober 2021 på Wayback Machine 20 oktober 2021
  49. ↑ [Ny Botswana-variant med 32 "hemska" mutationer är den mest utvecklade Covid-stammen NÅGONSIN och kan vara "värre än Delta" - som experten säger att den kan ha dykt upp hos en HIV-patient], 25 november 2021
  50. ↑ Ny COVID-variant Omicron orsakar global panik Arkiverad 28 november 2021 på Wayback Machine , 2021-11-28
  51. ↑ I Storbritannien kommer karantän att införas för de som är i kontakt med bärare av omicron-stammen Arkivkopia daterad 28 november 2021 på Wayback Machine // RIA Novosti, 2021-11-27
  52. ↑ Spåra SARS-CoV-2-  varianter . Världshälsoorganisationen . Hämtad 17 juni 2021. Arkiverad från originalet 9 juni 2021.
  53. ↑ I Latinamerika rasar en farlig ny stam av coronavirus - "lambda" . Hämtad 24 juni 2021. Arkiverad från originalet 24 juni 2021.
  54. ↑ En mutant till: en ny, potentiellt farlig stam av Covid-19 har börjat spridas i världen . Insidern . Hämtad 17 februari 2021. Arkiverad från originalet 16 februari 2021.
  55. ↑ De flesta restriktioner lempes i Nordjylland . Sundheds- og Ældreministeriet (19 november 2020). — “Sekventeringen af ​​de positiva prov visar samtidigt, att det inte är påvist ytterligare fall av minkvariant med kluster 5 sedan den 15 september, varför Statens Serums Institut bedömer, att denna variant med stor sandsynlighed er døet ud. ("Med hög troligen [...] dog ut")". Hämtad 16 januari 2021. Arkiverad från originalet 20 januari 2021.
  56. ↑ 1 2 Ursprung, utveckling och global spridning av SARS-CoV-2 (otillgänglig länk) . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 21 februari 2021. 
  57. ↑ Coronavirus: Gör mutationer det mer smittsamt? , BBC News  (18 juli 2020). Arkiverad från originalet den 30 december 2020. Hämtad 5 januari 2021.
  58. ↑ Ny, mer smittsam stam av COVID-19 dominerar nu globala virusfall:  studie . medicalxpress.com . Hämtad 5 januari 2021. Arkiverad från originalet 17 november 2020.
  59. ↑ Bette Korber, Will M. Fischer, Sandrasegaram Gnanakaran, Hyejin Yoon, James Theiler. Spåra förändringar i SARS-CoV-2 Spike: Bevis på att D614G ökar smittsamheten hos COVID-19-viruset  // Cell. — 2020-08-20. - T. 182 , nr. 4 . — s. 812–827.e19 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . Arkiverad 1 november 2020.
  60. ↑ Rafal Butowt, Katarzyna Bilinska, Christopher S. Von Bartheld. [ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7581292/ Chemosensory Dysfunction in COVID-19: Integration of Genetic and Epidemiological Data Points to D614G Spike Protein Variant as a Contributing Factor] // ACS Chemical Neuroscience . — 2020-09-30. - T. 11 , nej. 20 . — S. 3180–3184 . — ISSN 1948-7193 . - doi : 10.1021/acschemneuro.0c00596 . Arkiverad från originalet den 12 januari 2021.
  61. ↑ cov-lineages/pangolin . — 2021-01-05. Arkiverad från originalet den 15 februari 2021.
  62. ↑ Allison J. Greaney, Andrea N. Loes, Katharine H. D. Crawford, Tyler N. Starr, Keara D. Malone. Omfattande kartläggning av mutationer till SARS-CoV-2-receptorbindande domän som påverkar igenkänning av polyklonala humana   serumantikroppar // bioRxiv . — 2021-01-04. — P. 2020.12.31.425021 . - doi : 10.1101/2020.12.31.425021 . Arkiverad från originalet den 26 januari 2021.
  63. ↑ Kai Kupferschmidt. Nya mutationer väcker spöke av "immun flykt"   // Vetenskap . — 2021-01-22. — Vol. 371 , utg. 6527 . — S. 329–330 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.371.6527.329 . Arkiverad 13 maj 2021.
  64. ↑ Smout, Alistair . Storbritannien för att hjälpa andra länder att spåra varianter av coronaviruset , Reuters  (26 januari 2021). Arkiverad från originalet den 26 januari 2021. Hämtad 29 januari 2021.
  65. ↑ Donnelly, Laura . Storbritannien för att hjälpa till att sekvensera mutationer av Covid runt om i världen för att hitta farliga nya varianter , The Telegraph  (26 januari 2021). Arkiverad från originalet den 27 januari 2021. Hämtad 29 januari 2021.
  66. ↑ Collier DA, Meng B, Ferreira, Gupta RK (2021). "Neutralisering av spike 69/70 deletion, E484K och N501Y SARS-CoV-2 av BNT162b2 vaccin-framkallade sera" . Hämtad 29 januari 2021. Arkiverad från originalet 26 januari 2021.
  67. ↑ Nya SARS-CoV-2-varianter - CDC . Hämtad 4 februari 2021. Arkiverad från originalet 15 maj 2021.
  68. ↑ Hur "mördar" T-celler kunde stärka COVID-immuniteten inför nya varianter Arkiverad 15 februari 2021 på Wayback Machine , 12 februari 2021
  69. ↑ Biotech förklarar vad som är fel med EpiVacCorona: "Det är en dummy. Flygplan med bekväm kabin, billigt och lätt att bygga. Men han flyger inte! . Nuvarande (23 juni 2021). Hämtad 24 juni 2021. Arkiverad från originalet 24 juni 2021.
  70. ↑ Korrespondens journal över av ställföreträdande Besedina . besedina.moscow . Hämtad 19 februari 2021. Arkiverad från originalet 17 februari 2021.
  71. ↑ EMA förbereder vägledning för att ta itu med COVID-19-varianter . Hämtad 19 februari 2021. Arkiverad från originalet 15 februari 2021.
  72. ↑ Lista över instruktioner efter ett möte med medlemmar av regeringen • Rysslands president . Rysslands president . Hämtad 19 februari 2021. Arkiverad från originalet 17 februari 2021.
  73. ↑ Sydafrikansk SARS-CoV-2-stam misstänkt för att minska immunsvaret mot Pfizer-vaccin . TASS . Hämtad 24 februari 2021. Arkiverad från originalet 18 februari 2021.
  74. ↑ Pfizer uppskattas vara 39 % effektiv mot deltainfektion i Israel . TASS . Hämtad 25 juli 2021. Arkiverad från originalet 25 juli 2021.