Alfa-galaktosidas
Melibiaser (eller α-galaktosidaser ) ( EC 3.2.1.22 ) är glykosylhydrolaser som i regel kan klyva, som regel, med bevarande av sin optiska konfiguration , terminala icke-reducerande rester av α-D-galaktos från α-D- galaktosider , inklusive från galaktooligosackarider , galactomannaner och galaktolipider . Deras enklaste naturliga substrat är disackariden melibios och trisackariden raffinos . I ett antal fall hittades transgalaktosidasaktivitet i melibiaser. a-N-acetylgalaktosaminidas liknar biokemiskt och evolutionärt a-galaktosidaser ( EC 3.2.1.49 ).
Familjer melibiasis
Baserat på deras struktur har de katalytiska domänerna av alla a-galaktosidaser tilldelats sex familjer: GH4 , GH27 , GH36 , GH57 , GH97 och GH110 .
- GH27- och GH36-familjerna på en högre hierarkisk nivå bildar GH-D-klanen. Domänerna i denna klan har en tredimensionell (β/α) 8 -fatstruktur, även känd som TIM-fat. Denna tredimensionella struktur är den vanligaste bland de katalytiska domänerna av alla glykosylhydrolaser, och även en av de vanligaste bland alla proteiner. Alla flercelliga organismer och de flesta av de studerade encelliga eukaryoterna och bakterierna har α-galaktosidaser. Bland arkéer finns de endast hos vissa arter. De flesta eukaryota a-galaktosidaser tillhör familjen GH27, medan de flesta bakteriella a-galaktosidaser tillhör familjen GH36. Dessa två familjer innehåller nästan uteslutande a-galaktosidaser och a-N-acetylgalaktosaminidas. Fylogenetisk analys av GH36-familjen visade dess polyfyletiska ursprung, vilket gjorde det möjligt att dela upp denna familj i åtta nya. Dessa åtta familjer bildar tillsammans med familjerna GH27 och GH31 superfamiljen α-galaktosidas.
- Katalytiska domäner av GH97-familjen har också en (β/α) 8 -fatstruktur. För närvarande har endast en representant för denna familj visat sig ha α-galaktosidasaktivitet - i ett av proteinerna från bakterien Bacteroides thetaiotaomicron .
- De katalytiska domänerna i GH57-familjen har en struktur som liknar TIM-pipan, (β/α) 7 - fat. GH57-familjen innehåller både arkeala α-galaktosidaser kända hittills, såväl som ett antal prokaryota glykosylhydrolaser med andra aktiviteter.
- GH4-familjen inkluderar bakteriella glykosidaser med bred substratspecificitet. Tre av dem visades ha a-galaktosidasaktivitet.
- GH110-familjen inkluderar unika α-galaktosidaser som kan klyva bort α-D-galaktosrester genom att invertera deras optiska konfiguration. Sådana enzymer har hittats i bakterierna Bacteroides fragilis , B. thetaiotaomicron och Streptomyces avermitilis .
Det är troligt att a-galaktosidasgenerna från familjerna GH27, GH36, GH57 och GH97 har ett gemensamt evolutionärt ursprung.
Ärftliga sjukdomar associerade med insufficiens melibiasis
Många mutationer i α-galaktosidasgenen hos människor leder till Fabrys sjukdom , och i α-N-acetylgalaktosaminidasgenen till Schindlers sjukdom , även känd
sjukdomKanzakissom
Se även
