Haplogrupp D (Y-DNA)

Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från versionen som granskades den 25 oktober 2020; kontroller kräver 19 redigeringar .
Haplogrupp D
Sorts Y-DNA
Utseendetid 64,7-83 tusen år sedan [1]
Spawn plats Afrika , Asien [1]
Anfäders grupp DE
systergrupper E
Subklader Dl, D2
Markörmutationer CTS3946, CTS4030/Z1605

Haplogrupp D (CTS3946) är en DNA- haplogrupp av Y-kromosomen. Både haplogrupp D och E innehåller enkelnukleotidpolymorfismen M168 , som finns i alla haplogrupper utom A och B (se grupp CT ), såväl som YAP unika händelsepolymorfism , unik för haplogrupp DE  , den gemensamma förfadern till D och E.

Ursprung

Haplogrupp D kommer från en mutation av den Y-kromosomala haplogruppen DE , som inträffade hos en man som förmodligen levde för 65,2 tusen år sedan. Livstiden för den gemensamma förfadern för alla levande bärare av Y-kromosomala haplogrupp D är 46,5 tusen år sedan (datumen bestäms av SNPs av YFull-företaget [2] ).

Chris Tyler-Smith och kollegor tror att haplogrupp D bildades i Afrika för cirka 73 tusen år sedan. n., och för cirka 71 tusen år sedan separerade den västafrikanska linjen D0 [1] . Både haplogrupp D och haplogrupp E innehåller egenskapen för en unik YAP-händelsepolymorfism , men visar ett gemensamt ursprung. Subkladden av haplogruppen D1- M174 uppstod, med stor sannolikhet i Asien, för cirka 60 tusen år sedan. Undergruppen av haplogrupp D1-M174 finns inte utanför Asien. Haplogrupp D2 hittades obetydligt i Afrika och Mindre Asien [3] .

Enligt T. Karafet uppstod haplogrupp D i Asien för cirka 60 tusen år sedan [4] [5] .

Paleogenetik

Översikt

För närvarande finns den med hög frekvens bland befolkningen i Tibet , den japanska ögruppen [10] och Andamanöarna , men på grund av okända omständigheter har den ännu inte hittats på Hindustan- halvön . Ainu i Japan, liksom Jarawa- och Onge -folken på Andamanöarna, har nästan uteslutande denna haplogrupp, även om Ainu, förutom D1a2-haplogruppen (81,3 % [11] ), även har en Y-kromosomal haplogrupp C3 med en frekvens på cirka 15 % .

Den Y-kromosomala haplogruppen D hittades också med låg eller måttlig frekvens bland folken i Centralasien och norra Östasien, såväl som bland Hankineserna och Miao-Yao-folken i Kina och vissa nationella minoriteter av kineserna provinserna Sichuan och Yunnan , som talar tibeto-burmesiska språk och bor i nära anslutning till tibetanerna. Subclade D1a1a-M15 identifierad i befolkningen av Yi-folket ( Liangshan Yi autonoma prefekturen ) var en förgrening av expansionen av tibetanska grupper från väst till öst på platån [12] .

Till skillnad från Haplogrupp C , migrerade Haplogrupp D inte från Asien genom Beringia till den nya världen .

Haplogrupp D är också känd för sin exceptionella geografiska differentiering, när en viss underklass av haplogruppen är tydligt lokaliserad i alla populationer där en stor andel av individerna har haplogrupp D:

Denna, uppenbarligen, uråldriga diversifiering av haplogrupp D antyder att den snarare borde karakteriseras som en "superhaplogrupp", "makrohaplogrupp".

Särskilt karakteristiska är exemplen på haplogrupp D i befolkningen på de japanska öarna, eftersom de innehåller ett komplex av minst fem separata mutationer som är karakteristiska för haplogrupp D, vilket tydligt skiljer dem från haplogrupp D som finns hos invånarna i Tibet och Andamanöarna . Detta faktum är bevis på att haplogrupp D1a2 var en modal haplogrupp av den förhistoriska Jomon- kulturen på de japanska öarna.

Underklasser

Fylogenetiskt träd

ISOGG (version: 14.151) [13] .

Anteckningar

  1. ↑ 1 2 3 4 Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. En sällsynt djuprotad D0 afrikansk Y-kromosomal haplogrupp och dess konsekvenser för utvidgningen av moderna människor ut ur Afrika  //  Genetik: tidskrift. - 2019. - 13 juni. - P. genetics.302368.2019 . — ISSN 0016-6731 . - doi : 10.1534/genetics.119.302368 . — PMID 31196864 .
  2. ↑ DYTree . Hämtad 30 mars 2018. Arkiverad från originalet 31 augusti 2019.
  3. ↑ 1 2 Estes, Roberta Spännande nya Y DNA Haplogroup D upptäckter!  (engelska) . DNAeXplained - Genetisk genealogi (21 juni 2019). Hämtad 8 juli 2019. Arkiverad från originalet 6 juli 2019.
  4. ↑ Shi et al. (2008) Y-kromosombevis för den tidigaste moderna mänskliga bosättningen i Östasien och flera ursprung för tibetanska och japanska befolkningar Arkiverade 31 mars 2010 på Wayback Machine , BMC Biology
  5. ↑ Tatiana M. Karafet et al. (2008), Abstrakt nya binära polymorfier omformar och ökar upplösningen av det mänskliga Y-kromosomala haplogruppträdet, genomforskning, DOI: 10.1101/gr.7172008
  6. ↑ Hugh McColl et al. Ancient Genomics avslöjar fyra förhistoriska migrationsvågor till Sydostasien , 2018
  7. ↑ POB-162 Fenotyp och fylogeni av neolitiska japanska jägare-samlare, Jomon-folk, baserat på hela kärngenomsekvenser // SMBE 2018 Arkiverad 7 juli 2018 på Wayback Machine
  8. ↑ 1 2 Chuan-Chao Wang et al. Genomiska insikter i bildandet av mänskliga populationer i Östasien Arkiverad 31 juli 2021 på Wayback Machine (kompletterande tabeller // Tabell 1. Nyligen rapporterade forntida individer), 2021
  9. ↑ Eugenia Boulygina et al. Mitokondriell och Y-kromosommångfald av den förhistoriska Koban-kulturen i norra Kaukasus , 2020
  10. ↑ Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking och Satoshi Horai, "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y-chromosomes", Journal of Human Genetics Volume 51, nummer 1 / januari 2006.
  11. ↑ Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Analys av hela Y-kromosomsekvenser avslöjar den japanska befolkningens historia under Jomon-perioden Arkiverad 30 september 2019 på Wayback Machine , 2019
  12. ↑ Fei Wang, Feng Song, Mengyuan Song, Jienan Li, Mingkun Xie, Yiping Hou . Genetisk rekonstruktion och fylogenetisk analys av 193 Y-SNP och 27 Y-STR i en kinesisk Yi etnisk grupp Arkiverad 16 juli 2021 på Wayback Machine 28 april 2021
  13. ↑ Y-DNA Haplogroup D and its Subcades - 2019 . Hämtad 6 september 2019. Arkiverad från originalet 11 oktober 2019.
  14. ↑ 1 2 3 Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Japanernas dubbla ursprung: gemensam grund för jägare-samlare och bonde Y-kromosomer". J. Hum. Genet. 51(1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082 .
  15. ↑ DYTree . www.yfull.com _ Hämtad 3 september 2019. Arkiverad från originalet 31 augusti 2019.
  16. ↑ Y-DNA Haplogrupp D och dess underkläder - 2014 . Hämtad 11 september 2017. Arkiverad från originalet 28 maj 2017.

Litteratur

Se även

Det evolutionära trädetför mänskliga Y-kromosomhaplogrupper
Y-kromosomal Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
I J K
jag J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) F R  

Länkar