Caspase

Domänstruktur för caspase

Kaspas 1 (CASP1)-strukturen, som ursprungligen kallades interleukin-1 beta-omvandlande enzym (ICE), är det första mänskliga kaspaset som har identifierats. [ett]
Identifierare
Symbol Peptidas_C14
Pfam PF00656
Pfam klan CL0093
Interpro IPR002398
PROSITE PS50208
MEROPS C14
SCOP 1 is
SUPERFAMILJ 1 is
Tillgängliga proteinstrukturer
Pfam strukturer
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma 3D-modell

Caspases ( engelsk  caspase ; förkortning från engelska  cysteine-dependent asp artate specific prote ase ) är proteolytiska enzymer som tillhör familjen cysteinproteaser som spjälkar proteiner uteslutande efter aspartat . Kaspaser spelar en viktig roll i processerna för apoptos , nekros och inflammation .

Kaspaser är indelade i initiatoriska, inflammatoriska och effektor (verkställande) sådana. Alla kaspaser syntetiseras initialt i en inaktiv form och aktiveras vid behov av initiatorkaspaser genom att klippa ett litet område. Initiatorkaspaser aktiveras på ett mer komplext sätt - av speciella proteinkomplex: apoptosomer , PIDD-somer , DISC . Från och med 2009 finns det 11 eller 12 bekräftade kaspaser hos människor och 10 hos möss [not 1] som utför en mängd olika cellulära funktioner.

Rollen av dessa enzymer i programmerad celldöd identifierades först 1993, och deras funktioner i apoptos är väl karakteriserade. Denna form av programmerad celldöd, som är utbredd under utveckling och under hela livet, tjänar till att upprätthålla cellulär homeostas. Kaspasaktivering ger kontrollerad förstörelse av cellulära komponenter, vilket leder till celldöd med minimal påverkan på omgivande vävnader (utan deras inblandning i processen) [3] .

Kaspaser spelar andra specifika roller i programmerad celldöd, såsom pyroptos och nekroptos. Dessa former av celldöd är viktiga för att skydda kroppen från cellulära stresssignaler och angrepp av patogener . Kaspaser spelar också en roll vid inflammation varigenom de direkt förbättrar bearbetningen av pro-inflammatoriska cytokiner såsom pro-IL1β. Dessa är signalmolekyler som möjliggör rekrytering av immunceller som attackerar infekterade celler eller vävnader. Det finns andra identifierade roller för kaspaser såsom cellproliferation , tumörsuppression, celldifferentiering , neuroutveckling , axonvägledning och åldrande [4] .

Kaspasbrist har identifierats som en av orsakerna till neoplasmutveckling . Tumörtillväxt kan ske genom en kombination av faktorer, inklusive mutationer i cellcykelgener som tar bort celltillväxtrestriktioner, kombinerat med mutationer i apoptotiska proteiner som kaspaser, som aktiveras och får onormalt växande celler att dö [5] . Omvänt kan överdriven aktivering av vissa kaspaser, såsom kaspas 3, leda till överdriven programmerad celldöd. Detta fenomen observeras i vissa neurodegenerativa sjukdomar , när det finns en irreversibel förlust av nervceller, ett exempel är Alzheimers sjukdom [5] . Kaspaser associerade med bearbetning av inflammatoriska signaler är också involverade i många sjukdomar. Otillräcklig aktivering av dessa kaspaser kan öka värdens känslighet för infektion, eftersom ett lämpligt immunsvar kanske inte inträffar [5] . Kaspasernas integrerade roll i celldöd och sjukdom har lett till forskning om användningen av enzymer som mål för läkemedel ( målinriktad terapi ). Till exempel är inflammatoriskt kaspas 1 involverat i patogenesen av autoimmuna sjukdomar; läkemedel som blockerar kaspas 1-aktivering har använts för att förbättra patienternas hälsa. Dessutom har forskare använt kaspaser som cancerterapi för att döda oönskade celler i blastomogena vävnader [6] .

Funktionell klassificering av kaspaser

De flesta kaspaser spelar en roll i programmerad celldöd. De sammanfattas i tabellen nedan. Enzymer klassificeras i tre typer: initierande, effektor eller exekverande och inflammatoriska [7] .

Programmerad celldöd Caspase typ Enzym En organism i vilken kaspaser finns
apoptos initierande Caspase 2 man och mus
Caspase 8 man och mus
Caspase 9 man och mus
Caspase 10 bara människa [8]
Avrättning Caspase 3 man och mus
Caspase 6 man och mus
Caspase 7 man och mus
pyroptos Inflammatorisk Caspase 1 man och mus
Caspase 4 man [not 2]
Caspase 5 man [not 2]
Caspase 11 mus [not 2]
Caspase 12 mus och några människor [not 1]
Caspase 13 bara kor [10]
Annan roll Övrig Caspaza 14 man och mus

Observera att förutom apoptos krävs även kaspas 8 för att hämma en annan form av programmerad celldöd som kallas nekroptos [11] . Kaspas 14 spelar en roll i differentieringen av epiteliala keratinocyter och kan bilda en epidermal barriär som skyddar mot uttorkning (uttorkning) och ultraviolett strålning [12] .

Caspase-aktivering

Kaspaser syntetiseras som inaktiva zymogener (procaspaser) som aktiveras först efter en lämplig stimulans. Denna post-translationella kontrollnivå möjliggör snabb och snäv reglering av enzymet.

Aktivering involverar dimerisering och ofta oligomerisering av prokaspaser, följt av klyvning i två subenheter av olika storlekar, stora och små. De stora och små subenheterna binder till varandra för att bilda ett aktivt heterodimert kaspas. Det aktiva enzymet i naturen existerar ofta som en heterotetramer, där prokaspasdimeren klyvs samman för att bilda heterotetrameren [13] .

Dimerisering

Aktivering av initiatorkaspaser och inflammatoriska kaspaser initieras genom dimerisering genom bindning till adaptorproteiner med protein-proteininteraktionsmotiv, de så kallade dödsvecken . Dödsvecken är belägna i en strukturell domän av kaspasen känd som pro-domänen, vilket är mer rikligt i de kaspaser som innehåller dödsveck än de som inte gör det. Prodomänen för de interna initiala initiatorkaspaserna och de inflammatoriska kaspaserna innehåller ett dödsveck känt som kaspasaktiverings- och rekryteringsdomänen (förkortning CARD ), medan prodomänen för de externa initiatorkaspaserna innehåller två dödsveck kända som döden effektordomäner (förkortning DED). ) [14] [15] .

Ofta, under kaspasaktivering, bildas multiproteinkomplex [13] . Några aktiverade multiproteinkomplex inkluderar:

Dela

Efter en lämplig dimeriseringsprocess spjälkar kaspaser vid interdomänlinkerregionerna för att bilda en stor och liten subenhet. Denna klyvning gör att slingorna på det aktiva stället kan anta en konformation som är gynnsam för enzymatisk aktivitet [16] . Klyvning av initiator- och effektor ( executor ) kaspaser sker på olika sätt, som beskrivs i tabellen nedan.

initiator caspas

Caspase 8

Exekutor caspase

Caspase Caspase 3

[17]

Några av rollerna som spelas av caspases

I apoptos

Apoptos är en form av programmerad celldöd när en cell genomgår morfologiska förändringar som minimerar dess effekt på omgivande celler för att undvika att inducera ett immunsvar. Cellen krymper och kondenserar - cytoskelettet förstörs, kärnhöljet demonteras och DNA-fragmentering sker. Detta gör att cellerna bildar slutna kroppar som kallas "vesiklar" för att undvika frisättning av cellulära komponenter i den extracellulära miljön. Dessutom förändras innehållet av fosfolipider i cellmembranet, vilket gör den döende cellen mer mottaglig för fagocytisk attack och utnyttjande [18] .

Apoptopiska kaspaser klassificeras i:

När aktiveringen av initiatorkaspaserna väl inträffar, startar en kedjereaktion, vilket leder till aktiveringen av flera andra effektorkaspaser. Exekutorkaspaser bryts ned över 600 cellulära komponenter [19] för att inducera morfologiska förändringar under apoptos.

Exempel på kaspaskaskader som uppstår under apoptos:

  1. Inre (mitokondriell) apoptossignaleringsväg : Under cellulär stress frisätts mitokondriellt cytokrom c till cytosolen. Denna molekyl binder ett adapterprotein ( APAF-1 ) som rekryterar initiatorkaspas 9 (via CARD-CARD interaktion). Detta resulterar i bildandet av ett kaspas som aktiverar ett multiproteinkomplex som kallas apoptosomen . Efter aktivering av initiatorkaspaser, såsom kaspas 9, sker klyvning och aktivering av andra effektorkaspaser. Detta leder till nedbrytning av cellulära komponenter under apoptos.
  2. Apoptos yttre signalväg : Kaspaskaskaden aktiveras också av extracellulära ligander via dödsreceptorer belägna på cellytan. Detta uppnås genom bildandet av ett polyprotein dödssignaleringskomplex (DISC), som rekryterar och aktiverar prokaspas. Till exempel binder FasL-liganden FasR-receptorn på den extracellulära ytan av receptorn; bindning aktiverar dödsdomäner i receptorns cytoplasmatiska svans. FADD-adapterproteinet kommer att rekrytera (via dödsdomän-till-dödsdomäninteraktion) pro-kaspas 8 via DED-domänen. Dessa proteiner FasR , FADD och procaspase 8 bildar ett dödsinducerande signalkomplex (DISC) i vilket kaspas 8 är aktiverat. 6 och kaspas 7), utformade för att förstöra cellulära komponenter, som visas nedan i det generaliserade diagrammet [20] .

I pyroptos

Pyroptos är en form av programmerad celldöd som till sin natur inducerar ett immunsvar . Det skiljer sig morfologiskt från andra typer av celldöd - celler sväller, spricker och frigör pro-inflammatoriskt cellulärt innehåll. Detta inträffar som svar på en rad stimuli, inklusive mikrobiella infektioner , såväl som hjärtinfarkter (som de som uppstår vid hjärtinfarkt ) [21] . Kaspas 1 , kaspas 4 och kaspas 5 hos människor och kaspas 1 och kaspas 11 hos möss spelar en viktig roll i induktionen av celldöd under pyroptos. Denna process begränsar livslängden och tiden för proliferation av intracellulära och extracellulära patogener.

Involvering av kaspas 1 i pyroptos

Kaspas 1-aktivering förmedlas av en repertoar av proteiner, vilket gör det möjligt att detektera en rad patogena ligander. Några mediatorer av kaspas 1-aktivering är: NOD-liknande receptorer (NLR), AIM2- liknande receptorer (ALR), Pyrin och IFI16 [22] . Dessa proteiner möjliggör aktivering av kaspas 1 genom att bilda ett aktiverande multiproteinkomplex som kallas inflammasomen .

Till exempel är den NOD-liknande leucinrika upprepningen, NLRP3, känslig för utflödet av kaliumjoner från cellen. Denna cellulära joniska obalans resulterar i oligomerisering av NLRP3-molekyler för att bilda ett multiproteinkomplex som kallas NLRP3-inflammasomen. Procaspase 1 förs in i närheten av en annan procaspasmolekyl, och ytterligare dimerisering och autoproteolytisk klyvning sker [22] .

Några patogena signaler som leder till pyroptos orsakad av kaspas 1-aktivering listas nedan:

  • DNA i cellens cytosol binder till AIM2-liknande receptorer och orsakar pyroptos
  • Apparaten i det bakteriella sekretionssystemet av typ III (finns i bakterierna Yersinia , Salmonella och Shigella [23] ) binder till en NOD-liknande leucinrik upprepning som kallas NAIP (NAIP1 hos människor och NAIP4 hos möss).
Pyroptos orsakad av aktivering av kaspas 4 och kaspas 5 hos människor och kaspas 11 hos möss

Dessa kaspaser har förmågan att inducera direkt pyroptos när lipopolysackarid (LPS) molekyler (finns i cellväggen hos gramnegativa bakterier ) kommer in och identifieras i värdcellens cytoplasma. Till exempel fungerar kaspas 4 som en receptor och aktiveras proteolytiskt utan behov av en inflammasom eller utan kaspas 1-aktivering [22] .

Det viktigaste nedströmssubstratet för pyroptopiska kaspaser är gasdermin D (GSDMD) [24] .

Roll i inflammation

Inflammation är en skyddande reaktion av kroppen som ett resultat av den negativa effekten av en skadlig stimulans, såsom vävnadsskada eller bakteriell infektion , och syftar till att återställa ett (normalt) homeostatiskt jämviktstillstånd [19] .

Kaspas 1, kaspas 4, kaspas 5 och kaspas 11 anses vara inflammatoriska kaspaser [7] .

  • Kaspas 1 är nyckeln i aktiveringen av pro-inflammatoriska cytokiner; de fungerar som signaler till immunceller och skapar en gynnsam miljö för immuncellsrekrytering vid skadeplatsen. Därför spelar kaspas 1 en grundläggande roll i det medfödda immunsystemet . Enzymet är ansvarigt för bearbetningen av cytokiner som pro-ILβ och pro-IL18, såväl som för deras utsöndring (frisättning) [22] .
  • Kaspas 4 och 5 hos människor och kaspas 11 hos möss har en unik roll som receptor varigenom de binder till LPS, en molekyl som finns rikligt på cellytorna hos gramnegativa bakterier. Bindning kan leda till bearbetning och utsöndring av cytokinerna IL-1β och IL-18 genom att aktivera kaspas 1; denna efterföljande effekt är densamma som beskrivits ovan. Detta leder också till utsöndring av ett annat inflammatoriskt cytokin som inte bearbetas. Cytokinmolekylen kallas pro-IL1α. Det finns också tecken på ett inflammatoriskt kaspas som främjar cytokinutsöndring av kaspas 11; processen sker genom inaktivering av membrankanalen, vilket blockerar utsöndringen av IL-1β [22] .
  • Kaspaser kan också inducera ett inflammatoriskt svar på transkriptionsnivån. Det finns bevis för att detta inflammatoriska svar främjar transkriptionen av nukleär faktor-KB ( NF-KB ), en transkriptionsfaktor som hjälper till att transkribera inflammatoriska cytokiner såsom IFN , TNF , IL-6 och IL-8. Till exempel aktiverar kaspas 1 kaspas 7, som i sin tur klyver poly(ADP-ribos)-polymeras , vilket aktiverar transkriptionen av gener som kontrolleras av NF-KB [19] .

Upptäckt av caspase

Robert Horvitz etablerade ursprungligen vikten av kaspaser vid apoptos och fann att ced-3-genen krävs för celldöd som inträffade under utvecklingen av nematoden C. elegans . Horwitz och kollegan Junying Yuan upptäckte 1993 att proteinet som kodas av ced-3-genen är ett cysteinproteas med liknande egenskaper som däggdjursinterleukin-1-beta-omvandlingsenzymet (ICE) (nu känt som kaspas 1). Vid den tiden var ICE den enda kända kaspasen [25] . Därefter har andra däggdjurscaspaser identifierats, förutom de som finns i organismer som fruktflugan Drosophila melanogaster .

Forskarna bestämde sig för kaspasnomenklaturen 1996. I många fall har en viss kaspas identifierats samtidigt av mer än ett laboratorium; var och en gav sedan proteinerna ett annat namn. Till exempel har kaspas 3 varit omväxlande känt som CPP32, apopain och Yama. Därför numrerades kaspaserna i den ordning som de identifierades [26] . Därför döptes ICE om till kaspas 1. ICE var det första kaspas från däggdjur som karakteriserades på grund av dess likhet med nematoddödsgenen ced-3, men huvudrollen för detta enzym verkar vara att mediera inflammation snarare än celldöd.

Evolution

Hos djur induceras apoptos av kaspaser, medan apoptos hos svampar och växter induceras av ett arginin- och lysinspecifikt kaspasliknande proteas som kallas metakaspas. Homologisökning avslöjade nära homologi mellan kaspaser och kaspasliknande proteiner från Reticulomyxa (encellig organism). En fylogenetisk studie indikerar att kaspas- och metakaspassekvensdivergens inträffade före eukaryot divergens [27] .

Se även

Litteratur

Länkar

  1. ↑ Wilson KP, Black JA, Thomson JA et al. Struktur och mekanism för interleukin-1 beta-omvandlande enzym  (engelska)  // Nature : journal. - 1994. - Juli ( vol. 370 , nr 6487 ). - S. 270-275 . - doi : 10.1038/370270a0 . — PMID 8035875 .
  2. ↑ Saleh, Maya; Vaillancourt, John P; Graham, Rona K; Huyck, Matthew; Srinivasula, Srinivasa M; Alnemri, Emad S; Steinberg, Martin H; Nolan, Vikki; Baldwin, Clinton T; Hotchkiss, Richard S; Buchman, Timothy G; Zehnbauer, Barbara A; Hayden, Michael R; Farrer, Lindsay A; Roy, Sophie; Nicholson, Donald W. Differentiell modulering av endotoxinrespons av humana kaspas-12 polymorfismer  //  Nature: journal. - 2004. - Vol. 429 , nr. 6987 . - S. 75-9 . - doi : 10.1038/nature02451 . — PMID 15129283 .
  3. ↑ Rathore, S.; Datta, G.; Kaur, I.; Malhotra, P.; Mohmmed, A. Störning av cellulär homeostas inducerar organellstress och utlöser apoptos liknande celldödsvägar i malariaparasit  (engelska)  // Cell Death & Disease : journal. - 2015. - 2 juli ( vol. 6 , nr 7 ). —P.e1803 . _ - doi : 10.1038/cddis.2015.142 . — PMID 26136076 .
  4. ↑ Shalini, S.; Dorstyn, L.; Dawar, S.; Kumar, S. Gamla, nya och framväxande funktioner hos kaspaser  // Cell Death & Differentiation  : journal  . - 2015. - 1 april ( vol. 22 , nr 4 ). - s. 526-539 . — ISSN 1350-9047 . - doi : 10.1038/cdd.2014.216 . — PMID 25526085 .
  5. ↑ 1 2 3 Goodsell, David S. Molecular Perspective: Caspases  //  Onkologen: journal. - 2000. - 1 oktober ( vol. 5 , nr 5 ). - s. 435-436 . — ISSN 1083-7159 . - doi : 10.1634/theoncologist.5-5-435 . — PMID 11040280 .
  6. ↑ McIlwain, David R.; Berger, Thorsten; Mak, Tak W. Caspase Functions in Cell Death and Disease  //  Cold Spring Harbor Perspectives in Biology: journal. - 2013. - 1 april ( vol. 5 , nr 4 ). — P. a008656 . — ISSN 1943-0264 . - doi : 10.1101/cshperspect.a008656 . — PMID 23545416 .
  7. ↑ 12 Lorenzo ; Galluzzi; Lopez-Soto, Alejandro; Kumar, Sharad; Kroemer, Guido. Caspases Connect Cell-Death Signaling to Organismal Homeostasis  (engelska)  // Immunity : journal. - Cell Press , 2016. - 16 februari ( vol. 44 , nr 2 ). - S. 221-231 . — ISSN 1074-7613 . - doi : 10.1016/j.immuni.2016.01.020 . — PMID 26885855 .
  8. ↑ Jänicke, Reiner U.; Sohn, Dennis; Totzke, Gudrun; Schulze-Osthoff, Klaus. Caspase-10 i mus eller inte? (engelska)  // Vetenskap . - 2006. - Juni ( vol. 312 , nr 5782 ). - S. 1874 . - doi : 10.1126/science.312.5782.1874a . — PMID 16809511 .
  9. ↑ Stowe, Irma; Lee, Bettina; Kayagaki, Nobuhiko. Caspase-11: beväpna skydden mot bakterieinfektion  (engelska)  // Immunologiska recensioner: journal. - 2015. - Vol. 265 , nr. 1 . - S. 75-84 . - doi : 10.1111/imr.12292 . — PMID 25879285 .
  10. ↑ Koenig, Ulrich; Eckhart, Leopold; Tschachler, Erwin. Bevis för att Caspase-13 inte är en människa utan en bovin gen  //  Biokemiska och biofysiska forskningskommunikationer : journal. - 2001. - Vol. 285 , nr. 5 . - P. 1150-1154 . - doi : 10.1006/bbrc.2001.5315 . — PMID 11478774 .
  11. ↑ Vanden Berghe T., Linkermann A., Jouan-Lanhouet S., Walczak H., Vandenabeele P. Regulated necrosis: the expanding network of non-apoptotic cell death pathways  // Nature Reviews  . Molecular Cell Biology  : tidskrift. - 2014. - Februari ( vol. 15 , nr 2 ). - S. 135-147 . doi : 10.1038 / nrm3737 . — PMID 24452471 .
  12. ↑ Denecker, Geertrui; Ovaere, Petra; Vandenabeele, Peter; Declercq, Wim. Caspase-14 avslöjar sina hemligheter  // The  Journal of Cell Biology : journal. - 2008. - 11 februari ( vol. 180 , nr 3 ). - s. 451-458 . — ISSN 0021-9525 . - doi : 10.1083/jcb.200709098 . — PMID 18250198 .
  13. ↑ 12 Shi, Yigong . Caspase Activation  (engelska)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2004. - 25 juni ( vol. 117 , nr 7 ). - s. 855-858 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2004.06.007 . — PMID 15210107 .
  14. ↑ Lahm, Armin; Paradisi, Andrea; Green, Douglas R; Melino, Gerry. Death fold domän interaktion i apoptos  // Cell Death and Differentiation  : journal  . - 2003. - Vol. 10 , nej. 1 . - S. 10-2 . - doi : 10.1038/sj.cdd.4401203 . — PMID 12655289 .
  15. ↑ Kumar, S. Kaspasfunktion vid programmerad celldöd  // Celldöd och differentiering  : journal  . - 2006. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 32-43 . - doi : 10.1038/sj.cdd.4402060 . — PMID 17082813 .
  16. ↑ Riedl, Stefan J.; Shi, Yigong. Molekylära mekanismer för kaspasreglering under apoptos  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : journal  . - 2004. - November ( vol. 5 , nr 11 ). - P. 897-907 . - doi : 10.1038/nrm1496 . — PMID 15520809 .
  17. ↑ Lavrik, I.; Krueger, A.; Schmitz, I.; Baumann, S.; Weyd, H.; Krammer, P.H.; Kirchhoff, S. Den aktiva kaspas-8-heterotetrameren bildas vid CD95 DISC  //  Cell Death & Differentiation  : journal. - 2003. - 1 januari ( vol. 10 , nr 1 ). - S. 144-145 . — ISSN 1350-9047 . - doi : 10.1038/sj.cdd.4401156 . — PMID 12655304 .
  18. ↑ Elmore, Susan. Apoptos: En översyn av programmerad celldöd  //  Toxicologic Pathology : journal. - 2007. - 1 juni ( vol. 35 , nr 4 ). - S. 495-516 . — ISSN 0192-6233 . - doi : 10.1080/01926230701320337 . — PMID 17562483 .
  19. ↑ 1 2 3 Sollberger, Gabriel; Strittmatter, Gerhard E.; Garstkiewicz, Martha; Sand, Jennifer; Öl, Hans-Dietmar. Caspase-1: The inflammasome and beyond  //  Innate Immunity: journal. - 2014. - 1 februari ( vol. 20 , nr 2 ). - S. 115-125 . — ISSN 1753-4259 . doi : 10.1177 / 1753425913484374 . — PMID 23676582 .
  20. ↑ Creagh, Emma M. Caspase crosstalk: integration av apoptotiska och medfödda immunsignalvägar  //  Trends in Immunology : journal. - Cell Press , 2014. - December ( vol. 35 , nr 12 ). - s. 631-640 . - doi : 10.1016/j.it.2014.10.004 . — PMID 25457353 .
  21. ↑ Bergsbaken, Tessa; Fink, Susan L.; Cookson, Brad T. Pyroptosis: värdcellsdöd och inflammation  (eng.)  // Nature Reviews Microbiology  : journal. - 2009. - Vol. 7 , nr. 2 . - S. 99-109 . - doi : 10.1038/nrmicro2070 . — PMID 19148178 .
  22. ↑ 1 2 3 4 5 Eldridge, Matthew JG; Shenoy, Avinash R. Antimikrobiella inflammasomer: enhetlig signalering mot olika bakteriella patogener  //  Current Opinion in Microbiology: journal. — Elsevier , 2015. — Vol. 23 . - S. 32-41 . - doi : 10.1016/j.mib.2014.10.008 . — PMID 25461570 .
  23. ↑ Grön ER , Mecsas J. Bakteriella utsöndringssystem: En översikt.  (engelska)  // Microbiology Spectrum. - 2016. - Februari ( vol. 4 , nr 1 ). - doi : 10.1128/microbiolspec.VMBF-0012-2015 . — PMID 26999395 .
  24. ↑ Han, Wan-ting; Wang, Haoqiang; Hu, lav; Chen, Pengda; Wang, Xin; Huang, Zhe; Yang, Zhang-Hua; Zhong, Chuan-Qi; Han, Jiahuai. Gasdermin D är en utförare av pyroptos och krävs för interleukin-1β-  utsöndring  // Cellforskning : journal. - 2015. - 1 december ( vol. 25 , nr 12 ). - P. 1285-1298 . — ISSN 1001-0602 . - doi : 10.1038/cr.2015.139 . — PMID 26611636 .
  25. ↑ Yuan, J. et al. C. elegans celldödsgen ced-3 kodar för ett protein som liknar däggdjursinterleukin-1 beta-omvandlande enzym  (engelska)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1993. - Vol. 75 , nr. 4 . - s. 641-652 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90485-9 . — PMID 8242740 .
  26. ↑ Alnemri ES; Emad S. et al. Human ICE/CED-3 - proteasnomenklatur   // Cell . - Cell Press , 1996. - Vol. 87 , nr. 2 . — S. 171 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81334-3 . — PMID 8861900 . Arkiverad från originalet den 17 december 2012.
  27. ↑ Klim, Joanna; Gladki, Arkadiusz; Kucharczyk, Roza; Zielenkiewicz, Urszula; Kacznowski, Szymon. Ancestral State Rekonstruktion av apoptosmaskineriet i eukaryoternas gemensamma förfader  // G3  : Gener, Genomes, Genetics : journal. - 2018. - 27 april ( vol. 8 , nr 6 ). - P. 2121-2134 . — ISSN 2160-1836 . - doi : 10.1534/g3.118.200295 . — PMID 29703784 .

Externa länkar

Anteckningar

  1. ↑ 1 2 Funktionell CASP12 uttrycks endast i vissa individer av afrikansk härkomst, medan individer av asiatisk eller kaukasisk härkomst endast uttrycker en icke-funktionell trunkerad form. [2]
  2. ↑ 1 2 3 CASP4 och CASP5 anses vara de mänskliga ortologerna av CASP11, som hittades i möss och råttor men inte hos människor. [9]
  Gå till Wikidata-objektet  Ordböcker och uppslagsverk
 Proteaser : Cystein (tiol) proteaser ( EC 3.4.22)
Kalpain
  • CAPN1
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPNS1
  • CAPNS2
Caspase
Cathepsin
Kommer från växter
(frukter)
Resten
  • Clostripain
  • Autofagin