Pseudoviridae

Pseudoviridae
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:PararnaviraeSorts:ArtverviricotaKlass:RevtraviricetesOrdning:OrterviralesFamilj:Pseudoviridae
Internationellt vetenskapligt namn
Pseudoviridae
Dotter taxa
  • hemivirus
  • Pseudovirus
  • Sirevirus

Pseudoviridae  är en familj av virus [2] som inkluderar tre släkten [3] .

Virus i familjen är faktiskt LTR-retrotransposoner av Ty1-copia-familjen. De replikerar med hjälp av strukturer som kallas virusliknande partiklar (VLP). VLP: er är inte smittsamma som vanliga virioner, men ändå utgör de en viktig del av livscykeln för pseudovirus [4] .

Taxonomi

Pseudoviridae klassificeras informellt i gruppen av RNA VI omvänd transkriptionsvirus och infekterar svampar och ryggradslösa djur .

Pseudoviridae inkluderar mycket olika medlemmar, och de flesta Pseudoviridae kodar för Gag och Pol i samma öppna läsram .

Pseudoviridae ingår i ordningen Ortervirales tillsammans med familjerna Belpaoviridae , Metaviridae , Retroviridae och Caulimoviridae [5] .

Familjen inkluderar följande släkten: [3]

Andra Pseudoviridae- arter som inte hänförs till släktet inkluderar:

Genom

Genomet av denna familj av virus är ett osegmenterat, -RT, positiv-sens enkelsträngat RNA och är 4200-9700 nukleotider långt . Genomet kodar för strukturella proteiner och icke -strukturella proteiner som kodar för RNA-beroende DNA-polymeras , replikas och omvänt transkriptas för omvänd transkriptionssteget under replikering .

Virologi

Virusets kapsid har inget skal och ser ungefär sfärisk ut. Kapsiden är rund med icosaedrisk symmetri med trianguleringstal (T) = 3 och 4. Den är också isometrisk till kvasi-isometrisk och har en diameter på 30-50 nm. LTR- retrotransposoner är dåligt karakteriserade och deras lipider har inte rapporterats.

Genomet integreras i värdgenomet och transkriberas av värdcellsenzymer såsom det eukaryota nukleära RNA-polymeraset II . Genomreplikation sker i värdcytoplasman , eller så kan kärnan och sammansättningen ske i cytoplasman eller i kärnan.

Anteckningar

  1. Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. Llorens, C (2 februari 2021). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Pseudoviridae ". Journal of General Virology . 102 (3). doi : 10.1099/ jgv.0.001563 . PMID 33528349 . 
  3. 1 2 ICTV-rapport Pseudoviridae .
  4. Familj: Pseudoviridae | ICTV  (engelska) . www.ictv.global . Hämtad: 19 augusti 2022.
  5. "Ortervirales: Ny virusordning som förenar fem familjer av omvänd transkriptionsvirus". Journal of Virology . 92 (12). Juni 2018. DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642  . _
  6. NCBI: Penicillium camemberti virus - GP1 (art)

Länkar