Hepatit B-virus
Den aktuella versionen av sidan har ännu inte granskats av erfarna bidragsgivare och kan skilja sig väsentligt från
versionen som granskades den 1 oktober 2022; verifiering kräver
1 redigering .
Hepatit B -virus (hepatit b-virus, "b"; engelska Hepatit B-virus , HBV) är ett DNA-innehållande virus från hepadnavirusfamiljen , det orsakande ämnet för viral hepatit B. I världen är, enligt olika uppskattningar, från 3 till 6 % av människor infekterade med viruset hepatit B. Bärandet av viruset åtföljs inte nödvändigtvis av hepatit, men bäraren av viruset kan infektera andra människor, liksom djur.
Sjukdom
Även om det finns ett vaccin för att förhindra hepatit B, är hepatit B-viruset fortfarande ett globalt folkhälsoproblem. Hepatit B kan vara akut och sedan bli kronisk, vilket leder till andra sjukdomar och hälsotillstånd [2] . Förutom att orsaka hepatit kan infektion med hepatit B-virus leda till cirros och hepatocellulärt karcinom [3] .
Det har också föreslagits att sjukdomen kan öka risken för cancer i bukspottkörteln [4] .
Klassificering
Hepatit B-viruset klassificeras i släktet Orthohepadnavirus , som innehåller 11 andra arter. Släktet klassificeras som en del av familjen Hepadnaviridae , som inkluderar fyra andra släkten: Avihepadnavirus , Herpetohepadnavirus , Metahepadnavirus och Parahepadnavirus [5] . Denna familj av virus är den enda medlemmen av den Blubervirales [5] virala ordningen .
Virus som liknar hepatit B har hittats i alla människoapor ( orangutanger , gibboner , gorillor och schimpanser ), Gamla världens apor [6] och Nya världens ulliga apor (ulliga apor hepatit B-virus), vilket tyder på ett gammalt ursprung. detta virus hos primater.
Viruset klassificeras i fyra huvudserotyper ( adr , adw, ayr, ayw) baserat på de antigena epitoper som finns på dess höljesproteiner . Dessa serotyper är baserade på en gemensam determinant (a) och två ömsesidigt uteslutande par av determinanter (d/y och w/r). Virusstammar delades också in i tio genotyper (AJ) och fyrtio subgenotyper i enlighet med den totala variationen i genomets nukleotidsekvens [7] . Genotyperna har en tydlig geografisk spridning och används för att spåra utvecklingen och överföringen av viruset. Skillnader mellan genotyper påverkar sjukdomens svårighetsgrad, förloppet och sannolikheten för komplikationer samt svar på behandling [8] [9] . Serotyper och genotyper matchar inte nödvändigtvis.
Oklassificerade arter
Hos fladdermöss har ett antal ännu oklassificerade arter som liknar hepatit B isolerats [10] .
Morfologi
Struktur av en viruspartikel
Hepatit B-viruset är en medlem av hepadnavirusfamiljen [11] . Viruspartikeln, som kallas Dane-partikeln [12] ( virion ), består av ett yttre lipidhölje och en icosaedrisk nukleokapsidkärna , som är sammansatt av protein . Nukleokapsiden innehåller viralt DNA och DNA-polymeras , som har omvänt transkriptasaktivitet som liknar retrovirus [13] . Det yttre skalet innehåller inbäddade proteiner som är involverade i virusets bindning till mottagliga celler och penetration in i dem. Viruset är ett av de minsta höljesförsedda djurvirus med en viriondiameter på 42 nm, men pleomorfa former finns också, inklusive filamentösa och sfäriska kroppar som saknar kärna. Dessa partiklar är icke-infektiösa och består av en lipid och ett protein som utgör en del av ytan av virion som kallas ytantigenet ( HBsAg ) och som produceras i överskott under virusets livscykel [14] .
Komponenter
Viruset består av:
- HBsAg (hepatit B -ytantigen ) var det första proteinet från hepatit B-viruset som upptäcktes [15] . Den består av ett litet (S), medium (M) och stort (L) protein [16] .
- HBcAg (hepatit B major-antigen) är det huvudsakliga strukturella proteinet i HBV-ikosaedriska nukleokapsiden och är involverat i viral replikation . Kapsidbildning är huvudfaktorn vid cellinfektion [17] . HBcAg främjar clearance av HBV in vivo , men det är inte känt om HBcAg måste vara i kapsidform för att hjälpa till att eliminera viruset [18] .
- Hepatit B-virus DNA-polymeras inkorporeras i nukleokapsiden tillsammans med pregenomiskt RNA (pgRNA). Inuti kapsiden genomgår pgRNA omvänd transkription för att bilda en (-) DNA-sträng. Samtidigt förstörs det mesta av RNA-mallen av polymerasets RNas-aktivitet. Detta följs av syntes av (+)-strängen av DNA, och polymeraset binder slutligen kovalent till (-)-strängen av DNA [19] [20] . Polymeraset kasseras efter att virion infekterar en ny cell.
- HBeAg (hepatit B-höljeantigen) kan hittas mellan den ikosaedriska kärnan av nukleokapsiden och lipidhöljet, men anses "oinvolverat" och utsöndras och ackumuleras i serumet. HBeAg och HBcAg är gjorda från samma läsram [21] .
- HBx är liten, 154 aminosyror lång , icke-strukturell, och spelar en viktig roll i HBV-associerad leversjukdom och i HBV-replikation i HepG2- celler [22] . Många aktiviteter har förknippats med HBx-uttryck. Men de molekylära mekanismerna för många av dessa aktiviteter är okända [23] . Detta protein är multifunktionellt, det aktiverar cellsignaleringsvägar och är väsentligt för virusinfektion [24] .
Hepatit D-viruset kräver att HBV-höljespartiklar blir virulenta [25] .
Evolution
Den tidiga utvecklingen av hepatit B-virus, liksom alla andra virus, är svår att fastställa. Identifieringen av hepadnavirus i ett brett spektrum av ryggradsdjur antyder en lång samevolution. Identifieringen av endogena element av hepadnaviridae som är gemensamma för olika fågelarter indikerar närvaron av detta virus i fåglar i minst 70 miljoner år [26] . Även om liknande bevis saknas för däggdjur, antyder den fylogenetiska positionen för ortohepadnavirus som en systerklad av avigepadnavirus närvaron av viruset i förfäderna till fostervatten och efterföljande samevolution med både fåglar och däggdjur efter att de divergerade (>300 miljoner år sedan). Det har också föreslagits att New World Bat Hepadnavirus kan vara källan till primat hepadnavirus [27] . Avichepadnavirus saknar ett X-protein, men genomet hos ankhepadnavirus har en rudimentär röntgenläsram [28] . X-proteinet kan ha sitt ursprung från DNA-glykosylas.
Nyligen har rekonstruktionen av arvsmassan från hepatit B-viruset från forntida mänskliga lämningar möjliggjort mer detaljerade studier av utvecklingen av detta virus hos människor [29] [30] [31] . År 2021 rekonstruerade en studie 137 gamla hepatit B-virusgenom och bevisade förekomsten av viruset hos människor sedan minst 10 000 år [29] . Den senaste gemensamma förfadern till alla kända mänskliga linjer av hepatit B-viruset har daterats till 20 000 till 12 000 år sedan. Det går dock inte att säga om viruset fanns hos människor långt tidigare eller förvärvades kort innan från en annan djurart. Utvecklingen av hepatit B-virus hos människor har visat sig spegla välkända händelser i mänsklighetens historia, såsom den första bosättningen i Amerika i slutet av Pleistocen och den neolitiska övergången i Europa [29] . Dessa studier har också visat att vissa gamla stammar av hepatit B-virus fortfarande infekterar människor, medan andra har dött ut [29] [30] [31] . HBV-stammar som finns i afrikanska och sydostasiatiska apor (schimpanser, gorillor, orangutanger och gibboner) verkar vara relaterade till mänskliga HBV-stammar, vilket kan återspegla tidigare överföring mellan arter [32] [29] .
En studie av isolat från den cirkumpolära arktiska mänskliga populationen visade att förfadern är subgenotyp B5 (den endemiska typen som finns i denna population), att förfädersviruset har sitt ursprung i Asien för cirka 2000 år sedan (95 % HPD 900 BC - 830 AD e.) [33] . Sammanslagningen skedde omkring år 1000 e.Kr. e. Denna subgenotyp spreds från Asien till en början till Grönland och spreds sedan västerut under de senaste 400 åren.
Genomets struktur
Storlek
Genomet av hepatit B-viruset består av cirkulärt DNA , men detta är ovanligt eftersom DNA:t inte är helt dubbelsträngat. Ena änden av fullängdssträngen är kopplad till det virala DNA-polymeraset . Genomets längd är 3020–3320 nukleotider (för en fullängdskedja) och 1700–2800 nukleotider (för en kort kedja) [34] .
Kodning
Den negativa (icke-kodande) strängen är komplementär till det virala mRNA:t. Viralt DNA finns i kärnan kort efter infektion av cellen. Delvis dubbelsträngat DNA blir helt dubbelsträngat genom att fullborda (+) sense-strängen med cellulära DNA-polymeraser (viralt DNA-polymeras används i ett senare skede) och ta bort det virala polymerasproteinet (P) från (-) sense-strängen och den korta RNA-sekvensen från den (+) semantiska tråden. Icke-kodande baser tas bort från ändarna av (−) sense-strängen och ändarna sammanfogas.
Virala gener transkriberas av cellulärt RNA-polymeras II i cellkärnan med kovalent sluten cirkulär DNA (cccDNA). Två förstärkare har identifierats i HBV-genomet, betecknade förstärkare I (EnhI) och förstärkare II (EnhII). Båda förstärkarna är mycket aktiva i celler av leverursprung, och tillsammans driver och reglerar de uttrycket av fullständiga virala transkript [35] [36] [37] .
Det finns fyra kända gener som kodas av genomet, kallade C, P, S och X. Kärnproteinet kodas av gen C (HBcAg) och dess startkodon föregås av ett AUG-startkodon, från vilket ett förkoordinatprotein produceras . HBeAg bildas som ett resultat av proteolytisk bearbetning av proteinet som föregår kärnan. DNA-polymeras kodas av genen P. S-genen är den gen som kodar för ytantigenet (HBsAg). HBsAg-genen är en lång öppen läsram, men innehåller tre in-frame "start" (ATG) kodoner som delar genen i tre sektioner: pre-S1, pre-S2 och S. På grund av de många startkodonen, polypeptider är tre olika storlekar kallas stora, medelstora och små (pre-S2).-S1 + pre-S2+ S, pre-S2+ S eller S produceras) [38] .
Funktionen av proteinet som kodas av gen X är inte helt klarlagt [39] , men vissa bevis tyder på att det kan fungera som en transkriptionell transaktivator. Intressant nog kodas 40 kDa X-nucleus-fusionsproteinet av ett långt viralt transkript på 3,9 kb, vars funktion förblir oklar [40] . Syntes av 3,9 kb RNA initieras i promotorregionen av gen X, och transkriptet polyadenyleras först efter den andra omgången av transkription. Ett liknande beteende är typiskt för andra typer av långa pregenomiska/prenukleära (pg/pc) RNA. Således måste den virala transkriptionsmekanismen ignorera poly(A)-signalen i den första omgången av transkription.
Flera icke-kodande RNA-element har identifierats i HBV-genomet . Dessa inkluderar: HBV PREalpha , HBV PREbeta och HBV epsilon RNA-inkapslingssignalen [41] [42] .
Genotyper
Åtta genotyper är kända, betecknade från A till H [8] . En möjlig ny genotyp "I" [43] har beskrivits , men acceptansen av denna beteckning är inte universell [44] .
Skillnaderna mellan genotyper är mer än 8%. Genotyper A och D är allestädes närvarande; Genotyperna C och B är typiska för Sydostasien och Japan. E genotypen är övervägande distribuerad i Afrika. F-genotypen har hittats bland de inhemska populationerna i Sydamerika och Alaska. G genotypen förekommer sporadiskt i olika delar av världen, särskilt i USA och Frankrike. Genotyperna E och G kännetecknas av låg variation i sekvensen av nukleotider i genomet jämfört med andra genotyper.
Genotyper av hepatit B-virus kan ha olika biologiska egenskaper. På senare tid har genotypen av viruset blivit allt viktigare i de kliniska aspekterna av förloppet av en virusinfektion, såväl som känsligheten för antivirala läkemedel. Hittills har det fastställts att infektion orsakad av hepatit B-virus genotyper B och C korrelerar med leverskador; och infektion orsakad av hepatit B-virus genotyp A botas effektivt genom terapeutiska metoder som använder interferon.
Genotyp D har 10 subgenotyper [45] [7] .
Virusreplikering
Livscykeln för hepatit B-viruset är komplex. Hepatit B är ett av få kända icke- retrovirala virus som använder omvänd transkription som en del av replikationsprocessen.
Anslutning
Viruset kommer in i cellen genom att binda till receptorer på cellytan och kommer in i den genom
endocytos medierad av antingen
clathrin eller
caveolin-1 [46] . HBV binder initialt till heparinsulfatet
proteoglykan . Pre-S1-segmentet av HBV L-proteinet binder sedan tätt till den samtransporterande natriumtaurocolate-polypeptiden (NTCP) som kodas av slc10a1-genen
[47] . NTCP finns huvudsakligen i det sinusformade membranet
i leverceller . Närvaron av NTCP i leverceller korrelerar med vävnadsspecificiteten för HBV-infektion
[46] .
Genomslag
Efter endocytos smälter det virala membranet ihop med värdcellmembranet och frisätter nukleokapsiden i cytoplasman
[48] .
Ta bort locket
Eftersom viruset replikerar med hjälp av RNA som produceras av värdenzymet måste det virala genomiska DNA:t överföras till cellkärnan. Kapsiden tros transporteras via
mikrotubuli till
kärnporen . Kärnproteinerna dissocierar från det partiellt dubbelsträngade virala DNA:t, som sedan blir helt dubbelsträngat (av värd-DNA-polymeraser) och omvandlas till kovalent stängt cirkulärt DNA ( cccDNA ), som fungerar som en transkriptionell mall för de fyra virala
mRNA :erna .
replikering
Det största mRNA:t (som är längre än det virala genomet) används för att göra nya kopior av genomet och för att producera
kapsidkärnproteinet och det virala RNA-beroende
DNA-polymeraset .
hopsättning
Dessa fyra virala transkript genomgår ytterligare bearbetning och fortsätter att producera avkommavirioner som frigörs från cellen eller återförs till kärnan och återvinns för att göra ännu fler kopior
[38] [49] .
Släpp
Det långa mRNA:t transporteras sedan tillbaka till cytoplasman, där P-virionproteinet syntetiserar DNA genom dess omvända transkriptasaktivitet.
Transaktiverade gener
HBV har förmågan att transaktivera FAM46A [50] .
Förebyggande
Yt-HBsAg-antigenet som nämns ovan, beläget i det yttre skalet, används för att producera ett mycket effektivt profylaktiskt vaccin .
Se även
Anteckningar
- ↑ Taxonomy of Viruses på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ Hu, J.; Protzer, U.; Siddiqui, A. (2019). "Återbesök av hepatit B-virus: utmaningar med botande terapier" . Journal of Virology . 93 (20). DOI : 10.1128/JVI.01032-19 . PMC 6798116 . PMID 31375584 .
- ↑ Schwalbe M, Ohlenschläger O, Marchanka A, Ramachandran R, Häfner S, Heise T, Görlach M (mars 2008). "Lösningsstruktur av stam-loop alfa av hepatit B-virus post-transkriptionellt reglerande element" . Nukleinsyraforskning . 36 (5): 1681-9. DOI : 10.1093/nar/gkn006 . PMC2275152 . _ PMID 18263618 .
- ↑ Hassan MM, Li D, El-Deeb AS, Wolff RA, Bondy ML, Davila M, Abbruzzese JL (oktober 2008). "Association mellan hepatit B-virus och cancer i bukspottkörteln" . Journal of Clinical Oncology . 26 (28): 4557-62. DOI : 10.1200/JCO.2008.17.3526 . PMC2562875 . _ PMID 18824707 .
- ↑ 1 2 ICTV-rapport Hepadnaviridae . (obestämd)
- ↑ Dupinay T, et al. (November 2013). "Upptäckt av naturligt förekommande överförbar kronisk hepatit B-virusinfektion bland Macaca fascicularis från Mauritius Island." Hepatologi . 58 (5): 1610-1620. DOI : 10.1002/hep.26428 . PMID 23536484 .
- ↑ 1 2 Hundie GB, Stalin Raj V, Gebre Michael D, Pas SD, Koopmans MP, Osterhaus AD, et al. (februari 2017). "En ny hepatit B-virus subgenotyp D10 som cirkulerar i Etiopien". Journal of Viral Hepatit . 24 (2): 163-173. DOI : 10.1111/jvh.12631 . PMID27808472 . _ S2CID 23073883 .
- ↑ 1 2 Kramvis A, Kew M, François G (mars 2005). Genotyper av hepatit B-virus. Vaccin . 23 (19): 2409-23. DOI : 10.1016/j.vaccine.2004.10.045 . PMID 15752827 .
- ↑ Magnius LO, Norder H (1995). "Subtyper, genotyper och molekylär epidemiologi av hepatit B-viruset som återspeglas av S-genens sekvensvariabilitet". Intervirologi . 38 (1-2): 24-34. DOI : 10.1159/000150411 . PMID 8666521 .
- ↑ Drexler JF, Geipel A, König A, Corman VM, van Riel D, Leijten LM, et al. (Oktober 2013). "fladdermöss bär på patogena hepadnavirus som är antigeniskt relaterade till hepatit B-virus och som kan infektera mänskliga hepatocyter . " Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 110 (40): 16151-6. Bibcode : 2013PNAS..11016151D . DOI : 10.1073/pnas.1308049110 . PMC 3791787 . PMID24043818 . _
- ↑ Zuckerman AJ. Kapitel 70: Hepatitvirus // Baron's Medical Microbiology / Baron S. - 4:e. - Univ of Texas Medical Branch, 1996. - ISBN 978-0-9631172-1-2 .
- ↑ VEM | Hepatit b . www.who.int . Hämtad 12 juli 2015. Arkiverad från originalet 10 juli 2015. (obestämd)
- ↑ Locarnini S (2004). "Molekylär virologi av hepatit B-virus". Seminarier i leversjukdom . 24 Suppl 1 (Suppl 1): 3-10. CiteSeerX 10.1.1.618.7033 . DOI : 10.1055/s-2004-828672 . PMID 15192795 .
- ↑ Howard CR (juli 1986). "Hepadnavirusens biologi". Journal of General Virology . 67 (7): 1215-35. DOI : 10.1099/0022-1317-67-7-1215 . PMID 3014045 .
- ↑ Jaroszewicz J, Calle Serrano B, Wursthorn K, Deterding K, Schlue J, Raupach R, et al. (april 2010). "Hepatit B-ytantigen (HBsAg) nivåer i den naturliga historien av hepatit B-virus (HBV)-infektion: ett europeiskt perspektiv". Journal of Hepatology . 52 (4): 514-22. DOI : 10.1016/j.jhep.2010.01.014 . PMID20207438 . _
- ↑ Seeger C, Mason W.S. (mars 2000). Hepatit B-virusbiologi . Mikrobiologi och molekylärbiologi recensioner . 64 (1): 51-68. DOI : 10.1128/mmbr.64.1.51-68.2000 . PMC 98986 . PMID 10704474 .
- ↑ Lin YJ, Huang LR, Yang HC, Tzeng HT, Hsu PN, Wu HL, et al. (maj 2010). "Hepatit B virus kärnantigen bestämmer viral persistens i en C57BL/6 musmodell" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (20): 9340-5. Bibcode : 2010PNAS..107.9340L . DOI : 10.1073/pnas.1004762107 . PMC2889105 . _ PMID20439715 . _
- ↑ Bourne CR, Katen SP, Fulz MR, Packianathan C, Zlotnick A (mars 2009). "Ett mutant hepatit B-virus kärnprotein härmar inhibitorer av icosahedral kapsid självmontering" . biokemi . 48 (8): 1736-42. DOI : 10.1021/bi801814y . PMC2880625 . _ PMID 19196007 .
- ↑ Menéndez-Arias L, Álvarez M, Pacheco B (oktober 2014). "Nukleosid/nukleotidanaloghämmare av hepatit B-viruspolymeras: verkningsmekanism och resistens". Aktuell åsikt i virologi . 8 :1-9. DOI : 10.1016/j.coviro.2014.04.005 . PMID24814823 . _
- ↑ Yang HC, Kao JH (september 2014). "Persistens av hepatit B-virus kovalent stängt cirkulärt DNA i hepatocyter: molekylära mekanismer och klinisk betydelse" . Nya mikrober och infektioner . 3 (9): e64. DOI : 10.1038/emi.2014.64 . PMC 4185362 . PMID26038757 . _
- ^ TSRI - Nyheter och publikationer . Hämtad: 3 januari 2009. (obestämd)
- ↑ Tang H, Oishi N, Kaneko S, Murakami S (oktober 2006). "Molekylära funktioner och biologiska roller för hepatit B-virus x protein". cancervetenskap . 97 (10): 977-83. DOI : 10.1111/j.1349-7006.2006.00299.x . PMID 16984372 .
- ↑ McClain SL, Clippinger AJ, Lizzano R, Bouchard MJ (november 2007). "Hepatit B-virusreplikation är associerad med en HBx-beroende mitokondriereglerad ökning av cytosoliska kalciumnivåer" . Journal of Virology . 81 (21): 12061-5. DOI : 10.1128/JVI.00740-07 . PMC2168786 . _ PMID 17699583 .
- ↑ Bouchard MJ, Puro RJ, Wang L, Schneider RJ (juli 2003). "Aktivering och hämning av cellulärt kalcium- och tyrosinkinassignaleringsvägar identifierar mål för HBx-proteinet som är involverat i hepatit B-virusreplikation . " Journal of Virology . 77 (14): 7713-9. DOI : 10.1128/JVI.77.14.7713-7719.2003 . PMC 161925 . PMID 12829810 .
- ↑ Chai N, Chang HE, Nicolas E, Han Z, Jarnik M, Taylor J (augusti 2008). "Egenskaper hos subvirala partiklar av hepatit B-virus" . Journal of Virology . 82 (16): 7812-7. DOI : 10.1128/JVI.00561-08 . PMC2519590 . _ PMID 18524834 .
- ↑ Suh, Alexander; Brosius, Jürgen; Schmitz, Jürgen; Kriegs, Jan Ole (2013-04-30). "Genomet hos ett mesozoiskt paleovirus avslöjar utvecklingen av hepatit B-virus . " Naturkommunikation _ _ ]. 4 (1): 1791. Bibcode : 2013NatCo...4.1791S . DOI : 10.1038/ncomms2798 . ISSN 2041-1723 . PMID 23653203 .
- ↑ Rasche A, Souza BF, Drexler JF (februari 2016). "Bat hepadnavirus och ursprunget till primat hepatit B-virus". Aktuell åsikt i virologi . 16 :86-94. DOI : 10.1016/j.coviro.2016.01.015 . PMID26897577 . _
- ↑ Lin B, Anderson D.A. (2000). "En rudimentiell X öppen läsram i anka hepatit B-virus." Intervirologi . 43 (3): 185-90. DOI : 10.1159/000025037 . PMID 11044813 . S2CID 22542029 .
- ↑ 1 2 3 4 5 Kocher, Arthur; Papac, Luca; Barquera, Rodrigo; Key, Felix M.; Spyrou, Maria A.; Hubler, Ron; Rohrlach, Adam B.; Aron, Franziska; Stahl, Raphaela; Wissgott, Antje; Bömmel, Florian van (2021-10-08). "Tio årtusenden av hepatit B-virusutveckling" . Vetenskap []. 374 (6564): 182-188. Bibcode : 2021Sci...374..182K . doi : 10.1126/science.abi5658 . PMID 34618559 . S2CID 238475573 .
- ↑ 1 2 Mühlemann B, Jones TC, Damgaard PB, Allentoft ME, Shevnina I, Logvin A, et al. (maj 2018). "Gamla hepatit B-virus från bronsåldern till medeltiden" . naturen . 557 (7705): 418-423. Bibcode : 2018Natur.557..418M . DOI : 10.1038/s41586-018-0097-z . PMID 29743673 . S2CID 13684815 .
- ↑ 1 2 Krause-Kyora, Ben; Susat, Julian; Key, Felix M; Kühnert, Denise; Bosse, Esther; Immel, Alexander; Rinne, Christoph; Kornell, Sabin-Christin; Japp, Diego; Franzenburg, Sören; Heyne, Henrike O (2018-05-10). Locarnini, Stephen, red. "Neolitiska och medeltida virusgenom avslöjar komplex utveckling av hepatit B" . eLife . 7 : e36666. DOI : 10.7554/eLife.36666 . ISSN 2050-084X . PMC 6008052 . PMID 29745896 .
- ↑ Paraskevis D, Magiorkinis G, Magiorkinis E, Ho SY, Belshaw R, Allain JP, Hatzakis A (mars 2013). "Datering av ursprunget och spridningen av hepatit B-virusinfektion hos människor och primater". Hepatologi . 57 (3): 908-16. DOI : 10.1002/hep.26079 . PMID 22987324 .
- ↑ Bouckaert R, Simons BC, Krarup H, Friesen TM, Osiowy C (2017). "Spåra hepatit B-virus (HBV) genotyp B5 (tidigare B6) evolutionär historia i det cirkumpolära Arktis genom fylogeografisk modellering" . PeerJ . 5 : e3757. doi : 10.7717/ peerj.3757 . PMC 5581946 . PMID28875087 . _
- ↑ Kay A, Zoulim F (augusti 2007). "Hepatit B-virus genetisk variabilitet och evolution" . virusforskning . 127 (2): 164-76. DOI : 10.1016/j.virusres.2007.02.021 . PMID 17383765 .
- ↑ Doitsh G, Shaul Y (februari 2004). "Enhancer I dominans i hepatit B-virusgenuttryck" . Molekylär och cellulär biologi . 24 (4): 1799-808. DOI : 10.1128/mcb.24.4.1799-1808.2004 . PMC 344184 . PMID 14749394 .
- ↑ Antonucci TK, Rutter WJ (februari 1989). "Hepatit B-virus (HBV)-promotorer regleras av HBV-förstärkaren på ett vävnadsspecifikt sätt" . Journal of Virology . 63 (2): 579-83. DOI : 10.1128/JVI.63.2.579-583.1989 . PMC 247726 . PMID 2536093 .
- ↑ Huan B, Siddiqui A (1993). "Reglering av hepatit B-virusgenuttryck". Journal of Hepatology . 17 Suppl 3: S20–3. DOI : 10.1016/s0168-8278(05)80419-2 . PMID 8509635 .
- ↑ 1 2 Beck J, Nassal M (januari 2007). "Hepatit B-virusreplikation" . World Journal of Gastroenterology . 13 (1): 48-64. doi : 10.3748/ wjg.v13.i1.48 . PMC 4065876 . PMID 17206754 .
- ↑ Bouchard MJ, Schneider RJ (december 2004). "Den gåtfulla X-genen av hepatit B-virus" . Journal of Virology . 78 (23): 12725-34. DOI : 10.1128/JVI.78.23.12725-12734.2004 . PMC 524990 . PMID 15542625 .
- ↑ Doitsh, Gilad; Shaul, Yosef (maj 2003). "Ett långt HBV-transkript som kodar för pX exporteras ineffektivt från kärnan" . Virologi [ engelska ] ]. 309 (2): 339-349. DOI : 10.1016/S0042-6822(03)00156-9 . PMID 12758180 .
- ↑ Smith GJ, Donello JE, Lück R, Steger G, Hope TJ (november 1998). "Hepatit B-virusets post-transkriptionella regulatoriska element innehåller två konserverade RNA-stamslingor som krävs för funktion . " Nukleinsyraforskning . 26 (21): 4818-27. DOI : 10.1093/nar/26.21.4818 . PMC 147918 . PMID 9776740 .
- ↑ Flodell S, Schleucher J, Cromsigt J, Ippel H, Kidd-Ljunggren K, Wijmenga S (november 2002). "Den apikala stamslingan av inkapslingssignalen för hepatit B-virus viks till en stabil tri-loop med två underliggande pyrimidinutbuktningar . " Nukleinsyraforskning . 30 (21): 4803-11. doi : 10.1093/nar/ gkf603 . PMC 135823 . PMID 12409471 .
- ↑ Olinger CM, Jutavijittum P, Hübschen JM, Yousukh A, Samountry B, Thammavong T, et al. (november 2008). "Möjlig ny genotyp av hepatit B-virus, Sydostasien" . Nya infektionssjukdomar . 14 (11): 1777-80. DOI : 10.3201/eid1411.080437 . PMC2630741 . _ PMID 18976569 .
- ↑ Kurbanov F, Tanaka Y, Kramvis A, Simmonds P, Mizokami M (augusti 2008). "När ska jag överväga en ny genotyp av hepatit B-virus?" . Journal of Virology . 82 (16): 8241-2. DOI : 10.1128/JVI.00793-08 . PMC2519592 . _ PMID 18663008 .
- ↑ Ghosh S, Banerjee P, Deny P, Mondal RK, Nandi M, Roychoudhury A, et al. (mars 2013). "Ny HBV-subgenotyp D9, en ny D/C-rekombinant, identifierad hos patienter med kronisk HBeAg-negativ infektion i östra Indien". Journal of Viral Hepatit . 20 (3): 209-18. DOI : 10.1111/j.1365-2893.2012.01655.x . PMID 23383660 . S2CID 205356299 .
- ↑ 1 2 Zhang Z, Zehnder B, Damrau C, Urban S (juli 2016). "Visualisering av hepatit B-virusinträde - nya verktyg och tillvägagångssätt för att direkt följa virusinträde i hepatocyter". FEBS Bokstäver . 590 (13): 1915-26. DOI : 10.1002/1873-3468.12202 . PMID27149321 . _
- ↑ Yan H, Liu Y, Sui J, Li W (september 2015). "NTCP öppnar dörren för hepatit B-virusinfektion." Antiviral forskning . 121 : 24-30. DOI : 10.1016/j.antiviral.2015.06.002 . PMID 26071008 .
- ↑ Watashi K, Wakita T (augusti 2015). "Hepatit B-virus och hepatit D-virusinträde, artspecificitet och vävnadstropism" . Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine . 5 (8): a021378. doi : 10.1101/cshperspect.a021378 . PMC 4526719 . PMID 26238794 .
- ↑ Bruss V (januari 2007). "Hepatit B-virus morfogenes" . World Journal of Gastroenterology . 13 (1): 65-73. doi : 10.3748/ wjg.v13.i1.65 . PMC 4065877 . PMID 17206755 .
- ↑ Fam46A (proteinkodning) . GeneCards . Genecards. Hämtad: 18 februari 2015. (obestämd)
Klassificering av virus enligt Baltimore |
---|
DNA | I: virus |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Oklassificerad | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Oklassificerad |
|
---|
|
---|
Oklassificerad |
- familj : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Släkten : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-virus |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Oklassificerad |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-virus |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Oklassificerad |
- Familjer : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRÅN | |
---|