Colimovirus

Colimovirus
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:PararnaviraeSorts:ArtverviricotaKlass:RevtraviricetesOrdning:OrterviralesFamilj:Colimovirus
Internationellt vetenskapligt namn
Caulimoviridae
Baltimore-gruppen
VII: dsDNA-RT-virus

Colimovirus [2] ( lat.  Caulimoviridae ) är en familj av DNA-innehållande växtvirus med en omvänd transkriptionsmekanism och dubbelsträngat DNA , det vill säga virus som innehåller ett omvänt transkriptionsstadium i sin replikationscykel.

Struktur av virioner

Virionen är enkel, utan lipidhölje. Nukleokapsidens morfologi representeras av två huvudformer: stavformad och icosaedrisk. Nukleokapsidens form beror på virusets storlek. De stavformade virionerna är cirka 35–50 nm i diameter och kan bli upp till 900 nm långa. Den ikosaedriska kapsiden är 45–50 nm i diameter och ungefär lika lång.

Genomstruktur och replikering

Genomet av detta virus är ett osegmenterat linjärt eller cykliskt dubbelsträngat DNA . Genomstorleken är cirka 6–8 kbs. Beroende på viruset kan genomet antingen ha en öppen läsram (ORF), som i Petuvirus , eller mer än åtta, som i Soymovirus . Genomet av denna virala familj kodar för följande proteiner: omvänt transkriptas , proteas , strukturella proteiner, såväl som andra proteiner med okända funktioner, men på ett eller annat sätt som är nödvändiga för virusreplikation .

Replikation sker både i cytoplasman och i värdcellens kärna. Först kommer det virala genomet in i cytoplasman. Där bildar den en superlindad minkromosom. Det transkriberar virusets mRNA , vilket är redundant (eftersom det uttrycks två gånger i vissa delar av genomet). Detta transkriberade RNA kommer in i cytoplasman, där det spelar två roller. Det kan antingen användas som en mall för translation av virala proteiner eller omvänt transkriberas till dsDNA med användning av viralt reversetas . Eftersom dessa virus har mycket gemensamt med retrovirus , grupperas de ofta tillsammans som pararetrovirus. Det finns dock en viktig skillnad här mellan retrovirus och virus i familjen Caulimoviridae . Till skillnad från retrovirus, integrerar de inte sitt genom i kromosomerna , eftersom deras genom inte kodar för integrasenzymet .

Det finns dock arter av Colimovirus-familjen, såsom Petunia venclearing virus , som ibland (främst under stressiga förhållanden) kan integrera sitt genom i det ekonomiska genomet [3] . Typiskt hänvisas sådana provirus ofta till som endogena pararetrovirus (EPRV).

Klassificering

Enligt International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) inkluderar familjen från och med mars 2016 8 släkten [4] :

Den rosa gula venvirusarten har en ovanlig genomorganisation som gör den till en unik art [5] .

Anteckningar

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ Pinevich A.V. , Sirotkin A.K. , Gavrilova O.V. , Potekhin A.A. Virologi: lärobok. - St Petersburg.  : St. Petersburg University Press, 2012. - S. 275. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
  3. ↑ Harper G., Hull R., Lockhart B. och Olszewski N. (2002). Virala sekvenser integrerade i växtgenom. Annual Review of Phytopathology 40 : 119-136. doi : 10.1146/annurev.phyto.40.120301.105642 . PMID 12147756 .
  4. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 26 mars 2017) .
  5. ↑ Mollov D., Lockhart B., Zlesak DC, Olszewski N. (2012). Komplett nukleotidsekvens av rosagul venvirus, en medlem av familjen Caulimoviridae som har en ny genomorganisation. Arch Virol .

Länkar