Pribnov låda

Pribnow-box ( även känd som Pribnow- Schaller-box ) är en specifik nukleotidsekvens  som krävs för promotorregionen av bakterier, till vilken RNA-polymeras binder [1] [2] . Pribnow-box-nukleotidsekvensen anses vara konsensussekvensen eftersom den förekommer i många organismer med liten variation. Denna sekvens är uppkallad efter David Pribnow och Heinz Schaller [1] [2] . ТАТААТ

Pribnow-boxen kallas också -10-sekvensen eftersom den är belägen cirka 10 baspar uppströms om transkriptionsstartpunkten .

Funktionerna för denna sekvens liknar TATA-boxen som finns i eukaryoter och arkéer : den känns igen och binds av RNA-polymerasstället under transkriptionsinitiering . Det är också den första punkten där komplementära DNA- strängar divergerar för att tillåta RNA- syntes att börja på DNA-mallen. Detta underlättas av ett stort antal AT-par, eftersom bindningarna mellan adenin och tymin är mindre starka än mellan guanin och cytosin [3] .

Sannolikhet att hitta varje nukleotid

T A T A A T
82 % 89 % 52 % 59 % 49 % 89 % [4]

Anteckningar

  1. 1 2 Pribnow D. Nukleotidsekvens för ett RNA-polymerasbindningsställe vid en tidig T7-promotor.  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1975. - Vol. 72, nr. 3 . - s. 784-788. — PMID 1093168 .
  2. 1 2 Schaller H. , Gray C. , Herrmann K. Nukleotidsekvens av ett RNA-polymerasbindningsställe från DNA från bakteriofag fd.  (engelska)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1975. - Vol. 72, nr. 2 . - s. 737-741. — PMID 1054851 .
  3. Yakovchuk P. , Protozanova E. , Frank-Kamenetskii MD Basstapling och basparning bidrar till termisk stabilitet hos DNA-dubbelhelixen. (engelska)  // Nukleinsyraforskning. - 2006. - Vol. 34, nr. 2 . - s. 564-574. doi : 10.1093 / nar/gkj454 . PMID 16449200 .  
  4. Harley CB , Reynolds RP Analys av E. coli-promotorsekvenser.  (engelska)  // Nukleinsyraforskning. - 1987. - Vol. 15, nr. 5 . - P. 2343-2361. — PMID 3550697 .