Transposoner

Transposoner ( eng.  transposable element, transposon ) är delar av DNA från organismer som kan förflyttas (transposition) och reproduktion inom genomet [1] . Transposoner är också kända som "hoppande gener" och är exempel på transposerbara genetiska element .

Transposoner hänvisar formellt till den så kallade icke-kodande delen av genomet - en som i sekvensen av DNA-baspar inte bär information om proteiners aminosyrasekvenser, även om vissa klasser av mobila element innehåller information om enzymer i deras sekvens transkriberas och katalyserar rörelser; till exempel kodar DNA-transposoner och DDP-1 för proteinerna transposas , BORS1 och BORS2 . Hos olika arter är transposoner fördelade i olika grad: hos människor utgör exempelvis transposoner upp till 45 % av hela DNA-sekvensen, hos fruktflugan Drosophila melanogaster utgör delen av transposerbara element endast 15–20 % av hela genomet [2] . I växter kan transposoner uppta huvuddelen av genomet, till exempel i majs ( Zea mays ), med en genomstorlek på 2,3 miljarder baspar, är minst 85 % olika transponerbara element [3] .

Upptäcktshistorik

Barbara McClintock studerade variationer i färgen på spannmål och blad på majs, och 1948, genom cytologiska och genetiska studier, kom hon till slutsatsen att mobila DNA-fragment, Ac/Ds- element, leder till somatisk mosaicism av växter [4] . Hon var den första som bevisade att det eukaryota genomet inte är statiskt, utan innehåller regioner som kan röra sig. 1983 fick Barbara McClintock Nobelpriset för detta arbete [5] .

Även om transposoner upptäcktes på 1940 -talet , blev det bara ett halvt sekel senare klart hur stor deras andel i genomet av organismer var. Att erhålla den första nukleotidsekvensen ( sekvensering ) av det mänskliga genomet visade att det finns minst 50 % av mobila element i DNA-sekvensen. En exakt uppskattning är svår att få eftersom vissa transposonregioner har förändrats så mycket över tiden att de inte kan identifieras med säkerhet [6] .

Eftersom transposoner har potential att orsaka skadliga mutationer och kromatinnedbrytningar , sedan upptäckten av transposerbara element, har det ansetts att deras verkan reduceras till genomisk parasitism. Men i början av 2000-talet dyker det upp mer och mer data om de möjliga fördelaktiga effekterna av transposoner för organismer [7] , om retrotransposonernas evolutionära inflytande på genomet hos placenta däggdjur [8] . Identifierar användningen av transposoner av organismer. Till exempel är DDP-1 retrotransposon RNA involverad i bildandet av heterokromatin under X-kromosominaktivering [9] . Fruktflugan saknar telomeras , men använder istället retrotransposon omvänt transkriptas för att förlänga telomera regioner, som hos Drosophila melanogaster är transposonupprepningar [10] [11] .

Typer av transposoner och mekanismer för deras rörelse

Transponerbara genetiska element hänvisar till repetitiva element i genomet - de som har flera kopior i en cells DNA-sekvens . Repetitiva element av genomet kan lokaliseras i tandem ( mikrosatelliter , telomerer , etc.) och kan spridas genom genomet (mobila element, pseudogener , etc.) [12] .

Mobila genetiska element beroende på typen av transposition kan delas in i två klasser: DNA-transposoner , som använder "klipp och klistra"-metoden, och retrotransposoner , vars rörelse har i sin algoritm syntesen av RNA från DNA , följt av omvänd syntes av DNA från en RNA-molekyl, det vill säga metoden "kopiera och klistra in".

Transposoner kan också delas in efter graden av autonomi. Både DNA-transposoner och retrotransposoner har autonoma och icke-autonoma element. Icke-autonoma element för transponering kräver enzymer som kodas av autonoma element, som ofta innehåller signifikant förändrade transposonregioner och ytterligare sekvenser. Antalet icke-autonoma transposoner i genomet kan avsevärt överstiga antalet autonoma [13] .

DNA-transposoner

DNA-transposoner rör sig runt genomet på ett klipp-och-klistra sätt tack vare ett komplex av enzymer som kallas transposas [1] . Information om aminosyrasekvensen för transposasproteinet kodas i sekvensen för transposonet. Dessutom kan denna DNA-region innehålla andra sekvenser associerade med transposonet, såsom gener eller delar därav. De flesta DNA-transposoner har en ofullständig sekvens. Sådana transposoner är inte autonoma och rör sig runt genomet på grund av ett transposas, som kodas av ett annat, komplett, DNA-transposon [1] .

I ändarna av DNA-transposonregionerna finns inverterade upprepningar, som är speciella transposasigenkänningsställen, vilket skiljer denna del av genomet från resten. Transposas kan göra dubbelsträngade DNA-snitt, skära och infoga ett transposon i mål-DNA:t [14] .

Ac/Ds växtelement tillhör DNA-transposoner , som först upptäcktes av Barbara McClintock i majs. Ac -element ( eng.  Activator ) är autonomt och kodar för transposas. Det finns flera typer av Ds- element som är kapabla att bilda kromosomavbrott och som rör sig genom genomet på grund av Ac- element [15] .

Helitroner är en  typ av transposon som finns i växter , djur och svampar , men som finns i stor utsträckning i majsgenomet, där den, till skillnad från andra organismer, finns i genrika delar av DNA [3] . Helitroner transponeras enligt den rullande cirkelmekanismen . Processen börjar med att en sträng av DNA-transposonet går sönder. Den frigjorda DNA-sträckan invaderar målsekvensen, där ett heteroduplex bildas . Med hjälp av DNA-replikation fullbordas införandet av transposonet i en ny plats [16] .  

Helitroner kan fånga intilliggande sekvenser under transponering.

Retrotransposoner

Retrotransposoner är mobila genetiska element som använder metoden "kopiera och klistra in" för att spridas i genomet hos djur [17] . Minst 45 % av det mänskliga genomet består av retrotransposoner och deras derivat. Rörelseprocessen involverar det mellanliggande steget av en RNA- molekyl , som läses från retrotransposonregionen och som i sin tur används som en mall för omvänd transkription till en DNA-sekvens. Det nysyntetiserade retrotransposonet sätts in i en annan region av genomet.

Aktiva retrotransposoner från däggdjur är indelade i tre huvudfamiljer: Alu-repetitioner, DDP-1, SVA.

• DDP-1-retrotransposoner  är långa spridda upprepningar, en typ av retrotransposoner som är utbredd i däggdjur och utgör upp till 20 % av genomet. DDP-1-element har en längd på cirka 6 tusen baspar [7] . De flesta av dessa retrotransposoner är ofullständigt representerade i genomet, även om det finns cirka 150 kompletta och potentiellt mobila DDP-1-element i den mänskliga DNA-sekvensen och cirka 3000 i musen [7] .
  Rörelseprocessen börjar med avläsning av RNA-molekylen från DDP-1-elementet. RNA transporteras till cytoplasman , där BORS1 (som är ett RNA-bindande protein) och BORS2 (som är ett protein med endonukleas- och omvänt transkriptasaktiviteter) translateras från det. BORS1, BORS2 och transposon-RNA bildar ett ribonukleoprotein och importeras till kärnan , där omvänd transkription av retrotransposon sker [18] .
  De flesta fall av införande av DDP-1-element är ofullständiga, och sådana kopior kan inte längre självmobiliseras [7] .
  Det finns information om de icke-kanoniska funktionerna hos DDP-1-element under inaktiveringen av X-kromosomen [9] .
• LTR  - långa terminala upprepningar  - retrotransposoner med ändliga repeterande sekvenser som spelar en viktig roll i transkriptionen och omvänd transkription av transposon-RNA [4] . LTR-element kodar för pol- och gag- proteiner , som är nära retrovirala proteiner, men till skillnad från de senare saknar LTR proteiner som kan bilda det yttre skalet ( superkapsid ) och lämna cellen [13] .
• CRP  - korta dispergerade upprepningar är icke-autonoma retrotransposoner: de kräver aktiviteten av DDP-1-element för rörelse; i DNA-sekvensen innehåller CRP endast RNA-polymerasbindningsstället [4] . RTP:erna inkluderar Alu-retrotransposoner.

• Alu-repeat ( Alu från Arthrobacter luteus ) är vitt spridda transposerbara element i det mänskliga genomet [19] . Alu-element är cirka 300 baspar långa och är ofta lokaliserade i introner , icke-översatta regioner av genomet och intergena regioner [12] . Alu- retrotransposoner prefixerades eftersom de innehåller restriktionsenzymigenkänningssekvensen AluI [12 ] . Sekvensanalys visade att Alu-element uppstod hos primater för cirka 65 miljoner år sedan från 7SL RNA-genen, som är en del av det ribosomala komplexet [12] . Alu-retrotransposoner har inte sitt eget omvänt transkriptas, så de behöver DDP-1-enzymer för rörelse.
  Alu-element är de platser där upp till 90 % av all A - I RNA-redigering sker [18] .
• SVA  är transposerbara element av 2-3 tusen baspar av DNA, som består av flera delar: korta spridda element (SRC), variabelt antal tandemupprepningar (VTR), Alu-sekvens1 [20] och CT-upprepning, med sekvensen CCCTCT , som förekommer oftast och har namnet hexamer (Hex) [21] . SVA-element varierar avsevärt i längd på grund av olika antal ingående upprepningar [21] . De är inte autonoma och kräver proteiner kodade i DDP1 retrotransposoner för rörelse, men de är aktiva i det mänskliga genomet [4] . SVA-element genomgår höga nivåer av DNA-metylering i de flesta mänskliga vävnader. Ett intressant faktum är undermetyleringen av DNA från SVA-retrotransposoner i mänskliga manliga könsceller , medan hos schimpanser är SVA-sekvenserna av spermatozoer mycket metylerade [22] .

Transposonblockerande mekanismer

Mobila delar av genomet är ganska brett representerade i växt- och djurgenom. Deras höga aktivitet är en risk för genomets stabilitet , så deras uttryck är hårt reglerat, särskilt i de vävnader som är involverade i bildandet av könsceller och överföringen av ärftlig information till ättlingar. Hos växter och djur sker regleringen av aktiviteten av mobila element i genomet genom de novo - metylering av DNA-sekvensen och aktiviteten av icke-kodande RNA tillsammans med Argonaut-proteinkomplex [23] .

Huvudrollen för små icke-kodande RNA som interagerar med pivi-komplexet, eller piRNA , är att undertrycka transposerbara genomiska element i könscellers vävnader. Denna roll för piRNA är ganska högt bevarad i djur [24] .

Hos möss är mobila element i genomet under ontogenesen övervägande i ett inaktivt tillstånd, vilket uppnås genom epigenetiska interaktioner och aktiviteten av icke-kodande RNA [25] . Under embryonal utveckling genomgår det epigenetiska DNA-metyleringsmärket omprogrammering: föräldramärken raderas och nya etableras [26] . Under denna period spelar en del av argonautproteinerna - piwi-proteiner (Mili och Miwi2) - och icke-kodande RNA som interagerar med dem - piRNA - en nyckelroll i de novo -undertryckandet av musretrotransposoner genom DNA-metylering och pingis cykel av piRNA-amplifiering och målsuppression [27] . Om möss saknar Mili- och Miwi2-proteiner, leder detta till aktivering av DDP-1 och LTP och stoppande av gametogenes och sterilitet hos män [24] . Nyligen arbete har visat att hos flugan Drosophila melanogaster är SFG-1- proteinet en aktiv cofaktor vid suppression .

Mekanismen för piRNA- inducerad undertryckning av transposoner har inte klarlagts helt, men den kan representeras schematiskt av följande modell [28] :

• primär ackumulering av enkelsträngade RNA-molekyler, piRNA- prekursorer ;
• mognad av piRNA och deras amplifiering med hjälp av pewee-proteiner (pingiscykel);
• suppression av måltransposonet, vilket kan ske på flera sätt: RNA-nedbrytning (via RNas-aktiviteten i den H-liknande domänen av argonautproteiner), translationell suppression och rekrytering av kromatinmodifierande system (såsom SWI/SNF-proteiner [13] ) och ytterligare epigenetisk undertryckande transposon.

Till skillnad från virus , som använder värden för att reproducera och kan lämna den, existerar mobila genetiska element uteslutande i värden. Till viss del kan därför transposoner reglera sin verksamhet. Ett exempel på detta är Ac - DNA-transposoner  - autonoma mobila element av växter som kodar för sitt eget transposas. Ac -element visar förmågan att minska aktiviteten av transposas med en ökning av dess kopior [29] .

Även undertryckandet av växtautonoma DNA-transposoner MuDR kan ske med hjälp av Muk. Muk är en variant av MuDR och har flera palindromiska DNA-regioner i sin sekvens. När Muk transkriberas bildar detta RNA en hårnål, som sedan skärs av ett komplex av enzymer till små störande RNA (siRNA), som tystar MuDR-aktiviteten via RNA-interferensprocessen [29] .

Sjukdomar

Från och med 2012 har 96 olika mänskliga sjukdomar dokumenterats som orsakas av de novo introduktion av mobila genetiska element [22] . Alu-repetitioner orsakar ofta kromosomavvikelser och är orsaken till 50 typer av sjukdomar [30] . Så vid neurofibromatos typ I hittades 18 fall av inbäddade retrotransposoner , varav 6 förekommer på 3 specifika platser. Aktiviteten av mobila element DDP-1 i somatiska vävnader registrerades hos patienter med lungcancer [22] .

Om transponeringen som orsakar sjukdomar sker i gameter , ärver de följande generationerna sjukdomarna. Så, blödarsjuka kan uppstå på grund av införandet av DDP-1-retrotransposonet i DNA-regionen som kodar för koagulationsfaktor VIII -genen . Hos möss registrerades fall av onkogenes, utvecklingsstopp och sterilitet på grund av införandet av mobila element i genomet [30] .

Transposonernas evolutionära roll

Vissa stadier av evolutionen av organismer orsakades av aktiviteten hos mobila element i genomet. Redan den första nukleotidsekvensen i det mänskliga genomet bevisade att många gener var derivat av transposoner [6] . Mobila element i genomet kan påverka genomets organisation genom att rekombinera genetiska sekvenser och vara en del av sådana grundläggande strukturella element av kromatin som centromerer och telomerer [31] . Transposerbara element kan påverka närliggande gener genom att ändra mönster ( mönster ) av splitsning och polyadenylering eller fungera som förstärkare eller promotorer [13] . Transposoner kan påverka geners struktur och funktion genom att stänga av och ändra funktioner, ändra strukturen av gener, mobilisera och omorganisera genfragment och förändra den epigenetiska kontrollen av gener [16] .

Transposonreplikation kan orsaka vissa sjukdomar, men trots detta togs transposonerna inte bort under evolutionen och fanns kvar i DNA- sekvenserna hos nästan alla organismer, antingen i form av hela kopior som kunde röra sig längs DNA:t, eller i förkortad form, efter att ha förlorat förmågan att röra sig. Men trunkerade kopior kan också delta i sådana processer som post-transkriptionell reglering av gener, rekombination, etc. [31] En annan viktig punkt i transposonernas potentiella förmåga att påverka evolutionens hastighet är att deras reglering beror på epigenetiska faktorer. Detta leder till transposonernas förmåga att svara på miljöförändringar och orsaka genetisk instabilitet [31] . Vid stress aktiveras transposoner antingen direkt eller genom att minska deras undertryckande av argonautproteiner och piRNAs [13] . I växter är mobila genetiska element mycket känsliga för olika typer av stress; deras aktivitet kan påverkas av många abiotiska och biotiska faktorer , inklusive salthalt , skador, kyla, värme, bakteriella och virusinfektioner [16] .

En annan möjlig mekanism för utvecklingen av organismers genom är horisontell genöverföring  - processen att överföra gener mellan organismer som inte är i ett "förfader-ättling"-förhållande. Det finns bevis för att interaktioner mellan parasitiska organismer och djurvärdar kan leda till horisontell transposonassisterad genöverföring som har skett mellan ryggradsdjur och ryggradslösa djur [32] .

Exempel på den evolutionära rollen för mobila genetiska element

Däggdjursförvärvad immunitet tros ha sitt ursprung i käkfiskar för ungefär 500 miljoner år sedan [33] . Förvärvad immunitet tillåter bildandet av antikroppar för många typer av patogener som kommer in i kroppen hos däggdjur, inklusive människor. För att bilda olika antikroppar ändrar celler i immunsystemet DNA-sekvensen genom somatisk rekombination med hjälp av ett system som uppstod och utvecklades på grund av mobila element i genomet [33] .

Neuroner , celler i nervsystemet, kan ha ett mosaikgenom , det vill säga deras DNA-sekvens skiljer sig från DNA-sekvensen för andra celler, även om de alla bildades från en prekursorcell - en zygot . Hos råttor har speciellt insatta humana DDP-1 retrotransposoner visat sig vara aktiva även i vuxen ålder. Dessutom registrerades en ökning av kopior av DDP-1 retrotransposoner i neuronerna i vissa delar av hjärnan , särskilt hypotalamus , i jämförelse med andra vävnader hos vuxna [34] . Det har också visat sig att mobila element leder till heterogenitet i neuronerna hos flugan Drosophila melanogaster [2] . Aktiviteten hos mobila element i neuroner kan leda till synaptisk plasticitet och större variation i beteendesvar [7] .

DNA-sekvenserna för generna för telomeras- och DDP-1-retrotransposoner har en hög homologi, vilket indikerar möjligheten till ursprunget för telomeras från retrotransposoner [1] .

Växter har en mycket hög grad av genomevolution, därför är effekterna av transposerbara element som uppstod som ett resultat av domesticering , eftersom det hände nyligen, mest kända, och dessa förändringar är lätta att identifiera, eftersom de egenskaper som odlade växter var med valda är kända [16] . Ett exempel skulle vara förvärvet av en oval form av den romerska tomaten Solanum lycopersicum . Genen, som är belägen vid SUN- lokuset , flyttades genom retrotransposition till en annan DNA-region, där den regleras av olika promotorsekvenser i ovala tomater [16] .

Använda transposoner

Genteknik

Eftersom transposerbara element i genomet kan integreras i kromatin , används de i genteknik för den specifika och kontrollerade infogningen av gener eller delar av DNA som forskare studerar. Transposoner används för mutagenes och för att bestämma de reglerande delarna av genomet i laboratorier.

Det mest kända systemet för införd in vivo mutagenes  är det P-mobila elementet av flugan D. melanogaster , som kan användas för att studera genfunktioner, etablering av kromosomavvikelser , etc. [35]

Hos ryggradsdjur fanns det under lång tid ingen effektiv metod för transposonmodifiering av genomet. Det finns nu ett Tol2-transposerbart elementsystem härlett från den japanska fisken Oryzias latipes som används i både möss och mänskliga cellinjer [35] . Minos transposonsystem [36] är också framgångsrikt .

Transposonsystemet Törnrosa skapades baserat på DNA-sekvensen av ett fisktransposas .  Framgångsrik användning av detta system i möss har gjort det möjligt att identifiera kandidater för humana koloncanceronkogener [37] .

Fylogenetik

Förutom användningen av transposoner i genteknik är studiet av transposonaktivitet en metod för fylogenetik . Genom att analysera och jämföra nukleotidsekvenserna för olika arters genom kan man hitta transposoner som finns i vissa arter men saknas i andra. Arter som delar samma retrotransposon har troligen fått det från en gemensam förfader. Således är det möjligt att få information om arternas evolutionära utveckling och bygga fylogenetiska träd [38] .

Anteckningar

1. ↑ 1 2 3 4 Sivolob A. V. Molekylärbiologi . - Kiev: Printing Center "Kyiv University", 2008. - 384 sid.
2. ↑ 1 2 Perrat PN, DasGupta S., Wang J. et al. Transpositionsdriven genomisk heterogenitet i Drosophila-hjärnan  (engelska)  // Science : journal. - 2013. - Vol. 340 , nr. 6128 . - S. 91-95 . — ISSN 0036-8075 . - doi : 10.1126/science.1231965 .
3. ↑ 1 2 Patrick S. Schnable, Doreen Ware, Robert S. Fulton, et al. B73-majsgenomet: komplexitet, mångfald och dynamik  (engelska)  // Science : journal. - 2009. - Vol. 326 , nr. 5956 . - P. 1112-1115 . - doi : 10.1126/science.1178534 . — PMID 19965430 .
4. ↑ 1 2 3 4 Levin Henry L., Moran John V. Dynamisk interaktion mellan transposerbara element och deras värdar  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2011. - Vol. 12 , nr. 9 . - s. 615-627 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg3030 .
5. ↑ Nobelpris till Barbara McClintock   // Nature . - 1983. - Vol. 305 , nr. 5935 . - S. 575-575 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/305575a0 .
6. ↑ 1 2 Lander Eric S., Linton Lauren M., Birren Bruce. Initial sekvensering och analys av det mänskliga genomet  //  Nature : journal. - 2001. - Vol. 409 , nr. 6822 . - P. 860-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/35057062 .
7. ↑ 1 2 3 4 5 Sångaren Tatjana, McConnell Michael J., Marchetto Maria CN et al. LINE-1 retrotransposoner: mediatorer av somatisk variation i neuronala genom? (engelska)  // Trends in Neurosciences : journal. - Cell Press , 2010. - Vol. 33 , nr. 8 . - s. 345-354 . — ISSN 01662236 . - doi : 10.1016/j.tins.2010.04.001 .
8. ↑ Kaneko-Ishino Tomoko, Ishino Fumitoshi. Retrotransposontystnad genom DNA-metylering bidrog till utvecklingen av placentation och genomisk prägling hos däggdjur  //  Development, Growth & Differentiation: journal. - 2010. - Vol. 52 , nr. 6 . - s. 533-543 . — ISSN 00121592 . - doi : 10.1111/j.1440-169X.2010.01194.x .
9. ↑ 1 2 Melamed Esther, Arnold Arthur P. Rollen av LINEs och CpG-öar i doskompensation på kycklingens Z-kromosom  //  Kromosomforskning: journal. - 2009. - Vol. 17 , nr. 6 . - s. 727-736 . — ISSN 0967-3849 . - doi : 10.1007/s10577-009-9068-4 .
10. ↑ Abad JP TAHRE, en ny telomerisk retrotransposon från Drosophila melanogaster, avslöjar ursprunget till Drosophila Telomeres   // Molecular Biology and Evolution : journal. - Oxford University Press , 2004. - Vol. 21 , nr. 9 . - P. 1620-1624 . — ISSN 0737-4038 . - doi : 10.1093/molbev/msh180 .
11. ↑ Nick Fulcher, Elisa Derboven, Sona Valuchova & Karel Riha. Om kepsen passar, bär den: en översikt över telomera strukturer över evolution  //  Cellular and molecular life sciences : CMLS : journal. - 2013. - doi : 10.1007/s00018-013-1469-z . — PMID 24042202 .
12. ↑ 1 2 3 4 Batzer Mark A., Deininger Prescott L. Alu upprepningar och mänsklig genomisk mångfald  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2002. - Vol. 3 , nr. 5 . - S. 370-379 . — ISSN 14710056 . doi : 10.1038 / nrg798 .
13. ↑ 1 2 3 4 5 R. Keith Slotkin, Robert Martienssen. Transposerbara element och den epigenetiska regleringen av genomet  // Naturrecensioner  . Genetik  : tidskrift. - 2007. - April ( vol. 8 , nr 4 ). - S. 272-285 . doi : 10.1038 / nrg2072 . — PMID 17363976 .
14. ↑ av Opijnen Tim, Camilli Andrew. Transposoninsättningssekvensering: ett nytt verktyg för systemnivåanalys av mikroorganismer  (engelska)  // Nature Reviews Microbiology  : journal. - 2013. - Vol. 11 , nr. 7 . - s. 435-442 . — ISSN 1740-1526 . - doi : 10.1038/nrmicro3033 .
15. ↑ Chunguang Du, Andrew Hoffman, Limei He, Jason Caronna & Hugo K. Dooner. Den kompletta Ac/Ds-transposonfamiljen av majs  (neopr.)  // BMC-genomik. - 2011. - T. 12 . - S. 588 . - doi : 10.1186/1471-2164-12-588 . — PMID 22132901 .
16. ↑ 1 2 3 4 5 Damon Lisch. Hur viktiga är transposoner för växtutveckling? (engelska)  // Naturrecensioner. Genetik  : tidskrift. - 2013. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 49-61 . doi : 10.1038 / nrg3374 . — PMID 23247435 .
17. ↑ Baillie J. Kenneth, Barnett Mark W., Upton Kyle R. Somatisk retrotransposition förändrar det genetiska landskapet i den mänskliga hjärnan  //  Nature : journal. - 2011. - Vol. 479 , nr. 7374 . - s. 534-537 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature10531 .
18. ↑ 1 2 Cordaux Richard, Batzer Mark A. Effekten av retrotransposoner på mänsklig genomevolution  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2009. - Vol. 10 , nej. 10 . - s. 691-703 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg2640 .
19. ↑ Hannah Stower. Alternativ skarvning: Regulating Alu element 'exonization'  //  Nature Reviews Genetics  : journal. - 2013. - Vol. 14 , nr. 3 . - S. 152-153 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg3428 .
20. ↑ Varki Ajit, Geschwind Daniel H., Eichler Evan E. Mänsklig unikhet: genominteraktioner med miljö, beteende och kultur  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2008. - Vol. 9 , nej. 10 . - s. 749-763 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg2428 .
21. ↑ 1 2 Hancks DC, Mandal PK, Cheung LE et al. Den minimala aktiva mänskliga SVA-retrotransposonen kräver endast 5'-hexamer- och alu-liknande domäner   // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2012. - Vol. 32 , nr. 22 . - P. 4718-4726 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.00860-12 .
22. ↑ 1 2 3 Hancks Dustin C., Kazazian Haig H. Aktiva mänskliga retrotransposoner: variation och sjukdom  //  Current Opinion in Genetics & Development: journal. - 2012. - Vol. 22 , nr. 3 . - S. 191-203 . — ISSN 0959437X . - doi : 10.1016/j.gde.2012.02.006 .
23. ↑ Law Julie A., Jacobsen Steven E. Etablering, underhåll och modifiering av DNA-metyleringsmönster i växter och djur  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2010. - Vol. 11 , nr. 3 . - S. 204-220 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg2719 .
24. ↑ 1 2 Siomi Mikiko C., Sato Kaoru, Pezic Dubravka et al. PIWI-interagerande små RNA: spetsen för genomförsvar  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : tidskrift  . - 2011. - Vol. 12 , nr. 4 . - S. 246-258 . — ISSN 1471-0072 . - doi : 10.1038/nrm3089 .
25. ↑ De Fazio Serena, Bartonicek Nenad, Di Giacomo Monica. Endonukleasaktiviteten hos Mili ger bränsle till piRNA-förstärkning som tystar LINE1-element  (engelska)  // Nature : journal. - 2011. - Vol. 480 , nr. 7376 . - S. 259-263 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature10547 .
26. ↑ Popp Christian, Dean Wendy, Feng Suhua. Genomomfattande radering av DNA-metylering i mus primordiala könsceller påverkas av AID-brist  //  Nature : journal. - 2010. - Vol. 463 , nr. 7284 . - P. 1101-1105 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature08829 .
27. ↑ Castel Stephane E., Martienssen Robert A. RNA-interferens i kärnan: roller för små RNA i transkription, epigenetik och vidare  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2013. - Vol. 14 , nr. 2 . - S. 100-112 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg3355 .
28. ↑ Luteijn Maartje J., Ketting René F.  PIWI -interagerande RNA: från generation till transgenerationell epigenetik  // Nature Reviews Genetics  : journal. - 2013. - Vol. 14 , nr. 8 . - s. 523-534 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg3495 .
29. ↑ 1 2 Damon Lisch. Reglering av transponerbara element i majs  (neopr.)  // Aktuell åsikt inom växtbiologi. - 2012. - T. 15 , nr 5 . - S. 511-516 . - doi : 10.1016/j.pbi.2012.07.001 . — PMID 22824142 .
30. ↑ 1 2 Zamudio N., Bourc'his D. Transponerbara element i däggdjurets könslinje: en bekväm nisch eller en dödlig fälla? (engelska)  // Ärftlighet: journal. - 2010. - Vol. 105 , nr. 1 . - S. 92-104 . — ISSN 0018-067X . - doi : 10.1038/hdy.2010.53 .
31. ↑ 1 2 3 Rebollo Rita, Horard Beatrice, Hubert Benjamin et al.  Hoppande gener och epigenetik : Mot nya arter  // Gen. — Elsevier , 2010. — Vol. 454 , nr. 1-2 . - S. 1-7 . — ISSN 03781119 . - doi : 10.1016/j.gene.2010.01.003 .
32. ↑ Gilbert Clément, Schaack Sarah, Pace II John K. et al. En roll för interaktioner mellan värd och parasit i horisontell överföring av transposoner över phyla  (engelska)  // Nature: journal. - 2010. - Vol. 464 , nr. 7293 . - P. 1347-1350 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature08939 .
33. ↑ 1 2 Flajnik Martin F., Kasahara Masanori. Ursprung och utveckling av det adaptiva immunsystemet: genetiska händelser och selektiva tryck  (engelska)  // Nature Reviews Genetics  : journal. - 2009. - Vol. 11 , nr. 1 . - S. 47-59 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg2703 .
34. ↑ Coufal Nicole G., Garcia-Perez José L., Peng Grace E. L1 retrotransposition i mänskliga neurala progenitorceller  (italienska)  // Nature: diario. - 2009. - V. 460 , n. 7259 . - P. 1127-1131 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature08248 .
35. ↑ 1 2 Carlson Corey M., Largaespada David A. Insättningsmutagenes hos möss: nya perspektiv och verktyg  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2005. - Vol. 6 , nr. 7 . - S. 568-580 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg1638 .
36. ↑ Venken Koen J T., Schulze Karen L., Haelterman Nele A. MiMIC: en mycket mångsidig transposoninsättningsresurs för att konstruera Drosophila melanogaster-gener  // Nature Methods  : journal  . - 2011. - Vol. 8 , nr. 9 . - s. 737-743 . — ISSN 1548-7091 . - doi : 10.1038/nmeth.1662 .
37. ↑ Mars H Nikki, Rust Alistair G., Wright Nicholas A. Insertionell mutagenes identifierar flera nätverk av samverkande gener som driver intestinal tumörbildning  // Nature Genetics  : journal  . - 2011. - Vol. 43 , nr. 12 . - P. 1202-1209 . — ISSN 1061-4036 . - doi : 10.1038/ng.990 .
38. ↑ Inferring Phylogenetic Trees from Transposon Data , < http://content.csbs.utah.edu/~rogers/ant1050/trantree.html > 

Ordlista

• Ac/Ds  - activation-dissociation system ( eng.  Activator-dissociation system )
• BORS1  - protein av den första öppna läsramen ( Eng.  Open läsram 1 protein, ORF1p ); BORS2  - protein i den andra öppna läsramen
• DDP  - långa spridda upprepningar ( eng.  Long Interspersed Elements, LINE, L )
• LTR  - långa terminalupprepningar ( eng.  Long Terminal Repeat, LTR )
• KDP  - korta spridda upprepningar ( eng.  Short INTEspersed Elements, SINE )
• SVA ( eng.  SINE-R-VNTR-Alu ) - element av KDP-VChTP-Alu (där VChTP - tandemupprepningar  varierar i antal , eng.  Variabelt antal tandemupprepningar, VNTR ).
• SFG-1  - gametocytspecifik faktor 1 ( eng.  gametocytspecifik faktor 1, GTSF1 )

Litteratur

• Golubovsky M. D. Instabilitet hos gener och mobila element: om historien om studier och upptäckter // Historisk och biologisk forskning. 2011. Nr 4. S.60-78.
• Titov I.I., Vorozheikin P.S. miRNA-innehållande mänskliga transposoner  // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. - T. 15 , nr 323-326 .
• Avdeev Yu. I., Avdeev A. Yu. Detektion av könscellstransposoner i solanum lycopersicum L. spontana mutanter och växtförädling // nr. 2013. Nr 2. P.103-109.
• Danilevskaya O.N. Mobila genetiska element i Drosophila: upptäcktens historia och upptäckarnas öde // Istoriko-biologicheskie issledovaniya. 2011. Nr 4. P.79-89.
• Yurchenko N. N., Kovalenko L. V., Zakharov I. K. Mobila genetiska element: instabilitet hos gener och genom  // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. - T. 15 , nr 2 . - S. 261-270 .

Se även

• Transposon Tn10

Ordböcker och uppslagsverk	Stor dansk Stor norsk Britannica (online)
I bibliografiska kataloger	BNF : 12262439n J9U : 987007538808305171 LCCN : sh85135694