Pararnavirae
Pararnavirae är ett rike av virus skapat av International Committee on Taxonomy of Viruses som inkluderar alla retrotranskriberade virus. Den inkluderar grupperna VI och VII enligt Baltimore-klassificeringen [2] . de kan innehålla DNA eller RNA , men de replikerar med användning av omvänt transkriptas , det vill säga genom en mellanliggande sträng av genetiskt material som skiljer sig från den som de är sammansatta av. Riket omfattar två ordnar och sex familjer.
DNA-virus i detta rike är nära besläktade med RNA-virus, så de klassificeras i Ribovirian- riket tillsammans med det senare. Ursprunget till dessa virus verkar gå tillbaka till uppkomsten av eukaryoter . Det har föreslagits att retrotranskriptionella virus härrörde från en händelse där en retrotransposon integrerades i kapsiden av ett annat virus, och ersatte genomet och enzymerna från värdviruset, men det har också föreslagits att det också kan vara ett RNA-virus. Senare retrotransfekterade virus uppstod från LTR-retrotransposoner som ett resultat av virusinfektion. De klassificeras i familjerna Pseudoviridae , Metaviridae och Belpaoviridae [3] [4] .
Humant immunbristvirus (HIV) och hepatit B-virus är bland de arter som drabbar människor [5] .
Klassificering
Fylogeni
En fylogenetisk studie av omvänt transkriptas gav följande resultat, och endogeniserade LTR-retrotransposoner tilldelade familjerna Pseudoviridae, Metaviridae och Belpaviridae inkluderades också: [6] [7]
Referenser
- ↑ Taxonomy of Viruses på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ Virustaxonomi: 2019 års release . talk.ictvonline.org . International Committee on Taxonomy of Viruses. Tillträdesdatum: 25 april 2020. (obestämd)
- ↑ Arshan, Nasir; Caetano-Anollés, Gustavo (25 september 2015). "En fylogenomisk datadriven utforskning av viralt ursprung och evolution" . Vetenskapens framsteg . 1 (8): e1500527. Bibcode : 2015SciA....1E0527N . doi : 10.1126/ sciadv.1500527 . PMC 4643759 . PMID26601271 . _
- ↑ Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Virusvärlden som ett evolutionärt nätverk av virus och kapsidlösa själviska element . Mikrobiologi och molekylärbiologi recensioner.
- ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH Förslag: Skapa ett megataxonomiskt ramverk, som fyller alla huvudsakliga taxonomiska led, för Riboviria . International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . Tillträdesdatum: 21 maj 2020.
- ↑ Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: New Virus Order Unifying Five Families of Reverse-Transcription Viruses // Journal of Virology / Rozanne M. Sandri-Goldin. — 2018-06-15. — Vol. 92 , iss. 12 . — P.e00515–18 . — ISSN 1098-5514 0022-538X, 1098-5514 . - doi : 10.1128/JVI.00515-18 .
- ↑ Carlos Llorens, Beatriz Soriano, Maria Navarrete-Muñoz, Ahmed Hafez, Vicente Arnau. 3 // Omvänt transkriberande virus av familjerna Belpaoviridae, Metaviridae och Pseudoviridae (ordning Ortervirales) . - Elsevier, 2020. - ISBN 978-0-12-809633-8 .
Anteckningar
Klassificering av virus enligt Baltimore |
---|
DNA | I: virus |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Oklassificerad | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Oklassificerad |
|
---|
|
---|
Oklassificerad |
- familj : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Släkten : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-virus |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Oklassificerad |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-virus |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Oklassificerad |
- Familjer : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRÅN | |
---|