Caudovirales
Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från
versionen som granskades den 9 juli 2019; kontroller kräver
5 redigeringar .
Caudovirales ( lat. , från cauda - svans ) - ordningen DNA-innehållande virus - bakteriofager , vars virioner har en icosaedrisk huvudform och en spiralformad svans.
Genomet representeras av en enda icke-segmenterad linjär dubbelsträngad DNA -molekyl . En linjär molekyl kan ibland anta en ringform; enkelsträngade luckor kan också förekomma i en dubbelsträngad struktur. Ändarna av molekylen är kovalent kopplade till terminala proteiner. Genomet kan innehålla från 18 till 500 tusen baspar och kodar för både strukturella och icke-strukturella proteiner [2] .
Ordningen omfattar ett stort antal virus [3] , av vilka många har liknande gener, men deras sekvens kan variera avsevärt även inom samma släkte. Det gemensamma ursprunget bedöms av den karakteristiska strukturen hos viruspartiklarna.
År 2016, på förslag från underkommittén för bakteriella och arkeala virus från International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) , ändrades de vetenskapliga namnen på företrädare för orden och andra bakteriofager:
- kombinationer som och phi togs bort från namnen på släkten [4] ;
- i artnamnen ersattes ordet fag med virus som ett erkännande av det faktum att bakteriofager är vanliga virus; förtydligade infekterade organismer till namnet på släktet, tog bort de specifika namnen på prokaryoter och bindestreck; tog bort kombinationen phi där det inte finns någon historisk anledning till dess närvaro [5] .
Klassificering
Från och med april 2018 ingår följande familjer och underfamiljer i ordningen [3] :
- Ackermanviridae
- Autographiviridae
- Chaseviridae
- Demerecviridae
- Drexlerviridae
- Guelinviridae
- Herelleviridae
- Myoviridae
- Podoviridae
- Rountreeviridae
- Salasmaviridae
- Schitoviridae
- Siphoviridae
- Zobellviridae
- Incertae sedis
Anteckningar
- ↑ Taxonomy of Viruses på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ ICTVdB Management (2006). 02. Caudovirales. Arkiverad 15 juni 2010 på Wayback Machine i: ICTVdB - The Universal Virus Database, version 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
- ↑ 1 2 Taxonomy of Viruses (engelska) på webbplatsen för International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 10 maj 2018) .
- ↑ Byte av namn på alla fagsläkten : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2015.006aB. - 2015. - 5 sid.
- ↑ För att byta namn på alla (522) existerande bakterievirus och 2 arkaeala virusarter : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2015.025aB. - 2015. - 18 sid.
Klassificering av virus enligt Baltimore |
---|
DNA | I: virus |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Oklassificerad | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Oklassificerad |
|
---|
|
---|
Oklassificerad |
- familj : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Släkten : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-virus |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Oklassificerad |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-virus |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Oklassificerad |
- Familjer : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRÅN | |
---|