Kristendomen på Madagaskar spreds ganska långsamt. För det första eftersom det är ett av få länder i världen där majoriteten av befolkningen är trogna anhängare av stamreligioner. Även bland de konverterade kan spår av forntida stamtros starka inflytande ses. Och det andra distributionsproblemet är isoleringen av bosättningar, på grund av vilket missionärer inte ofta kan besöka byar och lokala invånare ofta återvänder till sin stamreligion.
Som i många afrikanska stater tog grekiska handlare hit ortodoxin . "1953 byggdes en ortodox kyrka av grekiska kolonister i huvudstaden Antananarivo . Efter militärkuppen 1972, liksom andra utlänningar, deporterades prästen från landet.”
Början av ortodoxin bland lokalbefolkningen här lades 1994 av Hieromonk Nektary (Kellis) , som kom från Australien . Fem år senare fanns det över 12 tusen ortodoxa och de som förberedde sig för dop på ön.
I staden Antananarivo , landets huvudstad, byggdes en katedral för att hedra antagandet av den allra heligaste Theotokos, tillsammans med den låg stiftsförvaltningen och ett barnhem för flera hundra barn.
Den 26 mars 1995, på korsets söndag, i Assumption Cathedral i huvudstaden, ordinerade Metropolitan Chrysostomos i Zimbabwe diakon John Rikotondrazafi till presbyter. Detta är den första madagaskiska prästen . Han vigdes till diakon i Harare , Zimbabwes huvudstad . Dessförinnan studerade han den liturgiska stadgan i tre månader.
En annan lokalinvånare, Jean Christos Tsakanias, skickades för att studera vid ett seminarium i staden Nairobi ( Kenya ).
Redan 1995 fanns det 63 ortodoxa församlingar, sju skolor och tolv lokala präster på ön. Den ortodoxa kyrkan fick officiellt erkännande från Madagaskars regering.
Med patriarken Peter VII :s välsignelse valde den heliga synoden i kyrkan i Alexandria den 23 september 1997 fader Nectarios till Madagaskars första biskop. Madagaskar blev ett självständigt stift, innan dess var det en del av Metropolen Zimbabwe.
Senare byggdes en medicinsk poliklinik på en mark som donerats av den grekiske konsuln. Här planerade Vladyka Nektary att bygga ett tempel, ett seminarium, ett kloster och en ögonklinik.
Biskop Nectarios tonserade också den första madagaskiska nunnan med namnet Christodoulos.
Ortodoxi adopteras oftast av fattiga människor. I byar och byar bor människor i hyddor gjorda av palmkvistar, deras kapell och tempel är gjorda av samma material. Lokala präster tjänar dessa tempel och kapell utspridda på landsbygden.
Det är mycket arbete i uppdraget, det finns inte tillräckligt med händer och människor. Den ortodoxa missionen är den fattigaste i materiella termer. Men samtidigt försöker hon delta i program för att hjälpa behövande.
Vladyka Nectarios dog i en flygkrasch tillsammans med patriarken Peter VII den 11 september 2004. De var på väg till berget Athos i en grekiskt flygvapenhelikopter.
År 2019 finns det två ortodoxa stift som verkar på Madagaskars territorium: Madagaskars metropol och Touliars biskopsdöme . [ett]